More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4916 on replicon NC_008697
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008697  Noca_4916  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
277 aa  546  1e-154  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.503338  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1592  alpha/beta hydrolase fold  46.04 
 
 
267 aa  210  2e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.121533  normal  0.0764642 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2533  alpha/beta hydrolase fold  35.61 
 
 
394 aa  127  3e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.763523  hitchhiker  0.000713201 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1813  alpha/beta hydrolase fold  33.68 
 
 
287 aa  125  1e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.557453  normal  0.0116174 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1310  alpha/beta hydrolase fold  32.85 
 
 
269 aa  104  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.557665  normal  0.708974 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3383  alpha/beta hydrolase fold  29.63 
 
 
284 aa  103  4e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5527  alpha/beta hydrolase fold  32.45 
 
 
307 aa  100  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.563792  normal  0.509486 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1609  Alpha/beta hydrolase fold  31.56 
 
 
293 aa  98.2  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0304  Alpha/beta hydrolase  30.11 
 
 
283 aa  97.8  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0682  alpha/beta family hydrolase  29.29 
 
 
286 aa  97.4  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.819683 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5225  alpha/beta hydrolase fold  29.06 
 
 
283 aa  97.1  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4356  alpha/beta hydrolase fold  29.85 
 
 
283 aa  95.9  6e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3020  alpha/beta hydrolase fold  29.37 
 
 
283 aa  95.5  8e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.702014  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5346  alpha/beta hydrolase fold  29.37 
 
 
283 aa  95.5  8e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00669533  normal  0.437988 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4694  alpha/beta hydrolase fold  28.68 
 
 
283 aa  95.1  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.165062 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4924  alpha/beta hydrolase fold  29.37 
 
 
283 aa  94.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6598  alpha/beta hydrolase fold protein  30.08 
 
 
283 aa  89.7  4e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1132  putative hydrolase  30.15 
 
 
285 aa  89.4  6e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.96812  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  30.42 
 
 
267 aa  86.3  5e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2652  alpha/beta hydrolase fold protein  28.63 
 
 
268 aa  85.9  6e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.191504  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28630  putative hydrolase  32.86 
 
 
287 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000201744 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  30.27 
 
 
270 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  41.28 
 
 
265 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2073  alpha/beta hydrolase fold  30.74 
 
 
278 aa  84.7  0.000000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.944371  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5984  alpha/beta hydrolase fold  30.43 
 
 
300 aa  84  0.000000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0152397 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  30.27 
 
 
270 aa  83.2  0.000000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  30.65 
 
 
270 aa  82.8  0.000000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  37.17 
 
 
287 aa  83.2  0.000000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03123  hydrolase protein  30.64 
 
 
279 aa  82.8  0.000000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  31.03 
 
 
270 aa  82.8  0.000000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5136  alpha/beta hydrolase fold protein  27.6 
 
 
291 aa  82.4  0.000000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1039  alpha/beta hydrolase fold protein  29.45 
 
 
277 aa  82.4  0.000000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4587  hydrolase; menaquinone biosynthesis related protein; prolyl aminopeptidase  23.49 
 
 
270 aa  82.4  0.000000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4696  alpha/beta hydrolase fold  24.55 
 
 
270 aa  82  0.000000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2502  putative hydrolase  33.81 
 
 
283 aa  82  0.000000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0916  alpha/beta hydrolase fold protein  30.23 
 
 
252 aa  82  0.000000000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1628  alpha/beta hydrolase fold protein  31.68 
 
 
229 aa  81.6  0.00000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.989142  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5014  alpha/beta fold family hydrolase  24 
 
 
270 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5203  alpha/beta hydrolase fold protein  28.74 
 
 
260 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.112668  normal  0.598208 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4996  hydrolase, alpha/beta fold family  24 
 
 
270 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.556402  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4967  hydrolase, alpha/beta fold family  23.74 
 
 
270 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4523  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  42.57 
 
 
271 aa  81.6  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.104364  normal  0.231171 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1698  alpha/beta hydrolase fold  26.77 
 
 
397 aa  79.7  0.00000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4609  hydrolase; menaquinone biosynthesis related protein; prolyl aminopeptidase  25.09 
 
 
270 aa  79.7  0.00000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10564  peroxidase bpoC (non-haem peroxidase)  31.39 
 
 
262 aa  79.7  0.00000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0807819 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1232  alpha/beta hydrolase fold protein  27.24 
 
 
277 aa  79.7  0.00000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0253  hydrolase, alpha/beta fold family  24.91 
 
 
270 aa  79.3  0.00000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000360358  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4939  alpha/beta hydrolase fold  30.27 
 
 
278 aa  79.3  0.00000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.1422  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0446  3-oxoadipate enol-lactonase  28.98 
 
 
264 aa  79.3  0.00000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3317  putative hydrolase or acyltransferase  28.09 
 
 
296 aa  79  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3325  putative hydrolase or acyltransferase  27.24 
 
