More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_1217 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_1217  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 342 aa  670    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1660  putative alpha/beta hydrolase  61.56 
 
 		 319 aa  381  1e-105  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1400  alpha/beta hydrolase fold  62.46 
 
 		 320 aa  378  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.700473 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4675  alpha/beta hydrolase fold  63.93 
 
 		 334 aa  369  1e-101  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.719467  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1420  alpha/beta hydrolase fold  64.83 
 
 		 320 aa  367  1e-100  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3987  alpha/beta hydrolase fold  61.86 
 
 		 329 aa  342  4e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.38084 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2029  alpha/beta hydrolase fold  44.98 
 
 		 343 aa  223  4e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.62215 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5208  alpha/beta hydrolase fold  44.06 
 
 		 346 aa  209  6e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.32318  normal  0.119045 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3278  alpha/beta hydrolase fold  40.49 
 
 		 351 aa  208  1e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3577  alpha/beta hydrolase fold protein  37.32 
 
 		 358 aa  200  3e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.351187  normal  0.127844 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5961  alpha/beta hydrolase fold protein  44.37 
 
 		 345 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.576377  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2743  alpha/beta hydrolase fold  41.75 
 
 		 331 aa  193  4e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.529791  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2970  alpha/beta hydrolase fold protein  39.12 
 
 		 331 aa  192  5e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3689  hypothetical protein  34.88 
 
 		 335 aa  189  7e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.29493  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0129  alpha/beta hydrolase fold  42.03 
 
 		 338 aa  186  5e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.773269  normal  0.28797 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2865  alpha/beta hydrolase fold  38.32 
 
 		 331 aa  183  3e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2352  alpha/beta hydrolase  33.12 
 
 		 314 aa  159  6e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.517024  normal  0.362082 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2534  alpha/beta hydrolase fold  34.29 
 
 		 330 aa  156  4e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1838  alpha/beta hydrolase fold  35.11 
 
 		 333 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.886983  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3884  alpha/beta hydrolase fold  32.38 
 
 		 341 aa  150  2e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.447806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3829  alpha/beta hydrolase fold  37.11 
 
 		 331 aa  150  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1468  alpha/beta hydrolase fold  33.46 
 
 		 340 aa  145  1e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.890362 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1594  putative alpha/beta hydrolase  33.95 
 
 		 320 aa  144  3e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.404575 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0056  alpha/beta hydrolase fold  33.21 
 
 		 332 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1380  alpha/beta hydrolase fold  29.55 
 
 		 321 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0105  alpha/beta hydrolase  36.04 
 
 		 328 aa  136  6.0000000000000005e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00875507  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49180  Alpha/beta hydrolase fold protein  34.46 
 
 		 321 aa  135  8e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1905  alpha/beta hydrolase fold  30.94 
 
 		 354 aa  135  9e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2822  alpha/beta fold family hydrolase  29.64 
 
 		 324 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0099  alpha/beta fold family hydrolase  29.64 
 
 		 324 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0011  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase)  30.63 
 
 		 317 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.903743  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8725  alpha/beta hydrolase fold protein  32.4 
 
 		 332 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1260  alpha/beta fold family hydrolase  29.64 
 
 		 327 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.809  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1076  hypothetical protein  29.34 
 
 		 324 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.773392  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1641  alpha/beta hydrolase fold  30.26 
 
 		 317 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.24202 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2675  alpha/beta fold family hydrolase  29.34 
 
 		 324 aa  133  5e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.457884  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0102  alpha/beta hydrolase fold  32.49 
 
 		 332 aa  132  6e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5045  alpha/beta hydrolase fold  31.46 
 
 		 325 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.6879  normal  0.399471 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0434  alpha/beta hydrolase fold  30.38 
 
 		 318 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.332302  hitchhiker  0.0000000111123 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0446  alpha/beta hydrolase fold protein  30.39 
 
 		 318 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.2537  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0087  alpha/beta hydrolase fold protein  31.34 
 
 		 332 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5377  alpha/beta hydrolase fold protein  30.74 
 
 		 332 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.306055  normal  0.839367 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0402  alpha/beta fold family hydrolase  28.88 
 
 		 324 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2782  alpha/beta hydrolase fold protein  30.79 
 
 		 325 aa  127  3e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1537  alpha/beta fold family hydrolase  29.46 
 
 		 326 aa  127  3e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5411  alpha/beta hydrolase fold  30.8 
 
 		 328 aa  127  3e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.173049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0118  alpha/beta fold family hydrolase  29.46 
 
 		 326 aa  127  3e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.347516  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3567  alpha/beta hydrolase fold  30.45 
 
 		 328 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.253365  hitchhiker  0.00645223 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2167  alpha/beta hydrolase fold  29.89 
 
 		 317 aa  126  6e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2945  alpha/beta hydrolase fold protein  30.64 
 
 		 330 aa  125  1e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6057  alpha/beta hydrolase fold  31.91 
 
 		 332 aa  124  2e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00402067  normal  0.493992 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5011  putative alpha/beta hydrolase  30.9 
 
