More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_2167 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_2167  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 317 aa  629  1e-179  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0011  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase)  89.91 
 
 		 317 aa  551  1e-156  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.903743  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1641  alpha/beta hydrolase fold  90.22 
 
 		 317 aa  552  1e-156  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.24202 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1380  alpha/beta hydrolase fold  48.29 
 
 		 321 aa  296  4e-79  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1594  putative alpha/beta hydrolase  47.59 
 
 		 320 aa  264  1e-69  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.404575 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2352  alpha/beta hydrolase  44.41 
 
 		 314 aa  243  3.9999999999999997e-63  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.517024  normal  0.362082 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2029  alpha/beta hydrolase fold  38.19 
 
 		 343 aa  175  9.999999999999999e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.62215 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3278  alpha/beta hydrolase fold  34.48 
 
 		 351 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5208  alpha/beta hydrolase fold  36.68 
 
 		 346 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.32318  normal  0.119045 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3577  alpha/beta hydrolase fold protein  33.22 
 
 		 358 aa  158  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.351187  normal  0.127844 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3689  hypothetical protein  35.77 
 
 		 335 aa  151  1e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.29493  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5377  alpha/beta hydrolase fold protein  34.07 
 
 		 332 aa  151  1e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.306055  normal  0.839367 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8725  alpha/beta hydrolase fold protein  35.64 
 
 		 332 aa  150  3e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0102  alpha/beta hydrolase fold  34.59 
 
 		 332 aa  150  3e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5961  alpha/beta hydrolase fold protein  34.81 
 
 		 345 aa  149  5e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.576377  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1905  alpha/beta hydrolase fold  33.79 
 
 		 354 aa  145  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0056  alpha/beta hydrolase fold  33.56 
 
 		 332 aa  142  8e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0105  alpha/beta hydrolase  33.56 
 
 		 328 aa  141  9.999999999999999e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00875507  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3466  alpha/beta hydrolase fold protein  31.25 
 
 		 390 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3987  alpha/beta hydrolase fold  32.63 
 
 		 329 aa  139  7.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.38084 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0087  alpha/beta hydrolase fold protein  32.78 
 
 		 332 aa  138  1e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2720  alpha/beta hydrolase fold protein  32.97 
 
 		 342 aa  138  1e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1660  putative alpha/beta hydrolase  30.19 
 
 		 319 aa  137  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2782  alpha/beta hydrolase fold protein  34.59 
 
 		 325 aa  137  2e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2535  alpha/beta hydrolase fold  32.27 
 
 		 344 aa  136  4e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1316  alpha/beta hydrolase fold  32.78 
 
 		 311 aa  136  4e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.541831  normal  0.727397 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1512  alpha/beta hydrolase fold protein  32.78 
 
 		 311 aa  136  4e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49180  Alpha/beta hydrolase fold protein  34.11 
 
 		 321 aa  136  6.0000000000000005e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2945  alpha/beta hydrolase fold protein  33.96 
 
 		 330 aa  135  7.000000000000001e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3935  alpha/beta hydrolase fold protein  32.4 
 
 		 371 aa  135  9e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5011  putative alpha/beta hydrolase  33.45 
 
 		 350 aa  134  9.999999999999999e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.418737  normal  0.1806 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3642  alpha/beta hydrolase fold  32.42 
 
 		 379 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.20936  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6057  alpha/beta hydrolase fold  34.63 
 
 		 332 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00402067  normal  0.493992 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3925  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 367 aa  133  5e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.182869  normal  0.384279 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1420  alpha/beta hydrolase fold  30.1 
 
 		 320 aa  133  5e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4675  alpha/beta hydrolase fold  30.45 
 
 		 334 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.719467  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5140  alpha/beta hydrolase fold  35.47 
 
 		 305 aa  129  6e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.773664  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1217  alpha/beta hydrolase fold  29.68 
 
 		 342 aa  129  7.000000000000001e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3884  alpha/beta hydrolase fold  33 
 
 		 341 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.447806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1011  alpha/beta hydrolase fold  29.06 
 
 		 322 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.99925 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1400  alpha/beta hydrolase fold  29.51 
 
 		 320 aa  127  3e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.700473 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1140  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 		 320 aa  121  9.999999999999999e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.64719  normal  0.115917 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1838  alpha/beta hydrolase fold  32.67 
 
 		 333 aa  120  3e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.886983  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0129  alpha/beta hydrolase fold  34.35 
 
 		 338 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.773269  normal  0.28797 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5045  alpha/beta hydrolase fold  30.82 
 
 		 325 aa  117  3e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.6879  normal  0.399471 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2989  alpha/beta hydrolase fold  28.47 
 
 		 339 aa  117  3e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.720192 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1468  alpha/beta hydrolase fold  31.25 
 
 		 340 aa  116  5e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.890362 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2534  alpha/beta hydrolase fold  29.52 
 
 		 330 aa  116  5e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2743  alpha/beta hydrolase fold  32.54 
 
 		 331 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.529791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4934  Alpha/beta hydrolase fold  32.13 
 
