More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_2073 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_2073  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 278 aa  565  1e-160  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.944371  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3821  alpha/beta hydrolase fold  37.4 
 
 		 256 aa  145  6e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2929  putative alpha/beta hydrolase  36.82 
 
 		 277 aa  139  3.9999999999999997e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0296814 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1055  alpha/beta hydrolase  34.92 
 
 		 239 aa  106  4e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1592  alpha/beta hydrolase fold  30.08 
 
 		 267 aa  85.1  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.121533  normal  0.0764642 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4916  alpha/beta hydrolase fold  30.74 
 
 		 277 aa  84.7  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.503338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5645  alpha/beta hydrolase fold protein  28.63 
 
 		 273 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.530376  normal  0.570131 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1813  alpha/beta hydrolase fold  28.72 
 
 		 287 aa  71.2  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.557453  normal  0.0116174 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1823  alpha/beta hydrolase fold protein  29.64 
 
 		 264 aa  70.5  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.754545  normal  0.278795 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3298  hypothetical protein  23.86 
 
 		 258 aa  65.1  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.24994 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1090  hydrolase, alpha/beta fold family  25.91 
 
 		 275 aa  64.3  0.000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2533  alpha/beta hydrolase fold  26.06 
 
 		 394 aa  63.9  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.763523  hitchhiker  0.000713201 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0208  alpha/beta hydrolase fold  24.8 
 
 		 291 aa  63.5  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0918  alpha/beta hydrolase fold  28.92 
 
 		 255 aa  63.2  0.000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.891406  normal  0.241554 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1935  alpha/beta hydrolase  27.31 
 
 		 268 aa  62.8  0.000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2526  alpha/beta hydrolase fold  24.28 
 
 		 275 aa  62.8  0.000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4917  putative hydrolase  27.52 
 
 		 272 aa  62.8  0.000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.491161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1699  alpha/beta hydrolase fold  22.71 
 
 		 254 aa  62.4  0.000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2846  alpha/beta hydrolase  27.21 
 
 		 263 aa  62.4  0.000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.455911  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0821  esterase/lipase/thioesterase  26.26 
 
 		 256 aa  60.8  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.546429  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4667  alpha/beta hydrolase fold  33.06 
 
 		 260 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.113193  normal  0.117505 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2479  alpha/beta hydrolase fold  26.26 
 
 		 256 aa  60.8  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.261597 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5043  alpha/beta fold family hydrolase  21.88 
 
 		 279 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1308  alpha/beta fold family hydrolase  24.82 
 
 		 275 aa  59.7  0.00000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.100773  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5036  hydrolase, alpha/beta fold family  21.91 
 
 		 279 aa  59.7  0.00000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0916  alpha/beta hydrolase fold protein  27.44 
 
 		 252 aa  58.9  0.00000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2555  alpha/beta hydrolase fold protein  26.12 
 
 		 234 aa  58.9  0.00000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.249679  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0198  hydrolase, alpha/beta fold family  21.53 
 
 		 279 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4774  alpha/beta fold family hydrolase  21.33 
 
 		 279 aa  58.5  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4614  alpha/beta hydrolase fold protein  21.33 
 
 		 279 aa  58.5  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4636  alpha/beta hydrolase fold protein  21.33 
 
 		 279 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1118  alpha/beta hydrolase fold  25.55 
 
 		 275 aa  58.5  0.0000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5136  alpha/beta fold family hydrolase  21.33 
 
 		 279 aa  58.5  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5015  hydrolase, alpha/beta fold family  21.33 
 
 		 279 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5048  hydrolase, alpha/beta fold family  21.91 
 
 		 279 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0507  alpha/beta hydrolase fold  26.47 
 
 		 264 aa  57.8  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1698  alpha/beta hydrolase fold  25.37 
 
 		 397 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15660  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  26.71 
 
 		 277 aa  57  0.0000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0398174  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1704  alpha/beta fold family hydrolase  26.48 
 
 		 262 aa  56.6  0.0000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000659233  normal  0.0248748 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4726  alpha/beta hydrolase fold  21.18 
 
 		 279 aa  56.2  0.0000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4154  alpha/beta hydrolase  28.16 
 
 		 249 aa  55.8  0.0000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.451839 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13227  lipase lipV  32.2 
 
 		 261 aa  55.8  0.0000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2528  alpha/beta hydrolase fold  25.72 
 
 		 301 aa  55.5  0.0000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2510  alpha/beta hydrolase fold protein  25.44 
 
 		 267 aa  55.1  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00182924  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2398  alpha/beta hydrolase fold protein  29.79 
 
 		 282 aa  55.1  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.240634  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3502  alpha/beta hydrolase fold protein  30.39 
 
 		 268 aa  54.7  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0503333  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0817  hypothetical protein  25.6 
 
 		 256 aa  54.7  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000104367  normal  0.28548 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0743  hypothetical protein  25.6 
 
 		 256 aa  54.3  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.000000000000786446  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0804  hypothetical protein  25.6 
 
 		 256 aa  54.3  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000284969  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1130  alpha/beta hydrolase fold protein  34.51 
 
