More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_1512 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_1512  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 		 311 aa  624  1e-178  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1316  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 311 aa  624  1e-178  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.541831  normal  0.727397 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5011  putative alpha/beta hydrolase  53.77 
 
 		 350 aa  331  1e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.418737  normal  0.1806 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5377  alpha/beta hydrolase fold protein  52.07 
 
 		 332 aa  312  5.999999999999999e-84  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.306055  normal  0.839367 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2782  alpha/beta hydrolase fold protein  51.56 
 
 		 325 aa  311  9e-84  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2945  alpha/beta hydrolase fold protein  52.45 
 
 		 330 aa  308  5.9999999999999995e-83  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1905  alpha/beta hydrolase fold  51.01 
 
 		 354 aa  301  1e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0087  alpha/beta hydrolase fold protein  51.06 
 
 		 332 aa  293  2e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0056  alpha/beta hydrolase fold  50.7 
 
 		 332 aa  292  6e-78  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0102  alpha/beta hydrolase fold  50.35 
 
 		 332 aa  291  8e-78  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8725  alpha/beta hydrolase fold protein  51.06 
 
 		 332 aa  291  1e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6057  alpha/beta hydrolase fold  51.06 
 
 		 332 aa  287  2e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00402067  normal  0.493992 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3466  alpha/beta hydrolase fold protein  47.06 
 
 		 390 aa  259  5.0000000000000005e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2535  alpha/beta hydrolase fold  45.99 
 
 		 344 aa  249  4e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2720  alpha/beta hydrolase fold protein  46.69 
 
 		 342 aa  244  9e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49180  Alpha/beta hydrolase fold protein  44.44 
 
 		 321 aa  239  4e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2989  alpha/beta hydrolase fold  39.86 
 
 		 339 aa  227  2e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.720192 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3935  alpha/beta hydrolase fold protein  39.6 
 
 		 371 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3642  alpha/beta hydrolase fold  39.31 
 
 		 379 aa  193  2e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.20936  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3925  alpha/beta hydrolase fold  41.16 
 
 		 367 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.182869  normal  0.384279 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5140  alpha/beta hydrolase fold  37.1 
 
 		 305 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.773664  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0741  hypothetical protein  49.66 
 
 		 292 aa  145  1e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1594  putative alpha/beta hydrolase  34.94 
 
 		 320 aa  143  4e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.404575 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2167  alpha/beta hydrolase fold  32.62 
 
 		 317 aa  132  6.999999999999999e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0011  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase)  32.26 
 
 		 317 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.903743  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0105  alpha/beta hydrolase  34.59 
 
 		 328 aa  130  4.0000000000000003e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00875507  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1641  alpha/beta hydrolase fold  31.9 
 
 		 317 aa  129  8.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.24202 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0129  alpha/beta hydrolase fold  35.25 
 
 		 338 aa  124  2e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.773269  normal  0.28797 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1660  putative alpha/beta hydrolase  30.54 
 
 		 319 aa  123  4e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2029  alpha/beta hydrolase fold  32.58 
 
 		 343 aa  120  1.9999999999999998e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.62215 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1140  alpha/beta hydrolase fold  30.6 
 
 		 320 aa  121  1.9999999999999998e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.64719  normal  0.115917 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1380  alpha/beta hydrolase fold  32.69 
 
 		 321 aa  120  3.9999999999999996e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1217  alpha/beta hydrolase fold  29.73 
 
 		 342 aa  119  6e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5411  alpha/beta hydrolase fold  32.14 
 
 		 328 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.173049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3567  alpha/beta hydrolase fold  32.57 
 
 		 328 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.253365  hitchhiker  0.00645223 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1011  alpha/beta hydrolase fold  30.74 
 
 		 322 aa  113  4.0000000000000004e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.99925 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4934  Alpha/beta hydrolase fold  33.79 
 
 		 320 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3858  alpha/beta hydrolase fold  32.14 
 
 		 327 aa  109  6e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.387123 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4699  alpha/beta hydrolase fold  32.28 
 
 		 327 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3663  alpha/beta hydrolase fold  32.28 
 
 		 327 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.378837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2352  alpha/beta hydrolase  29.49 
 
 		 314 aa  108  1e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.517024  normal  0.362082 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5045  alpha/beta hydrolase fold  31.51 
 
 		 325 aa  108  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.6879  normal  0.399471 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3987  alpha/beta hydrolase fold  30.38 
 
 		 329 aa  108  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.38084 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2445  Alpha/beta hydrolase  32.39 
 
 		 327 aa  105  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3278  alpha/beta hydrolase fold  27.4 
 
 		 351 aa  103  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2534  alpha/beta hydrolase fold  30.23 
 
 		 330 aa  103  4e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1400  alpha/beta hydrolase fold  30.8 
 
 		 320 aa  103  5e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.700473 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0608  alpha/beta hydrolase fold  30.36 
 
 		 300 aa  102  7e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2743  alpha/beta hydrolase fold  32.2 
 
 		 331 aa  102  7e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.529791  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0446  alpha/beta hydrolase fold protein  28.17 
 
 		 318 aa  102  1e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.2537  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1412  alpha/beta fold family hydrolase  27.27 
 
