More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_3689 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_3689  hypothetical protein  100 
 
 		 335 aa  670    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.29493  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3577  alpha/beta hydrolase fold protein  57.59 
 
 		 358 aa  372  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.351187  normal  0.127844 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3278  alpha/beta hydrolase fold  57.28 
 
 		 351 aa  369  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2029  alpha/beta hydrolase fold  41.25 
 
 		 343 aa  203  3e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.62215 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1660  putative alpha/beta hydrolase  40.71 
 
 		 319 aa  199  6e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1420  alpha/beta hydrolase fold  43.87 
 
 		 320 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1400  alpha/beta hydrolase fold  41.9 
 
 		 320 aa  192  7e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.700473 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4675  alpha/beta hydrolase fold  39.64 
 
 		 334 aa  189  7e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.719467  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1217  alpha/beta hydrolase fold  37.54 
 
 		 342 aa  188  1e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3987  alpha/beta hydrolase fold  41.38 
 
 		 329 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.38084 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5961  alpha/beta hydrolase fold protein  39 
 
 		 345 aa  176  6e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.576377  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5208  alpha/beta hydrolase fold  38.57 
 
 		 346 aa  172  5e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.32318  normal  0.119045 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1594  putative alpha/beta hydrolase  32.85 
 
 		 320 aa  146  5e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.404575 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2167  alpha/beta hydrolase fold  35.89 
 
 		 317 aa  145  6e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0129  alpha/beta hydrolase fold  35.76 
 
 		 338 aa  145  9e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.773269  normal  0.28797 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0011  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase)  35.08 
 
 		 317 aa  144  2e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.903743  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2534  alpha/beta hydrolase fold  31.75 
 
 		 330 aa  144  2e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3884  alpha/beta hydrolase fold  32.06 
 
 		 341 aa  144  3e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.447806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1641  alpha/beta hydrolase fold  35.08 
 
 		 317 aa  143  5e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.24202 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2352  alpha/beta hydrolase  32.18 
 
 		 314 aa  137  2e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.517024  normal  0.362082 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2743  alpha/beta hydrolase fold  33.73 
 
 		 331 aa  130  3e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.529791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3829  alpha/beta hydrolase fold  34.47 
 
 		 331 aa  129  6e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2970  alpha/beta hydrolase fold protein  33.86 
 
 		 331 aa  129  9.000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1380  alpha/beta hydrolase fold  31.89 
 
 		 321 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1838  alpha/beta hydrolase fold  32.37 
 
 		 333 aa  126  5e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.886983  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1468  alpha/beta hydrolase fold  32.58 
 
 		 340 aa  122  9e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.890362 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2865  alpha/beta hydrolase fold  32.68 
 
 		 331 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0102  alpha/beta hydrolase fold  28.97 
 
 		 332 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0087  alpha/beta hydrolase fold protein  28.97 
 
 		 332 aa  116  5e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1905  alpha/beta hydrolase fold  28.19 
 
 		 354 aa  114  3e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5045  alpha/beta hydrolase fold  30.74 
 
 		 325 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.6879  normal  0.399471 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8725  alpha/beta hydrolase fold protein  27.85 
 
 		 332 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1011  alpha/beta hydrolase fold  29.24 
 
 		 322 aa  112  8.000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.99925 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49180  Alpha/beta hydrolase fold protein  29.45 
 
 		 321 aa  111  2.0000000000000002e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5377  alpha/beta hydrolase fold protein  26.67 
 
 		 332 aa  110  3e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.306055  normal  0.839367 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0056  alpha/beta hydrolase fold  28.62 
 
 		 332 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5411  alpha/beta hydrolase fold  30.8 
 
 		 328 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.173049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3567  alpha/beta hydrolase fold  28.85 
 
 		 328 aa  109  5e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.253365  hitchhiker  0.00645223 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6057  alpha/beta hydrolase fold  28.33 
 
 		 332 aa  107  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00402067  normal  0.493992 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0434  alpha/beta hydrolase fold  30.08 
 
 		 318 aa  106  5e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.332302  hitchhiker  0.0000000111123 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1140  alpha/beta hydrolase fold  26.81 
 
 		 320 aa  106  6e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.64719  normal  0.115917 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0105  alpha/beta hydrolase  31.14 
 
 		 328 aa  103  3e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00875507  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4934  Alpha/beta hydrolase fold  31.64 
 
 		 320 aa  101  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4699  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 		 327 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3663  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 		 327 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.378837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2445  Alpha/beta hydrolase  28.57 
 
 		 327 aa  100  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0446  alpha/beta hydrolase fold protein  28.46 
 
 		 318 aa  100  3e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.2537  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3858  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 		 327 aa  100  4e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.387123 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5011  putative alpha/beta hydrolase  28.07 
 
 		 350 aa  100  5e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.418737  normal  0.1806 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5140  alpha/beta hydrolase fold  34.38 
 
 		 305 aa  99.8  6e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.773664  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1076  hypothetical protein  27.68 
 
 		 324 aa  95.9  8e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.773392  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0099  alpha/beta fold family hydrolase  26.48 
 
