More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_0608 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_0608  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 300 aa  596  1e-169  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5766  alpha/beta hydrolase fold protein  42.09 
 
 		 302 aa  183  3e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1316  alpha/beta hydrolase fold  30.36 
 
 		 311 aa  108  8.000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.541831  normal  0.727397 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1512  alpha/beta hydrolase fold protein  30.36 
 
 		 311 aa  108  8.000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5011  putative alpha/beta hydrolase  29.31 
 
 		 350 aa  108  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.418737  normal  0.1806 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8725  alpha/beta hydrolase fold protein  32.53 
 
 		 332 aa  107  3e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0056  alpha/beta hydrolase fold  32.65 
 
 		 332 aa  100  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0102  alpha/beta hydrolase fold  32.09 
 
 		 332 aa  99.8  5e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5377  alpha/beta hydrolase fold protein  31.45 
 
 		 332 aa  99.8  5e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.306055  normal  0.839367 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1594  putative alpha/beta hydrolase  27.66 
 
 		 320 aa  99  8e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.404575 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3466  alpha/beta hydrolase fold protein  28.07 
 
 		 390 aa  98.2  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0087  alpha/beta hydrolase fold protein  32.09 
 
 		 332 aa  97.8  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1905  alpha/beta hydrolase fold  30.1 
 
 		 354 aa  98.2  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2535  alpha/beta hydrolase fold  28.47 
 
 		 344 aa  97.1  4e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49180  Alpha/beta hydrolase fold protein  32.3 
 
 		 321 aa  94.4  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2720  alpha/beta hydrolase fold protein  28.57 
 
 		 342 aa  94.7  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6057  alpha/beta hydrolase fold  29.37 
 
 		 332 aa  89.7  6e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00402067  normal  0.493992 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3925  alpha/beta hydrolase fold  29.82 
 
 		 367 aa  89  8e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.182869  normal  0.384279 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2782  alpha/beta hydrolase fold protein  28.22 
 
 		 325 aa  88.6  1e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3935  alpha/beta hydrolase fold protein  28.73 
 
 		 371 aa  87.4  3e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0011  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase)  26.74 
 
 		 317 aa  85.1  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.903743  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3987  alpha/beta hydrolase fold  28.1 
 
 		 329 aa  85.1  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.38084 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1641  alpha/beta hydrolase fold  26.74 
 
 		 317 aa  84  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.24202 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2945  alpha/beta hydrolase fold protein  28.42 
 
 		 330 aa  84  0.000000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3642  alpha/beta hydrolase fold  28.36 
 
 		 379 aa  82.4  0.000000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.20936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3207  alpha/beta fold family hydrolase  31.05 
 
 		 271 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.39974  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1660  putative alpha/beta hydrolase  26.35 
 
 		 319 aa  79.7  0.00000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2167  alpha/beta hydrolase fold  26.6 
 
 		 317 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2893  alpha/beta fold family hydrolase  32.83 
 
 		 273 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.511984  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3470  alpha/beta fold family hydrolase  32.83 
 
 		 328 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3974  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  32.83 
 
 		 273 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0111  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  32.83 
 
 		 372 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3893  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  32.83 
 
 		 328 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.28749  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2989  alpha/beta hydrolase fold  26.51 
 
 		 339 aa  76.6  0.0000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.720192 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2534  alpha/beta hydrolase fold  27.64 
 
 		 330 aa  76.3  0.0000000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0504  inner-membrane translocator  30.5 
 
 		 571 aa  75.1  0.000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.92013  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1217  alpha/beta hydrolase fold  27.05 
 
 		 342 aa  75.1  0.000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4425  alpha/beta hydrolase fold  26.22 
 
 		 321 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4806  alpha/beta hydrolase fold  26.22 
 
 		 321 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.786039  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4512  alpha/beta hydrolase fold  26.22 
 
 		 321 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.999363 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5045  alpha/beta hydrolase fold  28.22 
 
 		 325 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.6879  normal  0.399471 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1140  alpha/beta hydrolase fold  26.98 
 
 		 320 aa  71.6  0.00000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.64719  normal  0.115917 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1420  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 		 320 aa  70.5  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0105  alpha/beta hydrolase  29.52 
 
 		 328 aa  69.7  0.00000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00875507  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1011  alpha/beta hydrolase fold  28.46 
 
 		 322 aa  69.3  0.00000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.99925 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4675  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 		 334 aa  69.3  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.719467  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5208  alpha/beta hydrolase fold  28.74 
 
 		 346 aa  68.9  0.00000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.32318  normal  0.119045 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1380  alpha/beta hydrolase fold  26.53 
 
 		 321 aa  67.4  0.0000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1400  alpha/beta hydrolase fold  25.08 
 
 		 320 aa  67  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.700473 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7062  alpha/beta hydrolase fold  28.78 
 
 		 296 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2675  alpha/beta fold family hydrolase  25.09 
 
 		 324 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.457884  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0741  hypothetical protein  40.15 
 
