More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_5411 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_5411  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 328 aa  642    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.173049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3567  alpha/beta hydrolase fold  96.04 
 
 		 328 aa  596  1e-169  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.253365  hitchhiker  0.00645223 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2445  Alpha/beta hydrolase  89.35 
 
 		 327 aa  533  1e-150  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4699  alpha/beta hydrolase fold  88.75 
 
 		 327 aa  533  1e-150  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3858  alpha/beta hydrolase fold  88.75 
 
 		 327 aa  532  1e-150  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.387123 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3663  alpha/beta hydrolase fold  88.75 
 
 		 327 aa  533  1e-150  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.378837  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5045  alpha/beta hydrolase fold  85.26 
 
 		 325 aa  527  1e-149  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.6879  normal  0.399471 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0434  alpha/beta hydrolase fold  64.72 
 
 		 318 aa  404  1e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.332302  hitchhiker  0.0000000111123 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0446  alpha/beta hydrolase fold protein  63.16 
 
 		 318 aa  395  1e-109  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.2537  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0099  alpha/beta fold family hydrolase  63.87 
 
 		 324 aa  385  1e-106  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1076  hypothetical protein  63.87 
 
 		 324 aa  385  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.773392  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0402  alpha/beta fold family hydrolase  63.67 
 
 		 324 aa  385  1e-106  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2675  alpha/beta fold family hydrolase  63.87 
 
 		 324 aa  385  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.457884  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1260  alpha/beta fold family hydrolase  63.87 
 
 		 327 aa  385  1e-106  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.809  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2822  alpha/beta fold family hydrolase  63.87 
 
 		 324 aa  385  1e-106  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0118  alpha/beta fold family hydrolase  63.46 
 
 		 326 aa  374  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.347516  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1537  alpha/beta fold family hydrolase  63.46 
 
 		 326 aa  374  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1011  alpha/beta hydrolase fold  45.89 
 
 		 322 aa  259  5.0000000000000005e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.99925 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4934  Alpha/beta hydrolase fold  49.32 
 
 		 320 aa  251  8.000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1140  alpha/beta hydrolase fold  40.45 
 
 		 320 aa  228  1e-58  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.64719  normal  0.115917 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0105  alpha/beta hydrolase  43.15 
 
 		 328 aa  219  5e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00875507  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03823  Alpha/beta hydrolase fold protein  36.51 
 
 		 310 aa  198  1.0000000000000001e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1400  alpha/beta hydrolase fold  32.55 
 
 		 320 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.700473 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1660  putative alpha/beta hydrolase  32.12 
 
 		 319 aa  137  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4675  alpha/beta hydrolase fold  33.22 
 
 		 334 aa  138  2e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.719467  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3987  alpha/beta hydrolase fold  34.93 
 
 		 329 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.38084 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1217  alpha/beta hydrolase fold  30.8 
 
 		 342 aa  127  3e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1420  alpha/beta hydrolase fold  30.91 
 
 		 320 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2945  alpha/beta hydrolase fold protein  31.12 
 
 		 330 aa  126  5e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2782  alpha/beta hydrolase fold protein  31.27 
 
 		 325 aa  124  2e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2534  alpha/beta hydrolase fold  33.45 
 
 		 330 aa  120  3e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2970  alpha/beta hydrolase fold protein  32.67 
 
 		 331 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3278  alpha/beta hydrolase fold  29.62 
 
 		 351 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3577  alpha/beta hydrolase fold protein  28.99 
 
 		 358 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.351187  normal  0.127844 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2743  alpha/beta hydrolase fold  33.45 
 
 		 331 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.529791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5011  putative alpha/beta hydrolase  33.33 
 
 		 350 aa  116  6e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.418737  normal  0.1806 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1380  alpha/beta hydrolase fold  29.08 
 
 		 321 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2029  alpha/beta hydrolase fold  31.83 
 
 		 343 aa  114  2.0000000000000002e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.62215 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5208  alpha/beta hydrolase fold  35.29 
 
 		 346 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.32318  normal  0.119045 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1512  alpha/beta hydrolase fold protein  32.14 
 
 		 311 aa  114  3e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1316  alpha/beta hydrolase fold  32.14 
 
 		 311 aa  114  3e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.541831  normal  0.727397 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2352  alpha/beta hydrolase  31.97 
 
 		 314 aa  113  5e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.517024  normal  0.362082 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2989  alpha/beta hydrolase fold  32.32 
 
 		 339 aa  112  6e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.720192 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2865  alpha/beta hydrolase fold  32.67 
 
 		 331 aa  112  7.000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49180  Alpha/beta hydrolase fold protein  31.99 
 
 		 321 aa  112  7.000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3689  hypothetical protein  30.34 
 
 		 335 aa  112  9e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.29493  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5961  alpha/beta hydrolase fold protein  35.45 
 
 		 345 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.576377  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2167  alpha/beta hydrolase fold  30.43 
 
 		 317 aa  108  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0011  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase)  29.74 
 
 		 317 aa  107  3e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.903743  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5377  alpha/beta hydrolase fold protein  31.72 
 
