More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_2743 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_2743  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 331 aa  638    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.529791  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2970  alpha/beta hydrolase fold protein  96.68 
 
 		 331 aa  620  1e-177  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2865  alpha/beta hydrolase fold  83.99 
 
 		 331 aa  539  9.999999999999999e-153  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5208  alpha/beta hydrolase fold  55.56 
 
 		 346 aa  293  3e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.32318  normal  0.119045 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5961  alpha/beta hydrolase fold protein  54.85 
 
 		 345 aa  288  7e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.576377  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0129  alpha/beta hydrolase fold  54.76 
 
 		 338 aa  277  2e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.773269  normal  0.28797 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1660  putative alpha/beta hydrolase  45.12 
 
 		 319 aa  215  7e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4675  alpha/beta hydrolase fold  41.27 
 
 		 334 aa  200  3e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.719467  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1420  alpha/beta hydrolase fold  41.33 
 
 		 320 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1400  alpha/beta hydrolase fold  39.75 
 
 		 320 aa  195  1e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.700473 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1217  alpha/beta hydrolase fold  41.52 
 
 		 342 aa  192  5e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2029  alpha/beta hydrolase fold  38.93 
 
 		 343 aa  181  1e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.62215 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3987  alpha/beta hydrolase fold  39.6 
 
 		 329 aa  179  7e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.38084 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2534  alpha/beta hydrolase fold  35.99 
 
 		 330 aa  158  9e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1838  alpha/beta hydrolase fold  40.52 
 
 		 333 aa  158  1e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.886983  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3278  alpha/beta hydrolase fold  31.85 
 
 		 351 aa  150  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1594  putative alpha/beta hydrolase  35.91 
 
 		 320 aa  147  3e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.404575 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1468  alpha/beta hydrolase fold  39.26 
 
 		 340 aa  142  6e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.890362 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3577  alpha/beta hydrolase fold protein  31.16 
 
 		 358 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.351187  normal  0.127844 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3884  alpha/beta hydrolase fold  35.38 
 
 		 341 aa  138  1e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.447806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3829  alpha/beta hydrolase fold  39.41 
 
 		 331 aa  132  6.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3689  hypothetical protein  33.73 
 
 		 335 aa  130  3e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.29493  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49180  Alpha/beta hydrolase fold protein  35.9 
 
 		 321 aa  127  2.0000000000000002e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0105  alpha/beta hydrolase  34.92 
 
 		 328 aa  123  4e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00875507  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0011  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase)  33 
 
 		 317 aa  122  8e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.903743  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1011  alpha/beta hydrolase fold  33.22 
 
 		 322 aa  121  9.999999999999999e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.99925 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1140  alpha/beta hydrolase fold  29.68 
 
 		 320 aa  121  9.999999999999999e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.64719  normal  0.115917 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5045  alpha/beta hydrolase fold  32.47 
 
 		 325 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.6879  normal  0.399471 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0434  alpha/beta hydrolase fold  29.78 
 
 		 318 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.332302  hitchhiker  0.0000000111123 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1641  alpha/beta hydrolase fold  32.33 
 
 		 317 aa  119  9e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.24202 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3858  alpha/beta hydrolase fold  32.76 
 
 		 327 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.387123 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0446  alpha/beta hydrolase fold protein  29.22 
 
 		 318 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.2537  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5411  alpha/beta hydrolase fold  33.45 
 
 		 328 aa  117  3e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.173049  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2352  alpha/beta hydrolase  32.41 
 
 		 314 aa  116  6e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.517024  normal  0.362082 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8725  alpha/beta hydrolase fold protein  31.03 
 
 		 332 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3567  alpha/beta hydrolase fold  32.29 
 
 		 328 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.253365  hitchhiker  0.00645223 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4699  alpha/beta hydrolase fold  32.18 
 
 		 327 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2167  alpha/beta hydrolase fold  32.67 
 
 		 317 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3663  alpha/beta hydrolase fold  32.18 
 
 		 327 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.378837  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0056  alpha/beta hydrolase fold  29.47 
 
 		 332 aa  114  3e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0102  alpha/beta hydrolase fold  29.47 
 
 		 332 aa  113  5e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1905  alpha/beta hydrolase fold  30.63 
 
 		 354 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2445  Alpha/beta hydrolase  31.62 
 
 		 327 aa  110  3e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5011  putative alpha/beta hydrolase  31.33 
 
 		 350 aa  110  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.418737  normal  0.1806 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5377  alpha/beta hydrolase fold protein  28.75 
 
 		 332 aa  108  9.000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.306055  normal  0.839367 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2989  alpha/beta hydrolase fold  29.18 
 
 		 339 aa  107  4e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.720192 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3466  alpha/beta hydrolase fold protein  32.33 
 
 		 390 aa  104  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0087  alpha/beta hydrolase fold protein  28.67 
 
 		 332 aa  103  5e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1512  alpha/beta hydrolase fold protein  32.2 
 
