More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_3210 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_3210  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 		 271 aa  544  1e-154  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.45774  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0643  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase  29.1 
 
 		 267 aa  83.6  0.000000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3725  3-oxoadipate enol-lactonase  28.2 
 
 		 263 aa  81.3  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1857  3-oxoadipate enol-lactonase  30.56 
 
 		 260 aa  81.3  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.115671  normal  0.0686473 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0341  alpha/beta hydrolase fold  26.67 
 
 		 265 aa  80.1  0.00000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1002  alpha/beta hydrolase fold  29 
 
 		 280 aa  77.4  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3219  alpha/beta hydrolase fold protein  30.43 
 
 		 270 aa  77  0.0000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.910977  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2732  alpha/beta hydrolase fold  22.26 
 
 		 271 aa  75.5  0.0000000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4916  alpha/beta hydrolase fold  35.03 
 
 		 277 aa  75.5  0.0000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.503338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1168  alpha/beta hydrolase fold protein  28.52 
 
 		 271 aa  75.1  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.375352  normal  0.0130652 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0560  3-oxoadipate enol-lactonase  27 
 
 		 262 aa  75.1  0.000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.027284  normal  0.123793 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  26.64 
 
 		 264 aa  75.1  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2162  bioH protein  28.74 
 
 		 266 aa  73.9  0.000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  26.19 
 
 		 270 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3317  putative hydrolase or acyltransferase  35.66 
 
 		 296 aa  74.3  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0874  3-oxoadipate enol-lactonase  29.76 
 
 		 260 aa  73.9  0.000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.839441  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3061  alpha/beta hydrolase fold  31.5 
 
 		 280 aa  73.6  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3421  putative hydrolase or acyltransferase  35.66 
 
 		 296 aa  73.2  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0121666 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3241  putative hydrolase or acyltransferase  35.66 
 
 		 296 aa  73.2  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3567  3-oxoadipate enol-lactonase  28.69 
 
 		 264 aa  73.2  0.000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0409722 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3325  putative hydrolase or acyltransferase  35.66 
 
 		 296 aa  73.2  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0252993  normal  0.633189 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2126  alpha/beta hydrolase fold protein  28.79 
 
 		 263 aa  72.8  0.000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2122  alpha/beta hydrolase fold  28.06 
 
 		 249 aa  72  0.000000000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.237751 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1681  alpha/beta hydrolase fold  27.65 
 
 		 273 aa  72  0.000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0641945  normal  0.147127 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0648  alpha/beta hydrolase fold protein  37.5 
 
 		 226 aa  72  0.00000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0281045 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2572  alpha/beta hydrolase fold protein  27.35 
 
 		 263 aa  72  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  25.88 
 
 		 262 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1007  3-oxoadipate enol-lactonase  29.5 
 
 		 268 aa  70.9  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3731  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  29.5 
 
 		 372 aa  71.2  0.00000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5546  alpha/beta hydrolase fold protein  30.43 
 
 		 264 aa  70.5  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1259  3-oxoadipate enol-lactonase  27.13 
 
 		 261 aa  70.5  0.00000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1693  hydrolase, alpha/beta fold family  30.83 
 
 		 263 aa  70.5  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.37571  normal  0.210784 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0193  alpha/beta hydrolase fold protein  28.1 
 
 		 262 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.821297  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0159  alpha/beta hydrolase fold protein  30.23 
 
 		 279 aa  70.1  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2307  alpha/beta fold family hydrolase  23.75 
 
 		 277 aa  70.1  0.00000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2652  alpha/beta hydrolase fold protein  27.31 
 
 		 268 aa  69.7  0.00000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.191504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3245  alpha/beta hydrolase fold  25.84 
 
 		 271 aa  69.7  0.00000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2121  alpha/beta hydrolase fold  30.74 
 
 		 256 aa  69.3  0.00000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00152914  normal  0.180644 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1663  3-oxoadipate enol-lactonase  29.13 
 
 		 263 aa  68.9  0.00000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0244187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3055  alpha/beta hydrolase fold  30.68 
 
 		 277 aa  68.9  0.00000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0115287 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  26.09 
 
 		 270 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0595  putative lactone hydrolase  28.63 
 
 		 265 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.208776 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  26.29 
 
 		 270 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10564  peroxidase bpoC (non-haem peroxidase)  28.63 
 
 		 262 aa  68.2  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0807819 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0298  B-ketoadipate enol-lactone hydrolase protein  27.31 
 
 		 279 aa  67.8  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0479  alpha/beta hydrolase fold  26.35 
 
 		 262 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.108292 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2308  alpha/beta fold family hydrolase  25.4 
 
 		 283 aa  67.4  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.628895 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5449  alpha/beta hydrolase fold  25.76 
 
 		 272 aa  67.4  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.343862 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13040  3-oxoadipate enol-lactonase  32.11 
 
 		 261 aa  67.8  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3531  hydrolase or acyltransferase-like protein  28.51 
 
 		 425 aa  67.8  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.17214 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7077  3-oxoadipate enol-lactonase  25.93 
 
