More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_0056 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010172  Mext_0056  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
332 aa  666    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0102  alpha/beta hydrolase fold  96.69 
 
 
332 aa  603  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0087  alpha/beta hydrolase fold protein  92.77 
 
 
332 aa  577  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5377  alpha/beta hydrolase fold protein  82.12 
 
 
332 aa  553  1e-156  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.306055  normal  0.839367 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1905  alpha/beta hydrolase fold  82.21 
 
 
354 aa  524  1e-148  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8725  alpha/beta hydrolase fold protein  80.12 
 
 
332 aa  520  1e-146  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6057  alpha/beta hydrolase fold  78.44 
 
 
332 aa  487  1e-136  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00402067  normal  0.493992 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5011  putative alpha/beta hydrolase  53.74 
 
 
350 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.418737  normal  0.1806 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2945  alpha/beta hydrolase fold protein  52.41 
 
 
330 aa  311  9e-84  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2782  alpha/beta hydrolase fold protein  52.88 
 
 
325 aa  310  2e-83  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1316  alpha/beta hydrolase fold  50.17 
 
 
311 aa  294  1e-78  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.541831  normal  0.727397 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1512  alpha/beta hydrolase fold protein  50.17 
 
 
311 aa  294  1e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49180  Alpha/beta hydrolase fold protein  48.98 
 
 
321 aa  285  9e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2720  alpha/beta hydrolase fold protein  47.81 
 
 
342 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3466  alpha/beta hydrolase fold protein  50.55 
 
 
390 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2535  alpha/beta hydrolase fold  46.64 
 
 
344 aa  261  1e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2989  alpha/beta hydrolase fold  42.77 
 
 
339 aa  258  9e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.720192 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3935  alpha/beta hydrolase fold protein  45.7 
 
 
371 aa  246  4.9999999999999997e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3642  alpha/beta hydrolase fold  46.38 
 
 
379 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.20936  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3925  alpha/beta hydrolase fold  44.84 
 
 
367 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.182869  normal  0.384279 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2029  alpha/beta hydrolase fold  33.57 
 
 
343 aa  146  5e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.62215 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1660  putative alpha/beta hydrolase  31.61 
 
 
319 aa  146  6e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5140  alpha/beta hydrolase fold  34.07 
 
 
305 aa  139  8.999999999999999e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.773664  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1217  alpha/beta hydrolase fold  33.21 
 
 
342 aa  137  3.0000000000000003e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1641  alpha/beta hydrolase fold  33.55 
 
 
317 aa  135  7.000000000000001e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.24202 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0011  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase)  33.55 
 
 
317 aa  135  9e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.903743  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3987  alpha/beta hydrolase fold  35.11 
 
 
329 aa  135  9e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.38084 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2167  alpha/beta hydrolase fold  31.37 
 
 
317 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0741  hypothetical protein  48.61 
 
 
292 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1380  alpha/beta hydrolase fold  31.94 
 
 
321 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4675  alpha/beta hydrolase fold  31.61 
 
 
334 aa  130  3e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.719467  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1420  alpha/beta hydrolase fold  32.16 
 
 
320 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2352  alpha/beta hydrolase  32.76 
 
 
314 aa  128  1.0000000000000001e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.517024  normal  0.362082 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1400  alpha/beta hydrolase fold  31.15 
 
 
320 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.700473 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4934  Alpha/beta hydrolase fold  33.9 
 
 
320 aa  126  4.0000000000000003e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1594  putative alpha/beta hydrolase  31.46 
 
 
320 aa  126  5e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.404575 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0129  alpha/beta hydrolase fold  34.63 
 
 
338 aa  126  6e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.773269  normal  0.28797 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2534  alpha/beta hydrolase fold  30.25 
 
 
330 aa  121  9.999999999999999e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0446  alpha/beta hydrolase fold protein  30.61 
 
 
318 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.2537  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0402  alpha/beta fold family hydrolase  34.01 
 
 
324 aa  120  3e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0105  alpha/beta hydrolase  33 
 
 
328 aa  118  9.999999999999999e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00875507  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0099  alpha/beta fold family hydrolase  33.33 
 
 
324 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2822  alpha/beta fold family hydrolase  33.33 
 
 
324 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2675  alpha/beta fold family hydrolase  33.33 
 
 
324 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.457884  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1260  alpha/beta fold family hydrolase  33.33 
 
 
327 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.809  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1076  hypothetical protein  33.33 
 
 
324 aa  117  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.773392  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0434  alpha/beta hydrolase fold  30.47 
 
 
318 aa  117  3e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.332302  hitchhiker  0.0000000111123 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2970  alpha/beta hydrolase fold protein  29.82 
 
 
331 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5208  alpha/beta hydrolase fold  30.38 
 
 
346 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.32318  normal  0.119045 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2743  alpha/beta hydrolase fold  29.47 
 
 
331 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.529791  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2865  alpha/beta hydrolase fold  30.82 
 