 		 295 aa  102  1e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.405065 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1420  alpha/beta hydrolase fold  29.31 
 
 		 320 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0434  alpha/beta hydrolase fold  27.82 
 
 		 318 aa  100  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.332302  hitchhiker  0.0000000111123 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5208  alpha/beta hydrolase fold  29.83 
 
 		 346 aa  100  3e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.32318  normal  0.119045 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3577  alpha/beta hydrolase fold protein  27.12 
 
 		 358 aa  100  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.351187  normal  0.127844 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0402  alpha/beta fold family hydrolase  28.62 
 
 		 324 aa  100  4e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1095  alpha/beta hydrolase fold  28.62 
 
 		 302 aa  99  9e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1838  alpha/beta hydrolase fold  31.58 
 
 		 333 aa  98.6  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.886983  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2970  alpha/beta hydrolase fold protein  30.9 
 
 		 331 aa  98.2  1e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5961  alpha/beta hydrolase fold protein  31.85 
 
 		 345 aa  97.1  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.576377  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4675  alpha/beta hydrolase fold  29.93 
 
 		 334 aa  96.7  5e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.719467  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2675  alpha/beta fold family hydrolase  28.33 
 
 		 324 aa  96.7  5e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.457884  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0099  alpha/beta fold family hydrolase  28.33 
 
 		 324 aa  96.3  6e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1076  hypothetical protein  28.33 
 
 		 324 aa  96.3  6e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.773392  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2822  alpha/beta fold family hydrolase  28.33 
 
 		 324 aa  96.3  6e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3829  alpha/beta hydrolase fold  29.12 
 
 		 331 aa  96.3  6e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1260  alpha/beta fold family hydrolase  28.33 
 
 		 327 aa  96.3  6e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.809  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1468  alpha/beta hydrolase fold  30.94 
 
 		 340 aa  94.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.890362 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2865  alpha/beta hydrolase fold  31.65 
 
 		 331 aa  93.6  4e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3055  alpha/beta hydrolase fold  27.88 
 
 		 277 aa  92.8  7e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0115287 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0531  alpha/beta hydrolase fold protein  28.52 
 
 		 273 aa  89.7  6e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3689  hypothetical protein  25.5 
 
 		 335 aa  89.7  6e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.29493  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2885  alpha/beta hydrolase fold protein  28.24 
 
 		 275 aa  89.4  7e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00297178 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3786  Alpha/beta hydrolase fold  28.36 
 
 		 274 aa  88.6  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00563208  hitchhiker  0.00293132 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0837  alpha/beta fold family hydrolase  27.3 
 
 		 299 aa  87.8  2e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11862  haloalkane dehalogenase  25 
 
 		 286 aa  87.4  2e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.608613 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1253  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 		 298 aa  87.8  2e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.188153  normal  0.590935 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3884  alpha/beta hydrolase fold  28.52 
 
 		 341 aa  86.3  6e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.447806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0118  alpha/beta fold family hydrolase  28.15 
 
 		 326 aa  85.5  9e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.347516  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1537  alpha/beta fold family hydrolase  28.15 
 
 		 326 aa  85.5  9e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5766  alpha/beta hydrolase fold protein  28.89 
 
 		 302 aa  85.5  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4111  alpha/beta hydrolase fold protein  26.74 
 
 		 288 aa  85.5  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0346007  normal  0.0462514 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13602  2-hydroxy-6-oxo-6-phenylhexa-2,4-dienoate hydrolase bphD  30.04 
 
 		 291 aa  84.3  0.000000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.552922 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2882  alpha/beta hydrolase fold  28.15 
 
 		 276 aa  83.2  0.000000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.035123 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1491  alpha/beta hydrolase fold  25.28 
 
 		 297 aa  83.2  0.000000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00412587  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1463  Alpha/beta hydrolase  29.71 
 
 		 278 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.234917  normal  0.480235 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0221  alpha/beta hydrolase fold  28.21 
 
 		 286 aa  82.4  0.000000000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5093  alpha/beta hydrolase fold  27.08 
 
 		 299 aa  82.4  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.284245 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4708  alpha/beta hydrolase fold  27.08 
 
 		 299 aa  82.4  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1080  alpha/beta hydrolase fold  25.62 
 
 		 296 aa  82  0.00000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4794  alpha/beta hydrolase fold  27.08 
 
 		 299 aa  82.4  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2147  alpha/beta hydrolase fold  25.28 
 
 		 278 aa  82  0.00000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5680  alpha/beta hydrolase fold protein  29.73 
 
 		 324 aa  80.9  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3235  alpha/beta hydrolase fold  28.32 
 
 		 316 aa  80.9  0.00000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.423188  normal  0.602457 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0672  alpha/beta hydrolase fold  27.44 
 
 		 315 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.240082 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1331  Alpha/beta hydrolase fold  27.57 
 
 		 278 aa  78.6  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000258733 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2456  alpha/beta hydrolase fold  27.67 
 
 		 278 aa  78.6  0.0000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0153839  normal  0.505758 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1464  alpha/beta hydrolase fold  26.69 
 
 		 294 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2528  alpha/beta hydrolase fold  23.88 
 
 		 301 aa  77.8  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4512  alpha/beta hydrolase fold  26.21 
 
 		 321 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.999363 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>