 		 269 aa  67  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.335255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2154  alpha/beta hydrolase fold protein  26.81 
 
 		 257 aa  67.4  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0016859 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0446  3-oxoadipate enol-lactonase  27.6 
 
 		 264 aa  67  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3860  prolyl aminopeptidase  27.51 
 
 		 286 aa  67  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.4706  normal  0.0554671 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0099  alpha/beta fold family hydrolase  31.95 
 
 		 220 aa  67  0.0000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000675213 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  28.63 
 
 		 265 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  24.18 
 
 		 270 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  27.18 
 
 		 314 aa  66.6  0.0000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1348  3-oxoadipate enol-lactonase  28.09 
 
 		 256 aa  66.6  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.786206 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1981  alpha/beta hydrolase fold protein  32.28 
 
 		 278 aa  66.2  0.0000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.141718 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0170  alpha/beta hydrolase fold protein  28.46 
 
 		 307 aa  65.9  0.0000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.37958  hitchhiker  0.00283274 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4957  alpha/beta hydrolase fold  27.31 
 
 		 272 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.174321  normal  0.0565751 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0511  alpha/beta hydrolase fold protein  27.82 
 
 		 265 aa  65.9  0.0000000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327319  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2398  alpha/beta hydrolase fold protein  35.04 
 
 		 282 aa  65.5  0.0000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.240634  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5939  3-oxoadipate enol-lactonase  27.82 
 
 		 275 aa  65.9  0.0000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.178478 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4002  alpha/beta hydrolase fold protein  23.64 
 
 		 266 aa  65.1  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4206  3-oxoadipate enol-lactonase  27.51 
 
 		 268 aa  65.1  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3042  Alpha/beta hydrolase  34.19 
 
 		 380 aa  65.1  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.440112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2446  alpha/beta hydrolase fold protein  28.9 
 
 		 309 aa  65.1  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.969901  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0152  alpha/beta hydrolase fold  26.98 
 
 		 279 aa  64.3  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.632153 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3377  alpha/beta hydrolase fold  26.67 
 
 		 273 aa  64.3  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0392  alpha/beta hydrolase fold  24.64 
 
 		 273 aa  64.3  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2449  alpha/beta hydrolase fold  29.08 
 
 		 279 aa  64.7  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0045755  normal  0.669691 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4238  3-oxoadipate enol-lactonase  28.16 
 
 		 262 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.368271 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1108  alpha/beta hydrolase fold  29.34 
 
 		 246 aa  63.9  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00367251  hitchhiker  0.00365287 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1578  3-oxoadipate enol-lactonase  28.85 
 
 		 261 aa  64.7  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000336054  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1065  alpha/beta hydrolase fold  26.02 
 
 		 275 aa  64.3  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.289777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1019  alpha/beta hydrolase fold  27.59 
 
 		 286 aa  64.3  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.154023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1259  alpha/beta hydrolase fold  24.05 
 
 		 284 aa  64.3  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1808  hypothetical protein  28.45 
 
 		 219 aa  63.9  0.000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1693  putative hydrolase  26.92 
 
 		 272 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.800205 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3602  alpha/beta hydrolase fold  25.77 
 
 		 264 aa  63.9  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3606  3-oxoadipate enol-lactonase  28.84 
 
 		 265 aa  63.9  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0197721  hitchhiker  0.000894779 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0750  alpha/beta hydrolase fold  26.89 
 
 		 281 aa  63.9  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0913521  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0764  alpha/beta hydrolase fold  26.89 
 
 		 281 aa  63.9  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.116226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4421  alpha/beta hydrolase fold protein  24.1 
 
 		 299 aa  63.9  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54655  predicted protein  23.42 
 
 		 293 aa  63.9  0.000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0744  alpha/beta hydrolase fold  26.89 
 
 		 281 aa  63.9  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.477105  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3689  alpha/beta hydrolase fold protein  26.28 
 
 		 302 aa  63.2  0.000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  26 
 
 		 267 aa  62.8  0.000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1008  alpha/beta hydrolase fold protein  24.72 
 
 		 275 aa  62.8  0.000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6126  3-oxoadipate enol-lactonase  24.14 
 
 		 263 aa  62.8  0.000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4484  alpha/beta hydrolase fold protein  25.83 
 
 		 283 aa  62.8  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3452  alpha/beta hydrolase fold  24.47 
 
 		 311 aa  62.4  0.000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.156566  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0415  alpha/beta hydrolase fold protein  22.83 
 
 		 253 aa  62.4  0.000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3365  Alpha/beta hydrolase  25.36 
 
 		 264 aa  62.4  0.000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0174  cyclic nucleotide-binding protein  24.9 
 
 		 456 aa  62  0.000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000271627  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3235  alpha/beta hydrolase fold  26.76 
 
 		 316 aa  62  0.000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.423188  normal  0.602457 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1996  alpha/beta hydrolase fold  32.8 
 
 		 254 aa  62  0.000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.507588  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2250  B-ketoadipate enol-lactone hydrolase transmembrane protein  30.12 
 
 		 270 aa  61.6  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0146051  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>