More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2496 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2496  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 		 277 aa  550  1e-155  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3470  alpha/beta hydrolase fold protein  46.42 
 
 		 273 aa  194  1e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.304783  normal  0.0123461 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5612  alpha/beta hydrolase fold  38.26 
 
 		 311 aa  149  5e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00676484  hitchhiker  0.00203627 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3723  alpha/beta hydrolase fold  54.24 
 
 		 281 aa  126  4.0000000000000003e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0906881  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0929  alpha/beta hydrolase fold  38.35 
 
 		 317 aa  124  1e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.345522  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1447  alpha/beta hydrolase fold protein  25.98 
 
 		 271 aa  83.6  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5449  alpha/beta hydrolase fold  29.32 
 
 		 272 aa  77  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.343862 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1681  alpha/beta hydrolase fold  28.16 
 
 		 273 aa  75.5  0.0000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0641945  normal  0.147127 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0780  alpha/beta hydrolase fold  26.82 
 
 		 276 aa  75.5  0.0000000000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0600224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  41.44 
 
 		 265 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2964  alpha/beta hydrolase fold  39.09 
 
 		 282 aa  75.5  0.000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1384  alpha/beta hydrolase fold  48.96 
 
 		 320 aa  73.6  0.000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.276644  normal  0.809393 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5157  alpha/beta hydrolase fold  38.52 
 
 		 341 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0226  alpha/beta hydrolase fold  39.64 
 
 		 271 aa  71.2  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0595  putative lactone hydrolase  29.19 
 
 		 265 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.208776 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0751  alpha/beta hydrolase fold  25.19 
 
 		 270 aa  70.5  0.00000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.158146 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0419  alpha/beta hydrolase fold  30.2 
 
 		 270 aa  70.5  0.00000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4523  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  40 
 
 		 271 aa  70.1  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.104364  normal  0.231171 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3962  3-oxoadipate enol-lactonase  38.46 
 
 		 266 aa  69.7  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.535477  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1367  3-oxoadipate enol-lactonase  45.63 
 
 		 256 aa  69.3  0.00000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1385  3-oxoadipate enol-lactonase  45.63 
 
 		 256 aa  69.3  0.00000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.279159  normal  0.947236 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3546  alpha/beta hydrolase fold protein  36.29 
 
 		 308 aa  69.3  0.00000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.375362  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0891  alpha/beta hydrolase fold  33.87 
 
 		 271 aa  69.3  0.00000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.020907 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1401  3-oxoadipate enol-lactonase  45.63 
 
 		 256 aa  68.9  0.00000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.926851 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36070  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  37.21 
 
 		 313 aa  68.9  0.00000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.338915  normal  0.660761 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0084  3-oxoadipate enol-lactonase  28.14 
 
 		 282 aa  68.2  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1565  alpha/beta hydrolase fold  26.48 
 
 		 363 aa  68.6  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.461626  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0881  alpha/beta hydrolase fold protein  38.89 
 
 		 307 aa  67.8  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.415782 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  30.24 
 
 		 264 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4771  alpha/beta hydrolase fold  37.78 
 
 		 315 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2514  alpha/beta hydrolase fold protein  37.91 
 
 		 296 aa  67.4  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4857  alpha/beta hydrolase fold  37.78 
 
 		 315 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1600  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  29.55 
 
 		 371 aa  67  0.0000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  38.96 
 
 		 270 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3496  alpha/beta hydrolase fold  37.07 
 
 		 289 aa  66.6  0.0000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.340747  normal  0.70145 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0341  alpha/beta hydrolase fold  30 
 
 		 265 aa  66.6  0.0000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4044  alpha/beta hydrolase fold  39.66 
 
 		 310 aa  66.6  0.0000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5072  alpha/beta hydrolase fold protein  46.34 
 
 		 281 aa  66.2  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.157677 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4002  alpha/beta hydrolase fold  42 
 
 		 351 aa  65.9  0.0000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.228982  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  40.26 
 
 		 270 aa  65.5  0.0000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  40.26 
 
 		 270 aa  65.5  0.0000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0524  alpha/beta hydrolase fold protein  38.76 
 
 		 308 aa  65.5  0.0000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1808  short chain dehydrogenase  41.35 
 
 		 596 aa  65.5  0.0000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.67175  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_5003  hypothetical protein  35.61 
 
 		 305 aa  65.5  0.0000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.219261  hitchhiker  0.00420621 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4437  alpha/beta hydrolase fold  39.81 
 
 		 310 aa  65.5  0.0000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.684387  hitchhiker  0.00120619 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3725  3-oxoadipate enol-lactonase  25.99 
 
 		 263 aa  65.1  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2174  short chain dehydrogenase  41.35 
 
 		 596 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.828892  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0259  alpha/beta hydrolase fold protein  39.62 
 
 		 308 aa  65.1  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.951313  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0820  short chain dehydrogenase  41.35 
 
 		 596 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2264  alpha/beta hydrolase fold protein  31.43 
 
