More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3044 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_3044  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 
278 aa  568  1e-161  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2788  alpha/beta hydrolase fold protein  51.21 
 
 
208 aa  211  7.999999999999999e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.156666 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1902  EstC  36.02 
 
 
235 aa  158  1e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00691738  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1760  alpha/beta hydrolase fold  33.76 
 
 
235 aa  155  9e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000242559  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1801  hypothetical protein  34.04 
 
 
238 aa  145  5e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0314686 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3165  alpha/beta hydrolase fold  31.38 
 
 
237 aa  137  2e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000928141  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5834  hypothetical protein  35.68 
 
 
259 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0216579  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1008  alpha/beta hydrolase fold  28.51 
 
 
240 aa  109  4.0000000000000004e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.854645  normal  0.0281886 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4177  esterase EstC, putative  28.4 
 
 
261 aa  105  8e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.10139  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4720  alpha/beta hydrolase fold  27.85 
 
 
241 aa  105  8e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3716  hypothetical protein  32.1 
 
 
260 aa  104  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.103811 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2864  alpha/beta hydrolase  26.47 
 
 
245 aa  103  3e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.134825  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2476  esterase EstC, putative  28.57 
 
 
261 aa  103  3e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.706044 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2246  hypothetical protein  27.08 
 
 
241 aa  102  5e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0661824  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3619  alpha/beta hydrolase fold protein  32.26 
 
 
286 aa  101  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.938744  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0924  hypothetical protein  26.16 
 
 
242 aa  99.4  6e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.289399  normal  0.196921 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3712  esterase EstC, putative  28 
 
 
256 aa  98.2  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3699  esterase EstC, putative  28 
 
 
256 aa  97.8  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3772  esterase EstC, putative  28 
 
 
256 aa  97.8  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.307611 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2104  esterase EstC  28.47 
 
 
336 aa  95.9  7e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3278  esterase EstC  28.52 
 
 
301 aa  95.5  8e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.3053  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1492  esterase EstC  28.47 
 
 
336 aa  95.5  9e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0320622  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1132  esterase EstC  28.52 
 
 
301 aa  95.5  9e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.120886  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1412  esterase EstC  28.52 
 
 
301 aa  95.5  9e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.678673  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2398  esterase EstC  28.47 
 
 
309 aa  95.5  9e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0534637  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2250  hypothetical protein  25.32 
 
 
242 aa  95.1  1e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.32812  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1504  hypothetical protein  34.04 
 
 
263 aa  94.7  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3164  esterase EstC  28.52 
 
 
301 aa  95.1  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6162  alpha/beta hydrolase fold protein  31.45 
 
 
271 aa  94.4  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0015  esterase  26.94 
 
 
294 aa  94  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2362  esterase EstC  27.76 
 
 
301 aa  92.4  6e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1550  hypothetical protein  32.1 
 
 
257 aa  92  9e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0203315  hitchhiker  0.00285566 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5508  esterase  27.87 
 
 
294 aa  90.9  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0202414 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6978  putative secreted protein  30.69 
 
 
276 aa  90.9  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.304279  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0420  putative hydrolase protein  32.37 
 
 
234 aa  90.9  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00809324  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5176  alpha/beta hydrolase fold  27.24 
 
 
311 aa  90.1  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4955  esterase  27.53 
 
 
294 aa  90.1  4e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.666917  normal  0.0409605 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5683  alpha/beta hydrolase fold  27.24 
 
 
294 aa  90.1  4e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00198544 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3673  signal peptide protein  28.68 
 
 
255 aa  90.1  4e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4552  alpha/beta hydrolase fold  27.59 
 
 
294 aa  90.1  4e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.192078  normal  0.395987 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2162  hypothetical protein  31.56 
 
 
256 aa  89.7  5e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00663104  normal  0.456218 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1509  putative secreted protein  30.47 
 
 
276 aa  89.4  6e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6320  putative secreted protein  30.47 
 
 
276 aa  89.4  6e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.574941 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3171  alpha/beta hydrolase fold  26.99 
 
 
294 aa  89  9e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0561096  normal  0.674436 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2628  hypothetical protein  32.44 
 
 
263 aa  87.8  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3455  putative esterase  27.62 
 
 
234 aa  87.8  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1601  hypothetical protein  31.02 
 
 
261 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.488204  normal  0.0819094 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0526  hypothetical protein  32.78 
 
 
256 aa  87.4  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.1738  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5405  alpha/beta hydrolase fold protein  30.4 
 
 
274 aa  86.7  4e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0752119  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6527  putative esterase  26.56 
 