 		 350 aa  123  4e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.418737  normal  0.1806 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1011  alpha/beta hydrolase fold  30.8 
 
 		 322 aa  122  7e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.99925 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1512  alpha/beta hydrolase fold protein  29.49 
 
 		 311 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1316  alpha/beta hydrolase fold  29.49 
 
 		 311 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.541831  normal  0.727397 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3466  alpha/beta hydrolase fold protein  33.92 
 
 		 390 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1140  alpha/beta hydrolase fold  31.7 
 
 		 320 aa  119  9e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.64719  normal  0.115917 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03823  Alpha/beta hydrolase fold protein  27.49 
 
 		 310 aa  117  1.9999999999999998e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2535  alpha/beta hydrolase fold  31.01 
 
 		 344 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2720  alpha/beta hydrolase fold protein  30.82 
 
 		 342 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2989  alpha/beta hydrolase fold  30.55 
 
 		 339 aa  117  3e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.720192 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4699  alpha/beta hydrolase fold  29.45 
 
 		 327 aa  116  5e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3663  alpha/beta hydrolase fold  29.45 
 
 		 327 aa  116  5e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.378837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2445  Alpha/beta hydrolase  30.07 
 
 		 327 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3858  alpha/beta hydrolase fold  29.09 
 
 		 327 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.387123 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3935  alpha/beta hydrolase fold protein  30.32 
 
 		 371 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3642  alpha/beta hydrolase fold  30.32 
 
 		 379 aa  112  7.000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.20936  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3925  alpha/beta hydrolase fold  29.96 
 
 		 367 aa  108  1e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.182869  normal  0.384279 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5140  alpha/beta hydrolase fold  32.38 
 
 		 305 aa  108  1e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.773664  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4934  Alpha/beta hydrolase fold  28.12 
 
 		 320 aa  105  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1353  alpha/beta hydrolase fold  25.74 
 
 		 339 aa  89.7  7e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.687878  normal  0.202512 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4425  alpha/beta hydrolase fold  28.53 
 
 		 321 aa  87.4  3e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4806  alpha/beta hydrolase fold  28.53 
 
 		 321 aa  87.4  3e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.786039  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4512  alpha/beta hydrolase fold  28.53 
 
 		 321 aa  87.4  3e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.999363 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1095  alpha/beta hydrolase fold  29.59 
 
 		 302 aa  87  4e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2918  alpha/beta hydrolase fold  27.47 
 
 		 312 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.906544 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2696  alpha/beta hydrolase fold  25.7 
 
 		 312 aa  84  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.623815  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1258  putative hydrolase  27.16 
 
 		 312 aa  83.2  0.000000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0672  alpha/beta hydrolase fold  28.89 
 
 		 315 aa  82.8  0.000000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.240082 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1491  alpha/beta hydrolase fold  28.77 
 
 		 297 aa  81.6  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00412587  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5680  alpha/beta hydrolase fold protein  30.27 
 
 		 324 aa  80.5  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0316  alpha/beta hydrolase fold  26.69 
 
 		 316 aa  80.9  0.00000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00247828  hitchhiker  0.00660595 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2335  alpha/beta hydrolase fold  30.66 
 
 		 315 aa  81.3  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3143  alpha/beta hydrolase fold  31.01 
 
 		 309 aa  80.1  0.00000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.03403  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1945  alpha/beta hydrolase fold  26.71 
 
 		 346 aa  79.7  0.00000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1253  alpha/beta hydrolase fold  26.28 
 
 		 298 aa  77.4  0.0000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.188153  normal  0.590935 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3858  alpha/beta hydrolase fold  27.76 
 
 		 304 aa  76.3  0.0000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10135  epoxide hydrolase ephF  29.47 
 
 		 300 aa  76.3  0.0000000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.890635 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1827  alpha/beta hydrolase fold  27.3 
 
 		 285 aa  76.3  0.0000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2528  alpha/beta hydrolase fold  27.56 
 
 		 301 aa  74.3  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3779  cyclic nucleotide-binding protein  26.76 
 
 		 453 aa  73.2  0.000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0440455  normal  0.0476196 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0148  alpha/beta hydrolase fold  29.72 
 
 		 266 aa  72.8  0.000000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.443703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3655  alpha/beta hydrolase fold  27.33 
 
 		 312 aa  73.2  0.000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0033  alpha/beta hydrolase fold  30.53 
 
 		 290 aa  72.4  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0608  alpha/beta hydrolase fold  27.05 
 
 		 300 aa  70.5  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0741  hypothetical protein  36.84 
 
 		 292 aa  69.7  0.00000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4692  hydrolase  27.27 
 
 		 313 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.236013  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4681  alpha/beta hydrolase fold protein  28.94 
 
 		 333 aa  68.2  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0837  alpha/beta fold family hydrolase  27 
 
 		 299 aa  67.4  0.0000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1080  alpha/beta hydrolase fold  26.53 
 
 		 296 aa  67  0.0000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>