More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_5208 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_5208  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
346 aa  655    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.32318  normal  0.119045 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5961  alpha/beta hydrolase fold protein  82.69 
 
 
345 aa  496  1e-139  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.576377  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2970  alpha/beta hydrolase fold protein  54.15 
 
 
331 aa  306  4.0000000000000004e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2743  alpha/beta hydrolase fold  54.15 
 
 
331 aa  297  2e-79  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.529791  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2865  alpha/beta hydrolase fold  54.46 
 
 
331 aa  296  4e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0129  alpha/beta hydrolase fold  56.23 
 
 
338 aa  264  1e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.773269  normal  0.28797 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1660  putative alpha/beta hydrolase  44.83 
 
 
319 aa  226  6e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1400  alpha/beta hydrolase fold  45.26 
 
 
320 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.700473 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1420  alpha/beta hydrolase fold  45.08 
 
 
320 aa  217  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3987  alpha/beta hydrolase fold  45.18 
 
 
329 aa  216  7e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.38084 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1217  alpha/beta hydrolase fold  44.14 
 
 
342 aa  212  9e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4675  alpha/beta hydrolase fold  44.55 
 
 
334 aa  211  1e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.719467  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3278  alpha/beta hydrolase fold  38.8 
 
 
351 aa  190  4e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3577  alpha/beta hydrolase fold protein  36.63 
 
 
358 aa  189  8e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.351187  normal  0.127844 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2534  alpha/beta hydrolase fold  40 
 
 
330 aa  186  7e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2029  alpha/beta hydrolase fold  42.07 
 
 
343 aa  182  6e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.62215 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1594  putative alpha/beta hydrolase  39.62 
 
 
320 aa  181  1e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.404575 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3689  hypothetical protein  37.19 
 
 
335 aa  181  2e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.29493  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3884  alpha/beta hydrolase fold  40.12 
 
 
341 aa  176  4e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.447806  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1838  alpha/beta hydrolase fold  41.61 
 
 
333 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.886983  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1468  alpha/beta hydrolase fold  42.39 
 
 
340 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.890362 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2167  alpha/beta hydrolase fold  36.17 
 
 
317 aa  160  4e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3829  alpha/beta hydrolase fold  40.43 
 
 
331 aa  160  4e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0011  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase)  35.46 
 
 
317 aa  159  5e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.903743  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1641  alpha/beta hydrolase fold  35.46 
 
 
317 aa  159  7e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.24202 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49180  Alpha/beta hydrolase fold protein  36.62 
 
 
321 aa  144  3e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1140  alpha/beta hydrolase fold  32.35 
 
 
320 aa  139  4.999999999999999e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.64719  normal  0.115917 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2352  alpha/beta hydrolase  33.93 
 
 
314 aa  139  8.999999999999999e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.517024  normal  0.362082 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0105  alpha/beta hydrolase  38.16 
 
 
328 aa  137  2e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00875507  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1011  alpha/beta hydrolase fold  35.08 
 
 
322 aa  137  4e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.99925 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03823  Alpha/beta hydrolase fold protein  28.83 
 
 
310 aa  130  3e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1380  alpha/beta hydrolase fold  30.45 
 
 
321 aa  129  8.000000000000001e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8725  alpha/beta hydrolase fold protein  30.98 
 
 
332 aa  120  3e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5011  putative alpha/beta hydrolase  31.91 
 
 
350 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.418737  normal  0.1806 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0102  alpha/beta hydrolase fold  30.2 
 
 
332 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5411  alpha/beta hydrolase fold  35.12 
 
 
328 aa  116  6e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.173049  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0056  alpha/beta hydrolase fold  30.2 
 
 
332 aa  115  8.999999999999998e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4934  Alpha/beta hydrolase fold  35.28 
 
 
320 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1905  alpha/beta hydrolase fold  29.47 
 
 
354 aa  113  5e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0087  alpha/beta hydrolase fold protein  29.87 
 
 
332 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5045  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 
325 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.6879  normal  0.399471 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2782  alpha/beta hydrolase fold protein  32.13 
 
 
325 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2989  alpha/beta hydrolase fold  29.61 
 
 
339 aa  110  4.0000000000000004e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.720192 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5377  alpha/beta hydrolase fold protein  28.52 
 
 
332 aa  109  8.000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.306055  normal  0.839367 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3567  alpha/beta hydrolase fold  33.44 
 
 
328 aa  108  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.253365  hitchhiker  0.00645223 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3466  alpha/beta hydrolase fold protein  34.07 
 
 
390 aa  108  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2945  alpha/beta hydrolase fold protein  31.33 
 
 
330 aa  107  2e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2535  alpha/beta hydrolase fold  31.41 
 
 
344 aa  107  3e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3642  alpha/beta hydrolase fold  32.67 
 
 
379 aa  104  2e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.20936  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2445  Alpha/beta hydrolase  32.53 
 
 
327 aa  104  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3935  alpha/beta hydrolase fold protein  34.36 
 
 
371 aa  103  5e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0434  alpha/beta hydrolase fold  29.15 
 
