More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_2535 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_2535  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 344 aa  689    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2720  alpha/beta hydrolase fold protein  78.53 
 
 		 342 aa  547  1e-154  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3466  alpha/beta hydrolase fold protein  68.33 
 
 		 390 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3935  alpha/beta hydrolase fold protein  58.43 
 
 		 371 aa  369  1e-101  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3642  alpha/beta hydrolase fold  57.83 
 
 		 379 aa  362  4e-99  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.20936  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3925  alpha/beta hydrolase fold  58.23 
 
 		 367 aa  350  2e-95  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.182869  normal  0.384279 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5377  alpha/beta hydrolase fold protein  48.06 
 
 		 332 aa  271  1e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.306055  normal  0.839367 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0056  alpha/beta hydrolase fold  46.64 
 
 		 332 aa  261  2e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0102  alpha/beta hydrolase fold  46.29 
 
 		 332 aa  259  5.0000000000000005e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5011  putative alpha/beta hydrolase  44.44 
 
 		 350 aa  258  8e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.418737  normal  0.1806 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0087  alpha/beta hydrolase fold protein  45.94 
 
 		 332 aa  258  8e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1905  alpha/beta hydrolase fold  45.39 
 
 		 354 aa  258  1e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8725  alpha/beta hydrolase fold protein  44.17 
 
 		 332 aa  256  6e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6057  alpha/beta hydrolase fold  46.29 
 
 		 332 aa  253  5.000000000000001e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00402067  normal  0.493992 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1512  alpha/beta hydrolase fold protein  45.99 
 
 		 311 aa  249  4e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1316  alpha/beta hydrolase fold  45.99 
 
 		 311 aa  249  4e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.541831  normal  0.727397 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49180  Alpha/beta hydrolase fold protein  45.49 
 
 		 321 aa  243  3.9999999999999997e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2989  alpha/beta hydrolase fold  40.99 
 
 		 339 aa  241  9e-63  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.720192 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2782  alpha/beta hydrolase fold protein  44.06 
 
 		 325 aa  239  5.999999999999999e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2945  alpha/beta hydrolase fold protein  44.12 
 
 		 330 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2029  alpha/beta hydrolase fold  34.16 
 
 		 343 aa  150  4e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.62215 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5140  alpha/beta hydrolase fold  35.57 
 
 		 305 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.773664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2167  alpha/beta hydrolase fold  32.23 
 
 		 317 aa  132  7.999999999999999e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0741  hypothetical protein  43.66 
 
 		 292 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1641  alpha/beta hydrolase fold  32.23 
 
 		 317 aa  125  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.24202 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0011  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase)  31.87 
 
 		 317 aa  123  4e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.903743  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2352  alpha/beta hydrolase  33.45 
 
 		 314 aa  124  4e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.517024  normal  0.362082 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0105  alpha/beta hydrolase  32.52 
 
 		 328 aa  123  4e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00875507  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4934  Alpha/beta hydrolase fold  32.75 
 
 		 320 aa  122  9e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1594  putative alpha/beta hydrolase  29.39 
 
 		 320 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.404575 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1660  putative alpha/beta hydrolase  31.73 
 
 		 319 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1217  alpha/beta hydrolase fold  31.01 
 
 		 342 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3987  alpha/beta hydrolase fold  32.98 
 
 		 329 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.38084 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1011  alpha/beta hydrolase fold  30.28 
 
 		 322 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.99925 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1140  alpha/beta hydrolase fold  30.63 
 
 		 320 aa  114  2.0000000000000002e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.64719  normal  0.115917 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1380  alpha/beta hydrolase fold  28.34 
 
 		 321 aa  114  3e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3858  alpha/beta hydrolase fold  31.3 
 
 		 327 aa  109  6e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.387123 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2445  Alpha/beta hydrolase  31.95 
 
 		 327 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5961  alpha/beta hydrolase fold protein  33.22 
 
 		 345 aa  109  7.000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.576377  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4699  alpha/beta hydrolase fold  30.92 
 
 		 327 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3663  alpha/beta hydrolase fold  30.92 
 
 		 327 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.378837  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5208  alpha/beta hydrolase fold  32.86 
 
 		 346 aa  105  9e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.32318  normal  0.119045 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0434  alpha/beta hydrolase fold  29.06 
 
 		 318 aa  105  1e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.332302  hitchhiker  0.0000000111123 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5045  alpha/beta hydrolase fold  31.2 
 
 		 325 aa  103  3e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.6879  normal  0.399471 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2675  alpha/beta fold family hydrolase  29.06 
 
 		 324 aa  103  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.457884  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0099  alpha/beta fold family hydrolase  29.06 
 
 		 324 aa  103  4e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2822  alpha/beta fold family hydrolase  29.06 
 
 		 324 aa  103  4e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0446  alpha/beta hydrolase fold protein  28.68 
 
 		 318 aa  103  4e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.2537  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2865  alpha/beta hydrolase fold  31.07 
 
 		 331 aa  103  4e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1076  hypothetical protein  29.06 
 
 		 324 aa  103  5e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.773392  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1260  alpha/beta fold family hydrolase  29.06 
 
