More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_1400 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_1400  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 320 aa  630  1e-180  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.700473 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1420  alpha/beta hydrolase fold  87.5 
 
 		 320 aa  532  1e-150  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4675  alpha/beta hydrolase fold  81.17 
 
 		 334 aa  504  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.719467  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3987  alpha/beta hydrolase fold  62.84 
 
 		 329 aa  372  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.38084 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1660  putative alpha/beta hydrolase  59.28 
 
 		 319 aa  363  2e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1217  alpha/beta hydrolase fold  63.01 
 
 		 342 aa  363  3e-99  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5208  alpha/beta hydrolase fold  45.73 
 
 		 346 aa  215  9e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.32318  normal  0.119045 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2029  alpha/beta hydrolase fold  41.25 
 
 		 343 aa  210  3e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.62215 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3278  alpha/beta hydrolase fold  39.65 
 
 		 351 aa  205  7e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5961  alpha/beta hydrolase fold protein  44.78 
 
 		 345 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.576377  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3577  alpha/beta hydrolase fold protein  38.95 
 
 		 358 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.351187  normal  0.127844 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2970  alpha/beta hydrolase fold protein  40.06 
 
 		 331 aa  198  7.999999999999999e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3689  hypothetical protein  41.9 
 
 		 335 aa  192  7e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.29493  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2743  alpha/beta hydrolase fold  40 
 
 		 331 aa  191  2e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.529791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2865  alpha/beta hydrolase fold  39.74 
 
 		 331 aa  181  2e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0129  alpha/beta hydrolase fold  42.01 
 
 		 338 aa  166  5e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.773269  normal  0.28797 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2534  alpha/beta hydrolase fold  35.79 
 
 		 330 aa  162  7e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1838  alpha/beta hydrolase fold  35.89 
 
 		 333 aa  161  2e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.886983  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5045  alpha/beta hydrolase fold  32.2 
 
 		 325 aa  154  2e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.6879  normal  0.399471 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0446  alpha/beta hydrolase fold protein  31.65 
 
 		 318 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.2537  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0434  alpha/beta hydrolase fold  31.76 
 
 		 318 aa  153  4e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.332302  hitchhiker  0.0000000111123 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2352  alpha/beta hydrolase  31.47 
 
 		 314 aa  151  1e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.517024  normal  0.362082 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3884  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 341 aa  149  7e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.447806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1468  alpha/beta hydrolase fold  35.47 
 
 		 340 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.890362 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1594  putative alpha/beta hydrolase  33.91 
 
 		 320 aa  144  2e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.404575 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0402  alpha/beta fold family hydrolase  31.74 
 
 		 324 aa  143  3e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3567  alpha/beta hydrolase fold  32.72 
 
 		 328 aa  143  5e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.253365  hitchhiker  0.00645223 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0099  alpha/beta fold family hydrolase  31.51 
 
 		 324 aa  140  3e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1260  alpha/beta fold family hydrolase  31.51 
 
 		 327 aa  140  3e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.809  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2822  alpha/beta fold family hydrolase  31.51 
 
 		 324 aa  140  3e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1076  hypothetical protein  31.51 
 
 		 324 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.773392  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03823  Alpha/beta hydrolase fold protein  30.1 
 
 		 310 aa  139  3.9999999999999997e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3829  alpha/beta hydrolase fold  37.12 
 
 		 331 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2675  alpha/beta fold family hydrolase  31.51 
 
 		 324 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.457884  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1380  alpha/beta hydrolase fold  33.09 
 
 		 321 aa  139  7.999999999999999e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2445  Alpha/beta hydrolase  30.86 
 
 		 327 aa  137  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5411  alpha/beta hydrolase fold  31.99 
 
 		 328 aa  137  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.173049  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0105  alpha/beta hydrolase  32.56 
 
 		 328 aa  133  3.9999999999999996e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00875507  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1011  alpha/beta hydrolase fold  32.64 
 
 		 322 aa  132  6.999999999999999e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.99925 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1140  alpha/beta hydrolase fold  30.23 
 
 		 320 aa  132  7.999999999999999e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.64719  normal  0.115917 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0011  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase)  29.79 
 
 		 317 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.903743  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1641  alpha/beta hydrolase fold  29.79 
 
 		 317 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.24202 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4699  alpha/beta hydrolase fold  30.11 
 
 		 327 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3663  alpha/beta hydrolase fold  30.11 
 
 		 327 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.378837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0118  alpha/beta fold family hydrolase  31.29 
 
 		 326 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.347516  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1537  alpha/beta fold family hydrolase  31.29 
 
 		 326 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3858  alpha/beta hydrolase fold  29.78 
 
 		 327 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.387123 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5377  alpha/beta hydrolase fold protein  28.89 
 
 		 332 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.306055  normal  0.839367 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8725  alpha/beta hydrolase fold protein  32.31 
 
 		 332 aa  126  5e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2167  alpha/beta hydrolase fold  29.89 
 
 		 317 aa  126  6e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4934  Alpha/beta hydrolase fold  31.47 
 