 		 292 aa  65.1  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0099  alpha/beta fold family hydrolase  25.09 
 
 		 324 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1260  alpha/beta fold family hydrolase  25.09 
 
 		 327 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.809  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1076  hypothetical protein  25.09 
 
 		 324 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.773392  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6120  alpha/beta hydrolase fold  32.26 
 
 		 272 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.894817  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1990  alpha/beta hydrolase fold protein  28.29 
 
 		 308 aa  64.3  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000207277 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2822  alpha/beta fold family hydrolase  25.09 
 
 		 324 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4100  alpha/beta hydrolase fold  42.72 
 
 		 303 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.100635 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5680  alpha/beta hydrolase fold protein  29.55 
 
 		 324 aa  64.7  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2420  alpha/beta hydrolase fold  26.07 
 
 		 278 aa  64.3  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0232728  decreased coverage  0.0000010023 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7407  Alpha/beta hydrolase  28.11 
 
 		 274 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.945303 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0402  alpha/beta fold family hydrolase  24.5 
 
 		 324 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5140  alpha/beta hydrolase fold  26.25 
 
 		 305 aa  63.5  0.000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.773664  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0074  alpha/beta hydrolase fold  29.46 
 
 		 275 aa  63.2  0.000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.224768  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2865  alpha/beta hydrolase fold  28.74 
 
 		 331 aa  63.2  0.000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1108  Alpha/beta hydrolase  38.71 
 
 		 298 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.024849  normal  0.376021 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2970  alpha/beta hydrolase fold protein  29.46 
 
 		 331 aa  63.2  0.000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0369  alpha/beta hydrolase fold protein  38.46 
 
 		 262 aa  62.4  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.598497 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4565  alpha/beta hydrolase fold  41.75 
 
 		 303 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0422308  hitchhiker  0.000747551 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0129  alpha/beta hydrolase fold  29.23 
 
 		 338 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.773269  normal  0.28797 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3858  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 283 aa  61.2  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.167759  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2456  alpha/beta hydrolase fold  32.84 
 
 		 278 aa  60.5  0.00000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0153839  normal  0.505758 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3987  alpha/beta hydrolase fold  39.81 
 
 		 298 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.136743  normal  0.0524037 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0178  alpha/beta fold family hydrolase  28.41 
 
 		 296 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5888  alpha/beta hydrolase fold  28.89 
 
 		 274 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.653505  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3786  Alpha/beta hydrolase fold  26.52 
 
 		 274 aa  59.7  0.00000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00563208  hitchhiker  0.00293132 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1827  alpha/beta hydrolase fold  30.72 
 
 		 285 aa  59.7  0.00000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3567  alpha/beta hydrolase fold  25.33 
 
 		 328 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.253365  hitchhiker  0.00645223 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1778  alpha/beta hydrolase fold  28.03 
 
 		 366 aa  59.7  0.00000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0401666  normal  0.253947 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5594  alpha/beta hydrolase fold  41.75 
 
 		 305 aa  59.3  0.00000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.106478 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3661  alpha/beta hydrolase fold  41.75 
 
 		 305 aa  59.3  0.00000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.193412  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4706  alpha/beta hydrolase fold  41.75 
 
 		 305 aa  59.3  0.00000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.456588  normal  0.159063 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2743  alpha/beta hydrolase fold  29.06 
 
 		 331 aa  58.5  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.529791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2009  alpha/beta hydrolase fold  32.7 
 
 		 294 aa  58.5  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2147  alpha/beta hydrolase fold  32.56 
 
 		 278 aa  58.5  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2352  alpha/beta hydrolase  28.26 
 
 		 314 aa  58.5  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.517024  normal  0.362082 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6154  alpha/beta hydrolase fold  27.84 
 
 		 274 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4771  alpha/beta hydrolase fold protein  39.2 
 
 		 278 aa  58.9  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0144083  hitchhiker  0.000189374 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2766  alpha/beta hydrolase fold protein  41.23 
 
 		 277 aa  58.5  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3110  alpha/beta hydrolase fold protein  35.25 
 
 		 304 aa  58.2  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.228638  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1812  alpha/beta hydrolase fold  21.14 
 
 		 297 aa  58.2  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.204114  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0033  alpha/beta hydrolase fold  27.02 
 
 		 290 aa  57.8  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6821  alpha/beta hydrolase fold protein  33.82 
 
 		 300 aa  57.4  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3655  alpha/beta hydrolase fold  26.52 
 
 		 312 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6489  alpha/beta hydrolase fold  26.6 
 
 		 274 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.802107 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5411  alpha/beta hydrolase fold  24.75 
 
 		 328 aa  57  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.173049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1236  alpha/beta fold family hydrolase  32.43 
 
 		 239 aa  57  0.0000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000165889  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3250  Alpha/beta hydrolase fold  28.81 
 
 		 273 aa  56.2  0.0000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000000000180136  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2253  alpha/beta hydrolase fold  23.89 
 
 		 309 aa  56.2  0.0000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.128112  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>