85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3876 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_3876  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 		 249 aa  490  1e-137  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.226038  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3728  alpha/beta hydrolase fold  66.12 
 
 		 249 aa  298  7e-80  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.322506  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3801  alpha/beta hydrolase fold  66.39 
 
 		 247 aa  298  7e-80  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0108659 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3740  alpha/beta hydrolase fold  66.39 
 
 		 247 aa  298  8e-80  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1175  alpha/beta hydrolase fold  65.98 
 
 		 248 aa  296  2e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.634466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5155  alpha/beta hydrolase fold  64.9 
 
 		 247 aa  286  2e-76  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.811296  normal  0.168548 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0981  alpha/beta hydrolase fold protein  45.53 
 
 		 249 aa  179  4.999999999999999e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0446  alpha/beta hydrolase fold  40.62 
 
 		 252 aa  132  6.999999999999999e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.352973  normal  0.813784 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6047  alpha/beta family hydrolase  39.68 
 
 		 244 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1240  alpha/beta hydrolase fold protein  32.77 
 
 		 295 aa  80.9  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1179  alpha/beta hydrolase fold protein  31.15 
 
 		 278 aa  77.8  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0798469  normal  0.0102944 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0795  alpha/beta hydrolase fold protein  29.8 
 
 		 267 aa  63.9  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.814605  normal  0.361628 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1801  hypothetical protein  29.67 
 
 		 238 aa  56.6  0.0000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0314686 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0672  alpha/beta hydrolase fold  29.23 
 
 		 315 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.240082 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11862  haloalkane dehalogenase  28.85 
 
 		 286 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.608613 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22090  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  28.08 
 
 		 285 aa  51.2  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00622193 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3055  Alpha/beta hydrolase fold  27.72 
 
 		 281 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00610584 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1287  alpha/beta fold family hydrolase  32.37 
 
 		 349 aa  50.4  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.534862  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3635  alpha/beta hydrolase fold protein  26.97 
 
 		 281 aa  50.4  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2541  alpha/beta fold family hydrolase  32.37 
 
 		 311 aa  49.3  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.072753  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1292  alpha/beta fold family hydrolase  32.37 
 
 		 311 aa  49.3  0.00005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1026  alpha/beta fold family hydrolase  32.37 
 
 		 296 aa  49.3  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1365  alpha/beta fold family hydrolase  32.37 
 
 		 296 aa  49.3  0.00006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0541  alpha/beta fold family hydrolase  32.37 
 
 		 296 aa  49.3  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0269  alpha/beta fold family hydrolase  32.37 
 
 		 296 aa  49.3  0.00006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.127218  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0552  alpha/beta hydrolase fold protein  28.57 
 
 		 294 aa  48.9  0.00007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6120  alpha/beta hydrolase fold  34.78 
 
 		 272 aa  48.9  0.00008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.894817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1459  alpha/beta fold family hydrolase  31.65 
 
 		 296 aa  48.9  0.00008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5099  haloalkane dehalogenase  31.01 
 
 		 295 aa  48.9  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.548735  normal  0.0388419 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12242  short chain dehydrogenase  34.11 
 
 		 592 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0208017  normal  0.29752 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3859  alpha/beta hydrolase fold  36 
 
 		 278 aa  48.5  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0619  alpha/beta hydrolase fold  29.18 
 
 		 291 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4087  alpha/beta fold family hydrolase/acetyltransferase  32.38 
 
 		 556 aa  47.4  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.779957  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0878  alpha/beta hydrolase fold  26.51 
 
 		 317 aa  47.4  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0136792  hitchhiker  0.00000592996 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1464  alpha/beta hydrolase fold protein  35.64 
 
 		 279 aa  46.2  0.0004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2250  alpha/beta hydrolase fold protein  35.48 
 
 		 315 aa  46.2  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000261715  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1998  alpha/beta hydrolase fold  32.65 
 
 		 293 aa  46.2  0.0005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.918963  normal  0.449099 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2713  alpha/beta hydrolase fold  25.5 
 
 		 315 aa  45.8  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.812736 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2367  alpha/beta hydrolase fold  24.12 
 
 		 291 aa  45.8  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.926143  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2154  alpha/beta fold family hydrolase  31.43 
 
 		 308 aa  45.8  0.0006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0592253  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3210  alpha/beta hydrolase fold protein  26.74 
 
 		 271 aa  45.4  0.0007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.45774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6469  haloalkane dehalogenase  30.77 
 
