More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5612 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_5612  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 311 aa  631  1e-180  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00676484  hitchhiker  0.00203627 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0929  alpha/beta hydrolase fold  75.42 
 
 		 317 aa  424  1e-118  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.345522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3723  alpha/beta hydrolase fold  55.22 
 
 		 281 aa  320  9.999999999999999e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0906881  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2496  alpha/beta hydrolase fold protein  38.26 
 
 		 277 aa  166  5.9999999999999996e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3470  alpha/beta hydrolase fold protein  34.22 
 
 		 273 aa  154  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.304783  normal  0.0123461 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1447  alpha/beta hydrolase fold protein  27.03 
 
 		 271 aa  102  8e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0111  alpha/beta hydrolase fold protein  32 
 
 		 263 aa  84  0.000000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3531  hydrolase or acyltransferase-like protein  30.62 
 
 		 425 aa  77.8  0.0000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.17214 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2400  alpha/beta hydrolase fold  30.69 
 
 		 309 aa  76.3  0.0000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.124702 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_5003  hypothetical protein  25.27 
 
 		 305 aa  75.9  0.0000000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.219261  hitchhiker  0.00420621 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2348  alpha/beta hydrolase fold protein  28.37 
 
 		 275 aa  72.8  0.000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1647  alpha/beta hydrolase fold protein  28.94 
 
 		 276 aa  72  0.00000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36070  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  32.03 
 
 		 313 aa  71.6  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.338915  normal  0.660761 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1731  alpha/beta hydrolase fold  29.52 
 
 		 251 aa  71.2  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0259  alpha/beta hydrolase fold protein  33.59 
 
 		 308 aa  69.3  0.00000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.951313  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0429  alpha/beta hydrolase fold protein  30.11 
 
 		 282 aa  69.3  0.00000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1173  alpha/beta hydrolase fold  33.52 
 
 		 296 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.95564  decreased coverage  0.000000135804 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2762  alpha/beta hydrolase fold protein  35.19 
 
 		 280 aa  68.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0226  alpha/beta hydrolase fold  33.61 
 
 		 271 aa  68.6  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3126  alpha/beta hydrolase fold  31.09 
 
 		 303 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.221809  normal  0.0127742 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0524  alpha/beta hydrolase fold protein  32.68 
 
 		 308 aa  68.6  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1228  alpha/beta hydrolase fold protein  28.33 
 
 		 265 aa  67.8  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2405  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  31.06 
 
 		 369 aa  68.2  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0222007  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1071  alpha/beta hydrolase fold protein  28.5 
 
 		 265 aa  67.8  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4401  alpha/beta hydrolase fold  29.76 
 
 		 275 aa  67.4  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0419  alpha/beta hydrolase fold  35.34 
 
 		 270 aa  67.4  0.0000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3543  alpha/beta hydrolase fold  24.62 
 
 		 268 aa  67.4  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.447096  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3257  alpha/beta hydrolase fold protein  29.09 
 
 		 250 aa  66.6  0.0000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0159  alpha/beta hydrolase fold protein  26.55 
 
 		 279 aa  66.6  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1217  alpha/beta hydrolase fold protein  26.86 
 
 		 335 aa  66.2  0.0000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2186  alpha/beta fold family hydrolase  33.33 
 
 		 296 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3131  alpha/beta fold family hydrolase  33.33 
 
 		 296 aa  65.9  0.0000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2505  alpha/beta family hydrolase  29.1 
 
 		 279 aa  65.9  0.0000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2625  alpha/beta fold family hydrolase  33.33 
 
 		 296 aa  65.9  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.738195  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1459  alpha/beta fold family hydrolase  33.33 
 
 		 296 aa  65.9  0.0000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5947  alpha/beta hydrolase fold  27.81 
 
 		 390 aa  65.9  0.0000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00350915 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0891  alpha/beta hydrolase fold  42.86 
 
 		 271 aa  65.9  0.0000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.020907 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1684  alpha/beta fold family hydrolase  33.33 
 
 		 300 aa  65.9  0.0000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.163104  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4229  alpha/beta hydrolase fold  33.59 
 
 		 328 aa  65.5  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2704  alpha/beta fold family hydrolase  33.33 
 
 		 340 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4878  alpha/beta hydrolase fold  27.35 
 
 		 279 aa  65.9  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0658691 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2571  alpha/beta fold family hydrolase  33.33 
 
 		 349 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0298  B-ketoadipate enol-lactone hydrolase protein  26.02 
 
 		 279 aa  64.3  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10135  epoxide hydrolase ephF  32.65 
 
 		 300 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.890635 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3102  Alpha/beta hydrolase  24.91 
 
 		 276 aa  64.7  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4334  alpha/beta hydrolase fold protein  26.3 
 
 		 278 aa  64.7  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0684332 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2473  hypothetical protein  23.27 
 
 		 286 aa  64.3  0.000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1900  alpha/beta fold family hydrolase  32.67 
 
