More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1788 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_1788  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 		 279 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0842408  hitchhiker  0.00140329 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0653  alpha/beta hydrolase fold protein  46.33 
 
 		 310 aa  248  5e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.754721  normal  0.0538261 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1790  alpha/beta hydrolase fold  45.28 
 
 		 287 aa  233  4.0000000000000004e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.333084  hitchhiker  0.00365614 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1382  alpha/beta hydrolase fold  42.69 
 
 		 287 aa  204  9e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.327578  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2181  alpha/beta hydrolase fold  42.75 
 
 		 273 aa  204  1e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9382  alpha/beta hydrolase fold protein  41.92 
 
 		 259 aa  203  3e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1509  alpha/beta hydrolase fold  41.47 
 
 		 261 aa  201  9.999999999999999e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.725835  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0737  alpha/beta hydrolase fold protein  38.28 
 
 		 273 aa  197  1.0000000000000001e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.755425  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2251  Alpha/beta hydrolase fold-1  39.46 
 
 		 284 aa  192  5e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.154511  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3177  Alpha/beta hydrolase fold-1  38.2 
 
 		 272 aa  190  2e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.97494  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0636  alpha/beta hydrolase fold protein  40.45 
 
 		 263 aa  189  5e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1695  alpha/beta hydrolase fold protein  39.92 
 
 		 284 aa  188  8e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.194275  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1622  alpha/beta hydrolase fold  39.92 
 
 		 284 aa  187  1e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2025  alpha/beta hydrolase fold protein  37.69 
 
 		 276 aa  187  1e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0565493 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3365  alpha/beta hydrolase fold  39.77 
 
 		 265 aa  186  3e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.6363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4536  alpha/beta hydrolase fold protein  37.06 
 
 		 279 aa  184  1.0000000000000001e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.821334  normal  0.0123379 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3293  alpha/beta hydrolase fold  37.64 
 
 		 323 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.104393  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3606  alpha/beta hydrolase fold  39 
 
 		 265 aa  182  7e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000510854 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3368  alpha/beta hydrolase fold protein  36.64 
 
 		 326 aa  176  3e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5414  alpha/beta hydrolase fold protein  39.06 
 
 		 261 aa  176  4e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0420195 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2120  alpha/beta hydrolase fold protein  37.5 
 
 		 284 aa  176  4e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.466438 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4208  alpha/beta hydrolase fold protein  41.56 
 
 		 268 aa  172  3.9999999999999995e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5863  alpha/beta hydrolase fold protein  38 
 
 		 265 aa  170  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.279453 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0017  alpha/beta hydrolase fold  34.09 
 
 		 327 aa  169  6e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0512561 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1367  alpha/beta hydrolase fold  38.93 
 
 		 310 aa  160  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.819345  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1470  alpha/beta hydrolase fold protein  36.63 
 
 		 315 aa  158  8e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2639  alpha/beta hydrolase fold  34.59 
 
 		 280 aa  158  1e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2684  alpha/beta hydrolase fold  34.59 
 
 		 280 aa  158  1e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.9064  normal  0.0215233 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1299  hypothetical protein  34.19 
 
 		 262 aa  157  2e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000000570356  normal  0.587837 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2668  alpha/beta hydrolase fold  34.21 
 
 		 280 aa  155  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.105125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1106  alpha/beta hydrolase fold protein  36.09 
 
 		 283 aa  154  1e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.112481  normal  0.804859 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5301  putative oxidoreductase protein  34.38 
 
 		 258 aa  140  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0102616  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2473  hypothetical protein  28.29 
 
 		 286 aa  126  5e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3027  alpha/beta hydrolase fold protein  32.34 
 
 		 285 aa  125  5e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3585  alpha/beta hydrolase fold  31.7 
 
 		 270 aa  121  9.999999999999999e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4878  alpha/beta hydrolase fold  26.35 
 
 		 279 aa  116  5e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0658691 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2398  alpha/beta hydrolase fold protein  30.86 
 
 		 282 aa  116  5e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.240634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2505  alpha/beta family hydrolase  27.69 
 
 		 279 aa  112  7.000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3317  putative hydrolase or acyltransferase  27.64 
 
 		 296 aa  101  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3241  putative hydrolase or acyltransferase  27.64 
 
 		 296 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3421  putative hydrolase or acyltransferase  27.64 
 
 		 296 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0121666 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4064  alpha/beta hydrolase fold  24.41 
 
 		 283 aa  100  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3325  putative hydrolase or acyltransferase  27.27 
 
 		 296 aa  99.8  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0252993  normal  0.633189 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4384  alpha/beta hydrolase fold protein  23.36 
 
 		 283 aa  98.6  9e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.944451 
 
 
-
 
NC_004310  BR2178  hydrolase, putative  25 
 
 		 233 aa  95.1  1e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2090  putative hydrolase  25 
 
 		 233 aa  95.1  1e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.787524  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0099  alpha/beta fold family hydrolase  30.56 
 
 		 220 aa  94  2e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000675213 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0733  alpha/beta hydrolase fold  23.83 
 
 		 280 aa  92.4  7e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.204474  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7140  alpha/beta hydrolase fold protein  28.12 
 
