124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0446 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008048  Sala_0446  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
252 aa  492  9.999999999999999e-139  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.352973  normal  0.813784 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6047  alpha/beta family hydrolase  55.47 
 
 
244 aa  248  1e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5155  alpha/beta hydrolase fold  40.32 
 
 
247 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.811296  normal  0.168548 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3876  alpha/beta hydrolase fold protein  40.62 
 
 
249 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.226038  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1175  alpha/beta hydrolase fold  39.36 
 
 
248 aa  128  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.634466  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3728  alpha/beta hydrolase fold  38.49 
 
 
249 aa  124  1e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.322506  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3801  alpha/beta hydrolase fold  38.49 
 
 
247 aa  124  1e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0108659 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3740  alpha/beta hydrolase fold  38.1 
 
 
247 aa  122  5e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0981  alpha/beta hydrolase fold protein  35.46 
 
 
249 aa  106  4e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0795  alpha/beta hydrolase fold protein  34.18 
 
 
267 aa  90.1  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.814605  normal  0.361628 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1240  alpha/beta hydrolase fold protein  30.25 
 
 
295 aa  87.8  1e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1179  alpha/beta hydrolase fold protein  32.38 
 
 
278 aa  85.1  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0798469  normal  0.0102944 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2200  alpha/beta hydrolase fold protein  28.19 
 
 
278 aa  74.3  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0619  alpha/beta hydrolase fold  28.85 
 
 
291 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1230  alpha/beta hydrolase fold  26.32 
 
 
261 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6602  alpha/beta hydrolase fold  26.32 
 
 
261 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.472817  normal  0.1504 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6064  alpha/beta hydrolase fold protein  26.32 
 
 
262 aa  59.3  0.00000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25213  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3635  alpha/beta hydrolase fold protein  28.74 
 
 
281 aa  59.3  0.00000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2713  alpha/beta hydrolase fold  26.64 
 
 
315 aa  58.9  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.812736 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0685  Alpha/beta hydrolase fold  25.38 
 
 
287 aa  56.6  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.339922  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3546  alpha/beta hydrolase fold protein  26.72 
 
 
308 aa  56.6  0.0000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.375362  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0061  alpha/beta hydrolase fold  27.2 
 
 
287 aa  56.6  0.0000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4298  alpha/beta hydrolase fold  27.41 
 
 
288 aa  55.5  0.0000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0448  alpha/beta hydrolase fold  25.66 
 
 
292 aa  55.5  0.0000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.122113  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1121  alpha/beta hydrolase fold protein  29.04 
 
 
322 aa  55.1  0.0000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0702  alpha/beta hydrolase fold  27.31 
 
 
297 aa  53.9  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.506052 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0074  alpha/beta hydrolase fold  21.71 
 
 
275 aa  53.5  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.224768  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0208  alpha/beta hydrolase fold  25.66 
 
 
291 aa  52.8  0.000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2225  alpha/beta hydrolase fold  27.37 
 
 
273 aa  52.8  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3377  alpha/beta hydrolase fold  27.89 
 
 
273 aa  52.8  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2073  alpha/beta hydrolase fold  28.08 
 
 
278 aa  51.6  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.944371  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6120  alpha/beta hydrolase fold  33.04 
 
 
272 aa  51.2  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.894817  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3112  alpha/beta hydrolase fold  25.59 
 
 
315 aa  51.2  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.137258  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2677  Alpha/beta hydrolase  24.83 
 
 
315 aa  50.8  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.219797 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4676  alpha/beta hydrolase fold-containing protein  24.52 
 
 
331 aa  50.8  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.318593  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0725  alpha/beta hydrolase fold protein  27.76 
 
 
286 aa  50.8  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0555  alpha/beta hydrolase fold  26.67 
 
 
313 aa  50.8  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1199  alpha/beta hydrolase fold protein  24.15 
 
 
280 aa  50.8  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0214  alpha/beta hydrolase fold protein  24.53 
 
 
284 aa  50.1  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.252127  normal  0.202912 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2065  cyclic nucleotide-binding protein  29.8 
 
 
462 aa  49.7  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5198  alpha/beta hydrolase fold protein  24.72 
 
 
290 aa  50.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.45411e-23 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1766  alpha/beta hydrolase fold protein  25 
 
 
304 aa  49.7  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5344  putative hydrolase  25.09 
 
 
317 aa  49.7  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.824632  normal  0.198209 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4328  alpha/beta hydrolase fold protein  39.18 
 
 
324 aa  49.3  0.00007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3547  alpha/beta hydrolase fold  30.77 
 
 
274 aa  48.9  0.00007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.409212  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1587  alpha/beta hydrolase fold protein  26.2 
 
 
301 aa  48.9  0.00007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10135  epoxide hydrolase ephF  24.16 
 
 
300 aa  48.9  0.00008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.890635 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4186  alpha/beta hydrolase fold protein  28.95 
 
 
297 aa  48.9  0.00008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3055  Alpha/beta hydrolase fold  26.89 
 
 
281 aa  48.5  0.00009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00610584 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  27.35 
 