 		 290 aa  65.1  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.426899  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0913  short chain dehydrogenase  41.35 
 
 		 596 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.427766  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1996  alpha/beta hydrolase fold  44.94 
 
 		 254 aa  65.1  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.507588  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0934  alpha/beta hydrolase fold  26.07 
 
 		 266 aa  64.7  0.000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.570173  hitchhiker  0.00160688 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3092  alpha/beta hydrolase fold protein  30.18 
 
 		 309 aa  65.1  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000150861 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1628  alpha/beta hydrolase fold protein  42.59 
 
 		 229 aa  65.1  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.989142  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0446  3-oxoadipate enol-lactonase  28.79 
 
 		 264 aa  65.1  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3036  alpha/beta hydrolase fold protein  37.17 
 
 		 310 aa  64.7  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  38.18 
 
 		 267 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1900  putative hydrolase  40.78 
 
 		 275 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.118605  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5939  3-oxoadipate enol-lactonase  26.28 
 
 		 275 aa  64.7  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.178478 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3478  alpha/beta hydrolase fold  37.88 
 
 		 295 aa  64.7  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.497712 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  40.26 
 
 		 270 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2762  alpha/beta hydrolase fold protein  35.42 
 
 		 280 aa  63.9  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1050  alpha/beta hydrolase fold  40 
 
 		 322 aa  63.9  0.000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.173196  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13648  epoxide hydrolase ephA  34.97 
 
 		 322 aa  63.5  0.000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000134654 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2189  3-oxoadipate enol-lactonase  42.06 
 
 		 259 aa  63.2  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7077  3-oxoadipate enol-lactonase  26.64 
 
 		 269 aa  63.2  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.335255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22460  alpha/beta family hydrolase  40.78 
 
 		 275 aa  63.2  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.241397  hitchhiker  0.0000000538784 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7003  alpha/beta hydrolase fold  26.12 
 
 		 291 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00535586 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5373  alpha/beta hydrolase fold  38.1 
 
 		 337 aa  62.8  0.000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00480328 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13040  3-oxoadipate enol-lactonase  31.33 
 
 		 261 aa  62.4  0.000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1035  alpha/beta hydrolase fold protein  26.34 
 
 		 303 aa  62.4  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.493601  normal  0.43821 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2842  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 434 aa  62.4  0.000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3491  3-oxoadipate enol-lactonase  30.4 
 
 		 262 aa  62  0.000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.323872  normal  0.346177 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1078  alpha/beta hydrolase fold protein  25.4 
 
 		 253 aa  61.6  0.00000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2926  alpha/beta hydrolase fold protein  41.23 
 
 		 273 aa  61.6  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.557091  normal  0.933948 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2101  alpha/beta hydrolase fold  44.44 
 
 		 285 aa  61.6  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.715377  normal  0.912757 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4206  3-oxoadipate enol-lactonase  27.82 
 
 		 268 aa  61.6  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2974  3-oxoadipate enol-lactonase  36.51 
 
 		 260 aa  62  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.108542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3016  3-oxoadipate enol-lactonase  36.51 
 
 		 260 aa  62  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.352868  normal  0.357434 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3543  alpha/beta hydrolase fold  34.38 
 
 		 268 aa  61.6  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.447096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11967  epoxide hydrolase ephB  38.1 
 
 		 356 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.36863  normal  0.493708 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3435  alpha/beta hydrolase fold  26.24 
 
 		 302 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.898623  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0643  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase  26.64 
 
 		 267 aa  61.2  0.00000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1083  alpha/beta hydrolase fold  27.17 
 
 		 291 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1556  3-oxoadipate enol-lactonase  38.46 
 
 		 261 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2696  alpha/beta hydrolase fold protein  28.63 
 
 		 268 aa  60.8  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.094894  normal  0.233594 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1486  3-oxoadipate enol-lactonase  38.46 
 
 		 261 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4111  alpha/beta hydrolase fold protein  26.27 
 
 		 288 aa  60.8  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0346007  normal  0.0462514 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1492  alpha/beta hydrolase fold  25.75 
 
 		 291 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0070  3-oxoadipate enol-lactonase  38.46 
 
 		 261 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.678293  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2696  alpha/beta hydrolase fold  26.59 
 
 		 291 aa  61.2  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.498963  decreased coverage  0.00208278 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3236  alpha/beta hydrolase fold protein  37.27 
 
 		 308 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00307159  normal  0.0988326 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6337  alpha/beta hydrolase fold  25.75 
 
 		 291 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1477  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 		 308 aa  61.2  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0994252  normal  0.0692812 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0059  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase/4-carboxymuconolactone decarboxylase  38.46 
 
 		 261 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.440063  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0057  3-oxoadipate enol-lactonase  38.46 
 
 		 261 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0184524  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3649  short chain dehydrogenase  40.38 
 
 		 595 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.236438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1203  3-oxoadipate enol-lactonase  38.46 
 
 		 261 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1587  alpha/beta hydrolase fold protein  34.59 
 
 		 301 aa  60.5  0.00000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>