 		 296 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2613  alpha/beta hydrolase  26.62 
 
 		 270 aa  64.3  0.000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.101876  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5197  alpha/beta hydrolase fold protein  23.33 
 
 		 275 aa  63.5  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.747018 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1061  alpha/beta hydrolase fold protein  25.36 
 
 		 283 aa  63.9  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.39643 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1628  alpha/beta hydrolase fold protein  29.69 
 
 		 229 aa  63.9  0.000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.989142  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4002  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 351 aa  63.5  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.228982  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0671  alpha/beta hydrolase fold protein  28.1 
 
 		 291 aa  63.2  0.000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.437446  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23660  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  28.46 
 
 		 273 aa  63.2  0.000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0523777 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0152  alpha/beta hydrolase fold  25.41 
 
 		 279 aa  63.2  0.000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.632153 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4916  alpha/beta hydrolase fold  32.28 
 
 		 277 aa  63.2  0.000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.503338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3230  Alpha/beta hydrolase fold  30.95 
 
 		 289 aa  63.2  0.000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.95582  normal  0.900687 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0595  putative lactone hydrolase  26.35 
 
 		 265 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.208776 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0363  Alpha/beta hydrolase fold  31.67 
 
 		 295 aa  62.8  0.000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.176486  unclonable  0.0000000552802 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4523  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  28.83 
 
 		 271 aa  62.8  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.104364  normal  0.231171 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3143  alpha/beta hydrolase fold  26.42 
 
 		 309 aa  62.8  0.000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.03403  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4321  alpha/beta hydrolase fold  28.73 
 
 		 280 aa  62.8  0.000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0798376 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2047  Alpha/beta hydrolase fold  26.7 
 
 		 312 aa  62  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0648  alpha/beta hydrolase fold protein  28.57 
 
 		 226 aa  62  0.00000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0281045 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1579  putative hydrolase  36.52 
 
 		 294 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.144323  normal  0.811141 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5825  alpha/beta hydrolase fold  30.66 
 
 		 276 aa  61.6  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0224159  normal  0.292705 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4016  3-oxoadipate enol-lactonase  28.92 
 
 		 392 aa  61.6  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00993372  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2926  alpha/beta hydrolase fold protein  33.12 
 
 		 273 aa  62  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.557091  normal  0.933948 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2534  alpha/beta hydrolase fold  34.13 
 
 		 330 aa  62  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0874  3-oxoadipate enol-lactonase  29.36 
 
 		 260 aa  60.8  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.839441  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7536  Alpha/beta hydrolase  28.38 
 
 		 270 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5407  Alpha/beta hydrolase  33.56 
 
 		 296 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.632759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2084  alpha/beta hydrolase fold protein  25.53 
 
 		 275 aa  61.2  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.446473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3377  alpha/beta hydrolase fold  25.96 
 
 		 273 aa  61.6  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2542  alpha/beta hydrolase fold protein  25.18 
 
 		 310 aa  61.6  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.106613  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2792  alpha/beta hydrolase fold protein  31.09 
 
 		 260 aa  61.6  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.377437 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2011  alpha/beta hydrolase fold  31.37 
 
 		 298 aa  61.2  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.404957 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3998  alpha/beta hydrolase fold  31.11 
 
 		 344 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.260619  normal  0.902376 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1033  alpha/beta hydrolase fold  27.72 
 
 		 280 aa  61.2  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0702791 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1600  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  28.95 
 
 		 371 aa  61.6  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6565  alpha/beta hydrolase fold  29.59 
 
 		 270 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.250077 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0705  alpha/beta hydrolase fold  28 
 
 		 254 aa  60.8  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.052098 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0310  alpha/beta hydrolase fold  27.68 
 
 		 324 aa  60.5  0.00000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.40951  normal  0.178465 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7003  alpha/beta hydrolase fold  33.6 
 
 		 291 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00535586 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4035  alpha/beta hydrolase fold protein  31.73 
 
 		 280 aa  60.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.688921  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3993  alpha/beta hydrolase fold protein  31.73 
 
 		 280 aa  60.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0299  alpha/beta hydrolase fold  31.11 
 
 		 343 aa  60.8  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2011  alpha/beta hydrolase fold  32.67 
 
 		 296 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000219515 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2119  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 296 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0124464 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2138  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 296 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0193  alpha/beta hydrolase fold protein  26.24 
 
 		 262 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.821297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4043  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  27.78 
 
 		 372 aa  60.8  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.140528  normal  0.0217743 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1601  alpha/beta hydrolase fold  33.59 
 
 		 328 aa  60.1  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.875012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1098  Alpha/beta hydrolase fold  31.55 
 
 		 297 aa  60.5  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6136  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 		 294 aa  60.1  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.015637 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5976  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 296 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.609999  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2101  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 296 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1565  alpha/beta hydrolase fold  39.52 
 
 		 363 aa  60.1  0.00000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.461626  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2097  alpha/beta hydrolase fold  24.05 
 
 		 324 aa  60.1  0.00000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>