More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0099 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008530  LGAS_0099  alpha/beta fold family hydrolase  100 
 
 
220 aa  451  1.0000000000000001e-126  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000675213 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0648  alpha/beta hydrolase fold protein  32.84 
 
 
226 aa  112  5e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0281045 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1808  hypothetical protein  32.04 
 
 
219 aa  111  1.0000000000000001e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7140  alpha/beta hydrolase fold protein  29.3 
 
 
425 aa  103  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5414  alpha/beta hydrolase fold protein  30.18 
 
 
261 aa  100  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0420195 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3241  putative hydrolase or acyltransferase  29.29 
 
 
296 aa  99.8  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3317  putative hydrolase or acyltransferase  29.54 
 
 
296 aa  99.8  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3325  putative hydrolase or acyltransferase  29.11 
 
 
296 aa  98.6  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0252993  normal  0.633189 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3421  putative hydrolase or acyltransferase  29.11 
 
 
296 aa  97.8  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0121666 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2473  hypothetical protein  28.83 
 
 
286 aa  94.4  1e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1788  alpha/beta hydrolase fold protein  30.56 
 
 
279 aa  94  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0842408  hitchhiker  0.00140329 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1067  alpha/beta hydrolase fold protein  28.02 
 
 
239 aa  93.6  2e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1287  alpha/beta hydrolase fold protein  31.31 
 
 
255 aa  92  6e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00130508  normal  0.0205637 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2505  alpha/beta family hydrolase  28.7 
 
 
279 aa  90.5  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4536  alpha/beta hydrolase fold protein  26.32 
 
 
279 aa  89.7  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.821334  normal  0.0123379 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1622  alpha/beta hydrolase fold  28.85 
 
 
284 aa  89.7  3e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3027  alpha/beta hydrolase fold protein  28.57 
 
 
285 aa  89.7  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1695  alpha/beta hydrolase fold protein  28.46 
 
 
284 aa  88.2  8e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.194275  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2120  alpha/beta hydrolase fold protein  23.64 
 
 
284 aa  87.8  1e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.466438 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4878  alpha/beta hydrolase fold  25.33 
 
 
279 aa  85.5  5e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0658691 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2251  Alpha/beta hydrolase fold-1  27.27 
 
 
284 aa  84.7  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.154511  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4384  alpha/beta hydrolase fold protein  24.2 
 
 
283 aa  82.4  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.944451 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2398  alpha/beta hydrolase fold protein  27.02 
 
 
282 aa  82  0.000000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.240634  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1698  alpha/beta hydrolase fold  25.4 
 
 
397 aa  81.6  0.000000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4082  alpha/beta hydrolase fold  26.78 
 
 
272 aa  81.6  0.000000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4064  alpha/beta hydrolase fold  23.64 
 
 
283 aa  81.3  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0733  alpha/beta hydrolase fold  26.09 
 
 
280 aa  80.1  0.00000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.204474  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2627  alpha/beta hydrolase fold protein  34.86 
 
 
275 aa  79  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.546474 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0534  putative peroxidase  25.74 
 
 
281 aa  78.6  0.00000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.476086  normal  0.88579 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1039  alpha/beta hydrolase fold protein  25 
 
 
277 aa  78.2  0.00000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2090  putative hydrolase  28.65 
 
 
233 aa  77.8  0.0000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.787524  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0800  alpha/beta hydrolase fold  27.93 
 
 
267 aa  77.4  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.156653 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0653  alpha/beta hydrolase fold protein  25.4 
 
 
310 aa  78.2  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.754721  normal  0.0538261 
 
 
-
 
NC_004310  BR2178  hydrolase, putative  28.11 
 
 
233 aa  76.6  0.0000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  26.15 
 
 
265 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0446  3-oxoadipate enol-lactonase  25.97 
 
 
264 aa  77  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2132  hypothetical protein  26.15 
 
 
247 aa  76.3  0.0000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1310  alpha/beta hydrolase fold protein  25.09 
 
 
301 aa  75.9  0.0000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2992  Haloacetate dehalogenase H-1  32.76 
 
 
295 aa  75.5  0.0000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.779666  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2181  alpha/beta hydrolase fold  24.58 
 
 
273 aa  75.9  0.0000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5301  putative oxidoreductase protein  23.83 
 
 
258 aa  75.5  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0102616  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13198  peroxidase  37.68 
 
 
286 aa  75.9  0.0000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.285642 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1299  hypothetical protein  25.45 
 
 
262 aa  75.5  0.0000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000000570356  normal  0.587837 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1790  alpha/beta hydrolase fold  25.59 
 
 
287 aa  75.1  0.0000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.333084  hitchhiker  0.00365614 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0916  alpha/beta hydrolase fold protein  40.54 
 
 
252 aa  74.7  0.000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3478  alpha/beta hydrolase fold  27.76 
 
 
295 aa  74.3  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.497712 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3907  alpha/beta hydrolase fold  25.96 
 
 
269 aa  73.2  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000000804884  normal  0.943348 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3257  alpha/beta hydrolase fold protein  32.5 
 
 
302 aa  73.2  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4021  alpha/beta hydrolase fold protein  25.96 
 
 
269 aa  73.2  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  unclonable  0.000000197083  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1236  alpha/beta fold family hydrolase  24.88 
 
