More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_3567 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_3567  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 328 aa  645    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.253365  hitchhiker  0.00645223 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5411  alpha/beta hydrolase fold  96.04 
 
 		 328 aa  595  1e-169  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.173049  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2445  Alpha/beta hydrolase  90 
 
 		 327 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3858  alpha/beta hydrolase fold  89.07 
 
 		 327 aa  536  1e-151  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.387123 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4699  alpha/beta hydrolase fold  89.07 
 
 		 327 aa  537  1e-151  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3663  alpha/beta hydrolase fold  89.07 
 
 		 327 aa  537  1e-151  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.378837  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5045  alpha/beta hydrolase fold  84.29 
 
 		 325 aa  523  1e-147  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.6879  normal  0.399471 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0434  alpha/beta hydrolase fold  63.75 
 
 		 318 aa  404  1e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.332302  hitchhiker  0.0000000111123 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0446  alpha/beta hydrolase fold protein  62.5 
 
 		 318 aa  395  1e-109  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.2537  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1260  alpha/beta fold family hydrolase  64.19 
 
 		 327 aa  389  1e-107  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.809  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0099  alpha/beta fold family hydrolase  64.19 
 
 		 324 aa  389  1e-107  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2675  alpha/beta fold family hydrolase  64.19 
 
 		 324 aa  389  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.457884  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1076  hypothetical protein  64.19 
 
 		 324 aa  389  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.773392  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0402  alpha/beta fold family hydrolase  63.99 
 
 		 324 aa  390  1e-107  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2822  alpha/beta fold family hydrolase  64.19 
 
 		 324 aa  389  1e-107  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0118  alpha/beta fold family hydrolase  63.78 
 
 		 326 aa  377  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.347516  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1537  alpha/beta fold family hydrolase  63.78 
 
 		 326 aa  377  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1011  alpha/beta hydrolase fold  46.23 
 
 		 322 aa  263  4e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.99925 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4934  Alpha/beta hydrolase fold  48.3 
 
 		 320 aa  248  1e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1140  alpha/beta hydrolase fold  40.78 
 
 		 320 aa  229  4e-59  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.64719  normal  0.115917 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0105  alpha/beta hydrolase  42.81 
 
 		 328 aa  220  1.9999999999999999e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00875507  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03823  Alpha/beta hydrolase fold protein  36.18 
 
 		 310 aa  195  8.000000000000001e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1400  alpha/beta hydrolase fold  33.22 
 
 		 320 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.700473 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4675  alpha/beta hydrolase fold  32.88 
 
 		 334 aa  137  2e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.719467  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1660  putative alpha/beta hydrolase  31.79 
 
 		 319 aa  135  7.000000000000001e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3987  alpha/beta hydrolase fold  33.94 
 
 		 329 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.38084 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2945  alpha/beta hydrolase fold protein  31.64 
 
 		 330 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1420  alpha/beta hydrolase fold  30.88 
 
 		 320 aa  129  8.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2782  alpha/beta hydrolase fold protein  31.64 
 
 		 325 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1217  alpha/beta hydrolase fold  30.45 
 
 		 342 aa  126  4.0000000000000003e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3278  alpha/beta hydrolase fold  29.94 
 
 		 351 aa  122  6e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3577  alpha/beta hydrolase fold protein  29.64 
 
 		 358 aa  120  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.351187  normal  0.127844 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2534  alpha/beta hydrolase fold  32.87 
 
 		 330 aa  120  3e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2970  alpha/beta hydrolase fold protein  31.89 
 
 		 331 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1380  alpha/beta hydrolase fold  29.55 
 
 		 321 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5011  putative alpha/beta hydrolase  33 
 
 		 350 aa  117  3e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.418737  normal  0.1806 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2743  alpha/beta hydrolase fold  32.29 
 
 		 331 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.529791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2029  alpha/beta hydrolase fold  31.83 
 
 		 343 aa  115  1.0000000000000001e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.62215 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1512  alpha/beta hydrolase fold protein  32.57 
 
 		 311 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1316  alpha/beta hydrolase fold  32.57 
 
 		 311 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.541831  normal  0.727397 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2989  alpha/beta hydrolase fold  31.54 
 
 		 339 aa  113  5e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.720192 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2352  alpha/beta hydrolase  31.63 
 
 		 314 aa  112  6e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.517024  normal  0.362082 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3689  hypothetical protein  28.53 
 
 		 335 aa  112  8.000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.29493  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2865  alpha/beta hydrolase fold  32 
 
 		 331 aa  112  8.000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2167  alpha/beta hydrolase fold  30.8 
 
 		 317 aa  110  3e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0011  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase)  30.11 
 
 		 317 aa  109  5e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.903743  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49180  Alpha/beta hydrolase fold protein  30.98 
 
 		 321 aa  109  5e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5377  alpha/beta hydrolase fold protein  31.38 
 
 		 332 aa  109  7.000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.306055  normal  0.839367 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1641  alpha/beta hydrolase fold  29.74 
 
 		 317 aa  108  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.24202 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8725  alpha/beta hydrolase fold protein  32.31 
 
