More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_1594 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_1594  putative alpha/beta hydrolase  100 
 
 		 320 aa  639    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.404575 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0011  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase)  48.23 
 
 		 317 aa  268  8.999999999999999e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.903743  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1641  alpha/beta hydrolase fold  47.91 
 
 		 317 aa  267  2e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.24202 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2167  alpha/beta hydrolase fold  47.59 
 
 		 317 aa  264  2e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1380  alpha/beta hydrolase fold  41.32 
 
 		 321 aa  238  6.999999999999999e-62  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2352  alpha/beta hydrolase  43.95 
 
 		 314 aa  229  4e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.517024  normal  0.362082 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5208  alpha/beta hydrolase fold  41.96 
 
 		 346 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.32318  normal  0.119045 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2029  alpha/beta hydrolase fold  37.37 
 
 		 343 aa  180  2e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.62215 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5961  alpha/beta hydrolase fold protein  41.02 
 
 		 345 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.576377  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3278  alpha/beta hydrolase fold  34.04 
 
 		 351 aa  161  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3577  alpha/beta hydrolase fold protein  34.64 
 
 		 358 aa  161  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.351187  normal  0.127844 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4675  alpha/beta hydrolase fold  35 
 
 		 334 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.719467  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3987  alpha/beta hydrolase fold  35.27 
 
 		 329 aa  153  5e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.38084 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3689  hypothetical protein  33.1 
 
 		 335 aa  152  8e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.29493  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2970  alpha/beta hydrolase fold protein  34.69 
 
 		 331 aa  149  6e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2534  alpha/beta hydrolase fold  32.58 
 
 		 330 aa  146  5e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1316  alpha/beta hydrolase fold  34.27 
 
 		 311 aa  145  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.541831  normal  0.727397 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1512  alpha/beta hydrolase fold protein  34.27 
 
 		 311 aa  145  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1400  alpha/beta hydrolase fold  32.59 
 
 		 320 aa  145  1e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.700473 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1217  alpha/beta hydrolase fold  33.57 
 
 		 342 aa  144  1e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1660  putative alpha/beta hydrolase  32.14 
 
 		 319 aa  144  2e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1140  alpha/beta hydrolase fold  30.19 
 
 		 320 aa  142  8e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.64719  normal  0.115917 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2743  alpha/beta hydrolase fold  35.4 
 
 		 331 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.529791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1420  alpha/beta hydrolase fold  32.42 
 
 		 320 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49180  Alpha/beta hydrolase fold protein  36.7 
 
 		 321 aa  138  1e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0105  alpha/beta hydrolase  35.17 
 
 		 328 aa  138  1e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00875507  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0129  alpha/beta hydrolase fold  35.03 
 
 		 338 aa  138  1e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.773269  normal  0.28797 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2865  alpha/beta hydrolase fold  33.03 
 
 		 331 aa  135  7.000000000000001e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5011  putative alpha/beta hydrolase  31.74 
 
 		 350 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.418737  normal  0.1806 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8725  alpha/beta hydrolase fold protein  32.98 
 
 		 332 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1905  alpha/beta hydrolase fold  31.01 
 
 		 354 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3935  alpha/beta hydrolase fold protein  32.36 
 
 		 371 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3466  alpha/beta hydrolase fold protein  30.52 
 
 		 390 aa  127  3e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3642  alpha/beta hydrolase fold  32.73 
 
 		 379 aa  126  5e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.20936  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0056  alpha/beta hydrolase fold  30.85 
 
 		 332 aa  124  2e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5377  alpha/beta hydrolase fold protein  30.32 
 
 		 332 aa  123  3e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.306055  normal  0.839367 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0102  alpha/beta hydrolase fold  30.25 
 
 		 332 aa  124  3e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5140  alpha/beta hydrolase fold  32.95 
 
 		 305 aa  123  5e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.773664  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2535  alpha/beta hydrolase fold  29.08 
 
 		 344 aa  122  9e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2782  alpha/beta hydrolase fold protein  28.48 
 
 		 325 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0087  alpha/beta hydrolase fold protein  29.64 
 
 		 332 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3925  alpha/beta hydrolase fold  31.14 
 
 		 367 aa  115  8.999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.182869  normal  0.384279 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2720  alpha/beta hydrolase fold protein  29.37 
 
 		 342 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3829  alpha/beta hydrolase fold  31.68 
 
 		 331 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2945  alpha/beta hydrolase fold protein  27.87 
 
 		 330 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3884  alpha/beta hydrolase fold  30.41 
 
 		 341 aa  109  8.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.447806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1468  alpha/beta hydrolase fold  32.01 
 
 		 340 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.890362 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1011  alpha/beta hydrolase fold  29.08 
 
 		 322 aa  108  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.99925 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1838  alpha/beta hydrolase fold  31.99 
 
 		 333 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.886983  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6057  alpha/beta hydrolase fold  29.45 
 
 		 332 aa  107  3e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00402067  normal  0.493992 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2989  alpha/beta hydrolase fold  27.65 
 
