30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_3740 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_3740  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
247 aa  491  9.999999999999999e-139  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3801  alpha/beta hydrolase fold  99.19 
 
 
247 aa  488  1e-137  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0108659 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3728  alpha/beta hydrolase fold  98.79 
 
 
249 aa  486  1e-136  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.322506  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5155  alpha/beta hydrolase fold  71.02 
 
 
247 aa  309  2e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.811296  normal  0.168548 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1175  alpha/beta hydrolase fold  66.94 
 
 
248 aa  309  2.9999999999999997e-83  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.634466  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3876  alpha/beta hydrolase fold protein  66.39 
 
 
249 aa  297  1e-79  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.226038  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0981  alpha/beta hydrolase fold protein  41.37 
 
 
249 aa  152  4e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0446  alpha/beta hydrolase fold  38.4 
 
 
252 aa  124  2e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.352973  normal  0.813784 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6047  alpha/beta family hydrolase  40.24 
 
 
244 aa  122  5e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1179  alpha/beta hydrolase fold protein  31.84 
 
 
278 aa  79.3  0.00000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0798469  normal  0.0102944 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1240  alpha/beta hydrolase fold protein  30.51 
 
 
295 aa  72.4  0.000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0795  alpha/beta hydrolase fold protein  27.88 
 
 
267 aa  61.6  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.814605  normal  0.361628 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6602  alpha/beta hydrolase fold  26.36 
 
 
261 aa  52  0.000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.472817  normal  0.1504 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1230  alpha/beta hydrolase fold  26.36 
 
 
261 aa  52  0.000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2355  alpha/beta fold family hydrolase  43.37 
 
 
345 aa  48.9  0.00007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.110523  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22090  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  28.52 
 
 
285 aa  48.9  0.00007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00622193 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1259  alpha/beta hydrolase fold  21.19 
 
 
284 aa  48.9  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1736  alpha/beta hydrolase fold  30.04 
 
 
290 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2250  alpha/beta hydrolase fold protein  39 
 
 
315 aa  47.8  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000261715  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2065  cyclic nucleotide-binding protein  28.02 
 
 
462 aa  46.2  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1047  alpha/beta hydrolase fold  26.77 
 
 
275 aa  44.7  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.975256  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0831  alpha/beta hydrolase fold protein  26.12 
 
 
344 aa  44.3  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8731  short chain dehydrogenase  40.26 
 
 
590 aa  43.5  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.199229  normal  0.347677 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2696  alpha/beta hydrolase fold protein  28.24 
 
 
268 aa  43.5  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.094894  normal  0.233594 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1786  cyclic nucleotide-binding protein  26.92 
 
 
462 aa  43.1  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00355982 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3859  alpha/beta hydrolase fold  34.02 
 
 
278 aa  43.1  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3055  Alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 
281 aa  43.1  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00610584 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5099  haloalkane dehalogenase  26.88 
 
 
295 aa  42.4  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.548735  normal  0.0388419 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12242  short chain dehydrogenase  38.46 
 
 
592 aa  42.7  0.006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0208017  normal  0.29752 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2350  hypothetical protein  32.58 
 
 
264 aa  42.4  0.007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000109829  hitchhiker  0.000000775471 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>