More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2446 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_2446  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 		 309 aa  617  1e-176  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.969901  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3291  alpha/beta hydrolase fold protein  32.85 
 
 		 296 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2916  alpha/beta hydrolase fold protein  31.67 
 
 		 284 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1331  Alpha/beta hydrolase fold  28.47 
 
 		 278 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000258733 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3391  alpha/beta hydrolase fold  33.56 
 
 		 336 aa  109  5e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.445153  normal  0.48468 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1183  Alpha/beta hydrolase  31.23 
 
 		 279 aa  107  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.330922  normal  0.0773535 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1095  alpha/beta hydrolase fold  31.96 
 
 		 302 aa  105  8e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1320  alpha/beta hydrolase fold  29.76 
 
 		 345 aa  104  2e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.543574  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  35.04 
 
 		 299 aa  103  5e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0074  alpha/beta hydrolase fold  27.6 
 
 		 275 aa  102  6e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.224768  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3858  alpha/beta hydrolase fold  30.23 
 
 		 283 aa  100  2e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.167759  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3522  alpha/beta hydrolase fold protein  30.24 
 
 		 289 aa  100  3e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.328717  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2274  2-hydroxymuconic semialdehyde hydrolase  32.97 
 
 		 291 aa  100  4e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3689  alpha/beta hydrolase fold protein  30.42 
 
 		 302 aa  98.2  2e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3822  alpha/beta hydrolase fold  30.74 
 
 		 308 aa  97.8  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  31.32 
 
 		 264 aa  97.4  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3451  alpha/beta hydrolase fold protein  28.92 
 
 		 340 aa  97.4  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2456  alpha/beta hydrolase fold  30.11 
 
 		 278 aa  97.8  2e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0153839  normal  0.505758 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4130  alpha/beta hydrolase fold protein  30.74 
 
 		 301 aa  97.4  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3130  alpha/beta hydrolase fold  28.92 
 
 		 343 aa  97.1  3e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0116924  normal  0.0589149 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3327  alpha/beta hydrolase fold  29.37 
 
 		 340 aa  97.1  3e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.445805 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0312  alpha/beta hydrolase fold  29.33 
 
 		 285 aa  97.1  3e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5020  putative alpha/beta hydrolase  28.77 
 
 		 334 aa  96.7  4e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.479747 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0323  alpha/beta hydrolase fold  28.07 
 
 		 285 aa  96.7  4e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.619665  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0333  alpha/beta hydrolase fold  28.07 
 
 		 285 aa  96.7  4e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.240836 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  31.6 
 
 		 308 aa  96.3  5e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0725  alpha/beta hydrolase fold protein  31.47 
 
 		 286 aa  95.9  7e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0592  alpha/beta hydrolase fold  31.73 
 
 		 288 aa  95.9  7e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1265  alpha/beta hydrolase fold protein  30.15 
 
 		 267 aa  95.9  8e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.463266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0341  alpha/beta hydrolase fold  31.41 
 
 		 265 aa  95.5  9e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4183  alpha/beta hydrolase fold  29.79 
 
 		 279 aa  95.5  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.221808 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2882  alpha/beta hydrolase fold  31.85 
 
 		 276 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.035123 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0221  alpha/beta hydrolase fold  42.74 
 
 		 286 aa  95.1  1e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  28.33 
 
 		 314 aa  94.4  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7140  alpha/beta hydrolase fold protein  28.77 
 
 		 425 aa  94.4  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3786  Alpha/beta hydrolase fold  31.01 
 
 		 274 aa  94.4  3e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00563208  hitchhiker  0.00293132 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4621  alpha/beta hydrolase fold  32.87 
 
 		 283 aa  94  3e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3545  alpha/beta hydrolase fold protein  32.87 
 
 		 283 aa  94  3e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.158387  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0298  B-ketoadipate enol-lactone hydrolase protein  30.21 
 
 		 279 aa  92.8  6e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0572  alpha/beta hydrolase fold  30.9 
 
 		 266 aa  92.4  8e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0569  alpha/beta hydrolase fold protein  32.27 
 
 		 270 aa  92.4  9e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1491  alpha/beta hydrolase fold  31.14 
 
 		 297 aa  91.7  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00412587  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1108  alpha/beta hydrolase fold  30.18 
 
 		 246 aa  92.4  1e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00367251  hitchhiker  0.00365287 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1754  alpha/beta hydrolase fold  28.09 
 
 		 277 aa  91.3  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3014  alpha/beta hydrolase fold protein  29.3 
 
 		 340 aa  91.7  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1253  alpha/beta hydrolase fold  29.93 
 
 		 336 aa  90.5  3e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.264331  normal  0.195785 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4206  3-oxoadipate enol-lactonase  27.72 
 
 		 268 aa  90.9  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5919  alpha/beta hydrolase fold protein  29.7 
 
 		 381 aa  90.1  4e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.539909 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2308  alpha/beta fold family hydrolase  25 
 
 		 283 aa  90.5  4e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.628895 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4525  alpha/beta hydrolase fold  27.97 
 