 		 311 aa  102  9e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1316  alpha/beta hydrolase fold  32.2 
 
 		 311 aa  102  9e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.541831  normal  0.727397 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6057  alpha/beta hydrolase fold  30.53 
 
 		 332 aa  101  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00402067  normal  0.493992 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2720  alpha/beta hydrolase fold protein  30.72 
 
 		 342 aa  102  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1380  alpha/beta hydrolase fold  29.33 
 
 		 321 aa  100  3e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2535  alpha/beta hydrolase fold  31.34 
 
 		 344 aa  100  4e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03823  Alpha/beta hydrolase fold protein  27.09 
 
 		 310 aa  99  1e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4934  Alpha/beta hydrolase fold  33.22 
 
 		 320 aa  97.8  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2782  alpha/beta hydrolase fold protein  30.8 
 
 		 325 aa  97.4  3e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0402  alpha/beta fold family hydrolase  26.23 
 
 		 324 aa  94.7  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0099  alpha/beta fold family hydrolase  25.25 
 
 		 324 aa  94  3e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1260  alpha/beta fold family hydrolase  25.25 
 
 		 327 aa  94  3e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.809  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2822  alpha/beta fold family hydrolase  25.25 
 
 		 324 aa  94  3e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1076  hypothetical protein  25.25 
 
 		 324 aa  93.2  5e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.773392  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2675  alpha/beta fold family hydrolase  25.25 
 
 		 324 aa  93.2  6e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.457884  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2945  alpha/beta hydrolase fold protein  29.58 
 
 		 330 aa  90.9  3e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5140  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 305 aa  86.3  7e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.773664  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1537  alpha/beta fold family hydrolase  25.08 
 
 		 326 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0118  alpha/beta fold family hydrolase  25.08 
 
 		 326 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.347516  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4425  alpha/beta hydrolase fold  28.76 
 
 		 321 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4512  alpha/beta hydrolase fold  28.76 
 
 		 321 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.999363 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4806  alpha/beta hydrolase fold  28.76 
 
 		 321 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.786039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2626  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 330 aa  77  0.0000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0626174  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09348  probable hydrolytic enzyme  35.77 
 
 		 331 aa  74.7  0.000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0100804  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  31.51 
 
 		 299 aa  74.7  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3642  alpha/beta hydrolase fold  30 
 
 		 379 aa  73.9  0.000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.20936  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3935  alpha/beta hydrolase fold protein  30.5 
 
 		 371 aa  74.3  0.000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1827  alpha/beta hydrolase fold  39.67 
 
 		 285 aa  72.4  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5680  alpha/beta hydrolase fold protein  32.25 
 
 		 324 aa  71.2  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1401  alpha/beta fold family hydrolase/acetyltransferase-like protein  28.38 
 
 		 196 aa  71.2  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000259828  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3197  haloalkane dehalogenase  30.85 
 
 		 310 aa  71.2  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0300138 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1945  alpha/beta hydrolase fold  28.06 
 
 		 346 aa  70.9  0.00000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2462  AMP-dependent synthetase and ligase  34.59 
 
 		 861 aa  70.9  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.199446  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1463  Alpha/beta hydrolase  40 
 
 		 278 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.234917  normal  0.480235 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5919  alpha/beta hydrolase fold protein  28.75 
 
 		 381 aa  70.5  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.539909 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0177  alpha/beta hydrolase fold protein  27.65 
 
 		 329 aa  69.7  0.00000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0608  alpha/beta hydrolase fold  25.32 
 
 		 311 aa  68.9  0.0000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000717376  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0741  hypothetical protein  38.93 
 
 		 292 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03953  haloalkane dehalogenase  28.2 
 
 		 300 aa  68.9  0.0000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6195  proline-specific peptidase  31.02 
 
 		 296 aa  67.8  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.816289 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6375  proline-specific peptidase  30.74 
 
 		 296 aa  68.6  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.713939 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1643  alpha/beta hydrolase fold  27.03 
 
 		 298 aa  68.2  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.450863 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3643  alpha/beta hydrolase fold  28.42 
 
 		 284 aa  68.2  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.191319  normal  0.297531 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36600  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  33.9 
 
 		 922 aa  68.6  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.478291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1589  alpha/beta hydrolase fold  30.23 
 
 		 297 aa  68.2  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000678244  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0935  alpha/beta hydrolase fold  26.67 
 
 		 288 aa  67.4  0.0000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0423109  normal  0.641404 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2973  haloalkane dehalogenase  28.19 
 
 		 302 aa  67.4  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.521193 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1050  alpha/beta hydrolase fold protein  30.26 
 
 		 345 aa  67.4  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.10497  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22090  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  29.37 
 
 		 285 aa  67  0.0000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00622193 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0527  inner-membrane translocator  25.59 
 
 		 562 aa  67  0.0000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.142697  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0672  alpha/beta hydrolase fold  28.98 
 
 		 315 aa  67  0.0000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.240082 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0119  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  35.94 
 
 		 380 aa  67  0.0000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.156608 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>