 		 254 aa  54.7  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.755121  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0756  hypothetical protein  25.6 
 
 		 256 aa  54.3  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000320823  normal  0.242139 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4321  alpha/beta hydrolase fold  25.28 
 
 		 280 aa  54.7  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0798376 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1800  alpha/beta hydrolase fold  35.4 
 
 		 260 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.155348 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04345  alpha/beta superfamily hydrolase  21.48 
 
 		 253 aa  54.3  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.660124  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0853  hypothetical protein  25.71 
 
 		 256 aa  53.9  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.000000437553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2696  alpha/beta hydrolase fold protein  27.78 
 
 		 268 aa  53.9  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.094894  normal  0.233594 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1981  alpha/beta hydrolase fold protein  28.36 
 
 		 278 aa  53.5  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.141718 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1832  magnesium chelatase accessory protein  31.23 
 
 		 302 aa  53.5  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0474032 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1565  alpha/beta hydrolase fold  24.9 
 
 		 363 aa  53.1  0.000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.461626  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5046  alpha/beta hydrolase fold protein  28.79 
 
 		 281 aa  53.5  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.186398  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0430  alpha/beta hydrolase fold  24.05 
 
 		 300 aa  53.1  0.000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.803425  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8386  hydrolase, alpha  38.83 
 
 		 304 aa  53.1  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.139718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5680  alpha/beta hydrolase fold protein  28.57 
 
 		 324 aa  53.1  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2408  Alpha/beta hydrolase fold  25.37 
 
 		 282 aa  52.4  0.000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.734786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1799  Alpha/beta hydrolase fold  25.82 
 
 		 275 aa  52.8  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3377  alpha/beta hydrolase fold  25.27 
 
 		 273 aa  52.4  0.000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6440  alpha/beta hydrolase fold  22.06 
 
 		 268 aa  52.8  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.200854 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3438  3-oxoadipate enol-lactonase  27.88 
 
 		 277 aa  52.8  0.000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.221809  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5527  alpha/beta hydrolase fold  21.84 
 
 		 307 aa  52.4  0.000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.563792  normal  0.509486 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0627  Alpha/beta hydrolase  25.53 
 
 		 289 aa  52.4  0.000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.355065 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0225  alpha/beta hydrolase fold  24.16 
 
 		 272 aa  52.4  0.000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.701432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1201  hypothetical protein  26.02 
 
 		 257 aa  52  0.000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000000612925  hitchhiker  0.000217368 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2523  alpha/beta hydrolase fold protein  27 
 
 		 279 aa  51.6  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2253  alpha/beta hydrolase fold  26.6 
 
 		 309 aa  52  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.128112  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2383  poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  26.92 
 
 		 294 aa  50.8  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.38703  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2367  alpha/beta hydrolase fold  25.09 
 
 		 291 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.926143  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2707  Alpha/beta hydrolase fold  27.04 
 
 		 264 aa  51.2  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3210  alpha/beta hydrolase fold protein  28.04 
 
 		 271 aa  51.2  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.45774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1310  alpha/beta hydrolase fold  25.19 
 
 		 269 aa  51.2  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.557665  normal  0.708974 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12729  hydrolase  27.37 
 
 		 341 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0446  3-oxoadipate enol-lactonase  24.62 
 
 		 264 aa  50.8  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0592  alpha/beta hydrolase fold  24.43 
 
 		 300 aa  51.2  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3398  Alpha/beta hydrolase fold  27.7 
 
 		 255 aa  50.4  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2258  alpha/beta hydrolase fold  26.92 
 
 		 277 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.40096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3515  alpha/beta hydrolase fold  19.62 
 
 		 279 aa  50.4  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  30.77 
 
 		 2762 aa  50.4  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0027  hydrolase, alpha/beta superfamily, CesH  21.13 
 
 		 260 aa  50.1  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2983  alpha/beta hydrolase fold protein  34.95 
 
 		 303 aa  50.1  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.283426 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  27.92 
 
 		 308 aa  50.1  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2225  alpha/beta hydrolase fold  23.86 
 
 		 273 aa  50.4  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1365  alpha/beta hydrolase fold protein  26.39 
 
 		 300 aa  49.7  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.371007  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3121  hypothetical protein  25.4 
 
 		 259 aa  49.7  0.00005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000331929  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0831  alpha/beta hydrolase fold protein  35.19 
 
 		 344 aa  49.7  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0446  alpha/beta hydrolase fold  28.08 
 
 		 252 aa  49.7  0.00005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.352973  normal  0.813784 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2011  alpha/beta hydrolase fold  38.83 
 
 		 298 aa  49.7  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.404957 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0431  alpha/beta hydrolase fold  26.73 
 
 		 325 aa  49.7  0.00006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0538885  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2860  hypothetical protein  33.16 
 
 		 226 aa  49.7  0.00006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0102244 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0356  alpha/beta hydrolase fold  24.82 
 
 		 256 aa  49.7  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.122696  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14730  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  24.64 
 
 		 264 aa  49.7  0.00006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.31361 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1465  alpha/beta hydrolase fold protein  27.85 
 
 		 289 aa  49.7  0.00006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.647363  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>