More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_5961 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_5961  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 
345 aa  662    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.576377  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5208  alpha/beta hydrolase fold  87.21 
 
 
346 aa  499  1e-140  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.32318  normal  0.119045 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2970  alpha/beta hydrolase fold protein  53.4 
 
 
331 aa  301  8.000000000000001e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2743  alpha/beta hydrolase fold  54.82 
 
 
331 aa  300  3e-80  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.529791  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2865  alpha/beta hydrolase fold  54.89 
 
 
331 aa  292  6e-78  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0129  alpha/beta hydrolase fold  55.56 
 
 
338 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.773269  normal  0.28797 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1660  putative alpha/beta hydrolase  45.11 
 
 
319 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1400  alpha/beta hydrolase fold  44 
 
 
320 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.700473 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3987  alpha/beta hydrolase fold  44.97 
 
 
329 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.38084 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4675  alpha/beta hydrolase fold  45.79 
 
 
334 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.719467  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1217  alpha/beta hydrolase fold  44.37 
 
 
342 aa  208  1e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1420  alpha/beta hydrolase fold  43.14 
 
 
320 aa  204  2e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3278  alpha/beta hydrolase fold  38.74 
 
 
351 aa  194  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3577  alpha/beta hydrolase fold protein  37.38 
 
 
358 aa  194  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.351187  normal  0.127844 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3689  hypothetical protein  38.39 
 
 
335 aa  193  4e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.29493  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2029  alpha/beta hydrolase fold  41.26 
 
 
343 aa  189  4e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.62215 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1838  alpha/beta hydrolase fold  41.91 
 
 
333 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.886983  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1594  putative alpha/beta hydrolase  41.46 
 
 
320 aa  183  5.0000000000000004e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.404575 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2534  alpha/beta hydrolase fold  37.5 
 
 
330 aa  179  5.999999999999999e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3884  alpha/beta hydrolase fold  40.25 
 
 
341 aa  177  3e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.447806  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1468  alpha/beta hydrolase fold  39.86 
 
 
340 aa  170  3e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.890362 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3829  alpha/beta hydrolase fold  40.79 
 
 
331 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2167  alpha/beta hydrolase fold  35.11 
 
 
317 aa  154  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0011  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase)  34.51 
 
 
317 aa  152  1e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.903743  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1641  alpha/beta hydrolase fold  34.51 
 
 
317 aa  151  2e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.24202 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0105  alpha/beta hydrolase  38.94 
 
 
328 aa  144  3e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00875507  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1011  alpha/beta hydrolase fold  35.9 
 
 
322 aa  139  7e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.99925 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49180  Alpha/beta hydrolase fold protein  34.84 
 
 
321 aa  137  2e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1140  alpha/beta hydrolase fold  32.03 
 
 
320 aa  135  8e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.64719  normal  0.115917 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2352  alpha/beta hydrolase  34.65 
 
 
314 aa  132  6.999999999999999e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.517024  normal  0.362082 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4934  Alpha/beta hydrolase fold  37.03 
 
 
320 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03823  Alpha/beta hydrolase fold protein  29.81 
 
 
310 aa  127  3e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5011  putative alpha/beta hydrolase  34.87 
 
 
350 aa  127  3e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.418737  normal  0.1806 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3642  alpha/beta hydrolase fold  34.3 
 
 
379 aa  124  2e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.20936  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3935  alpha/beta hydrolase fold protein  35.67 
 
 
371 aa  125  2e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8725  alpha/beta hydrolase fold protein  32.21 
 
 
332 aa  124  3e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0056  alpha/beta hydrolase fold  31.86 
 
 
332 aa  123  5e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0102  alpha/beta hydrolase fold  31.53 
 
 
332 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2782  alpha/beta hydrolase fold protein  31.67 
 
 
325 aa  120  3e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5411  alpha/beta hydrolase fold  35.45 
 
 
328 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.173049  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0087  alpha/beta hydrolase fold protein  31.53 
 
 
332 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1380  alpha/beta hydrolase fold  28.44 
 
 
321 aa  118  9.999999999999999e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5377  alpha/beta hydrolase fold protein  30.28 
 
 
332 aa  117  3e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.306055  normal  0.839367 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1905  alpha/beta hydrolase fold  31.06 
 
 
354 aa  117  3e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3567  alpha/beta hydrolase fold  34.78 
 
 
328 aa  116  6e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.253365  hitchhiker  0.00645223 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3466  alpha/beta hydrolase fold protein  33.56 
 
 
390 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5045  alpha/beta hydrolase fold  34.73 
 
 
325 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.6879  normal  0.399471 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3925  alpha/beta hydrolase fold  36.05 
 
 
367 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.182869  normal  0.384279 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2989  alpha/beta hydrolase fold  31.45 
 
 
339 aa  115  1.0000000000000001e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.720192 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2535  alpha/beta hydrolase fold  33.22 
 
 
344 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2945  alpha/beta hydrolase fold protein  30.79 
 
