More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3245 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_3245  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
271 aa  552  1e-156  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3429  alpha/beta hydrolase fold protein  62.45 
 
 
270 aa  353  2e-96  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.210707 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0832  alpha/beta hydrolase fold  60.59 
 
 
266 aa  335  3.9999999999999995e-91  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0843  Alpha/beta hydrolase fold  53.9 
 
 
272 aa  285  4e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2628  non-heme peroxidase, putative  49.25 
 
 
273 aa  246  3e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2092  alpha/beta hydrolase fold  45.56 
 
 
275 aa  217  2e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.168465  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1663  alpha/beta hydrolase fold  43.58 
 
 
271 aa  199  3.9999999999999996e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3855  alpha/beta hydrolase fold  40.37 
 
 
270 aa  167  2e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3873  alpha/beta hydrolase fold protein  41.42 
 
 
271 aa  157  1e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.627652  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3789  alpha/beta hydrolase fold  41.42 
 
 
271 aa  152  5.9999999999999996e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1664  biotin biosynthesis protein  35.52 
 
 
266 aa  148  9e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000138969  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5163  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 
272 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.365318  normal  0.119098 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5253  arylesterase, putative  32.97 
 
 
272 aa  135  5e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0220  alpha/beta hydrolase fold  32.6 
 
 
272 aa  136  5e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.723702 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12958  arylesterase (aryl-ester hydrolase)  31 
 
 
276 aa  135  8e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5467  alpha/beta hydrolase fold protein  32.22 
 
 
273 aa  132  5e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1463  alpha/beta hydrolase fold  34.17 
 
 
273 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.879851  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6365  alpha/beta hydrolase fold  34.17 
 
 
273 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0929699  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0675  arylesterase  32.23 
 
 
272 aa  129  6e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3458  Alpha/beta hydrolase fold  33.21 
 
 
274 aa  128  8.000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.419988  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2901  alpha/beta hydrolase fold  32.6 
 
 
272 aa  128  8.000000000000001e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0641701  normal  0.105734 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3732  Alpha/beta hydrolase fold-1  40.38 
 
 
286 aa  128  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.093145  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7032  alpha/beta hydrolase fold  33.45 
 
 
273 aa  126  3e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.137031  normal  0.207733 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3265  Alpha/beta hydrolase fold  30.37 
 
 
272 aa  125  6e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.279729  normal  0.0341286 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2195  alpha/beta hydrolase fold  28.24 
 
 
297 aa  124  1e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.131585  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4478  Alpha/beta hydrolase fold  30.4 
 
 
272 aa  124  2e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.785695  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1605  alpha/beta hydrolase fold  32.95 
 
 
334 aa  124  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.695033  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3996  alpha/beta hydrolase fold  32.59 
 
 
277 aa  124  2e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4936  alpha/beta hydrolase fold  32.96 
 
 
273 aa  123  3e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000404482 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3404  alpha/beta hydrolase fold protein  32.69 
 
 
273 aa  123  4e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4854  alpha/beta hydrolase fold  31.11 
 
 
273 aa  122  5e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.395513  normal  0.376362 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5598  alpha/beta hydrolase fold  32.59 
 
 
273 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.33887  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7597  non-heme chloroperoxidase  31.37 
 
 
272 aa  121  9.999999999999999e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1809  non-heme chloroperoxidase  30.74 
 
 
273 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.308788  normal  0.0377897 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2084  alpha/beta hydrolase fold protein  32.6 
 
 
275 aa  121  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.446473  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0314  alpha/beta hydrolase fold  31.97 
 
 
303 aa  120  1.9999999999999998e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.000332733  normal  0.010488 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5814  alpha/beta hydrolase fold  32.59 
 
 
273 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.086599  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0874  alpha/beta hydrolase fold protein  27.76 
 
 
301 aa  119  6e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0621  alpha/beta hydrolase fold  31.95 
 
 
277 aa  119  7e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.600914  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5284  alpha/beta hydrolase fold  30.63 
 
 
273 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2613  alpha/beta hydrolase  31.95 
 
 
270 aa  118  9.999999999999999e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.101876  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2162  bioH protein  31.06 
 
 
266 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4821  alpha/beta hydrolase fold  32.33 
 
 
277 aa  117  3e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02370  non-heme chloroperoxidase (abhydrolase_1 family)  29.93 
 
 
274 aa  117  3e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.165493  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3239  chloride peroxidase  32.14 
 
 
273 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.826064  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1131  bioH protein  30.71 
 
 
263 aa  116  5e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0256  alpha/beta hydrolase fold protein  29.12 
 
 
292 aa  115  6e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.022774  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3177  alpha/beta hydrolase fold  31.05 
 
 
273 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0955063  normal  0.862905 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2090  bromoperoxidase  30.97 
 