 
308 aa  48.5  0.00009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0419  alpha/beta hydrolase fold  27.62 
 
 
270 aa  48.1  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4516  alpha/beta hydrolase fold  26.53 
 
 
310 aa  48.5  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.320967  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2137  alpha/beta hydrolase fold protein  27.37 
 
 
363 aa  48.5  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0198184  normal  0.0171478 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4104  putative epoxide hydrolase  33.63 
 
 
302 aa  47.8  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.526897  normal  0.0962746 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3841  alpha/beta hydrolase fold  26.15 
 
 
288 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4088  alpha/beta hydrolase fold protein  24.44 
 
 
309 aa  47.4  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.90454  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0258  alpha/beta hydrolase fold protein  35.92 
 
 
283 aa  47.8  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2037  Alpha/beta hydrolase fold  25.83 
 
 
302 aa  46.6  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.421524 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4150  alpha/beta hydrolase fold protein  26.15 
 
 
288 aa  47  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0383403  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1877  Epoxide hydrolase domain protein  30.69 
 
 
361 aa  47.4  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.119141  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5281  alpha/beta hydrolase  29.35 
 
 
272 aa  47  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.228654 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5417  alpha/beta fold family hydrolase  33.96 
 
 
288 aa  47  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.779274  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1548  alpha/beta hydrolase fold  23.35 
 
 
287 aa  46.6  0.0004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.133161  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1209  esterase/lipase  28.18 
 
 
311 aa  46.2  0.0005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0535  alpha/beta hydrolase fold  30.1 
 
 
298 aa  46.2  0.0005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0990  alpha/beta hydrolase fold  22.99 
 
 
298 aa  46.2  0.0005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6705  alpha/beta hydrolase fold protein  22.52 
 
 
335 aa  46.2  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1459  alpha/beta hydrolase fold  24.81 
 
 
276 aa  45.8  0.0006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5996  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)  23.31 
 
 
260 aa  45.8  0.0007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3189  alpha/beta hydrolase  32.26 
 
 
306 aa  45.4  0.0008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2022  alpha/beta hydrolase fold protein  28.57 
 
 
265 aa  45.4  0.0009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0500364  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13648  epoxide hydrolase ephA  31.15 
 
 
322 aa  45.4  0.0009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000134654 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0147  alpha/beta hydrolase  28.85 
 
 
282 aa  44.7  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3843  alpha/beta hydrolase fold  31.52 
 
 
316 aa  45.1  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2929  putative alpha/beta hydrolase  35.19 
 
 
277 aa  44.7  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0296814 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06730  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  24.54 
 
 
343 aa  45.4  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1459  alpha/beta fold family hydrolase  27.55 
 
 
296 aa  44.3  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1144  alpha/beta hydrolase fold protein  38.95 
 
 
323 aa  44.7  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.273901  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0430  alpha/beta hydrolase fold protein  29.64 
 
 
296 aa  44.3  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5020  putative alpha/beta hydrolase  29.2 
 
 
334 aa  44.3  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.479747 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3236  alpha/beta hydrolase fold protein  34.62 
 
 
308 aa  43.9  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00307159  normal  0.0988326 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7062  alpha/beta hydrolase fold  26.59 
 
 
296 aa  44.3  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1436  alpha/beta hydrolase fold  25.36 
 
 
308 aa  44.7  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0205853 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8523  alpha/beta hydrolase fold protein  26.64 
 
 
323 aa  43.9  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2342  alpha/beta hydrolase fold protein  26.04 
 
 
287 aa  43.9  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.556895  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6167  alpha/beta hydrolase fold protein  32.04 
 
 
289 aa  43.9  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000738645  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6541  alpha/beta hydrolase fold protein  27.87 
 
 
288 aa  43.9  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.403554  normal  0.0826923 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3496  alpha/beta hydrolase fold  28.74 
 
 
289 aa  43.5  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.340747  normal  0.70145 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4449  alpha/beta hydrolase fold  28.2 
 
 
293 aa  43.9  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.178174  normal  0.73876 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1786  cyclic nucleotide-binding protein  26.05 
 
 
462 aa  43.5  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00355982 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0955  alpha/beta hydrolase fold  25.48 
 
 
309 aa  43.5  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0174  cyclic nucleotide-binding protein  29.32 
 
 
456 aa  43.1  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000271627  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3833  alpha/beta hydrolase fold protein  22.59 
 
 
302 aa  43.1  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.549204 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7956  haloalkane dehalogenase  25.37 
 
 
292 aa  43.1  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1598  alpha/beta hydrolase fold protein  23.35 
 
 
328 aa  43.1  0.005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  decreased coverage  0.00288726 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5106  alpha/beta hydrolase fold protein  33.64 
 
 
287 aa  43.1  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0636822  normal  0.0262926 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1166  alpha/beta hydrolase fold protein  25.64 
 
 
333 aa  42.7  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.110517 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10250  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  27.64 
 
 
289 aa  43.1  0.005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2645  Alpha/beta hydrolase  26.15 
 
 
289 aa  42.7  0.006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0678318 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2679  alpha/beta hydrolase fold  26.79 
 
 
288 aa  42.7  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.113925  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>