 		 290 aa  89.7  6e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.212373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3602  alpha/beta hydrolase fold  32.84 
 
 		 264 aa  89.7  6e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1788  alpha/beta hydrolase fold protein  24.58 
 
 		 279 aa  89.4  6e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0842408  hitchhiker  0.00140329 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4321  alpha/beta hydrolase fold  29.35 
 
 		 280 aa  89.7  6e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0798376 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0174  cyclic nucleotide-binding protein  28.96 
 
 		 456 aa  89.4  8e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000271627  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1306  alpha/beta hydrolase fold  30.99 
 
 		 276 aa  89  9e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.258208  normal  0.0573899 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3171  alpha/beta hydrolase fold protein  26.87 
 
 		 270 aa  89  9e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3361  alpha/beta hydrolase fold  28.52 
 
 		 340 aa  88.6  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.013073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0952  alpha/beta hydrolase fold  28.47 
 
 		 350 aa  88.6  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167574  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0511  alpha/beta hydrolase fold protein  29.39 
 
 		 265 aa  88.6  1e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327319  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1253  alpha/beta hydrolase fold  30.99 
 
 		 298 aa  88.2  1e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.188153  normal  0.590935 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  30 
 
 		 270 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2798  alpha/beta hydrolase fold protein  29.89 
 
 		 270 aa  89  1e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7077  3-oxoadipate enol-lactonase  27.31 
 
 		 269 aa  88.2  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.335255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2626  alpha/beta hydrolase fold  24.47 
 
 		 330 aa  88.2  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0626174  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1412  alpha/beta fold family hydrolase  31.47 
 
 		 295 aa  88.2  2e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.405065 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0135  alpha/beta hydrolase fold  29.45 
 
 		 265 aa  88.2  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2918  alpha/beta hydrolase fold  31.18 
 
 		 312 aa  88.2  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.906544 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1166  alpha/beta hydrolase fold protein  26.55 
 
 		 333 aa  88.2  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.110517 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6136  alpha/beta hydrolase fold protein  33.09 
 
 		 294 aa  87.4  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.015637 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3110  alpha/beta hydrolase fold protein  30.74 
 
 		 304 aa  88.2  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.228638  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3157  alpha/beta fold family hydrolase  28.62 
 
 		 266 aa  87  3e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0531  alpha/beta hydrolase fold protein  31.23 
 
 		 273 aa  87.4  3e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3664  alpha/beta hydrolase fold protein  27.13 
 
 		 350 aa  87.4  3e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09348  probable hydrolytic enzyme  26.57 
 
 		 331 aa  87.4  3e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0100804  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  27.18 
 
 		 287 aa  87.4  3e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2754  alpha/beta hydrolase fold protein  28.73 
 
 		 284 aa  87  3e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0912  alpha/beta hydrolase fold  30.56 
 
 		 264 aa  87.4  3e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3528  hypothetical protein  29.02 
 
 		 269 aa  87  3e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000191254  unclonable  0.00000397849 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3344  alpha/beta hydrolase fold  29.74 
 
 		 289 aa  87  3e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2786  alpha/beta hydrolase fold  31.21 
 
 		 283 aa  87  3e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.200125 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0778  alpha/beta hydrolase fold  28.37 
 
 		 290 aa  87  4e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.588108  normal  0.620375 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  27.7 
 
 		 265 aa  86.7  4e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1968  putative alpha/beta hydrolase fold  29.5 
 
 		 259 aa  87  4e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0153168  normal  0.143128 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0527  inner-membrane translocator  26.42 
 
 		 562 aa  87  4e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.142697  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2696  alpha/beta hydrolase fold  31.54 
 
 		 312 aa  87  4e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.623815  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2964  alpha/beta hydrolase fold  28.9 
 
 		 282 aa  87  4e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1637  alpha/beta hydrolase fold  26.28 
 
 		 287 aa  87  4e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3775  alpha/beta hydrolase fold protein  29.17 
 
 		 309 aa  86.7  4e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  29.5 
 
 		 270 aa  86.3  5e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0672  alpha/beta hydrolase fold  32.21 
 
 		 315 aa  86.3  5e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.240082 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0392  alpha/beta hydrolase fold  26.22 
 
 		 273 aa  86.7  5e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2437  alpha/beta hydrolase fold  32.36 
 
 		 251 aa  86.7  5e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  27.34 
 
 		 262 aa  86.3  6e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4676  3-oxoadipate enol-lactonase  31.6 
 
 		 259 aa  86.3  6e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.256206  normal  0.172762 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1459  alpha/beta hydrolase fold  27.18 
 
 		 276 aa  86.3  6e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  30.42 
 
 		 295 aa  86.3  6e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3844  alpha/beta hydrolase fold protein  31.34 
 
 		 289 aa  85.9  7e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.185404  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1434  alpha/beta hydrolase  31.2 
 
 		 261 aa  86.3  7e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1258  putative hydrolase  30.8 
 
 		 312 aa  85.9  8e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  29.29 
 
 		 270 aa  85.9  8e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.114885 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>