 		 287 aa  45.8  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.805806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2614  alpha/beta hydrolase fold  30.48 
 
 		 339 aa  45.4  0.0008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8731  short chain dehydrogenase  40.74 
 
 		 590 aa  45.4  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.199229  normal  0.347677 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2547  alpha/beta hydrolase fold  30.48 
 
 		 339 aa  45.4  0.0008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2799  alpha/beta hydrolase fold protein  31.43 
 
 		 302 aa  45.4  0.0009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1714  alpha/beta hydrolase fold  30.48 
 
 		 290 aa  45.1  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1511  alpha/beta hydrolase fold  30.48 
 
 		 295 aa  44.7  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2735  alpha/beta hydrolase fold  30.48 
 
 		 301 aa  45.1  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.211844  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2137  alpha/beta hydrolase fold protein  29.74 
 
 		 363 aa  45.1  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0198184  normal  0.0171478 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2073  alpha/beta hydrolase fold  28.86 
 
 		 278 aa  45.1  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.944371  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2696  alpha/beta hydrolase fold  26.14 
 
 		 291 aa  45.1  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.498963  decreased coverage  0.00208278 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2983  alpha/beta hydrolase fold protein  35.56 
 
 		 303 aa  44.7  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.283426 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1736  alpha/beta hydrolase fold  28.85 
 
 		 290 aa  45.1  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4917  putative hydrolase  28.35 
 
 		 272 aa  45.1  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.491161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2714  alpha/beta hydrolase fold  30.48 
 
 		 320 aa  45.1  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2696  alpha/beta hydrolase fold protein  25.3 
 
 		 268 aa  44.3  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.094894  normal  0.233594 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4800  alpha/beta hydrolase fold protein  32.35 
 
 		 283 aa  44.3  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.176635  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1743  alpha/beta fold family hydrolase  30.48 
 
 		 318 aa  44.3  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42481  predicted protein  28.85 
 
 		 332 aa  43.9  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00503465  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6731  alpha/beta hydrolase fold  28.28 
 
 		 323 aa  44.3  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4895  alpha/beta hydrolase fold  26.07 
 
 		 282 aa  44.3  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0335992  normal  0.294667 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1547  alpha/beta hydrolase fold  30.48 
 
 		 302 aa  43.9  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0208  alpha/beta hydrolase fold  25.48 
 
 		 291 aa  44.3  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1581  alpha/beta hydrolase fold  30.48 
 
 		 302 aa  43.9  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.217247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1551  alpha/beta hydrolase fold  30.48 
 
 		 302 aa  43.9  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1065  alpha/beta hydrolase fold  24.33 
 
 		 275 aa  44.3  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.289777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3189  alpha/beta hydrolase  33.33 
 
 		 306 aa  43.5  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2355  alpha/beta fold family hydrolase  40.48 
 
 		 345 aa  43.5  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.110523  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1446  alpha/beta hydrolase fold  31.43 
 
 		 303 aa  43.5  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.947535  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3044  alpha/beta hydrolase fold protein  35.29 
 
 		 278 aa  43.5  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7956  haloalkane dehalogenase  27.48 
 
 		 292 aa  43.5  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0304  Alpha/beta hydrolase  33.59 
 
 		 283 aa  43.1  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  26.92 
 
 		 287 aa  42.7  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0491  alpha/beta hydrolase fold  29.59 
 
 		 321 aa  42.7  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4694  alpha/beta hydrolase fold  34.4 
 
 		 283 aa  42.7  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.165062 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1047  alpha/beta hydrolase fold  27.51 
 
 		 275 aa  42.7  0.006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.975256  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3775  alpha/beta hydrolase fold protein  26.43 
 
 		 309 aa  42.4  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3797  alpha/beta hydrolase fold protein  32.32 
 
 		 248 aa  42.7  0.006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3383  alpha/beta hydrolase fold  31.29 
 
 		 284 aa  42.7  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1199  alpha/beta hydrolase fold protein  23.2 
 
 		 280 aa  42  0.008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1525  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  28.57 
 
 		 245 aa  42.4  0.008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.169593  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2638  alpha/beta hydrolase fold protein  32.93 
 
 		 294 aa  42  0.01  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33830  short chain dehydrogenase  29.64 
 
 		 568 aa  42  0.01  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1923  alpha/beta hydrolase fold protein  24.54 
 
 		 304 aa  42  0.01  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>