 
318 aa  102  9e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.332302  hitchhiker  0.0000000111123 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1316  alpha/beta hydrolase fold  29.97 
 
 
311 aa  102  1e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.541831  normal  0.727397 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3925  alpha/beta hydrolase fold  32.67 
 
 
367 aa  102  1e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.182869  normal  0.384279 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1512  alpha/beta hydrolase fold protein  29.97 
 
 
311 aa  102  1e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0446  alpha/beta hydrolase fold protein  29.55 
 
 
318 aa  101  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.2537  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5140  alpha/beta hydrolase fold  36.94 
 
 
305 aa  101  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.773664  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2720  alpha/beta hydrolase fold protein  29.63 
 
 
342 aa  99.8  6e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4699  alpha/beta hydrolase fold  31.72 
 
 
327 aa  99  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3663  alpha/beta hydrolase fold  31.72 
 
 
327 aa  99  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.378837  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1260  alpha/beta fold family hydrolase  29.87 
 
 
327 aa  97.8  2e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.809  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3858  alpha/beta hydrolase fold  31.38 
 
 
327 aa  97.8  3e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.387123 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6057  alpha/beta hydrolase fold  28.87 
 
 
332 aa  97.8  3e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00402067  normal  0.493992 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0099  alpha/beta fold family hydrolase  29.84 
 
 
324 aa  96.3  6e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2822  alpha/beta fold family hydrolase  29.84 
 
 
324 aa  96.3  6e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1076  hypothetical protein  29.84 
 
 
324 aa  95.9  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.773392  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2675  alpha/beta fold family hydrolase  29.84 
 
 
324 aa  95.5  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.457884  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0402  alpha/beta fold family hydrolase  29.84 
 
 
324 aa  93.2  5e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0118  alpha/beta fold family hydrolase  29.64 
 
 
326 aa  86.7  6e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.347516  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1537  alpha/beta fold family hydrolase  29.64 
 
 
326 aa  86.7  6e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4425  alpha/beta hydrolase fold  28.21 
 
 
321 aa  83.6  0.000000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4512  alpha/beta hydrolase fold  28.21 
 
 
321 aa  83.6  0.000000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.999363 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4806  alpha/beta hydrolase fold  28.21 
 
 
321 aa  83.6  0.000000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.786039  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1620  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 
303 aa  81.3  0.00000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0935  alpha/beta hydrolase fold  30.33 
 
 
288 aa  80.9  0.00000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0423109  normal  0.641404 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3841  alpha/beta hydrolase fold  32.34 
 
 
288 aa  76.3  0.0000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5680  alpha/beta hydrolase fold protein  33.58 
 
 
324 aa  75.9  0.0000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2896  Alpha/beta hydrolase fold  29.97 
 
 
304 aa  73.6  0.000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.144018 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4298  alpha/beta hydrolase fold  31.31 
 
 
288 aa  72.8  0.000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2705  alpha/beta hydrolase fold  29.02 
 
 
309 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.601677  normal  0.0914485 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4150  alpha/beta hydrolase fold protein  31.68 
 
 
288 aa  72.4  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0383403  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2696  alpha/beta hydrolase fold  29.71 
 
 
312 aa  71.2  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.623815  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1491  alpha/beta hydrolase fold  28.9 
 
 
297 aa  71.2  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00412587  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1095  alpha/beta hydrolase fold  28.62 
 
 
302 aa  70.9  0.00000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3643  alpha/beta hydrolase fold  30.18 
 
 
284 aa  71.2  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.191319  normal  0.297531 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2918  alpha/beta hydrolase fold  30.38 
 
 
312 aa  70.9  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.906544 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2754  alpha/beta hydrolase fold protein  30.53 
 
 
284 aa  70.5  0.00000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1253  alpha/beta hydrolase fold  29.29 
 
 
298 aa  69.3  0.00000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.188153  normal  0.590935 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3798  alpha/beta hydrolase fold protein  27.73 
 
 
258 aa  69.3  0.00000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6643  putative triacylglycerol lipase  28.42 
 
 
275 aa  68.6  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.192902  normal  0.181736 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1258  putative hydrolase  30.09 
 
 
312 aa  68.9  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0912  alpha/beta hydrolase fold  29.09 
 
 
264 aa  68.9  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4414  alpha/beta hydrolase fold  27.67 
 
 
277 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1463  Alpha/beta hydrolase  36.84 
 
 
278 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.234917  normal  0.480235 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5766  alpha/beta hydrolase fold protein  29.1 
 
 
302 aa  67.4  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2885  alpha/beta hydrolase fold protein  32.27 
 
 
275 aa  67.4  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00297178 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5919  alpha/beta hydrolase fold protein  27.67 
 
 
381 aa  67.8  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.539909 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53540  hydrolase  29.13 
 
 
313 aa  67  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.187191  decreased coverage  0.0000594216 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3126  alpha/beta hydrolase fold  27.99 
 
 
303 aa  67  0.0000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.221809  normal  0.0127742 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2564  alpha/beta hydrolase fold  27.48 
 
 
288 aa  66.6  0.0000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>