More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_3466 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_3466  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 		 390 aa  776    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2720  alpha/beta hydrolase fold protein  72.22 
 
 		 342 aa  491  9.999999999999999e-139  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2535  alpha/beta hydrolase fold  68.33 
 
 		 344 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3935  alpha/beta hydrolase fold protein  55.39 
 
 		 371 aa  359  4e-98  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3642  alpha/beta hydrolase fold  54.2 
 
 		 379 aa  354  1e-96  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.20936  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3925  alpha/beta hydrolase fold  53.62 
 
 		 367 aa  345  1e-93  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.182869  normal  0.384279 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5377  alpha/beta hydrolase fold protein  51.65 
 
 		 332 aa  291  2e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.306055  normal  0.839367 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8725  alpha/beta hydrolase fold protein  50 
 
 		 332 aa  281  1e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1905  alpha/beta hydrolase fold  49.47 
 
 		 354 aa  281  2e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0056  alpha/beta hydrolase fold  50.55 
 
 		 332 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0102  alpha/beta hydrolase fold  50.55 
 
 		 332 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0087  alpha/beta hydrolase fold protein  48.24 
 
 		 332 aa  266  5.999999999999999e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6057  alpha/beta hydrolase fold  49.26 
 
 		 332 aa  265  1e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00402067  normal  0.493992 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5011  putative alpha/beta hydrolase  44.88 
 
 		 350 aa  260  3e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.418737  normal  0.1806 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1512  alpha/beta hydrolase fold protein  47.06 
 
 		 311 aa  259  8e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1316  alpha/beta hydrolase fold  47.06 
 
 		 311 aa  259  8e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.541831  normal  0.727397 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49180  Alpha/beta hydrolase fold protein  46.13 
 
 		 321 aa  254  1.0000000000000001e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2782  alpha/beta hydrolase fold protein  44.85 
 
 		 325 aa  242  7.999999999999999e-63  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2945  alpha/beta hydrolase fold protein  43.57 
 
 		 330 aa  235  9e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2989  alpha/beta hydrolase fold  43.31 
 
 		 339 aa  230  4e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.720192 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2029  alpha/beta hydrolase fold  34.24 
 
 		 343 aa  146  5e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.62215 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0011  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase)  33.44 
 
 		 317 aa  144  3e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.903743  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1641  alpha/beta hydrolase fold  33.44 
 
 		 317 aa  144  3e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.24202 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2352  alpha/beta hydrolase  35.62 
 
 		 314 aa  143  6e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.517024  normal  0.362082 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2167  alpha/beta hydrolase fold  31.19 
 
 		 317 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0741  hypothetical protein  46.48 
 
 		 292 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0105  alpha/beta hydrolase  34.52 
 
 		 328 aa  132  6.999999999999999e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00875507  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5140  alpha/beta hydrolase fold  34.04 
 
 		 305 aa  127  3e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.773664  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0129  alpha/beta hydrolase fold  37.15 
 
 		 338 aa  125  9e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.773269  normal  0.28797 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1140  alpha/beta hydrolase fold  31.67 
 
 		 320 aa  125  9e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.64719  normal  0.115917 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1660  putative alpha/beta hydrolase  32.74 
 
 		 319 aa  124  3e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1594  putative alpha/beta hydrolase  30.58 
 
 		 320 aa  124  3e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.404575 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4934  Alpha/beta hydrolase fold  33.82 
 
 		 320 aa  122  8e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1380  alpha/beta hydrolase fold  30.21 
 
 		 321 aa  122  9.999999999999999e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1217  alpha/beta hydrolase fold  33.92 
 
 		 342 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3987  alpha/beta hydrolase fold  33.69 
 
 		 329 aa  119  7e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.38084 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1011  alpha/beta hydrolase fold  30.9 
 
 		 322 aa  116  7.999999999999999e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.99925 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03823  Alpha/beta hydrolase fold protein  27.34 
 
 		 310 aa  109  1e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5961  alpha/beta hydrolase fold protein  33.56 
 
 		 345 aa  109  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.576377  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0402  alpha/beta fold family hydrolase  31.31 
 
 		 324 aa  107  5e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5208  alpha/beta hydrolase fold  33.9 
 
 		 346 aa  107  5e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.32318  normal  0.119045 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2822  alpha/beta fold family hydrolase  30.98 
 
 		 324 aa  106  9e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0099  alpha/beta fold family hydrolase  30.98 
 
 		 324 aa  106  9e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1076  hypothetical protein  30.98 
 
 		 324 aa  106  9e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.773392  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1838  alpha/beta hydrolase fold  31.33 
 
 		 333 aa  106  9e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.886983  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2675  alpha/beta fold family hydrolase  30.98 
 
 		 324 aa  105  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.457884  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1260  alpha/beta fold family hydrolase  30.98 
 
 		 327 aa  105  1e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.809  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2743  alpha/beta hydrolase fold  32.33 
 
 		 331 aa  104  2e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.529791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3884  alpha/beta hydrolase fold  28.1 
 
 		 341 aa  105  2e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.447806  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2865  alpha/beta hydrolase fold  32.45 
 
 		 331 aa  104  3e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0446  alpha/beta hydrolase fold protein  29.14 
 
