More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3470 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_3470  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 
273 aa  552  1e-156  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.304783  normal  0.0123461 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2496  alpha/beta hydrolase fold protein  46.39 
 
 
277 aa  213  2.9999999999999995e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5612  alpha/beta hydrolase fold  34.22 
 
 
311 aa  152  7e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00676484  hitchhiker  0.00203627 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3723  alpha/beta hydrolase fold  35.34 
 
 
281 aa  141  9.999999999999999e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0906881  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0929  alpha/beta hydrolase fold  36.5 
 
 
317 aa  136  3.0000000000000003e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.345522  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1447  alpha/beta hydrolase fold protein  28.21 
 
 
271 aa  102  9e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5072  alpha/beta hydrolase fold protein  27.97 
 
 
281 aa  90.9  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.157677 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5507  alpha/beta hydrolase fold  30.04 
 
 
269 aa  91.3  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00124996 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0084  3-oxoadipate enol-lactonase  28.16 
 
 
282 aa  87  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1367  3-oxoadipate enol-lactonase  34.52 
 
 
256 aa  86.3  5e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1385  3-oxoadipate enol-lactonase  34.52 
 
 
256 aa  86.3  5e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.279159  normal  0.947236 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1401  3-oxoadipate enol-lactonase  34.52 
 
 
256 aa  85.9  6e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.926851 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0152  alpha/beta hydrolase fold  29.24 
 
 
279 aa  83.6  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.632153 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  44.21 
 
 
264 aa  82  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0159  alpha/beta hydrolase fold protein  29.54 
 
 
279 aa  81.3  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1996  alpha/beta hydrolase fold  29.32 
 
 
254 aa  81.3  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.507588  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4165  3-oxoadipate enol-lactonase  31.53 
 
 
256 aa  80.9  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1655  alpha/beta hydrolase fold  39.23 
 
 
331 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2860  putative epoxide hydrolase  37.21 
 
 
334 aa  80.5  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.111933 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1819  alpha/beta hydrolase fold  41.51 
 
 
331 aa  80.1  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.091231  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0298  B-ketoadipate enol-lactone hydrolase protein  28.4 
 
 
279 aa  79.3  0.00000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3962  3-oxoadipate enol-lactonase  28.57 
 
 
266 aa  79  0.00000000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.535477  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0341  alpha/beta hydrolase fold  41.05 
 
 
265 aa  76.6  0.0000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0263  Alpha/beta hydrolase fold  39.05 
 
 
266 aa  75.9  0.0000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.191481  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2189  3-oxoadipate enol-lactonase  31.55 
 
 
259 aa  75.9  0.0000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1628  alpha/beta hydrolase fold protein  29.79 
 
 
229 aa  75.9  0.0000000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.989142  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13040  3-oxoadipate enol-lactonase  29.66 
 
 
261 aa  75.9  0.0000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3126  alpha/beta hydrolase fold  31.36 
 
 
303 aa  75.5  0.0000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.221809  normal  0.0127742 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0479  alpha/beta hydrolase fold  30.46 
 
 
262 aa  75.9  0.0000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.108292 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  25.96 
 
 
270 aa  75.5  0.0000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  27.31 
 
 
265 aa  75.5  0.0000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_5003  hypothetical protein  26.28 
 
 
305 aa  75.1  0.000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.219261  hitchhiker  0.00420621 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36070  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  34.88 
 
 
313 aa  75.1  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.338915  normal  0.660761 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2974  3-oxoadipate enol-lactonase  24.39 
 
 
260 aa  75.1  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.108542  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3016  3-oxoadipate enol-lactonase  24.39 
 
 
260 aa  75.1  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.352868  normal  0.357434 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0115  3-oxoadipate enol-lactonase  26.92 
 
 
282 aa  74.7  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0111  alpha/beta hydrolase fold protein  24.41 
 
 
263 aa  74.3  0.000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2705  alpha/beta hydrolase fold  25.79 
 
 
309 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.601677  normal  0.0914485 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1492  alpha/beta hydrolase fold  36.15 
 
 
291 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0226  alpha/beta hydrolase fold  38.74 
 
 
271 aa  74.3  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2526  alpha/beta hydrolase fold  26.92 
 
 
275 aa  73.9  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7003  alpha/beta hydrolase fold  36.15 
 
 
291 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00535586 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6337  alpha/beta hydrolase fold  36.15 
 
 
291 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3157  alpha/beta fold family hydrolase  37.14 
 
 
266 aa  73.6  0.000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2264  alpha/beta hydrolase fold protein  27.78 
 
 
290 aa  73.6  0.000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.426899  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2292  alpha/beta hydrolase fold  30.17 
 
 
275 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.288944 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1681  alpha/beta hydrolase fold  29.8 
 
 
273 aa  73.6  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0641945  normal  0.147127 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2964  alpha/beta hydrolase fold  32.71 
 
 
282 aa  73.2  0.000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0572  alpha/beta hydrolase fold  38.54 
 
 
266 aa  73.6  0.000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1483  alpha/beta hydrolase fold  29.13 
 
