More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4235 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4235  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 252 aa  506  1e-143  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.125145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4236  alpha/beta hydrolase fold  40.48 
 
 		 255 aa  135  5e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0388465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1653  alpha/beta hydrolase fold  33.06 
 
 		 274 aa  134  9e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0637812  hitchhiker  0.00860523 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3776  alpha/beta hydrolase fold  47.41 
 
 		 361 aa  101  1e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.904669  decreased coverage  0.00241214 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4384  alpha/beta hydrolase fold protein  29.55 
 
 		 283 aa  97.4  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.944451 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0648  alpha/beta hydrolase fold protein  34.18 
 
 		 226 aa  96.3  4e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0281045 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3055  alpha/beta hydrolase fold  29.92 
 
 		 277 aa  95.5  8e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0115287 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3361  alpha/beta hydrolase fold  31.99 
 
 		 340 aa  94.7  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.013073  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3014  alpha/beta hydrolase fold protein  31.62 
 
 		 340 aa  94  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  29.37 
 
 		 314 aa  93.2  3e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1078  alpha/beta hydrolase fold protein  25.3 
 
 		 253 aa  93.2  4e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0391  alpha/beta hydrolase fold  28.46 
 
 		 291 aa  93.2  4e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0403  alpha/beta hydrolase fold  28.46 
 
 		 291 aa  93.2  4e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0412  alpha/beta hydrolase fold  28.46 
 
 		 291 aa  93.2  4e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0866892  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2307  alpha/beta fold family hydrolase  24.03 
 
 		 277 aa  92.4  5e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0952  alpha/beta hydrolase fold  44.92 
 
 		 350 aa  92.4  5e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167574  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3291  alpha/beta hydrolase fold protein  30.57 
 
 		 296 aa  92  8e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0994  alpha/beta hydrolase fold  27.48 
 
 		 281 aa  91.7  1e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.795664 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  29.37 
 
 		 295 aa  91.7  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1823  alpha/beta hydrolase fold protein  31.85 
 
 		 322 aa  90.1  3e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0504  inner-membrane translocator  31.1 
 
 		 571 aa  90.1  3e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.92013  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2410  alpha/beta hydrolase fold protein  31.28 
 
 		 265 aa  90.1  3e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.991498  normal  0.124354 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3606  alpha/beta hydrolase fold  32.18 
 
 		 265 aa  89.4  5e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000510854 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3853  3-oxoadipate enol-lactonase  32.56 
 
 		 396 aa  89.4  5e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126877  normal  0.866495 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1824  alpha/beta hydrolase fold protein  31.14 
 
 		 309 aa  89.4  5e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4064  alpha/beta hydrolase fold  27.71 
 
 		 283 aa  88.6  8e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4246  alpha/beta hydrolase fold  29.18 
 
 		 288 aa  88.6  8e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.912428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12729  hydrolase  26.98 
 
 		 341 aa  88.2  1e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4279  alpha/beta hydrolase fold  28.89 
 
 		 290 aa  87.8  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0429244  normal  0.222336 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1402  alpha/beta hydrolase fold protein  29.78 
 
 		 298 aa  87.8  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0653602  normal  0.476592 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  41.32 
 
 		 299 aa  87.8  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3365  alpha/beta hydrolase fold  29.8 
 
 		 265 aa  87.8  2e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.6363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0531  alpha/beta hydrolase fold protein  35.6 
 
 		 273 aa  86.3  4e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0527  inner-membrane translocator  26.23 
 
 		 562 aa  86.7  4e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.142697  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2400  alpha/beta hydrolase fold  28.79 
 
 		 288 aa  85.9  6e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0986  alpha/beta hydrolase fold protein  30.8 
 
 		 279 aa  85.5  7e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.900551 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2516  hydrolase, alpha/beta fold family  26.83 
 
 		 242 aa  85.5  7e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.018154  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  25.68 
 
 		 270 aa  85.5  8e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5411  alpha/beta hydrolase fold  45.45 
 
 		 328 aa  85.1  9e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.173049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2367  alpha/beta hydrolase fold  30.88 
 
 		 291 aa  84.7  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.926143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3791  alpha/beta hydrolase fold  28.02 
 
 		 287 aa  85.1  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3787  alpha/beta hydrolase fold  28.02 
 
 		 287 aa  85.1  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.265139  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3860  alpha/beta hydrolase fold  28.02 
 
 		 287 aa  85.1  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4681  alpha/beta hydrolase fold protein  28.57 
 
 		 333 aa  84.7  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3645  alpha/beta fold family hydrolase  31.44 
 
 		 292 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0431011  normal  0.291573 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7140  alpha/beta hydrolase fold protein  39.82 
 
 		 425 aa  84.3  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5045  alpha/beta hydrolase fold  43.2 
 
 		 325 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.6879  normal  0.399471 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  27.44 
 
 		 287 aa  84  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2449  alpha/beta fold family hydrolase  27.71 
 
 		 242 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00496811  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1754  alpha/beta hydrolase fold  40.34 
 
 		 277 aa  83.6  0.000000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3952  alpha/beta hydrolase fold  39.34 
 