 
296 aa  79  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0252993  normal  0.633189 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  27.76 
 
 
262 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4749  alpha/beta fold family hydrolase  23.43 
 
 
270 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5110  alpha/beta fold family hydrolase  23.43 
 
 
270 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.98697  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1935  alpha/beta hydrolase  28.63 
 
 
268 aa  78.2  0.0000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0186  alpha/beta hydrolase fold protein  28.03 
 
 
258 aa  77.4  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1090  hydrolase, alpha/beta fold family  24.91 
 
 
275 aa  77  0.0000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2510  alpha/beta hydrolase fold protein  29.03 
 
 
267 aa  77  0.0000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00182924  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3421  putative hydrolase or acyltransferase  28.09 
 
 
296 aa  77  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0121666 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4985  SHCHC synthase  24.55 
 
 
270 aa  77  0.0000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.30423  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2264  alpha/beta hydrolase fold protein  25.84 
 
 
290 aa  76.6  0.0000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.426899  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2505  alpha/beta family hydrolase  28.25 
 
 
279 aa  76.6  0.0000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2449  alpha/beta hydrolase fold  27.6 
 
 
279 aa  76.3  0.0000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0045755  normal  0.669691 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7676  alpha/beta hydrolase fold protein  28.68 
 
 
269 aa  75.9  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0911  alpha/beta hydrolase fold protein  29.26 
 
 
276 aa  76.3  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.139412 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0182  hypothetical protein  33.12 
 
 
269 aa  75.9  0.0000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0161  hypothetical protein  33.12 
 
 
269 aa  75.9  0.0000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0155  alpha/beta fold family hydrolase  33.12 
 
 
269 aa  75.9  0.0000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0160  hypothetical protein  33.12 
 
 
269 aa  75.9  0.0000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1764  alpha/beta hydrolase fold protein  30.28 
 
 
265 aa  75.9  0.0000000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0171248  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  29.15 
 
 
264 aa  75.9  0.0000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4878  alpha/beta hydrolase fold  27.86 
 
 
279 aa  75.9  0.0000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0658691 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3241  putative hydrolase or acyltransferase  26.06 
 
 
296 aa  75.5  0.0000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1008  alpha/beta hydrolase fold protein  26.35 
 
 
275 aa  75.5  0.0000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4002  alpha/beta hydrolase fold protein  26.45 
 
 
266 aa  75.5  0.0000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1579  alpha/beta fold family hydrolase  25.94 
 
 
265 aa  75.1  0.000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5449  alpha/beta hydrolase fold  37.84 
 
 
272 aa  74.7  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.343862 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2189  3-oxoadipate enol-lactonase  29.85 
 
 
259 aa  75.1  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4252  alpha/beta hydrolase fold  28.37 
 
 
300 aa  75.1  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.733578  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3643  alpha/beta hydrolase fold  29.28 
 
 
284 aa  75.1  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.191319  normal  0.297531 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2090  putative hydrolase  31.05 
 
 
233 aa  74.7  0.000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.787524  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0204  hypothetical protein  33.76 
 
 
269 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2964  alpha/beta hydrolase fold  27.72 
 
 
282 aa  75.1  0.000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2731  hydrolase, alpha/beta fold family  28.57 
 
 
258 aa  75.1  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3210  alpha/beta hydrolase fold protein  35.03 
 
 
271 aa  75.5  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.45774  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2122  alpha/beta hydrolase fold  35.92 
 
 
249 aa  74.7  0.000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.237751 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1078  alpha/beta hydrolase fold protein  26.9 
 
 
253 aa  74.3  0.000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2473  hypothetical protein  33.33 
 
 
286 aa  74.7  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0341  alpha/beta hydrolase fold  28.31 
 
 
265 aa  74.3  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1663  3-oxoadipate enol-lactonase  29.92 
 
 
263 aa  74.3  0.000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0244187  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2348  alpha/beta hydrolase fold protein  28.57 
 
 
275 aa  74.3  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4001  alpha/beta hydrolase fold protein  26.22 
 
 
271 aa  74.3  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1248  alpha/beta hydrolase fold-containing protein  32.88 
 
 
311 aa  74.3  0.000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1483  alpha/beta hydrolase fold  28.32 
 
 
275 aa  74.3  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.768044  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0351  alpha/beta hydrolase fold  32.48 
 
 
283 aa  73.9  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.825015  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4115  alpha/beta hydrolase fold  30.19 
 
 
280 aa  73.9  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2251  3-oxoadipate enol-lactonase  27.78 
 
 
262 aa  73.6  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4235  alpha/beta hydrolase fold  34.45 
 
 
252 aa  73.6  0.000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.125145  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22460  alpha/beta family hydrolase  31.25 
 
 
275 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.241397  hitchhiker  0.0000000538784 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1217  alpha/beta hydrolase fold protein  28.62 
 
 
335 aa  73.6  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>