117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_1051 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_1051  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 273 aa  551  1e-156  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.380491  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1087  alpha/beta fold hydrolase  76.92 
 
 		 268 aa  428  1e-119  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1064  alpha/beta hydrolase fold protein  70.96 
 
 		 273 aa  396  1e-109  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.456045  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0968  putative hydrolase protein  70.96 
 
 		 273 aa  395  1e-109  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0492614 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1125  putative hydrolase protein  69.52 
 
 		 273 aa  382  1e-105  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.460343  normal  0.235814 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1891  hypothetical protein  57.2 
 
 		 275 aa  322  5e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2714  hydrolase  56.83 
 
 		 275 aa  320  9.999999999999999e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2635  hypothetical protein  56.83 
 
 		 275 aa  320  9.999999999999999e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.348998  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2580  hypothetical protein  56.46 
 
 		 275 aa  317  9e-86  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1692  hypothetical protein  56.09 
 
 		 275 aa  315  4e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.959069  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2196  hypothetical protein  56.09 
 
 		 275 aa  315  4e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.446951  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3122  hypothetical protein  56.09 
 
 		 275 aa  315  4e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.798487  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1469  hypothetical protein  56.09 
 
 		 275 aa  315  4e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.816074  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2563  alpha/beta hydrolase fold  54.41 
 
 		 267 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.19966  normal  0.119166 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1570  putative hydrolase  54.44 
 
 		 267 aa  312  3.9999999999999997e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.907427  normal  0.428132 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5416  hypothetical protein  55.68 
 
 		 281 aa  310  2e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.539112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2110  hypothetical protein  55.68 
 
 		 281 aa  309  4e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0833306  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2128  hypothetical protein  55.31 
 
 		 281 aa  308  5e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00833807  normal  0.0334295 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1160  hypothetical protein  55.31 
 
 		 309 aa  308  6.999999999999999e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00485022 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2147  hypothetical protein  54.55 
 
 		 281 aa  307  1.0000000000000001e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0977369  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2020  hypothetical protein  54.55 
 
 		 281 aa  307  1.0000000000000001e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0898087 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5967  hypothetical protein  55.31 
 
 		 281 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.895466  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1442  alpha/beta hydrolase fold protein  55.22 
 
 		 264 aa  299  4e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2844  hypothetical protein  50.91 
 
 		 280 aa  252  4.0000000000000004e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1830  alpha/beta hydrolase  42.91 
 
 		 270 aa  222  6e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3339  hypothetical protein  42.11 
 
 		 289 aa  216  2.9999999999999998e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1074  alpha/beta hydrolase fold protein  44.49 
 
 		 271 aa  214  9.999999999999999e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.722843  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2045  alpha/beta hydrolase fold  45.45 
 
 		 275 aa  213  2.9999999999999995e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1154  alpha/beta hydrolase fold  44.09 
 
 		 271 aa  212  5.999999999999999e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.269729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1357  hypothetical protein  41.83 
 
 		 283 aa  211  1e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0861154 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3591  hypothetical protein  42.35 
 
 		 269 aa  207  2e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.391737  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2272  alpha/beta hydrolase fold  41.04 
 
 		 286 aa  203  2e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0854176 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3737  alpha/beta fold family hydrolase  39.47 
 
 		 262 aa  187  1e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1702  hypothetical protein  39.47 
 
 		 287 aa  186  4e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0351534  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3490  alpha/beta fold family hydrolase  39.85 
 
 		 262 aa  185  6e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4165  hypothetical protein  39.1 
 
 		 287 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1692  hypothetical protein  35.82 
 
 		 261 aa  183  2.0000000000000003e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1691  hypothetical protein  35.82 
 
 		 261 aa  184  2.0000000000000003e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43550  putative hydrolase  39.7 
 
 		 270 aa  181  8.000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3652  putative hydrolase  40.07 
 
 		 270 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.681326  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2217  hypothetical protein  40.23 
 
 		 269 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.105926  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2460  alpha/beta hydrolase fold  39.7 
 
 		 267 aa  177  2e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.221809  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4203  Alpha/beta hydrolase fold  38.35 
 
 		 268 aa  176  3e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.510687 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2026  hypothetical protein  39.7 
 
 		 269 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.852935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2933  alpha/beta hydrolase fold  32.83 
 
 		 279 aa  155  6e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0612634  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4105  hypothetical protein  31.72 
 
 		 301 aa  155  1e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.710482  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02422  acyltransferase 3  31.27 
 
 		 267 aa  146  4.0000000000000006e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.888246  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2047  alpha/beta hydrolase fold  32.18 
 
 		 261 aa  143  2e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.939702  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0787  hydrolase  27.44 
 
 		 296 aa  107  2e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.906995 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1736  hypothetical protein  26.81 
 
 		 293 aa  107  2e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000795767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0793  putative hydrolase  28.78 
 
 		 296 aa  106  3e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2542  alpha/beta hydrolase fold  27.37 
 