 
239 aa  72.8  0.000000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000165889  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4916  alpha/beta hydrolase fold  36.61 
 
 
277 aa  73.2  0.000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.503338  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3365  alpha/beta hydrolase fold  26.89 
 
 
265 aa  72.8  0.000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.6363  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3798  alpha/beta hydrolase fold protein  25.6 
 
 
258 aa  72.8  0.000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2417  Alpha/beta hydrolase fold  34.45 
 
 
302 aa  72.8  0.000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0271863 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4521  alpha/beta hydrolase fold  32.04 
 
 
270 aa  72.4  0.000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.78404  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1968  putative alpha/beta hydrolase fold  22.66 
 
 
259 aa  72.4  0.000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0153168  normal  0.143128 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6643  putative triacylglycerol lipase  24.77 
 
 
275 aa  72  0.000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.192902  normal  0.181736 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1483  alpha/beta hydrolase fold  24.71 
 
 
275 aa  72  0.000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.768044  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3606  alpha/beta hydrolase fold  27.31 
 
 
265 aa  72  0.000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000510854 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2348  alpha/beta hydrolase fold protein  36.84 
 
 
275 aa  71.6  0.000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3581  alpha/beta hydrolase fold  31.67 
 
 
302 aa  71.2  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.950076 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0419  alpha/beta hydrolase fold  34.07 
 
 
270 aa  70.9  0.00000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5939  3-oxoadipate enol-lactonase  26.56 
 
 
275 aa  71.2  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.178478 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0911  alpha/beta hydrolase fold protein  26.03 
 
 
276 aa  70.9  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.139412 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1248  alpha/beta hydrolase fold-containing protein  37.04 
 
 
311 aa  70.9  0.00000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4433  alpha/beta hydrolase fold protein  27.17 
 
 
285 aa  70.1  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1764  alpha/beta hydrolase fold  24.09 
 
 
271 aa  70.9  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.718391  normal  0.0637777 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2731  hydrolase, alpha/beta fold family  35.51 
 
 
258 aa  70.1  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4415  Alpha/beta hydrolase fold  32.71 
 
 
295 aa  70.1  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  23.93 
 
 
267 aa  69.7  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  25.96 
 
 
270 aa  69.7  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7536  Alpha/beta hydrolase  24.2 
 
 
270 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0912  alpha/beta hydrolase fold  31.4 
 
 
264 aa  69.3  0.00000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1168  alpha/beta hydrolase fold protein  24.16 
 
 
271 aa  68.9  0.00000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.375352  normal  0.0130652 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9382  alpha/beta hydrolase fold protein  25 
 
 
259 aa  69.3  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0531  alpha/beta hydrolase fold  27.03 
 
 
264 aa  68.9  0.00000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0176995 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5863  alpha/beta hydrolase fold  23.11 
 
 
270 aa  68.6  0.00000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.648074  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4562  alpha/beta hydrolase fold protein  25.42 
 
 
260 aa  68.6  0.00000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0378  alpha/beta fold family hydrolase  24.24 
 
 
244 aa  68.6  0.00000000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0818284  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3177  Alpha/beta hydrolase fold-1  24.22 
 
 
272 aa  68.6  0.00000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.97494  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4235  alpha/beta hydrolase fold  32.76 
 
 
252 aa  68.6  0.00000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.125145  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  25.21 
 
 
262 aa  68.2  0.00000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4032  alpha/beta hydrolase  34.51 
 
 
294 aa  68.2  0.00000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.118586  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1760  alpha/beta hydrolase fold  31.67 
 
 
302 aa  68.2  0.00000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.176394  normal  0.0428772 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1232  alpha/beta hydrolase fold protein  32.74 
 
 
277 aa  67.8  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1826  alpha/beta hydrolase fold  35.37 
 
 
285 aa  67.8  0.0000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.363916  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2555  alpha/beta hydrolase fold protein  23.7 
 
 
234 aa  68.2  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.249679  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1382  alpha/beta hydrolase fold  25.31 
 
 
287 aa  68.2  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.327578  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0769  alpha/beta fold family hydrolase  27.88 
 
 
259 aa  67.8  0.0000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.290033  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1825  alpha/beta hydrolase fold  29.83 
 
 
243 aa  67.8  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.388616  normal  0.284005 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0977  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  23.04 
 
 
266 aa  67  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.245429  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3098  alpha/beta fold family hydrolase  36.04 
 
 
300 aa  67  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.833481  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1035  alpha/beta hydrolase fold protein  34.82 
 
 
303 aa  66.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.493601  normal  0.43821 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2995  3-oxoadipate enol-lactonase  36.04 
 
 
300 aa  67  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000386793  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5458  alpha/beta hydrolase fold protein  24.77 
 
 
270 aa  67  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.306625  normal  0.0166355 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3343  alpha/beta fold family hydrolase  36.04 
 
 
300 aa  67  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2869  alpha/beta hydrolase fold protein  36.28 
 
 
291 aa  67.4  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.415646  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3320  hydrolase, alpha/beta fold family  36.04 
 
 
300 aa  67  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3210  alpha/beta hydrolase fold protein  31.95 
 
 
271 aa  67  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.45774  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3585  alpha/beta hydrolase fold  26.15 
 
 
270 aa  67  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>