 
246 aa  86.3  5e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.407204  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2859  hypothetical protein  41.96 
 
 
222 aa  86.3  5e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5714  hypothetical protein  27.62 
 
 
226 aa  86.3  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3511  hypothetical protein  32.89 
 
 
263 aa  85.9  7e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5441  hypothetical protein  33.05 
 
 
265 aa  85.5  8e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.235581 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6228  secreted protein  32.92 
 
 
232 aa  85.5  8e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4007  hypothetical protein  32.89 
 
 
263 aa  85.5  9e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.508442 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2328  signal peptide protein  28.4 
 
 
259 aa  85.1  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.267714 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0641  hypothetical protein  26.4 
 
 
261 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0033841  normal  0.0977111 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2994  putative secreted protein  28.09 
 
 
257 aa  85.1  0.000000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3448  hypothetical protein  32.44 
 
 
263 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5268  hypothetical protein  32.44 
 
 
263 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.744913  normal  0.596903 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2042  alpha/beta hydrolase fold protein  27.5 
 
 
279 aa  84  0.000000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.10769  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2275  hydrolase protein  29.83 
 
 
250 aa  83.6  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.318308  normal  0.404751 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3121  hypothetical protein  28.22 
 
 
229 aa  83.6  0.000000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.864442  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2482  alpha/beta hydrolase fold  32.53 
 
 
255 aa  82.8  0.000000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.601984 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0489  hypothetical protein  29.71 
 
 
230 aa  82  0.000000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.705006  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3238  Alpha/beta hydrolase  29.01 
 
 
258 aa  82  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.745191  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2532  hypothetical protein  28.46 
 
 
249 aa  82  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3533  putative esterase  27.99 
 
 
267 aa  80.5  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0813292  normal  0.433428 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1996  putative hydrolase protein  30.28 
 
 
257 aa  80.5  0.00000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.639101  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2393  alpha/beta hydrolase fold  27.23 
 
 
240 aa  80.1  0.00000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.507497 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3823  hypothetical protein  25.86 
 
 
255 aa  80.1  0.00000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.566879  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4581  hypothetical protein  27.69 
 
 
234 aa  79.7  0.00000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.924033  normal  0.968498 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2722  hypothetical protein  29.74 
 
 
289 aa  79.7  0.00000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.538859  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3124  hypothetical protein  27.98 
 
 
332 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.443405  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6793  secreted protein  27.82 
 
 
268 aa  79.3  0.00000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7189  hypothetical protein  29.1 
 
 
259 aa  79  0.00000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0370  hypothetical protein  29.67 
 
 
260 aa  78.2  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.623908  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38390  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  28.99 
 
 
235 aa  78.6  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2999  alpha/beta hydrolase fold protein  26.36 
 
 
229 aa  78.2  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.049692 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2690  hypothetical protein  27.82 
 
 
236 aa  78.6  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.834952  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7131  secreted protein  32.53 
 
 
283 aa  78.6  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000955642  normal  0.328861 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5667  putative esterase  24.8 
 
 
241 aa  78.2  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2737  alpha/beta hydrolase fold protein  31.33 
 
 
255 aa  77.8  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.747511  normal  0.973804 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3798  putative alpha/beta hydrolase family protein  25.51 
 
 
247 aa  77.4  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.875502  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0259  hypothetical protein  27.17 
 
 
270 aa  77  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0841  hypothetical protein  27.98 
 
 
266 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5922  hypothetical protein  27.39 
 
 
259 aa  76.6  0.0000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.130853  normal  0.331605 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3614  putative signal peptide protein  29.29 
 
 
244 aa  76.3  0.0000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.143133  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5732  esterase  29.67 
 
 
320 aa  75.9  0.0000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.668401 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5919  putative esterase  25 
 
 
243 aa  75.9  0.0000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1001  hypothetical protein  37.84 
 
 
273 aa  75.5  0.0000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1718  hypothetical protein  27.73 
 
 
276 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.205208  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5324  hypothetical protein  24.54 
 
 
252 aa  74.7  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.704501 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6933  hypothetical protein  24.89 
 
 
241 aa  75.1  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4027  hypothetical protein  27.34 
 
 
256 aa  73.9  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2054  putative hydrolase protein  28.1 
 
 
252 aa  74.3  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.036071  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4716  hypothetical protein  27.8 
 
 
259 aa  74.3  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4079  alpha/beta hydrolase fold  27.49 
 
 
246 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.313726 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1500  esterase/lipase/thioesterase domain-containing protein  26.69 
 
 
231 aa  73.9  0.000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0839932  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>