 		 340 aa  83.6  0.000000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.675872  normal  0.742045 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3567  alpha/beta hydrolase fold  45.9 
 
 		 328 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.253365  hitchhiker  0.00645223 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2085  alpha/beta hydrolase fold  31.11 
 
 		 277 aa  83.6  0.000000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.622652  normal  0.427031 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  27.82 
 
 		 265 aa  83.6  0.000000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0016  alpha/beta hydrolase fold protein  27.48 
 
 		 288 aa  83.2  0.000000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9382  alpha/beta hydrolase fold protein  33.82 
 
 		 259 aa  82.8  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2258  alpha/beta hydrolase fold  30.18 
 
 		 277 aa  82.8  0.000000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.40096  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5440  alpha/beta hydrolase fold  29.6 
 
 		 299 aa  82.8  0.000000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.341918 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2916  alpha/beta hydrolase fold protein  38.14 
 
 		 284 aa  82.4  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2691  3-oxoadipate enol-lactonase  30.08 
 
 		 266 aa  82.4  0.000000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000109702  normal  0.164043 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5837  alpha/beta hydrolase fold  29.6 
 
 		 316 aa  82.4  0.000000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.381935  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  26.32 
 
 		 262 aa  82.4  0.000000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1652  alpha/beta hydrolase fold  29.24 
 
 		 299 aa  82  0.000000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0627  alpha/beta hydrolase fold  29.24 
 
 		 299 aa  82  0.000000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1679  alpha/beta hydrolase fold  29.24 
 
 		 299 aa  82  0.000000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0545  alpha/beta hydrolase fold  29.24 
 
 		 299 aa  82  0.000000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5609  alpha/beta hydrolase fold  29.24 
 
 		 299 aa  82  0.000000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.333622  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1708  alpha/beta hydrolase fold  29.24 
 
 		 299 aa  82  0.000000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0456043  normal  0.790109 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  26.07 
 
 		 270 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2674  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  31.28 
 
 		 282 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.373688  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5377  alpha/beta hydrolase fold protein  38.84 
 
 		 332 aa  80.9  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.306055  normal  0.839367 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2161  alpha/beta hydrolase fold  38.52 
 
 		 340 aa  80.9  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.170083  hitchhiker  0.00519685 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1955  Alpha/beta hydrolase fold  28.85 
 
 		 339 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0521356  normal  0.151931 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0011  alpha/beta hydrolase fold protein  27.35 
 
 		 278 aa  80.9  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00883263 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2302  alpha/beta hydrolase fold  28.4 
 
 		 329 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2172  alpha/beta hydrolase fold  38.52 
 
 		 340 aa  80.9  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  26.85 
 
 		 270 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2263  alpha/beta hydrolase fold  31.11 
 
 		 277 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2218  alpha/beta hydrolase fold  38.52 
 
 		 340 aa  80.9  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.158046  normal  0.0966577 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3317  putative hydrolase or acyltransferase  32.23 
 
 		 296 aa  80.1  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0636  alpha/beta hydrolase fold protein  31.1 
 
 		 263 aa  80.1  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1546  alpha/beta hydrolase fold  40.35 
 
 		 285 aa  80.1  0.00000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.834926  hitchhiker  0.0047604 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3241  putative hydrolase or acyltransferase  33.06 
 
 		 296 aa  80.5  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3858  alpha/beta hydrolase fold  41.88 
 
 		 283 aa  80.5  0.00000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.167759  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0693  alpha/beta hydrolase fold  34.29 
 
 		 258 aa  80.5  0.00000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2178  hydrolase, putative  35.95 
 
 		 233 aa  79.7  0.00000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4878  alpha/beta hydrolase fold  29.39 
 
 		 279 aa  79.7  0.00000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0658691 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4748  alpha/beta hydrolase fold  28.46 
 
 		 295 aa  79.7  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.259792  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1253  alpha/beta hydrolase fold  27.17 
 
 		 298 aa  79.7  0.00000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.188153  normal  0.590935 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0269  alpha/beta fold family hydrolase  24.52 
 
 		 265 aa  79.3  0.00000000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.699859  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6643  putative triacylglycerol lipase  43.1 
 
 		 275 aa  79.3  0.00000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.192902  normal  0.181736 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4699  alpha/beta hydrolase fold  42.62 
 
 		 327 aa  79.3  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3663  alpha/beta hydrolase fold  42.62 
 
 		 327 aa  79.3  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.378837  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0538  alpha/beta hydrolase fold  29.04 
 
 		 299 aa  79  0.00000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.282885  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2445  alpha/beta hydrolase fold  36.89 
 
 		 340 aa  79.3  0.00000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.54824  normal  0.191947 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2090  putative hydrolase  35.29 
 
 		 233 aa  79  0.00000000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.787524  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2120  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 		 284 aa  79  0.00000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.466438 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3421  putative hydrolase or acyltransferase  32.23 
 
 		 296 aa  79  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0121666 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5198  alpha/beta hydrolase fold protein  31.21 
 
 		 290 aa  79  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.45411e-23 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0879  alpha/beta hydrolase fold  28.34 
 
 		 278 aa  78.6  0.00000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.101145 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>