 		 320 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0102  alpha/beta hydrolase fold  30.74 
 
 		 332 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0056  alpha/beta hydrolase fold  31.1 
 
 		 332 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0087  alpha/beta hydrolase fold protein  30.39 
 
 		 332 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1905  alpha/beta hydrolase fold  30.74 
 
 		 354 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2782  alpha/beta hydrolase fold protein  27.95 
 
 		 325 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2945  alpha/beta hydrolase fold protein  27.33 
 
 		 330 aa  113  5e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49180  Alpha/beta hydrolase fold protein  31.8 
 
 		 321 aa  113  5e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5011  putative alpha/beta hydrolase  29.33 
 
 		 350 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.418737  normal  0.1806 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6057  alpha/beta hydrolase fold  31.54 
 
 		 332 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00402067  normal  0.493992 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2989  alpha/beta hydrolase fold  30.94 
 
 		 339 aa  107  3e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.720192 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1512  alpha/beta hydrolase fold protein  30.8 
 
 		 311 aa  103  6e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1316  alpha/beta hydrolase fold  30.8 
 
 		 311 aa  103  6e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.541831  normal  0.727397 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3642  alpha/beta hydrolase fold  29.67 
 
 		 379 aa  102  7e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.20936  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3935  alpha/beta hydrolase fold protein  29.64 
 
 		 371 aa  102  8e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3925  alpha/beta hydrolase fold  28.93 
 
 		 367 aa  100  3e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.182869  normal  0.384279 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2720  alpha/beta hydrolase fold protein  28.12 
 
 		 342 aa  97.8  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5140  alpha/beta hydrolase fold  30.98 
 
 		 305 aa  97.1  4e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.773664  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3466  alpha/beta hydrolase fold protein  29.18 
 
 		 390 aa  96.3  6e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2535  alpha/beta hydrolase fold  27.56 
 
 		 344 aa  95.5  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3858  alpha/beta hydrolase fold  30.83 
 
 		 304 aa  88.6  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  30.8 
 
 		 299 aa  88.6  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2696  alpha/beta hydrolase fold  30 
 
 		 312 aa  84.3  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.623815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1353  alpha/beta hydrolase fold  28.68 
 
 		 339 aa  84  0.000000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.687878  normal  0.202512 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2918  alpha/beta hydrolase fold  28.27 
 
 		 312 aa  83.6  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.906544 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1258  putative hydrolase  28.27 
 
 		 312 aa  81.6  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4806  alpha/beta hydrolase fold  28.47 
 
 		 321 aa  80.5  0.00000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.786039  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4425  alpha/beta hydrolase fold  28.47 
 
 		 321 aa  80.5  0.00000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4512  alpha/beta hydrolase fold  28.47 
 
 		 321 aa  80.5  0.00000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.999363 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1945  alpha/beta hydrolase fold  29.35 
 
 		 346 aa  80.1  0.00000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0672  alpha/beta hydrolase fold  29.01 
 
 		 315 aa  79.7  0.00000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.240082 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0316  alpha/beta hydrolase fold  29.56 
 
 		 316 aa  79.7  0.00000000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00247828  hitchhiker  0.00660595 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5680  alpha/beta hydrolase fold protein  31.25 
 
 		 324 aa  78.6  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0935  alpha/beta hydrolase fold  29.2 
 
 		 288 aa  78.2  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0423109  normal  0.641404 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3143  alpha/beta hydrolase fold  30.18 
 
 		 309 aa  77.8  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.03403  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0119  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  37.98 
 
 		 380 aa  77  0.0000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.156608 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0527  inner-membrane translocator  24.65 
 
 		 562 aa  75.9  0.0000000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.142697  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2335  alpha/beta hydrolase fold  31.54 
 
 		 315 aa  75.1  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0741  hypothetical protein  39.55 
 
 		 292 aa  75.1  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3504  magnesium-chelatase 30 kDa subunit  27.33 
 
 		 302 aa  73.9  0.000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.477882 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1095  alpha/beta hydrolase fold  27.34 
 
 		 302 aa  72.4  0.00000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0274  Alpha/beta hydrolase fold  29.63 
 
 		 289 aa  71.2  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.642233  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2885  alpha/beta hydrolase fold protein  31.29 
 
 		 275 aa  70.9  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00297178 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1827  alpha/beta hydrolase fold  25.91 
 
 		 285 aa  70.1  0.00000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4541  alpha/beta hydrolase fold protein  28.46 
 
 		 288 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.707016  normal  0.231702 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1361  Alpha/beta hydrolase fold  26.43 
 
 		 298 aa  68.6  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00841082  hitchhiker  0.00000857461 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  28.83 
 
 		 308 aa  68.6  0.0000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1620  alpha/beta hydrolase fold  26.21 
 
 		 303 aa  68.6  0.0000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15080  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  27.96 
 
 		 288 aa  68.6  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.625795  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0911  Alpha/beta hydrolase fold  27.11 
 
 		 289 aa  68.2  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0219257  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>