171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3956 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_3956  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 334 aa  667    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00786101  normal  0.0406632 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2936  alpha/beta hydrolase fold  40.66 
 
 		 317 aa  189  5.999999999999999e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0681221 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1672  alpha/beta hydrolase fold  40.16 
 
 		 288 aa  144  2e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.324929  normal  0.537045 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1678  hypothetical protein  38.84 
 
 		 284 aa  140  3e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3622  alpha/beta hydrolase fold protein  32.58 
 
 		 301 aa  135  9.999999999999999e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2606  alpha/beta hydrolase  33.47 
 
 		 278 aa  108  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.210789  normal  0.690565 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1504  hypothetical protein  30.8 
 
 		 308 aa  103  3e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0349086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4496  alpha/beta hydrolase-like protein  30.9 
 
 		 302 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4634  hypothetical protein  31.25 
 
 		 314 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4620  alpha/beta hydrolase fold  32.23 
 
 		 300 aa  95.9  9e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.505321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0316  Alpha/beta hydrolase fold  28.81 
 
 		 317 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.151069  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0805  alpha/beta hydrolase fold  31.29 
 
 		 302 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.308415  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0815  putative hydrolase  33.61 
 
 		 298 aa  87.4  3e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3679  alpha/beta hydrolase fold protein  27.21 
 
 		 279 aa  86.7  6e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.2542  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1984  alpha/beta hydrolase  30.57 
 
 		 327 aa  82.4  0.000000000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1095  alpha/beta hydrolase fold  28.79 
 
 		 348 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1918  alpha/beta hydrolase  30.87 
 
 		 325 aa  80.1  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2192  alpha/beta hydrolase  27.52 
 
 		 346 aa  79.3  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.457111  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1341  putative hydrolase  30 
 
 		 300 aa  76.6  0.0000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0569  alpha/beta hydrolase  30.52 
 
 		 325 aa  75.9  0.0000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5902  alpha/beta hydrolase  27.24 
 
 		 346 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.169357  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2175  alpha/beta hydrolase  27.24 
 
 		 346 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.306533  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1818  hypothetical protein  27.43 
 
 		 473 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2214  alpha/beta hydrolase  27.96 
 
 		 357 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2091  alpha/beta hydrolase  26.91 
 
 		 352 aa  72  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2670  hypothetical protein  27.54 
 
 		 417 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.686285  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00524  alpha/beta hydrolase-like protein  23.74 
 
 		 288 aa  70.9  0.00000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0205  alpha/beta hydrolase  30.7 
 
 		 328 aa  70.9  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5485  Alpha/beta hydrolase  28.21 
 
 		 346 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2728  hypothetical protein  27.54 
 
 		 336 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0371718  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1464  hypothetical protein  25.48 
 
 		 328 aa  70.5  0.00000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3867  alpha/beta hydrolase-like protein  26.28 
 
 		 305 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.55924 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0596  putative hydrolase  32.31 
 
 		 298 aa  69.7  0.00000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.443892 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0643  hypothetical protein  27.54 
 
 		 336 aa  69.7  0.00000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.107821  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2369  hypothetical protein  27.54 
 
 		 336 aa  69.7  0.00000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.841526  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2916  hypothetical protein  27.54 
 
 		 336 aa  69.7  0.00000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.282253  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1490  alpha/beta fold family hydrolase  26.45 
 
 		 462 aa  69.7  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.679445  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1684  hypothetical protein  27.54 
 
 		 336 aa  69.7  0.00000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.490109  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3029  hypothetical protein  26.45 
 
 		 295 aa  69.3  0.00000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1594  alpha/beta fold family hydrolase  26.45 
 
 		 293 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40820  putative hydrolase  28.33 
 
 		 291 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1265  hypothetical protein  26.45 
 
 		 293 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00885366  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0605  hypothetical protein  26.45 
 
 		 293 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1460  alpha/beta fold family hydrolase  26.45 
 
 		 293 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.93684  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0548  hypothetical protein  26.45 
 
 		 293 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.491359  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1457  alpha/beta hydrolase  27.78 
 
 		 303 aa  68.6  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21420  predicted alpha/beta hydrolase  28.41 
 
 		 300 aa  68.2  0.0000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4327  alpha/beta hydrolase-like protein  26.78 
 
 		 305 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3462  putative hydrolase  27.5 
 
 		 291 aa  67.4  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.339923  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2996  alpha/beta hydrolase-like protein  30.83 
 
 		 306 aa  65.9  0.0000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.983134  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2795  hypothetical protein  27.35 
 
 		 293 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0611315  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3343  alpha/beta hydrolase-like protein  28.23 
 
 		 306 aa  65.1  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0438  hypothetical protein  32.39 
 
 		 312 aa  64.3  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.124542 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0797  putative hydrolase  32.38 
 