 
331 aa  114  3e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5961  alpha/beta hydrolase fold protein  31.86 
 
 
345 aa  114  3e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.576377  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3689  hypothetical protein  28.14 
 
 
335 aa  112  1.0000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.29493  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3278  alpha/beta hydrolase fold  29.25 
 
 
351 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1011  alpha/beta hydrolase fold  31.36 
 
 
322 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.99925 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3577  alpha/beta hydrolase fold protein  27.89 
 
 
358 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.351187  normal  0.127844 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1095  alpha/beta hydrolase fold  29.39 
 
 
302 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5045  alpha/beta hydrolase fold  30.3 
 
 
325 aa  110  3e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.6879  normal  0.399471 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1140  alpha/beta hydrolase fold  30.11 
 
 
320 aa  107  4e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.64719  normal  0.115917 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0118  alpha/beta fold family hydrolase  33.11 
 
 
326 aa  105  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.347516  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1537  alpha/beta fold family hydrolase  33.11 
 
 
326 aa  105  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3567  alpha/beta hydrolase fold  30.14 
 
 
328 aa  99.4  9e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.253365  hitchhiker  0.00645223 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5411  alpha/beta hydrolase fold  31.05 
 
 
328 aa  97.4  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.173049  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4699  alpha/beta hydrolase fold  29.08 
 
 
327 aa  95.9  8e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3663  alpha/beta hydrolase fold  29.08 
 
 
327 aa  95.9  8e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.378837  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2445  Alpha/beta hydrolase  29.08 
 
 
327 aa  95.5  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3884  alpha/beta hydrolase fold  28.33 
 
 
341 aa  95.1  1e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.447806  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0608  alpha/beta hydrolase fold  32.89 
 
 
300 aa  95.1  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3858  alpha/beta hydrolase fold  29.6 
 
 
327 aa  94.7  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.387123 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2528  alpha/beta hydrolase fold  25.74 
 
 
301 aa  94.4  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0837  alpha/beta fold family hydrolase  26.37 
 
 
299 aa  93.6  4e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0672  alpha/beta hydrolase fold  29.33 
 
 
315 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.240082 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1412  alpha/beta fold family hydrolase  25.69 
 
 
295 aa  90.5  3e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.405065 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1838  alpha/beta hydrolase fold  28.2 
 
 
333 aa  89.7  5e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.886983  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3235  alpha/beta hydrolase fold  26.86 
 
 
316 aa  89.7  6e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.423188  normal  0.602457 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  32.22 
 
 
299 aa  89.7  6e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1468  alpha/beta hydrolase fold  27.27 
 
 
340 aa  89.7  7e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.890362 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12729  hydrolase  29.29 
 
 
341 aa  88.6  1e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2885  alpha/beta hydrolase fold protein  27.74 
 
 
275 aa  86.3  7e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00297178 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0952  alpha/beta hydrolase fold  31.65 
 
 
350 aa  86.3  7e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167574  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1491  alpha/beta hydrolase fold  27.96 
 
 
297 aa  86.3  7e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00412587  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3779  cyclic nucleotide-binding protein  28.78 
 
 
453 aa  86.3  8e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0440455  normal  0.0476196 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1253  alpha/beta hydrolase fold  25.43 
 
 
298 aa  85.1  0.000000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.188153  normal  0.590935 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  29.11 
 
 
287 aa  85.5  0.000000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3776  alpha/beta hydrolase fold  31.45 
 
 
361 aa  85.1  0.000000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.904669  decreased coverage  0.00241214 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4806  alpha/beta hydrolase fold  30.11 
 
 
321 aa  85.1  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.786039  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4425  alpha/beta hydrolase fold  30.11 
 
 
321 aa  85.1  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4512  alpha/beta hydrolase fold  30.11 
 
 
321 aa  85.1  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.999363 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3829  alpha/beta hydrolase fold  29.09 
 
 
331 aa  84  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2103  alpha/beta hydrolase fold  30.98 
 
 
352 aa  82.4  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.225702  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5680  alpha/beta hydrolase fold protein  27.68 
 
 
324 aa  82.4  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  28.04 
 
 
295 aa  82  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03823  Alpha/beta hydrolase fold protein  26.71 
 
 
310 aa  81.3  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11862  haloalkane dehalogenase  27.65 
 
 
286 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.608613 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  26.83 
 
 
308 aa  81.3  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2194  alpha/beta hydrolase fold protein  30.42 
 
 
350 aa  80.5  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.984262  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2748  alpha/beta hydrolase fold protein  36.67 
 
 
311 aa  80.1  0.00000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00012747 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1736  Alpha/beta hydrolase fold-1  31.32 
 
 
320 aa  80.1  0.00000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0391  alpha/beta hydrolase fold  28.23 
 
 
291 aa  79.7  0.00000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3858  alpha/beta hydrolase fold  29.73 
 
 
304 aa  79.7  0.00000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>