 
278 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4227  alpha/beta hydrolase fold protein  30.26 
 
 
266 aa  114  1.0000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3450  alpha/beta hydrolase fold  30.51 
 
 
273 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2523  alpha/beta hydrolase fold protein  30.4 
 
 
269 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.10927  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2279  non-heme chloroperoxidase  31.88 
 
 
322 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.294789  normal  0.290543 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2407  alpha/beta hydrolase fold protein  31.39 
 
 
275 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0419558 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3804  alpha/beta hydrolase fold  33.46 
 
 
294 aa  113  3e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4112  alpha/beta hydrolase fold protein  30.15 
 
 
278 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.308124  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4148  alpha/beta hydrolase fold protein  32.21 
 
 
278 aa  112  6e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0778335  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3736  alpha/beta hydrolase fold  30.15 
 
 
305 aa  112  9e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.265867  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2381  putative non-heme chloroperoxidase  29.63 
 
 
273 aa  112  9e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.228721  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3969  alpha/beta hydrolase fold  32.36 
 
 
276 aa  111  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3997  alpha/beta hydrolase fold  31.14 
 
 
338 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.481692  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3158  bromoperoxidase  30.57 
 
 
278 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00429075  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5079  alpha/beta hydrolase fold  31.07 
 
 
277 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5209  Alpha/beta hydrolase fold  28.89 
 
 
273 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1384  alpha/beta hydrolase fold protein  30.57 
 
 
280 aa  110  2.0000000000000002e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.291568  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2267  alpha/beta hydrolase fold  32.2 
 
 
278 aa  110  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00239733 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3170  alpha/beta hydrolase fold  31.07 
 
 
277 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2815  carboxylesterase  30.9 
 
 
238 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5198  alpha/beta hydrolase fold  31.07 
 
 
277 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.581838  hitchhiker  0.00844034 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5868  alpha/beta hydrolase fold protein  34.44 
 
 
281 aa  110  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.139447 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2941  bromoperoxidase  29.85 
 
 
278 aa  110  3e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2915  arylesterase (aryl-ester hydrolase)  29.85 
 
 
278 aa  110  3e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3173  bromoperoxidase  29.85 
 
 
278 aa  110  3e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3165  bromoperoxidase  29.85 
 
 
278 aa  110  3e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0230592  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1149  alpha/beta hydrolase fold  29.55 
 
 
276 aa  110  3e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.163686 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0159  alpha/beta hydrolase fold protein  31.37 
 
 
277 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3150  bromoperoxidase  30.11 
 
 
278 aa  109  5e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.908823  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2427  alpha/beta hydrolase fold  33.71 
 
 
278 aa  109  5e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5030  Alpha/beta hydrolase fold  30.26 
 
 
274 aa  109  6e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.414449 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3745  Alpha/beta hydrolase  29.79 
 
 
280 aa  109  6e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.173154  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4632  bioH protein  29.7 
 
 
264 aa  108  1e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0107  Alpha/beta hydrolase fold  33.09 
 
 
286 aa  107  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6134  alpha/beta hydrolase fold  27.84 
 
 
273 aa  108  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.639564  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2561  alpha/beta hydrolase fold  33.46 
 
 
286 aa  108  1e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0975578  normal  0.452958 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001876  biotin synthesis protein BioH  29.84 
 
 
261 aa  107  2e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4969  Alpha/beta hydrolase  28.52 
 
 
273 aa  107  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0107972 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5600  alpha/beta hydrolase fold  28.52 
 
 
324 aa  107  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.350573  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1046  alpha/beta hydrolase fold protein  32.47 
 
 
274 aa  107  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5816  alpha/beta hydrolase fold  28.52 
 
 
324 aa  107  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.953252  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1315  alpha/beta hydrolase fold  30.91 
 
 
274 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.991982  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1520  alpha/beta hydrolase fold  29.52 
 
 
273 aa  107  3e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.495724  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2331  alpha/beta hydrolase fold  29.15 
 
 
274 aa  106  3e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0600878  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1286  chloride peroxidase  30.91 
 
 
274 aa  106  3e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.52779  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4250  putative bioH protein  27.47 
 
 
246 aa  107  3e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1303  chloride peroxidase  30.91 
 
 
274 aa  106  3e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.199298  normal  0.019602 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3872  biotin biosynthesis protein (BioH)  28.63 
 
 
246 aa  106  4e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2307  alpha/beta fold family hydrolase  27.1 
 
 
277 aa  106  4e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3362  alpha/beta hydrolase fold  28.89 
 
 
290 aa  106  4e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.351371  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0879  alpha/beta hydrolase fold  28.09 
 
 
278 aa  106  5e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.101145 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2099  biotin biosynthesis protein, BioH  30.12 
 
 
255 aa  105  6e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>