More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_0011 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007493  RSP_0011  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase)  100 
 
 
317 aa  630  1e-179  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.903743  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1641  alpha/beta hydrolase fold  99.05 
 
 
317 aa  624  1e-178  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.24202 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2167  alpha/beta hydrolase fold  89.91 
 
 
317 aa  555  1e-157  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1380  alpha/beta hydrolase fold  47.35 
 
 
321 aa  293  2e-78  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1594  putative alpha/beta hydrolase  48.23 
 
 
320 aa  268  5.9999999999999995e-71  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.404575 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2352  alpha/beta hydrolase  45.69 
 
 
314 aa  246  4e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.517024  normal  0.362082 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3278  alpha/beta hydrolase fold  34.48 
 
 
351 aa  168  9e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2029  alpha/beta hydrolase fold  37.34 
 
 
343 aa  168  1e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.62215 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5208  alpha/beta hydrolase fold  35.99 
 
 
346 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.32318  normal  0.119045 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3577  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 
358 aa  157  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.351187  normal  0.127844 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5377  alpha/beta hydrolase fold protein  36.19 
 
 
332 aa  154  2e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.306055  normal  0.839367 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8725  alpha/beta hydrolase fold protein  34.95 
 
 
332 aa  151  1e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0102  alpha/beta hydrolase fold  35.86 
 
 
332 aa  150  3e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3466  alpha/beta hydrolase fold protein  33.44 
 
 
390 aa  150  3e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3689  hypothetical protein  35.27 
 
 
335 aa  149  5e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.29493  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3925  alpha/beta hydrolase fold  36.2 
 
 
367 aa  148  9e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.182869  normal  0.384279 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3935  alpha/beta hydrolase fold protein  34.63 
 
 
371 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5961  alpha/beta hydrolase fold protein  34.35 
 
 
345 aa  147  3e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.576377  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1905  alpha/beta hydrolase fold  34.47 
 
 
354 aa  147  3e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3642  alpha/beta hydrolase fold  34.41 
 
 
379 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.20936  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3987  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 
329 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.38084 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1660  putative alpha/beta hydrolase  31.7 
 
 
319 aa  145  1e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2720  alpha/beta hydrolase fold protein  34.77 
 
 
342 aa  144  3e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0105  alpha/beta hydrolase  33.56 
 
 
328 aa  143  4e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00875507  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0056  alpha/beta hydrolase fold  34.83 
 
 
332 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5011  putative alpha/beta hydrolase  34.14 
 
 
350 aa  140  3e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.418737  normal  0.1806 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49180  Alpha/beta hydrolase fold protein  33.67 
 
 
321 aa  139  7e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4675  alpha/beta hydrolase fold  30.88 
 
 
334 aa  138  1e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.719467  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1217  alpha/beta hydrolase fold  30.5 
 
 
342 aa  137  2e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1420  alpha/beta hydrolase fold  30.42 
 
 
320 aa  136  5e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1316  alpha/beta hydrolase fold  32.44 
 
 
311 aa  135  9e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.541831  normal  0.727397 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0087  alpha/beta hydrolase fold protein  34.01 
 
 
332 aa  135  9e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1512  alpha/beta hydrolase fold protein  32.44 
 
 
311 aa  135  9e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6057  alpha/beta hydrolase fold  34.48 
 
 
332 aa  133  3e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00402067  normal  0.493992 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5140  alpha/beta hydrolase fold  36.72 
 
 
305 aa  132  6e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.773664  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1400  alpha/beta hydrolase fold  29.21 
 
 
320 aa  132  7.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.700473 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2782  alpha/beta hydrolase fold protein  34.94 
 
 
325 aa  130  3e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2535  alpha/beta hydrolase fold  31.91 
 
 
344 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0129  alpha/beta hydrolase fold  34.48 
 
 
338 aa  125  1e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.773269  normal  0.28797 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2989  alpha/beta hydrolase fold  30.07 
 
 
339 aa  124  3e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.720192 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03823  Alpha/beta hydrolase fold protein  29.21 
 
 
310 aa  123  4e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2945  alpha/beta hydrolase fold protein  33.23 
 
 
330 aa  122  5e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2743  alpha/beta hydrolase fold  33.78 
 
 
331 aa  122  7e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.529791  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1140  alpha/beta hydrolase fold  28.22 
 
 
320 aa  120  1.9999999999999998e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.64719  normal  0.115917 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1838  alpha/beta hydrolase fold  32.67 
 
 
333 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.886983  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2534  alpha/beta hydrolase fold  30.45 
 
 
330 aa  120  3.9999999999999996e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3884  alpha/beta hydrolase fold  32.32 
 
 
341 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.447806  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2970  alpha/beta hydrolase fold protein  32.14 
 
 
331 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1011  alpha/beta hydrolase fold  27.92 
 
 
322 aa  117  3e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.99925 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1468  alpha/beta hydrolase fold  31.25 
 
 
340 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.890362 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0434  alpha/beta hydrolase fold  29.66 
 
