45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_5155 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_5155  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
247 aa  493  9.999999999999999e-139  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.811296  normal  0.168548 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1175  alpha/beta hydrolase fold  85.02 
 
 
248 aa  406  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.634466  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3728  alpha/beta hydrolase fold  71.66 
 
 
249 aa  331  7.000000000000001e-90  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.322506  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3740  alpha/beta hydrolase fold  71.02 
 
 
247 aa  325  3e-88  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3801  alpha/beta hydrolase fold  71.02 
 
 
247 aa  325  3e-88  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0108659 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3876  alpha/beta hydrolase fold protein  64.9 
 
 
249 aa  295  3e-79  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.226038  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0981  alpha/beta hydrolase fold protein  42.97 
 
 
249 aa  180  2e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6047  alpha/beta family hydrolase  43.9 
 
 
244 aa  149  4e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0446  alpha/beta hydrolase fold  42 
 
 
252 aa  145  6e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.352973  normal  0.813784 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1240  alpha/beta hydrolase fold protein  32.77 
 
 
295 aa  89.7  4e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1179  alpha/beta hydrolase fold protein  30.54 
 
 
278 aa  85.5  8e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0798469  normal  0.0102944 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0795  alpha/beta hydrolase fold protein  28.19 
 
 
267 aa  73.2  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.814605  normal  0.361628 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8637  alpha/beta hydrolase fold protein  27.45 
 
 
370 aa  47.8  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0532982  normal  0.751963 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3055  Alpha/beta hydrolase fold  24.5 
 
 
281 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00610584 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22090  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  27.52 
 
 
285 aa  47.4  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00622193 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6062  hypothetical protein  29.03 
 
 
262 aa  46.6  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5099  haloalkane dehalogenase  28.48 
 
 
295 aa  47  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.548735  normal  0.0388419 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1418  alpha/beta hydrolase fold protein  25.79 
 
 
276 aa  45.8  0.0006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.961025  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1553  alpha/beta hydrolase fold protein  23.23 
 
 
286 aa  45.8  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000230075  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1065  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 
275 aa  45.8  0.0006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.289777  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2073  alpha/beta hydrolase fold  27.27 
 
 
278 aa  45.1  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.944371  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0341  alpha/beta hydrolase fold  23.81 
 
 
265 aa  44.7  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2137  alpha/beta hydrolase fold protein  27.24 
 
 
363 aa  45.1  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0198184  normal  0.0171478 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2677  Alpha/beta hydrolase  25.59 
 
 
315 aa  44.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.219797 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  23.11 
 
 
264 aa  43.9  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6469  haloalkane dehalogenase  30.37 
 
 
287 aa  44.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.805806  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2368  alpha/beta hydrolase fold  24.62 
 
 
219 aa  43.9  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.870626  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4895  alpha/beta hydrolase fold  26.38 
 
 
282 aa  43.9  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0335992  normal  0.294667 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2713  alpha/beta hydrolase fold  25.08 
 
 
315 aa  43.9  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.812736 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4016  alpha/beta hydrolase fold  35.63 
 
 
303 aa  43.1  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.459613  normal  0.722956 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6120  alpha/beta hydrolase fold  31.18 
 
 
272 aa  43.1  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.894817  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0672  alpha/beta hydrolase fold  25.19 
 
 
315 aa  43.1  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.240082 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2200  alpha/beta hydrolase fold protein  23.88 
 
 
278 aa  42.4  0.006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2983  alpha/beta hydrolase fold protein  26.29 
 
 
303 aa  42.4  0.006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.283426 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2250  alpha/beta hydrolase fold protein  36.63 
 
 
315 aa  42.4  0.007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000261715  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1140  alpha/beta fold family hydrolase  25.64 
 
 
308 aa  42.4  0.007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8516  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  40.43 
 
 
337 aa  42  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.802239  normal  0.759464 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3210  alpha/beta hydrolase fold protein  34 
 
 
271 aa  42.4  0.008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.45774  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2091  alpha/beta fold family hydrolase  25.64 
 
 
308 aa  42  0.009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1132  alpha/beta fold family hydrolase  25.64 
 
 
308 aa  42  0.009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.366992  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0689  alpha/beta fold family hydrolase  25.64 
 
 
308 aa  42  0.009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1296  alpha/beta fold family hydrolase  25.64 
 
 
308 aa  42  0.009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2203  alpha/beta fold family hydrolase  25.64 
 
 
308 aa  42  0.009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3044  alpha/beta hydrolase fold protein  33.73 
 
 
278 aa  41.6  0.01  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2154  alpha/beta fold family hydrolase  33.68 
 
 
308 aa  42  0.01  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0592253  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>