 
275 aa  73.2  0.000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.768044  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0193  alpha/beta hydrolase fold protein  32.43 
 
 
262 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.821297  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1348  3-oxoadipate enol-lactonase  27.95 
 
 
256 aa  72.8  0.000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.786206 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1002  alpha/beta hydrolase fold  26.62 
 
 
280 aa  73.2  0.000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0874  3-oxoadipate enol-lactonase  27.57 
 
 
260 aa  72.8  0.000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.839441  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0595  putative lactone hydrolase  26.09 
 
 
265 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.208776 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3404  alpha/beta hydrolase fold protein  41.05 
 
 
273 aa  72.8  0.000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  42.67 
 
 
270 aa  72.4  0.000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0337  alpha/beta hydrolase fold  30.04 
 
 
261 aa  72.4  0.000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0245494  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5939  3-oxoadipate enol-lactonase  28.74 
 
 
275 aa  72.4  0.000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.178478 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2400  alpha/beta hydrolase fold  29.57 
 
 
288 aa  72.4  0.000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1071  alpha/beta hydrolase fold protein  28.31 
 
 
265 aa  72.4  0.000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2178  alpha/beta hydrolase fold  30.87 
 
 
250 aa  72.4  0.000000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.719184 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1675  alpha/beta hydrolase fold  26.4 
 
 
301 aa  72.4  0.000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0263497  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0751  alpha/beta hydrolase fold  24.62 
 
 
270 aa  72.4  0.000000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.158146 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  42.67 
 
 
270 aa  72.4  0.000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2792  alpha/beta hydrolase fold protein  28.45 
 
 
260 aa  71.6  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.377437 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1968  putative alpha/beta hydrolase fold  28.23 
 
 
259 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0153168  normal  0.143128 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6522  alpha/beta hydrolase fold  27.8 
 
 
302 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2497  alpha/beta hydrolase fold  29.41 
 
 
323 aa  72  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0402748  hitchhiker  0.0077142 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0316  alpha/beta hydrolase fold  31.17 
 
 
316 aa  71.6  0.00000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00247828  hitchhiker  0.00660595 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6756  alpha/beta hydrolase fold  27.8 
 
 
302 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.216165  normal  0.0313623 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1083  alpha/beta hydrolase fold  27.67 
 
 
291 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  42.67 
 
 
270 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3532  alpha/beta hydrolase fold  26.87 
 
 
298 aa  71.2  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.961307  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3377  alpha/beta hydrolase fold  27.42 
 
 
273 aa  71.2  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2696  putative hydrolase  27.63 
 
 
387 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1731  alpha/beta hydrolase fold  28.87 
 
 
251 aa  70.5  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0891  alpha/beta hydrolase fold  42.86 
 
 
271 aa  70.9  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.020907 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4321  alpha/beta hydrolase fold  28.63 
 
 
280 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0798376 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1025  alpha/beta hydrolase fold protein  40.95 
 
 
301 aa  71.2  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3435  alpha/beta hydrolase fold  24.69 
 
 
302 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.898623  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1565  alpha/beta hydrolase fold  27.97 
 
 
363 aa  70.9  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.461626  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0322  alpha/beta hydrolase fold  35.14 
 
 
349 aa  70.5  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.529473  normal  0.20701 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5449  alpha/beta hydrolase fold  28.98 
 
 
272 aa  70.1  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.343862 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4130  alpha/beta hydrolase fold protein  25.48 
 
 
301 aa  70.1  0.00000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3787  alpha/beta hydrolase fold  28.9 
 
 
287 aa  70.1  0.00000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.265139  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3478  alpha/beta hydrolase fold  26.38 
 
 
295 aa  70.1  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.497712 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3860  alpha/beta hydrolase fold  28.9 
 
 
287 aa  70.1  0.00000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3655  alpha/beta hydrolase fold  27.56 
 
 
312 aa  69.7  0.00000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2263  alpha/beta hydrolase fold protein  35.24 
 
 
287 aa  69.7  0.00000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.7542  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1601  alpha/beta hydrolase fold  28.25 
 
 
328 aa  69.7  0.00000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.875012  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2328  alpha/beta hydrolase fold protein  29.41 
 
 
270 aa  69.3  0.00000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.674989  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1083  alpha/beta hydrolase fold  27.33 
 
 
291 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5256  alpha/beta hydrolase fold  24.69 
 
 
302 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.296577  normal  0.181761 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11967  epoxide hydrolase ephB  34.11 
 
 
356 aa  69.3  0.00000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.36863  normal  0.493708 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1112  alpha/beta hydrolase fold  29.74 
 
 
261 aa  68.9  0.00000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.64134 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0413  alpha/beta hydrolase fold  28.31 
 
 
257 aa  68.9  0.00000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.732531  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3791  alpha/beta hydrolase fold  28.44 
 
 
287 aa  68.9  0.00000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2629  alpha/beta hydrolase fold protein  27.59 
 
 
263 aa  68.9  0.00000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000794828  hitchhiker  0.00279844 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2129  alpha/beta hydrolase fold protein  29.09 
 
 
291 aa  68.9  0.00000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.437649  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>