 		 327 aa  103  5e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.809  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0402  alpha/beta fold family hydrolase  28.99 
 
 		 324 aa  102  9e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3567  alpha/beta hydrolase fold  31.07 
 
 		 328 aa  102  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.253365  hitchhiker  0.00645223 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0129  alpha/beta hydrolase fold  32.86 
 
 		 338 aa  100  3e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.773269  normal  0.28797 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2743  alpha/beta hydrolase fold  31.34 
 
 		 331 aa  100  3e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.529791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5411  alpha/beta hydrolase fold  31.07 
 
 		 328 aa  100  4e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.173049  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4675  alpha/beta hydrolase fold  29.35 
 
 		 334 aa  99.8  6e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.719467  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2970  alpha/beta hydrolase fold protein  30.66 
 
 		 331 aa  97.8  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0118  alpha/beta fold family hydrolase  28.99 
 
 		 326 aa  96.7  5e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.347516  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1537  alpha/beta fold family hydrolase  28.99 
 
 		 326 aa  96.7  5e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1400  alpha/beta hydrolase fold  27.56 
 
 		 320 aa  95.5  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.700473 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2534  alpha/beta hydrolase fold  27.62 
 
 		 330 aa  93.2  6e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1420  alpha/beta hydrolase fold  27.4 
 
 		 320 aa  92.4  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3278  alpha/beta hydrolase fold  27.96 
 
 		 351 aa  90.9  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0608  alpha/beta hydrolase fold  28.47 
 
 		 300 aa  90.1  5e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03823  Alpha/beta hydrolase fold protein  24.5 
 
 		 310 aa  89.7  6e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3577  alpha/beta hydrolase fold protein  26.22 
 
 		 358 aa  87.8  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.351187  normal  0.127844 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3884  alpha/beta hydrolase fold  25.84 
 
 		 341 aa  88.2  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.447806  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1095  alpha/beta hydrolase fold  28.04 
 
 		 302 aa  88.2  2e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0527  inner-membrane translocator  27.24 
 
 		 562 aa  86.3  7e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.142697  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1838  alpha/beta hydrolase fold  27.24 
 
 		 333 aa  86.3  7e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.886983  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3829  alpha/beta hydrolase fold  27.78 
 
 		 331 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3689  hypothetical protein  27.91 
 
 		 335 aa  81.6  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.29493  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5766  alpha/beta hydrolase fold protein  27.94 
 
 		 302 aa  80.5  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11862  haloalkane dehalogenase  31.2 
 
 		 286 aa  79.3  0.00000000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.608613 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4806  alpha/beta hydrolase fold  27.4 
 
 		 321 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.786039  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4425  alpha/beta hydrolase fold  27.4 
 
 		 321 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4512  alpha/beta hydrolase fold  27.4 
 
 		 321 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.999363 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0672  alpha/beta hydrolase fold  29.7 
 
 		 315 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.240082 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1468  alpha/beta hydrolase fold  26.14 
 
 		 340 aa  77.8  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.890362 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1736  alpha/beta hydrolase fold  29.2 
 
 		 290 aa  77.4  0.0000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1788  alpha/beta hydrolase fold protein  27.54 
 
 		 279 aa  74.3  0.000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0842408  hitchhiker  0.00140329 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2528  alpha/beta hydrolase fold  27.94 
 
 		 301 aa  73.9  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5680  alpha/beta hydrolase fold protein  29.12 
 
 		 324 aa  73.9  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1463  Alpha/beta hydrolase  34.35 
 
 		 278 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.234917  normal  0.480235 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1080  alpha/beta hydrolase fold  34.71 
 
 		 296 aa  73.6  0.000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2475  alpha/beta hydrolase fold protein  27.27 
 
 		 287 aa  73.2  0.000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1697  putative epoxide hydrolase  31.49 
 
 		 298 aa  72.8  0.000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3781  alpha/beta hydrolase fold  24.91 
 
 		 295 aa  72.8  0.000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2009  alpha/beta hydrolase fold  32.33 
 
 		 294 aa  72.8  0.000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1620  alpha/beta hydrolase fold  27.89 
 
 		 303 aa  72.4  0.00000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12729  hydrolase  27.09 
 
 		 341 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3235  alpha/beta hydrolase fold  33.9 
 
 		 316 aa  71.2  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.423188  normal  0.602457 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0221  alpha/beta hydrolase fold  37.78 
 
 		 286 aa  71.6  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0902  Alpha/beta hydrolase fold  30.81 
 
 		 300 aa  71.2  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.685434 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0608  alpha/beta hydrolase fold  23.3 
 
 		 311 aa  70.9  0.00000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000717376  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1998  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 		 293 aa  70.9  0.00000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.918963  normal  0.449099 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1248  alpha/beta hydrolase fold-containing protein  25.53 
 
 		 311 aa  71.2  0.00000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2945  alpha/beta hydrolase fold  37.61 
 
 		 290 aa  69.7  0.00000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2009  alpha/beta hydrolase fold  24.79 
 
 		 299 aa  69.7  0.00000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>