 		 324 aa  95.5  1e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2822  alpha/beta fold family hydrolase  26.48 
 
 		 324 aa  95.5  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2675  alpha/beta fold family hydrolase  27.68 
 
 		 324 aa  95.5  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.457884  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1260  alpha/beta fold family hydrolase  26.48 
 
 		 327 aa  95.5  1e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.809  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2945  alpha/beta hydrolase fold protein  27.92 
 
 		 330 aa  94.7  2e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0402  alpha/beta fold family hydrolase  27.84 
 
 		 324 aa  94  3e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2782  alpha/beta hydrolase fold protein  27.17 
 
 		 325 aa  94  3e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2989  alpha/beta hydrolase fold  27.04 
 
 		 339 aa  90.5  4e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.720192 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1316  alpha/beta hydrolase fold  25.5 
 
 		 311 aa  89.7  6e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.541831  normal  0.727397 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1512  alpha/beta hydrolase fold protein  25.5 
 
 		 311 aa  89.7  6e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0118  alpha/beta fold family hydrolase  26.3 
 
 		 326 aa  88.2  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.347516  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03823  Alpha/beta hydrolase fold protein  27.64 
 
 		 310 aa  88.2  2e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1537  alpha/beta fold family hydrolase  26.3 
 
 		 326 aa  88.2  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3642  alpha/beta hydrolase fold  29.6 
 
 		 379 aa  86.7  5e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.20936  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3466  alpha/beta hydrolase fold protein  28.3 
 
 		 390 aa  85.1  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3935  alpha/beta hydrolase fold protein  29.2 
 
 		 371 aa  84  0.000000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2535  alpha/beta hydrolase fold  27.91 
 
 		 344 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2720  alpha/beta hydrolase fold protein  28.41 
 
 		 342 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0672  alpha/beta hydrolase fold  27.8 
 
 		 315 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.240082 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5680  alpha/beta hydrolase fold protein  29.88 
 
 		 324 aa  80.5  0.00000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3925  alpha/beta hydrolase fold  29.43 
 
 		 367 aa  78.6  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.182869  normal  0.384279 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1491  alpha/beta hydrolase fold  26.32 
 
 		 297 aa  73.9  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00412587  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1080  alpha/beta hydrolase fold  26.62 
 
 		 296 aa  72.8  0.000000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1253  alpha/beta hydrolase fold  24.6 
 
 		 298 aa  72.4  0.000000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.188153  normal  0.590935 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1095  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 		 302 aa  70.9  0.00000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1825  alpha/beta hydrolase fold  30.33 
 
 		 243 aa  69.3  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.388616  normal  0.284005 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1353  alpha/beta hydrolase fold  24.09 
 
 		 339 aa  68.2  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.687878  normal  0.202512 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3298  hypothetical protein  36.7 
 
 		 258 aa  67.4  0.0000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.24994 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2696  alpha/beta hydrolase fold  25.1 
 
 		 312 aa  67  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.623815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2918  alpha/beta hydrolase fold  25.79 
 
 		 312 aa  66.6  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.906544 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0741  hypothetical protein  31.62 
 
 		 292 aa  66.6  0.0000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4806  alpha/beta hydrolase fold  27.55 
 
 		 321 aa  66.2  0.0000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.786039  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4425  alpha/beta hydrolase fold  27.55 
 
 		 321 aa  66.2  0.0000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4512  alpha/beta hydrolase fold  27.55 
 
 		 321 aa  66.2  0.0000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.999363 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1258  putative hydrolase  25.79 
 
 		 312 aa  65.9  0.0000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2964  alpha/beta hydrolase fold  35.45 
 
 		 282 aa  65.1  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1546  alpha/beta hydrolase fold  39.6 
 
 		 285 aa  65.5  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.834926  hitchhiker  0.0047604 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5766  alpha/beta hydrolase fold protein  26.17 
 
 		 302 aa  65.5  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2354  alpha/beta hydrolase fold protein  30.92 
 
 		 279 aa  64.7  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0658883  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1412  alpha/beta fold family hydrolase  25.09 
 
 		 295 aa  65.1  0.000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.405065 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0396  alpha/beta hydrolase fold protein  32.88 
 
 		 255 aa  63.9  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.075233 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0800  alpha/beta hydrolase fold  26.14 
 
 		 267 aa  63.9  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.156653 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2273  alpha/beta hydrolase fold  39.18 
 
 		 259 aa  63.5  0.000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000254072  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3798  alpha/beta hydrolase fold protein  28.45 
 
 		 258 aa  63.5  0.000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2519  alpha/beta hydrolase fold  28.21 
 
 		 243 aa  63.5  0.000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.54258 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2494  alpha/beta hydrolase fold protein  26.09 
 
 		 297 aa  63.5  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.120593  normal  0.158717 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2405  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  41.35 
 
 		 369 aa  63.2  0.000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0222007  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9504  alpha/beta hydrolase protein  40.54 
 
 		 272 aa  62.8  0.000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.932687  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0178  alpha/beta fold family hydrolase  35.64 
 
 		 296 aa  62.8  0.000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>