 		 330 aa  63.5  0.000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0808  hypothetical protein  23.14 
 
 		 285 aa  61.6  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00976323  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4709  alpha/beta hydrolase-like protein  24.49 
 
 		 295 aa  60.1  0.00000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0396894  decreased coverage  0.00396778 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3632  alpha/beta hydrolase-like protein  24.49 
 
 		 295 aa  60.1  0.00000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2212  hypothetical protein  27.08 
 
 		 297 aa  60.1  0.00000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.140894 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2032  hypothetical protein  34.43 
 
 		 294 aa  59.3  0.00000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.287773  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0288  hypothetical protein  25.5 
 
 		 290 aa  58.9  0.0000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.935727  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0301  hypothetical protein  25.5 
 
 		 290 aa  58.9  0.0000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.851897  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4551  alpha/beta fold family hydrolase  29.85 
 
 		 314 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0902601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5870  alpha/beta hydrolase-like protein  26.13 
 
 		 305 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.205699 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0520  hypothetical protein  36.56 
 
 		 287 aa  56.6  0.0000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1527  alpha/beta hydrolase-like  26.47 
 
 		 305 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.114402 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3931  alpha/beta hydrolase-like  25.23 
 
 		 305 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.269531  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4435  alpha/beta hydrolase-like protein  25.23 
 
 		 305 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1338  alpha/beta hydrolase fold  29.1 
 
 		 314 aa  56.6  0.0000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.51137  normal  0.315185 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1156  hypothetical protein  36.94 
 
 		 294 aa  55.5  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.40892  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0374  Acylglycerol lipase  27.27 
 
 		 279 aa  54.7  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3846  alpha/beta hydrolase fold  29.1 
 
 		 314 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0575  putative hydrolase  32.02 
 
 		 298 aa  54.3  0.000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48210  putative hydrolase  27.31 
 
 		 294 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000506825  normal  0.0564296 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4058  alpha/beta hydrolase fold  28.36 
 
 		 314 aa  53.5  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2671  alpha/beta hydrolase fold protein  32.56 
 
 		 270 aa  53.1  0.000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.661252 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1494  alpha/beta hydrolase fold  28.36 
 
 		 326 aa  53.1  0.000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0365671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4058  alpha/beta hydrolase-like protein  25.27 
 
 		 292 aa  53.1  0.000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3210  hypothetical protein  31.03 
 
 		 285 aa  52.8  0.000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.287956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1897  alpha/beta hydrolase-like protein  27.34 
 
 		 321 aa  52.8  0.000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.249943  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2882  alpha/beta hydrolase fold protein  34.29 
 
 		 309 aa  52.4  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.355624  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1297  hypothetical protein  33.1 
 
 		 324 aa  51.6  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.12258  normal  0.997754 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2956  alpha/beta hydrolase fold  32.14 
 
 		 277 aa  50.8  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1234  alpha/beta hydrolase fold protein  27.4 
 
 		 335 aa  50.8  0.00003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.34416  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2622  hypothetical protein  33.01 
 
 		 312 aa  51.2  0.00003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2622  alpha/beta hydrolase fold  33.94 
 
 		 314 aa  50.8  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.790671  normal  0.924395 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0144  hydrolase, alpha/beta fold family protein  22.52 
 
 		 297 aa  50.1  0.00005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.261778  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2418  putative esterase/lipase/thioesterase  33.93 
 
 		 317 aa  49.7  0.00007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.473748  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2799  alpha/beta hydrolase fold  25.62 
 
 		 284 aa  49.7  0.00008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.61266  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1082  alpha/beta hydrolase fold  33.93 
 
 		 317 aa  49.3  0.00009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2528  alpha/beta hydrolase fold protein  29.73 
 
 		 327 aa  49.3  0.00009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.757367  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2041  alpha/beta hydrolase fold protein  35.86 
 
 		 306 aa  49.3  0.00009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3654  alpha/beta hydrolase fold  31.03 
 
 		 272 aa  48.9  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3723  alpha/beta hydrolase fold  30.6 
 
 		 281 aa  48.5  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0906881  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3406  putative hydrolase-related protein  37.21 
 
 		 266 aa  47.8  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2496  alpha/beta hydrolase fold protein  32.48 
 
 		 277 aa  48.5  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3590  esterase/lipase/thioesterase family protein  38.24 
 
 		 302 aa  47.4  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3470  alpha/beta hydrolase fold protein  30.5 
 
 		 273 aa  47.8  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.304783  normal  0.0123461 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5147  hypothetical protein  31.85 
 
 		 336 aa  47.8  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.252623 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3467  hypothetical protein  30.56 
 
 		 332 aa  47.4  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25166  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3544  alpha/beta hydrolase fold  26.99 
 
 		 317 aa  47  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.941882  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>