 		 320 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3567  alpha/beta hydrolase fold  30.66 
 
 		 328 aa  114  3e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.253365  hitchhiker  0.00645223 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3858  alpha/beta hydrolase fold  29.75 
 
 		 327 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.387123 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03823  Alpha/beta hydrolase fold protein  28.79 
 
 		 310 aa  111  1.0000000000000001e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0446  alpha/beta hydrolase fold protein  28.52 
 
 		 318 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.2537  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0434  alpha/beta hydrolase fold  28.52 
 
 		 318 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.332302  hitchhiker  0.0000000111123 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2445  Alpha/beta hydrolase  29.75 
 
 		 327 aa  110  3e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4699  alpha/beta hydrolase fold  29.75 
 
 		 327 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5411  alpha/beta hydrolase fold  30.82 
 
 		 328 aa  110  3e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.173049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3663  alpha/beta hydrolase fold  29.75 
 
 		 327 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.378837  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2970  alpha/beta hydrolase fold protein  31.27 
 
 		 331 aa  107  3e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2822  alpha/beta fold family hydrolase  29.39 
 
 		 324 aa  106  6e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0099  alpha/beta fold family hydrolase  29.39 
 
 		 324 aa  106  6e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1076  hypothetical protein  29.39 
 
 		 324 aa  106  6e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.773392  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1260  alpha/beta fold family hydrolase  29.39 
 
 		 327 aa  106  6e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.809  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2675  alpha/beta fold family hydrolase  29.39 
 
 		 324 aa  105  7e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.457884  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0402  alpha/beta fold family hydrolase  29.14 
 
 		 324 aa  105  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3829  alpha/beta hydrolase fold  30.15 
 
 		 331 aa  97.1  4e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0118  alpha/beta fold family hydrolase  29.17 
 
 		 326 aa  94.4  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.347516  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1537  alpha/beta fold family hydrolase  29.17 
 
 		 326 aa  94.4  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2865  alpha/beta hydrolase fold  28.1 
 
 		 331 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5680  alpha/beta hydrolase fold protein  29.52 
 
 		 324 aa  86.3  6e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0741  hypothetical protein  41.67 
 
 		 292 aa  85.1  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0672  alpha/beta hydrolase fold  28.42 
 
 		 315 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.240082 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2367  alpha/beta hydrolase fold  29.35 
 
 		 291 aa  83.2  0.000000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.926143  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3733  magnesium chelatase accessory protein  28.29 
 
 		 293 aa  83.2  0.000000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.229293  normal  0.0818214 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3504  magnesium-chelatase 30 kDa subunit  25.35 
 
 		 302 aa  83.2  0.000000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.477882 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0912  alpha/beta hydrolase fold  29.35 
 
 		 264 aa  82.4  0.000000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4681  alpha/beta hydrolase fold protein  31.01 
 
 		 333 aa  81.6  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1620  alpha/beta hydrolase fold  27.05 
 
 		 303 aa  82  0.00000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  29.5 
 
 		 287 aa  80.9  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1770  alpha/beta hydrolase fold  24.12 
 
 		 323 aa  80.1  0.00000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00973065  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3776  alpha/beta hydrolase fold  29.5 
 
 		 361 aa  78.6  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.904669  decreased coverage  0.00241214 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12729  hydrolase  29.47 
 
 		 341 aa  78.6  0.0000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1080  alpha/beta hydrolase fold  27.15 
 
 		 296 aa  79  0.0000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4806  alpha/beta hydrolase fold  27.21 
 
 		 321 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.786039  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4425  alpha/beta hydrolase fold  27.21 
 
 		 321 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4512  alpha/beta hydrolase fold  27.21 
 
 		 321 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.999363 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0527  inner-membrane translocator  26.55 
 
 		 562 aa  76.6  0.0000000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.142697  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1095  alpha/beta hydrolase fold  24.57 
 
 		 302 aa  76.6  0.0000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0837  alpha/beta fold family hydrolase  26.32 
 
 		 299 aa  75.5  0.000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0608  alpha/beta hydrolase fold  27.48 
 
 		 300 aa  75.1  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0379  alpha/beta hydrolase fold  28.52 
 
 		 327 aa  75.5  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1945  alpha/beta hydrolase fold  28.19 
 
 		 346 aa  75.5  0.000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2065  magnesium chelatase accessory protein  27.57 
 
 		 384 aa  73.6  0.000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.178825 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0952  alpha/beta hydrolase fold  31.56 
 
 		 350 aa  73.2  0.000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167574  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2705  alpha/beta hydrolase fold  28.24 
 
 		 309 aa  72.8  0.000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.601677  normal  0.0914485 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4279  alpha/beta hydrolase fold  27.72 
 
 		 290 aa  73.2  0.000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0429244  normal  0.222336 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1353  alpha/beta hydrolase fold  26.23 
 
 		 339 aa  72.8  0.000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.687878  normal  0.202512 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2212  putative lipase  29.04 
 
 		 315 aa  72.8  0.000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.799877  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5766  alpha/beta hydrolase fold protein  26.09 
 
 		 302 aa  72.8  0.000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>