 		 318 aa  104  3e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.2537  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0434  alpha/beta hydrolase fold  29.52 
 
 		 318 aa  103  6e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.332302  hitchhiker  0.0000000111123 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2970  alpha/beta hydrolase fold protein  31.91 
 
 		 331 aa  102  8e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1468  alpha/beta hydrolase fold  30.74 
 
 		 340 aa  101  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.890362 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3858  alpha/beta hydrolase fold  30.48 
 
 		 327 aa  100  5e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.387123 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4675  alpha/beta hydrolase fold  29.5 
 
 		 334 aa  100  6e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.719467  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4699  alpha/beta hydrolase fold  30.48 
 
 		 327 aa  99.4  9e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3663  alpha/beta hydrolase fold  30.48 
 
 		 327 aa  99.4  9e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.378837  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3567  alpha/beta hydrolase fold  31.02 
 
 		 328 aa  97.8  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.253365  hitchhiker  0.00645223 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1420  alpha/beta hydrolase fold  28.67 
 
 		 320 aa  96.7  6e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5045  alpha/beta hydrolase fold  29.74 
 
 		 325 aa  96.7  7e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.6879  normal  0.399471 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1400  alpha/beta hydrolase fold  29.18 
 
 		 320 aa  96.3  8e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.700473 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2534  alpha/beta hydrolase fold  27.74 
 
 		 330 aa  95.5  1e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1095  alpha/beta hydrolase fold  27.96 
 
 		 302 aa  95.9  1e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3278  alpha/beta hydrolase fold  28.34 
 
 		 351 aa  95.5  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2445  Alpha/beta hydrolase  30.11 
 
 		 327 aa  95.1  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3829  alpha/beta hydrolase fold  30.83 
 
 		 331 aa  95.5  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5411  alpha/beta hydrolase fold  30.86 
 
 		 328 aa  93.2  6e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.173049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0118  alpha/beta fold family hydrolase  28.62 
 
 		 326 aa  93.2  8e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.347516  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1537  alpha/beta fold family hydrolase  28.62 
 
 		 326 aa  93.2  8e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0608  alpha/beta hydrolase fold  28.07 
 
 		 300 aa  92.4  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1080  alpha/beta hydrolase fold  29.37 
 
 		 296 aa  89.4  9e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3577  alpha/beta hydrolase fold protein  27.14 
 
 		 358 aa  85.5  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.351187  normal  0.127844 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5680  alpha/beta hydrolase fold protein  28.87 
 
 		 324 aa  85.9  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3689  hypothetical protein  28.3 
 
 		 335 aa  85.1  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.29493  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11862  haloalkane dehalogenase  28.83 
 
 		 286 aa  84  0.000000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.608613 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0527  inner-membrane translocator  34.13 
 
 		 562 aa  82.8  0.000000000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.142697  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1736  alpha/beta hydrolase fold  29.61 
 
 		 290 aa  82  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2528  alpha/beta hydrolase fold  26.78 
 
 		 301 aa  81.6  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1491  alpha/beta hydrolase fold  27.1 
 
 		 297 aa  80.9  0.00000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00412587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0672  alpha/beta hydrolase fold  30.04 
 
 		 315 aa  80.5  0.00000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.240082 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2009  alpha/beta hydrolase fold  35.48 
 
 		 294 aa  80.1  0.00000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1788  alpha/beta hydrolase fold protein  37.5 
 
 		 279 aa  79.7  0.00000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0842408  hitchhiker  0.00140329 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3317  putative hydrolase or acyltransferase  26.22 
 
 		 296 aa  79.3  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0608  alpha/beta hydrolase fold  23.57 
 
 		 311 aa  79  0.0000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000717376  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0221  alpha/beta hydrolase fold  42.37 
 
 		 286 aa  79  0.0000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5766  alpha/beta hydrolase fold protein  27.31 
 
 		 302 aa  78.6  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1463  Alpha/beta hydrolase  35.38 
 
 		 278 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.234917  normal  0.480235 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0033  alpha/beta hydrolase fold  29.12 
 
 		 290 aa  78.6  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0547  twin-arginine translocation pathway signal  32.7 
 
 		 356 aa  77.8  0.0000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  29.45 
 
 		 295 aa  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1248  alpha/beta hydrolase fold-containing protein  25.19 
 
 		 311 aa  77.4  0.0000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0391  alpha/beta hydrolase fold  29.51 
 
 		 291 aa  77.4  0.0000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0403  alpha/beta hydrolase fold  29.51 
 
 		 291 aa  77.4  0.0000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0412  alpha/beta hydrolase fold  29.51 
 
 		 291 aa  77.4  0.0000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0866892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3071  alpha/beta hydrolase fold  32.2 
 
 		 290 aa  77  0.0000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.357729  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4806  alpha/beta hydrolase fold  27.24 
 
 		 321 aa  77  0.0000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.786039  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3786  Alpha/beta hydrolase fold  29.79 
 
 		 274 aa  77  0.0000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00563208  hitchhiker  0.00293132 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1253  alpha/beta hydrolase fold  23.96 
 
 		 298 aa  77  0.0000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.188153  normal  0.590935 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3421  putative hydrolase or acyltransferase  25.84 
 
 		 296 aa  77.4  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0121666 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>