 		 425 aa  92.4  7e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0074  alpha/beta hydrolase fold  26.06 
 
 		 275 aa  90.9  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.224768  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0800  alpha/beta hydrolase fold  26.15 
 
 		 267 aa  90.1  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.156653 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0911  alpha/beta hydrolase fold protein  25.58 
 
 		 276 aa  90.5  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.139412 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4082  alpha/beta hydrolase fold  26.07 
 
 		 272 aa  90.5  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2446  alpha/beta hydrolase fold protein  24.75 
 
 		 309 aa  89  7e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.969901  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0511  alpha/beta hydrolase fold protein  26.61 
 
 		 265 aa  88.6  1e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327319  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0648  alpha/beta hydrolase fold protein  28.06 
 
 		 226 aa  88.2  1e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0281045 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3084  3-oxoadipate enol-lactonase  27.33 
 
 		 300 aa  87.4  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0473381  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1929  3-Oxoadipate enol-lactonase  27.46 
 
 		 300 aa  87.8  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.878211  normal  0.500669 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1287  alpha/beta hydrolase fold protein  27.31 
 
 		 255 aa  86.7  3e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00130508  normal  0.0205637 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7536  Alpha/beta hydrolase  23.81 
 
 		 270 aa  86.7  4e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0378  alpha/beta fold family hydrolase  24.6 
 
 		 244 aa  86.3  5e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0818284  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0307  hypothetical protein  28.06 
 
 		 264 aa  85.5  8e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2732  alpha/beta hydrolase fold  26.35 
 
 		 271 aa  85.5  8e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2995  3-oxoadipate enol-lactonase  27.33 
 
 		 300 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000386793  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3313  3-Oxoadipate enol-lactonase  27.11 
 
 		 300 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5863  alpha/beta hydrolase fold  24.12 
 
 		 270 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.648074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  24.19 
 
 		 265 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3098  alpha/beta fold family hydrolase  27 
 
 		 300 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.833481  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3343  alpha/beta fold family hydrolase  27 
 
 		 300 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1595  alpha/beta hydrolase fold  25.76 
 
 		 275 aa  84.3  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.649162  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1265  alpha/beta hydrolase fold protein  27.41 
 
 		 267 aa  84.3  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.463266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3320  hydrolase, alpha/beta fold family  27 
 
 		 300 aa  84  0.000000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3303  3-Oxoadipate enol-lactonase  26 
 
 		 300 aa  84  0.000000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.664184  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0534  putative peroxidase  25.97 
 
 		 281 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.476086  normal  0.88579 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0977  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  26.29 
 
 		 266 aa  83.2  0.000000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.245429  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3307  alpha/beta fold family hydrolase  26.4 
 
 		 300 aa  82.8  0.000000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0291  hypothetical protein  26.48 
 
 		 264 aa  82  0.000000000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1534  lipolytic enzyme  25.76 
 
 		 294 aa  81.6  0.00000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.277395  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1698  alpha/beta hydrolase fold  27.35 
 
 		 397 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1764  alpha/beta hydrolase fold  23.86 
 
 		 271 aa  81.6  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.718391  normal  0.0637777 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2782  alpha/beta hydrolase fold protein  28.16 
 
 		 325 aa  81.6  0.00000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49180  Alpha/beta hydrolase fold protein  27.96 
 
 		 321 aa  81.3  0.00000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3011  alpha/beta hydrolase fold  25.61 
 
 		 300 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.245192  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0502  alpha/beta hydrolase fold  25.19 
 
 		 263 aa  80.9  0.00000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3171  alpha/beta hydrolase fold protein  26.55 
 
 		 270 aa  80.5  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5717  alpha/beta hydrolase fold  23.74 
 
 		 270 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2555  alpha/beta hydrolase fold protein  27.15 
 
 		 234 aa  80.5  0.00000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.249679  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6081  alpha/beta hydrolase fold  23.74 
 
 		 270 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2132  hypothetical protein  26.48 
 
 		 247 aa  79.7  0.00000000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1053  alpha/beta hydrolase fold protein  29.69 
 
 		 286 aa  79.7  0.00000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.73231  normal  0.291985 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3466  alpha/beta hydrolase fold protein  37.5 
 
 		 390 aa  79.7  0.00000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1808  hypothetical protein  26.98 
 
 		 219 aa  79.3  0.00000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6565  alpha/beta hydrolase fold  23.64 
 
 		 270 aa  79.3  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.250077 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1412  alpha/beta fold family hydrolase  24.83 
 
 		 295 aa  79.3  0.00000000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.405065 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0777  alpha/beta hydrolase fold  28.86 
 
 		 284 aa  79.3  0.00000000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.547366 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2456  alpha/beta hydrolase fold  24.56 
 
 		 278 aa  79.3  0.00000000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0153839  normal  0.505758 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2945  alpha/beta hydrolase fold protein  28.32 
 
 		 330 aa  79  0.00000000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1067  alpha/beta hydrolase fold protein  22.5 
 
 		 239 aa  78.6  0.0000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2720  alpha/beta hydrolase fold protein  26.98 
 
 		 342 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  25.35 
 
 		 270 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.441877 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>