 
318 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.332302  hitchhiker  0.0000000111123 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0446  alpha/beta hydrolase fold protein  29.32 
 
 
318 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.2537  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5045  alpha/beta hydrolase fold  29.39 
 
 
325 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.6879  normal  0.399471 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3567  alpha/beta hydrolase fold  29.72 
 
 
328 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.253365  hitchhiker  0.00645223 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4699  alpha/beta hydrolase fold  29.03 
 
 
327 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3663  alpha/beta hydrolase fold  29.03 
 
 
327 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.378837  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4934  Alpha/beta hydrolase fold  30.49 
 
 
320 aa  108  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3858  alpha/beta hydrolase fold  28.32 
 
 
327 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.387123 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5411  alpha/beta hydrolase fold  29.75 
 
 
328 aa  108  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.173049  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2445  Alpha/beta hydrolase  28.67 
 
 
327 aa  105  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0402  alpha/beta fold family hydrolase  28.88 
 
 
324 aa  105  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2822  alpha/beta fold family hydrolase  28.74 
 
 
324 aa  104  2e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0099  alpha/beta fold family hydrolase  28.74 
 
 
324 aa  104  2e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1076  hypothetical protein  28.74 
 
 
324 aa  104  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.773392  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3829  alpha/beta hydrolase fold  31.37 
 
 
331 aa  103  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2675  alpha/beta fold family hydrolase  28.74 
 
 
324 aa  103  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.457884  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1260  alpha/beta fold family hydrolase  28.74 
 
 
327 aa  103  3e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.809  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2865  alpha/beta hydrolase fold  29.64 
 
 
331 aa  103  5e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1537  alpha/beta fold family hydrolase  28.52 
 
 
326 aa  92.4  9e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0118  alpha/beta fold family hydrolase  28.52 
 
 
326 aa  92.4  9e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.347516  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1353  alpha/beta hydrolase fold  28.79 
 
 
339 aa  87.8  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.687878  normal  0.202512 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5680  alpha/beta hydrolase fold protein  28.41 
 
 
324 aa  85.5  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0741  hypothetical protein  38.46 
 
 
292 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0608  alpha/beta hydrolase fold  27.65 
 
 
300 aa  82.4  0.000000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1095  alpha/beta hydrolase fold  26.96 
 
 
302 aa  82  0.00000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3504  magnesium-chelatase 30 kDa subunit  26.57 
 
 
302 aa  81.3  0.00000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.477882 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1770  alpha/beta hydrolase fold  25.23 
 
 
323 aa  80.9  0.00000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00973065  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2528  alpha/beta hydrolase fold  27.53 
 
 
301 aa  80.5  0.00000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  29.45 
 
 
287 aa  79.7  0.00000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4806  alpha/beta hydrolase fold  26.41 
 
 
321 aa  79  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.786039  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4425  alpha/beta hydrolase fold  26.41 
 
 
321 aa  79  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4512  alpha/beta hydrolase fold  26.41 
 
 
321 aa  79  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.999363 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3733  magnesium chelatase accessory protein  28.01 
 
 
293 aa  77.8  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.229293  normal  0.0818214 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1080  alpha/beta hydrolase fold  27.15 
 
 
296 aa  77.8  0.0000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0912  alpha/beta hydrolase fold  28.26 
 
 
264 aa  77.8  0.0000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4681  alpha/beta hydrolase fold protein  29.66 
 
 
333 aa  77  0.0000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0475  alpha/beta hydrolase fold protein  28.11 
 
 
290 aa  76.3  0.0000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0531  alpha/beta hydrolase fold  29.55 
 
 
264 aa  76.3  0.0000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0176995 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1620  alpha/beta hydrolase fold  27.9 
 
 
303 aa  75.1  0.000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3776  alpha/beta hydrolase fold  28.62 
 
 
361 aa  73.9  0.000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.904669  decreased coverage  0.00241214 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2918  alpha/beta hydrolase fold  26.12 
 
 
312 aa  73.6  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.906544 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2367  alpha/beta hydrolase fold  27.54 
 
 
291 aa  73.6  0.000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.926143  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0837  alpha/beta fold family hydrolase  24.5 
 
 
299 aa  73.2  0.000000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0527  inner-membrane translocator  24.72 
 
 
562 aa  72.8  0.000000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.142697  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5766  alpha/beta hydrolase fold protein  26.18 
 
 
302 aa  72  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1945  alpha/beta hydrolase fold  25.85 
 
 
346 aa  72  0.00000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0033  alpha/beta hydrolase fold  28.33 
 
 
290 aa  72.4  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2705  alpha/beta hydrolase fold  27.02 
 
 
309 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.601677  normal  0.0914485 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3261  alpha/beta hydrolase fold protein  28.52 
 
 
272 aa  72  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.767293  normal  0.718789 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0952  alpha/beta hydrolase fold  30.66 
 
 
350 aa  71.6  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167574  normal  0.194203 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>