More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_0434 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_0434  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 318 aa  635    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.332302  hitchhiker  0.0000000111123 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0446  alpha/beta hydrolase fold protein  96.04 
 
 		 318 aa  589  1e-167  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.2537  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0402  alpha/beta fold family hydrolase  68.25 
 
 		 324 aa  425  1e-118  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2675  alpha/beta fold family hydrolase  67.62 
 
 		 324 aa  422  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.457884  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0099  alpha/beta fold family hydrolase  67.62 
 
 		 324 aa  422  1e-117  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1076  hypothetical protein  67.62 
 
 		 324 aa  422  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.773392  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1260  alpha/beta fold family hydrolase  67.62 
 
 		 327 aa  422  1e-117  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.809  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2822  alpha/beta fold family hydrolase  67.62 
 
 		 324 aa  422  1e-117  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1537  alpha/beta fold family hydrolase  67.19 
 
 		 326 aa  410  1e-113  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0118  alpha/beta fold family hydrolase  67.19 
 
 		 326 aa  410  1e-113  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.347516  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2445  Alpha/beta hydrolase  67.13 
 
 		 327 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4699  alpha/beta hydrolase fold  66.08 
 
 		 327 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5411  alpha/beta hydrolase fold  65.44 
 
 		 328 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.173049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3567  alpha/beta hydrolase fold  64.43 
 
 		 328 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.253365  hitchhiker  0.00645223 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3663  alpha/beta hydrolase fold  66.08 
 
 		 327 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.378837  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3858  alpha/beta hydrolase fold  66.08 
 
 		 327 aa  397  1e-109  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.387123 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5045  alpha/beta hydrolase fold  63.37 
 
 		 325 aa  390  1e-107  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.6879  normal  0.399471 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1011  alpha/beta hydrolase fold  46.9 
 
 		 322 aa  265  8e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.99925 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4934  Alpha/beta hydrolase fold  46.74 
 
 		 320 aa  247  2e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1140  alpha/beta hydrolase fold  41.5 
 
 		 320 aa  241  1e-62  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.64719  normal  0.115917 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0105  alpha/beta hydrolase  40 
 
 		 328 aa  217  2e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00875507  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03823  Alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 		 310 aa  177  1e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1400  alpha/beta hydrolase fold  31.76 
 
 		 320 aa  153  4e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.700473 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3987  alpha/beta hydrolase fold  33.11 
 
 		 329 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.38084 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4675  alpha/beta hydrolase fold  32.31 
 
 		 334 aa  138  1e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.719467  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2029  alpha/beta hydrolase fold  33.11 
 
 		 343 aa  138  2e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.62215 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2534  alpha/beta hydrolase fold  32.59 
 
 		 330 aa  135  7.000000000000001e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1420  alpha/beta hydrolase fold  30.82 
 
 		 320 aa  135  9e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1660  putative alpha/beta hydrolase  30.36 
 
 		 319 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2989  alpha/beta hydrolase fold  31.29 
 
 		 339 aa  132  1.0000000000000001e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.720192 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1217  alpha/beta hydrolase fold  31.9 
 
 		 342 aa  131  1.0000000000000001e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3278  alpha/beta hydrolase fold  30.67 
 
 		 351 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2945  alpha/beta hydrolase fold protein  27.65 
 
 		 330 aa  125  1e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2782  alpha/beta hydrolase fold protein  29.39 
 
 		 325 aa  123  4e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3577  alpha/beta hydrolase fold protein  29.71 
 
 		 358 aa  122  6e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.351187  normal  0.127844 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1905  alpha/beta hydrolase fold  31.21 
 
 		 354 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2970  alpha/beta hydrolase fold protein  30.26 
 
 		 331 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5011  putative alpha/beta hydrolase  28.9 
 
 		 350 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.418737  normal  0.1806 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2352  alpha/beta hydrolase  30.26 
 
 		 314 aa  117  3e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.517024  normal  0.362082 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0056  alpha/beta hydrolase fold  30.47 
 
 		 332 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8725  alpha/beta hydrolase fold protein  31.12 
 
 		 332 aa  115  7.999999999999999e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0011  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase)  29.66 
 
 		 317 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.903743  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0102  alpha/beta hydrolase fold  30.11 
 
 		 332 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1641  alpha/beta hydrolase fold  29.28 
 
 		 317 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.24202 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49180  Alpha/beta hydrolase fold protein  27.72 
 
 		 321 aa  114  2.0000000000000002e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2743  alpha/beta hydrolase fold  29.7 
 
 		 331 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.529791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6057  alpha/beta hydrolase fold  31.69 
 
 		 332 aa  112  8.000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00402067  normal  0.493992 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0087  alpha/beta hydrolase fold protein  29.75 
 
 		 332 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5377  alpha/beta hydrolase fold protein  28.57 
 
 		 332 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.306055  normal  0.839367 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2167  alpha/beta hydrolase fold  28.52 
 
