29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_1175 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_1175  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
248 aa  490  9.999999999999999e-139  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.634466  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5155  alpha/beta hydrolase fold  85.02 
 
 
247 aa  387  1e-107  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.811296  normal  0.168548 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3728  alpha/beta hydrolase fold  67.21 
 
 
249 aa  313  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.322506  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3801  alpha/beta hydrolase fold  66.94 
 
 
247 aa  309  2.9999999999999997e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0108659 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3740  alpha/beta hydrolase fold  66.94 
 
 
247 aa  309  2.9999999999999997e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3876  alpha/beta hydrolase fold protein  65.98 
 
 
249 aa  296  2e-79  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.226038  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0981  alpha/beta hydrolase fold protein  43.37 
 
 
249 aa  181  1e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6047  alpha/beta family hydrolase  41.2 
 
 
244 aa  137  1e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0446  alpha/beta hydrolase fold  39.36 
 
 
252 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.352973  normal  0.813784 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1240  alpha/beta hydrolase fold protein  30.12 
 
 
295 aa  76.6  0.0000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1179  alpha/beta hydrolase fold protein  28.93 
 
 
278 aa  75.1  0.0000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0798469  normal  0.0102944 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0795  alpha/beta hydrolase fold protein  28.74 
 
 
267 aa  73.2  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.814605  normal  0.361628 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2137  alpha/beta hydrolase fold protein  27.24 
 
 
363 aa  49.3  0.00005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0198184  normal  0.0171478 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1974  alpha/beta hydrolase fold protein  25 
 
 
315 aa  47.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.826576  normal  0.129189 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3055  Alpha/beta hydrolase fold  26.56 
 
 
281 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00610584 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6062  hypothetical protein  28.49 
 
 
262 aa  47  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22090  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  26.95 
 
 
285 aa  46.6  0.0004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00622193 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2073  alpha/beta hydrolase fold  33.67 
 
 
278 aa  44.7  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.944371  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6120  alpha/beta hydrolase fold  32.22 
 
 
272 aa  43.9  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.894817  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6064  alpha/beta hydrolase fold protein  25.38 
 
 
262 aa  43.9  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25213  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8637  alpha/beta hydrolase fold protein  26.73 
 
 
370 aa  43.1  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0532982  normal  0.751963 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2983  alpha/beta hydrolase fold protein  26.29 
 
 
303 aa  43.1  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.283426 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1792  alpha/beta hydrolase fold  23.46 
 
 
316 aa  43.1  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0957565 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1550  hypothetical protein  35.29 
 
 
257 aa  42.7  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0203315  hitchhiker  0.00285566 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3044  alpha/beta hydrolase fold protein  31.91 
 
 
278 aa  42.7  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1259  alpha/beta hydrolase fold  23.11 
 
 
284 aa  42.7  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1801  hypothetical protein  24.89 
 
 
238 aa  42  0.008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0314686 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8523  alpha/beta hydrolase fold protein  27.07 
 
 
323 aa  42  0.009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3642  alpha/beta fold family hydrolase  31.65 
 
 
262 aa  42  0.01  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>