 		 332 aa  108  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1905  alpha/beta hydrolase fold  33.92 
 
 		 354 aa  108  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5208  alpha/beta hydrolase fold  34.26 
 
 		 346 aa  107  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.32318  normal  0.119045 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1838  alpha/beta hydrolase fold  31.11 
 
 		 333 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.886983  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5961  alpha/beta hydrolase fold protein  34.78 
 
 		 345 aa  107  3e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.576377  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0087  alpha/beta hydrolase fold protein  31.67 
 
 		 332 aa  103  5e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6057  alpha/beta hydrolase fold  33.56 
 
 		 332 aa  102  6e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00402067  normal  0.493992 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5140  alpha/beta hydrolase fold  34.2 
 
 		 305 aa  102  7e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.773664  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0129  alpha/beta hydrolase fold  35.4 
 
 		 338 aa  101  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.773269  normal  0.28797 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2535  alpha/beta hydrolase fold  31.07 
 
 		 344 aa  101  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3829  alpha/beta hydrolase fold  30.74 
 
 		 331 aa  101  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2720  alpha/beta hydrolase fold protein  31.16 
 
 		 342 aa  101  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0102  alpha/beta hydrolase fold  31.05 
 
 		 332 aa  98.2  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0056  alpha/beta hydrolase fold  31.05 
 
 		 332 aa  97.8  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1594  putative alpha/beta hydrolase  29.55 
 
 		 320 aa  97.4  3e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.404575 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3466  alpha/beta hydrolase fold protein  31.02 
 
 		 390 aa  97.4  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1827  alpha/beta hydrolase fold  32.91 
 
 		 285 aa  95.5  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4806  alpha/beta hydrolase fold  30.49 
 
 		 321 aa  94.4  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.786039  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4425  alpha/beta hydrolase fold  30.49 
 
 		 321 aa  94.4  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4512  alpha/beta hydrolase fold  30.49 
 
 		 321 aa  94.4  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.999363 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1468  alpha/beta hydrolase fold  29.55 
 
 		 340 aa  94.4  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.890362 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3642  alpha/beta hydrolase fold  32.58 
 
 		 379 aa  91.7  1e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.20936  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5680  alpha/beta hydrolase fold protein  30.85 
 
 		 324 aa  91.3  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3935  alpha/beta hydrolase fold protein  31.84 
 
 		 371 aa  90.5  3e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3925  alpha/beta hydrolase fold  31.56 
 
 		 367 aa  89.7  7e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.182869  normal  0.384279 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3884  alpha/beta hydrolase fold  28.72 
 
 		 341 aa  89  1e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.447806  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0119  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  41.13 
 
 		 380 aa  88.2  2e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.156608 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4235  alpha/beta hydrolase fold  45.9 
 
 		 252 aa  83.6  0.000000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.125145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4082  alpha/beta hydrolase fold  31.47 
 
 		 284 aa  82.8  0.000000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.29051 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  39.26 
 
 		 299 aa  80.9  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0074  alpha/beta hydrolase fold  32.86 
 
 		 275 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.224768  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0527  inner-membrane translocator  31.4 
 
 		 562 aa  79.7  0.00000000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.142697  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2885  alpha/beta hydrolase fold protein  31.73 
 
 		 275 aa  79.3  0.00000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00297178 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1513  Alpha/beta hydrolase fold  39.85 
 
 		 293 aa  78.6  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0741  hypothetical protein  34.36 
 
 		 292 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1463  Alpha/beta hydrolase  40.16 
 
 		 278 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.234917  normal  0.480235 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  30.18 
 
 		 287 aa  77.8  0.0000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0879  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 278 aa  77.8  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.101145 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1412  alpha/beta fold family hydrolase  37.98 
 
 		 295 aa  77.4  0.0000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.405065 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1491  alpha/beta hydrolase fold  33.96 
 
 		 297 aa  76.6  0.0000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00412587  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4279  alpha/beta hydrolase fold  30.77 
 
 		 290 aa  76.6  0.0000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0429244  normal  0.222336 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4541  alpha/beta hydrolase fold protein  30.36 
 
 		 288 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.707016  normal  0.231702 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2542  alpha/beta hydrolase fold protein  32.2 
 
 		 310 aa  76.6  0.0000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.106613  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4384  alpha/beta hydrolase fold protein  31.82 
 
 		 283 aa  76.3  0.0000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.944451 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0392  alpha/beta hydrolase fold  35.09 
 
 		 273 aa  75.9  0.0000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3588  alpha/beta hydrolase fold protein  38.14 
 
 		 282 aa  75.5  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.291858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2367  alpha/beta hydrolase fold  31.27 
 
 		 291 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.926143  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0531  alpha/beta hydrolase fold protein  39.84 
 
 		 273 aa  74.7  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2334  alpha/beta hydrolase fold  39.37 
 
 		 258 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000909068  hitchhiker  0.0000846948 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1770  alpha/beta hydrolase fold  29.19 
 
 		 323 aa  74.3  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00973065  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3543  alpha/beta hydrolase fold  39.57 
 
 		 268 aa  74.3  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.447096  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>