 		 332 aa  107  3e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.306055  normal  0.839367 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1838  alpha/beta hydrolase fold  31.16 
 
 		 333 aa  106  7e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.886983  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1641  alpha/beta hydrolase fold  29.37 
 
 		 317 aa  105  8e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.24202 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1905  alpha/beta hydrolase fold  33.92 
 
 		 354 aa  105  8e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5140  alpha/beta hydrolase fold  34.94 
 
 		 305 aa  105  1e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.773664  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8725  alpha/beta hydrolase fold protein  32.75 
 
 		 332 aa  105  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0087  alpha/beta hydrolase fold protein  32.03 
 
 		 332 aa  101  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2720  alpha/beta hydrolase fold protein  32.44 
 
 		 342 aa  100  3e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2535  alpha/beta hydrolase fold  31.07 
 
 		 344 aa  99.8  5e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3829  alpha/beta hydrolase fold  30.62 
 
 		 331 aa  99.4  8e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6057  alpha/beta hydrolase fold  33.22 
 
 		 332 aa  99  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00402067  normal  0.493992 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0129  alpha/beta hydrolase fold  34.69 
 
 		 338 aa  97.1  3e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.773269  normal  0.28797 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0056  alpha/beta hydrolase fold  31.62 
 
 		 332 aa  96.7  4e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0102  alpha/beta hydrolase fold  31.29 
 
 		 332 aa  96.7  5e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4425  alpha/beta hydrolase fold  31.69 
 
 		 321 aa  96.3  6e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4806  alpha/beta hydrolase fold  31.69 
 
 		 321 aa  96.3  6e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.786039  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4512  alpha/beta hydrolase fold  31.69 
 
 		 321 aa  96.3  6e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.999363 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1594  putative alpha/beta hydrolase  28.62 
 
 		 320 aa  95.5  1e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.404575 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1827  alpha/beta hydrolase fold  31.47 
 
 		 285 aa  94.4  3e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3466  alpha/beta hydrolase fold protein  30.86 
 
 		 390 aa  92.8  6e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1468  alpha/beta hydrolase fold  29.21 
 
 		 340 aa  92.4  9e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.890362 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5680  alpha/beta hydrolase fold protein  30.28 
 
 		 324 aa  90.5  4e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3884  alpha/beta hydrolase fold  29.05 
 
 		 341 aa  88.6  1e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.447806  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0119  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  40.32 
 
 		 380 aa  86.3  6e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.156608 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3642  alpha/beta hydrolase fold  32.34 
 
 		 379 aa  86.3  7e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.20936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4235  alpha/beta hydrolase fold  45.45 
 
 		 252 aa  85.1  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.125145  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3935  alpha/beta hydrolase fold protein  31.6 
 
 		 371 aa  85.1  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3925  alpha/beta hydrolase fold  32.22 
 
 		 367 aa  83.6  0.000000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.182869  normal  0.384279 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2885  alpha/beta hydrolase fold protein  30.54 
 
 		 275 aa  81.6  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00297178 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2367  alpha/beta hydrolase fold  31.48 
 
 		 291 aa  80.5  0.00000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.926143  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0074  alpha/beta hydrolase fold  33.57 
 
 		 275 aa  80.5  0.00000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.224768  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4082  alpha/beta hydrolase fold  31.47 
 
 		 284 aa  80.1  0.00000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.29051 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  39.39 
 
 		 299 aa  79.7  0.00000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1513  Alpha/beta hydrolase fold  30.47 
 
 		 293 aa  79  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1463  Alpha/beta hydrolase  40.16 
 
 		 278 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.234917  normal  0.480235 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0741  hypothetical protein  34.97 
 
 		 292 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  33.33 
 
 		 265 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4541  alpha/beta hydrolase fold protein  29.8 
 
 		 288 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.707016  normal  0.231702 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3543  alpha/beta hydrolase fold  37.41 
 
 		 268 aa  77.8  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.447096  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0531  alpha/beta hydrolase fold protein  41.94 
 
 		 273 aa  78.2  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4279  alpha/beta hydrolase fold  30.59 
 
 		 290 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0429244  normal  0.222336 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0879  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 278 aa  77.4  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.101145 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1412  alpha/beta fold family hydrolase  35.19 
 
 		 295 aa  77  0.0000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.405065 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2542  alpha/beta hydrolase fold protein  32.2 
 
 		 310 aa  77  0.0000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.106613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0527  inner-membrane translocator  31.4 
 
 		 562 aa  77  0.0000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.142697  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0392  alpha/beta hydrolase fold  35.09 
 
 		 273 aa  76.3  0.0000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0935  alpha/beta hydrolase fold  30.13 
 
 		 288 aa  76.3  0.0000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0423109  normal  0.641404 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4384  alpha/beta hydrolase fold protein  31.82 
 
 		 283 aa  75.1  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.944451 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9212  alpha/beta hydrolase fold protein  37.5 
 
 		 283 aa  75.1  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1981  alpha/beta hydrolase fold  28.63 
 
 		 287 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.578343 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2405  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  41.03 
 
 		 369 aa  74.7  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0222007  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>