 		 317 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1838  alpha/beta hydrolase fold  30.63 
 
 		 333 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.886983  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3689  hypothetical protein  30.08 
 
 		 335 aa  106  5e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.29493  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3642  alpha/beta hydrolase fold  31.6 
 
 		 379 aa  105  8e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.20936  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2720  alpha/beta hydrolase fold protein  29.81 
 
 		 342 aa  105  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3935  alpha/beta hydrolase fold protein  31.88 
 
 		 371 aa  105  1e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2535  alpha/beta hydrolase fold  29.06 
 
 		 344 aa  105  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1594  putative alpha/beta hydrolase  28.42 
 
 		 320 aa  103  3e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.404575 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3466  alpha/beta hydrolase fold protein  29.52 
 
 		 390 aa  103  5e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2865  alpha/beta hydrolase fold  29.7 
 
 		 331 aa  102  1e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1512  alpha/beta hydrolase fold protein  27.82 
 
 		 311 aa  100  3e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3925  alpha/beta hydrolase fold  30.6 
 
 		 367 aa  100  3e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.182869  normal  0.384279 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1316  alpha/beta hydrolase fold  27.82 
 
 		 311 aa  100  3e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.541831  normal  0.727397 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0129  alpha/beta hydrolase fold  32.97 
 
 		 338 aa  100  3e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.773269  normal  0.28797 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3884  alpha/beta hydrolase fold  28.72 
 
 		 341 aa  100  4e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.447806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1380  alpha/beta hydrolase fold  25.47 
 
 		 321 aa  99.8  5e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5208  alpha/beta hydrolase fold  29.67 
 
 		 346 aa  98.6  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.32318  normal  0.119045 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4806  alpha/beta hydrolase fold  29.84 
 
 		 321 aa  96.7  5e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.786039  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4425  alpha/beta hydrolase fold  29.84 
 
 		 321 aa  96.7  5e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4512  alpha/beta hydrolase fold  29.84 
 
 		 321 aa  96.7  5e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.999363 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5140  alpha/beta hydrolase fold  28.95 
 
 		 305 aa  95.9  9e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.773664  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5961  alpha/beta hydrolase fold protein  31.14 
 
 		 345 aa  95.1  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.576377  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3829  alpha/beta hydrolase fold  28.78 
 
 		 331 aa  92  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1468  alpha/beta hydrolase fold  29 
 
 		 340 aa  90.1  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.890362 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5680  alpha/beta hydrolase fold protein  27.92 
 
 		 324 aa  87.4  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0119  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  27.97 
 
 		 380 aa  86.7  4e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.156608 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0741  hypothetical protein  39.67 
 
 		 292 aa  82  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2846  alpha/beta hydrolase  28.36 
 
 		 263 aa  79.7  0.00000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.455911  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5552  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  30.9 
 
 		 370 aa  79  0.00000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.077135  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1827  alpha/beta hydrolase fold  25.42 
 
 		 285 aa  77.4  0.0000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1770  alpha/beta hydrolase fold  25.91 
 
 		 323 aa  77.4  0.0000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00973065  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  27.05 
 
 		 262 aa  77  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3642  alpha/beta fold family hydrolase  27.03 
 
 		 262 aa  77  0.0000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1095  alpha/beta hydrolase fold  29.62 
 
 		 302 aa  76.6  0.0000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3731  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  30.38 
 
 		 372 aa  76.3  0.0000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  27.38 
 
 		 265 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1955  Alpha/beta hydrolase fold  29.03 
 
 		 339 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0521356  normal  0.151931 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2885  alpha/beta hydrolase fold protein  24.59 
 
 		 275 aa  74.7  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00297178 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1078  alpha/beta hydrolase fold protein  24.72 
 
 		 253 aa  73.9  0.000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1080  alpha/beta hydrolase fold  29.08 
 
 		 296 aa  73.9  0.000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1412  alpha/beta fold family hydrolase  25.63 
 
 		 295 aa  73.9  0.000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.405065 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2273  alpha/beta hydrolase fold  29.01 
 
 		 259 aa  73.6  0.000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000254072  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  36.03 
 
 		 308 aa  73.2  0.000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  26.98 
 
 		 299 aa  71.6  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2302  alpha/beta hydrolase fold  33.13 
 
 		 329 aa  72  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3104  alpha/beta hydrolase fold  34.88 
 
 		 296 aa  72  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4983  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  33.06 
 
 		 367 aa  72  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.40688 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4541  alpha/beta hydrolase fold protein  29.87 
 
 		 288 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.707016  normal  0.231702 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2251  Alpha/beta hydrolase fold-1  29.63 
 
 		 284 aa  71.2  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.154511  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2809  alpha/beta hydrolase fold protein  26.64 
 
 		 302 aa  71.2  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2696  alpha/beta hydrolase fold  26.04 
 
 		 312 aa  71.2  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.623815  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>