 
330 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2445  Alpha/beta hydrolase  33.56 
 
 
327 aa  110  5e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2720  alpha/beta hydrolase fold protein  31.38 
 
 
342 aa  108  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0434  alpha/beta hydrolase fold  31.41 
 
 
318 aa  107  4e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.332302  hitchhiker  0.0000000111123 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3858  alpha/beta hydrolase fold  32.76 
 
 
327 aa  106  5e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.387123 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0446  alpha/beta hydrolase fold protein  32.37 
 
 
318 aa  105  8e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.2537  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4699  alpha/beta hydrolase fold  32.98 
 
 
327 aa  105  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1316  alpha/beta hydrolase fold  32 
 
 
311 aa  105  2e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.541831  normal  0.727397 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3663  alpha/beta hydrolase fold  32.98 
 
 
327 aa  105  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.378837  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1512  alpha/beta hydrolase fold protein  32 
 
 
311 aa  105  2e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0402  alpha/beta fold family hydrolase  32.78 
 
 
324 aa  103  4e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0099  alpha/beta fold family hydrolase  32.44 
 
 
324 aa  103  5e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2675  alpha/beta fold family hydrolase  32.44 
 
 
324 aa  103  5e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.457884  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1260  alpha/beta fold family hydrolase  32.44 
 
 
327 aa  103  5e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.809  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2822  alpha/beta fold family hydrolase  32.44 
 
 
324 aa  103  5e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1076  hypothetical protein  32.44 
 
 
324 aa  102  7e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.773392  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6057  alpha/beta hydrolase fold  29.48 
 
 
332 aa  99.8  7e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00402067  normal  0.493992 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5140  alpha/beta hydrolase fold  36.28 
 
 
305 aa  99  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.773664  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0118  alpha/beta fold family hydrolase  32.23 
 
 
326 aa  92  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.347516  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1537  alpha/beta fold family hydrolase  32.23 
 
 
326 aa  92  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2885  alpha/beta hydrolase fold protein  34.77 
 
 
275 aa  82.8  0.000000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00297178 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4425  alpha/beta hydrolase fold  28.9 
 
 
321 aa  82.4  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4806  alpha/beta hydrolase fold  28.9 
 
 
321 aa  82.4  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.786039  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4512  alpha/beta hydrolase fold  28.9 
 
 
321 aa  82.4  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.999363 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1491  alpha/beta hydrolase fold  28.26 
 
 
297 aa  77.4  0.0000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00412587  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1095  alpha/beta hydrolase fold  27.05 
 
 
302 aa  75.9  0.0000000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0935  alpha/beta hydrolase fold  29.02 
 
 
288 aa  75.5  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0423109  normal  0.641404 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5680  alpha/beta hydrolase fold protein  31.48 
 
 
324 aa  75.1  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5766  alpha/beta hydrolase fold protein  30.11 
 
 
302 aa  73.9  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6643  putative triacylglycerol lipase  28.92 
 
 
275 aa  73.9  0.000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.192902  normal  0.181736 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1253  alpha/beta hydrolase fold  29.3 
 
 
298 aa  73.2  0.000000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.188153  normal  0.590935 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3841  alpha/beta hydrolase fold  30.03 
 
 
288 aa  72  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2696  alpha/beta hydrolase fold  30.9 
 
 
312 aa  72  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.623815  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0119  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  34.72 
 
 
380 aa  69.7  0.00000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.156608 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1463  Alpha/beta hydrolase  36.84 
 
 
278 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.234917  normal  0.480235 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1656  alpha/beta hydrolase fold  29.52 
 
 
304 aa  68.9  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4655  alpha/beta hydrolase fold protein  33.68 
 
 
305 aa  68.6  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.159987  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2705  alpha/beta hydrolase fold  29.39 
 
 
309 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.601677  normal  0.0914485 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4150  alpha/beta hydrolase fold protein  29.35 
 
 
288 aa  68.6  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0383403  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0033  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 
290 aa  67.4  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0074  alpha/beta hydrolase fold  26.37 
 
 
275 aa  67.4  0.0000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.224768  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2553  alpha/beta hydrolase fold  34.97 
 
 
354 aa  67.4  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.988163  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3264  hydrolase, alpha/beta fold family  26.52 
 
 
332 aa  67  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.250309  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0741  hypothetical protein  39.86 
 
 
292 aa  67  0.0000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0682  Alpha/beta hydrolase  38.82 
 
 
392 aa  67  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.904983  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2918  alpha/beta hydrolase fold  29.97 
 
 
312 aa  67.4  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.906544 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1620  alpha/beta hydrolase fold  32.74 
 
 
303 aa  67  0.0000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  30.72 
 
 
299 aa  66.2  0.0000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2626  alpha/beta hydrolase fold  26.19 
 
 
330 aa  66.2  0.0000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0626174  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1553  alpha/beta hydrolase fold protein  27.37 
 
 
286 aa  65.9  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000230075  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>