 		 294 aa  89  7e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00897918 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2106  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 		 292 aa  87  3e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.985837 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2358  alpha/beta hydrolase fold  28.41 
 
 		 290 aa  86.7  4e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.52126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1872  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 		 292 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2452  alpha/beta hydrolase fold  30.54 
 
 		 290 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3404  alpha/beta hydrolase fold  26.84 
 
 		 290 aa  83.2  0.000000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.375307 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4532  alpha/beta hydrolase fold  25.37 
 
 		 292 aa  80.1  0.00000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2333  alpha/beta hydrolase fold  24.63 
 
 		 289 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1365  alpha/beta hydrolase fold protein  34.09 
 
 		 300 aa  77.8  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.371007  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6315  hypothetical protein  26.49 
 
 		 292 aa  76.3  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0479  alpha/beta hydrolase fold  32.39 
 
 		 308 aa  76.3  0.0000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2013  alpha/beta hydrolase fold protein  24.63 
 
 		 289 aa  75.5  0.0000000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.096927  hitchhiker  0.0025286 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2450  alpha/beta hydrolase fold  24.54 
 
 		 289 aa  75.5  0.0000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72750  hypothetical protein  26.22 
 
 		 292 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.118117  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1750  alpha/beta hydrolase fold  26.95 
 
 		 290 aa  72.8  0.000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.99004  normal  0.411662 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2523  alpha/beta hydrolase fold protein  27.01 
 
 		 279 aa  72.8  0.000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1678  alpha/beta hydrolase fold protein  27.08 
 
 		 294 aa  72  0.000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0849008  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2705  alpha/beta hydrolase fold  28.33 
 
 		 305 aa  69.3  0.00000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.149803  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1673  alpha/beta hydrolase fold  29.62 
 
 		 296 aa  64.7  0.000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.478799  normal  0.0522844 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0430  alpha/beta hydrolase fold  28.03 
 
 		 300 aa  63.9  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.803425  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0880  alpha/beta hydrolase fold  33.14 
 
 		 296 aa  60.5  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.375408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0592  alpha/beta hydrolase fold  25.44 
 
 		 300 aa  57  0.0000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4240  alpha/beta hydrolase fold  22.56 
 
 		 296 aa  56.2  0.0000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.033675  hitchhiker  0.000000334465 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0252  alpha/beta hydrolase fold  31.21 
 
 		 305 aa  54.3  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.138606 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0107  alpha/beta hydrolase fold  26.74 
 
 		 315 aa  53.5  0.000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0430682  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03661  toxin biosynthesis protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G12320)  28.12 
 
 		 444 aa  53.1  0.000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.843085 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1534  alpha/beta hydrolase fold  26.1 
 
 		 285 aa  52.8  0.000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0162186  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0998  alpha/beta hydrolase fold  22.34 
 
 		 303 aa  50.8  0.00002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.461316  hitchhiker  0.000000131083 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3552  alpha/beta hydrolase fold protein  24.91 
 
 		 315 aa  51.2  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0336946  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_86220  predicted protein  23.29 
 
 		 320 aa  49.3  0.00007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3250  alpha/beta hydrolase fold protein  22.01 
 
 		 247 aa  47  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.176315 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0507  alpha/beta hydrolase fold  25.36 
 
 		 264 aa  46.6  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0758  alpha/beta hydrolase fold protein  24.91 
 
 		 299 aa  46.2  0.0006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.252363  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0105  alpha/beta hydrolase  31.07 
 
 		 328 aa  45.4  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00875507  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0853  alpha/beta hydrolase fold protein  39.76 
 
 		 454 aa  45.1  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.577102  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2528  alpha/beta hydrolase fold  26.5 
 
 		 301 aa  44.3  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1042  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 		 265 aa  44.7  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3531  hydrolase or acyltransferase-like protein  33.33 
 
 		 425 aa  44.3  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.17214 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3956  alpha/beta hydrolase fold  33.67 
 
 		 334 aa  44.3  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00786101  normal  0.0406632 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2786  hypothetical protein  27.36 
 
 		 328 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3334  hypothetical protein  36.71 
 
 		 278 aa  43.5  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2854  hypothetical protein  27.36 
 
 		 330 aa  43.5  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3068  hypothetical protein  27.36 
 
 		 330 aa  43.5  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3298  hypothetical protein  30.69 
 
 		 258 aa  43.5  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.24994 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1913  alpha/beta hydrolase fold  26.79 
 
 		 257 aa  43.5  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000359899  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0504  inner-membrane translocator  47.5 
 
 		 571 aa  43.5  0.004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.92013  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1095  alpha/beta hydrolase fold  50 
 
 		 302 aa  43.1  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0341  alpha/beta hydrolase fold  27.37 
 
 		 265 aa  43.5  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1480  Alpha/beta hydrolase fold  51.52 
 
 		 304 aa  43.1  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000123975  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>