 		 339 aa  105  1e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.720192 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0434  alpha/beta hydrolase fold  28.42 
 
 		 318 aa  104  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.332302  hitchhiker  0.0000000111123 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0446  alpha/beta hydrolase fold protein  28.08 
 
 		 318 aa  102  7e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.2537  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0741  hypothetical protein  47.37 
 
 		 292 aa  102  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0608  alpha/beta hydrolase fold  28.85 
 
 		 300 aa  99.4  8e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5045  alpha/beta hydrolase fold  26.67 
 
 		 325 aa  98.6  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.6879  normal  0.399471 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4934  Alpha/beta hydrolase fold  32.1 
 
 		 320 aa  98.2  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3567  alpha/beta hydrolase fold  29.93 
 
 		 328 aa  95.5  9e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.253365  hitchhiker  0.00645223 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0402  alpha/beta fold family hydrolase  26.76 
 
 		 324 aa  95.1  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0099  alpha/beta fold family hydrolase  26.89 
 
 		 324 aa  93.6  4e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1076  hypothetical protein  26.89 
 
 		 324 aa  93.6  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.773392  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2675  alpha/beta fold family hydrolase  26.89 
 
 		 324 aa  93.6  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.457884  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5411  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 		 328 aa  93.6  4e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.173049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2822  alpha/beta fold family hydrolase  26.89 
 
 		 324 aa  93.6  4e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1260  alpha/beta fold family hydrolase  26.89 
 
 		 327 aa  93.2  5e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.809  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2445  Alpha/beta hydrolase  27.47 
 
 		 327 aa  93.2  6e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03823  Alpha/beta hydrolase fold protein  26.05 
 
 		 310 aa  92.8  8e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4699  alpha/beta hydrolase fold  27.11 
 
 		 327 aa  91.3  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3663  alpha/beta hydrolase fold  27.11 
 
 		 327 aa  91.3  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.378837  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3858  alpha/beta hydrolase fold  27.11 
 
 		 327 aa  91.3  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.387123 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1095  alpha/beta hydrolase fold  29.04 
 
 		 302 aa  88.2  2e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0118  alpha/beta fold family hydrolase  26.69 
 
 		 326 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.347516  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1537  alpha/beta fold family hydrolase  26.69 
 
 		 326 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1620  alpha/beta hydrolase fold  28.47 
 
 		 303 aa  81.6  0.00000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2885  alpha/beta hydrolase fold protein  30.77 
 
 		 275 aa  80.9  0.00000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00297178 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0879  alpha/beta hydrolase fold  37.5 
 
 		 278 aa  79.3  0.00000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.101145 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0672  alpha/beta hydrolase fold  27.24 
 
 		 315 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.240082 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1412  alpha/beta fold family hydrolase  27.34 
 
 		 295 aa  78.2  0.0000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.405065 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2975  Alpha/beta hydrolase  31.54 
 
 		 302 aa  77.4  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.339139 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0033  alpha/beta hydrolase fold  30.96 
 
 		 290 aa  77  0.0000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3515  alpha/beta hydrolase fold protein  27.54 
 
 		 293 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2528  alpha/beta hydrolase fold  28.21 
 
 		 301 aa  76.6  0.0000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5766  alpha/beta hydrolase fold protein  26.71 
 
 		 302 aa  75.9  0.0000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4082  alpha/beta hydrolase fold  36.17 
 
 		 284 aa  75.9  0.0000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.29051 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5680  alpha/beta hydrolase fold protein  28.28 
 
 		 324 aa  74.7  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3655  alpha/beta hydrolase fold  27.46 
 
 		 312 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  28.83 
 
 		 287 aa  73.9  0.000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0323  alpha/beta hydrolase fold  29.11 
 
 		 285 aa  72.4  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.619665  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0333  alpha/beta hydrolase fold  29.11 
 
 		 285 aa  72.4  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.240836 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0312  alpha/beta hydrolase fold  29.11 
 
 		 285 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0392  alpha/beta hydrolase fold  26.37 
 
 		 273 aa  70.9  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1080  alpha/beta hydrolase fold  26.57 
 
 		 296 aa  70.1  0.00000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2542  alpha/beta hydrolase fold protein  36.15 
 
 		 310 aa  68.6  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.106613  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4141  alpha/beta hydrolase fold  34.68 
 
 		 286 aa  68.6  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0556153  normal  0.121245 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3733  magnesium chelatase accessory protein  27.39 
 
 		 293 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.229293  normal  0.0818214 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3302  alpha/beta hydrolase fold  28.63 
 
 		 275 aa  67.8  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0651749  normal  0.147146 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1253  alpha/beta hydrolase fold  29.96 
 
 		 336 aa  67.4  0.0000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.264331  normal  0.195785 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0504  inner-membrane translocator  25.18 
 
 		 571 aa  67  0.0000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.92013  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1186  2-hydroxy-6-oxo-6-phenylhexa-2,4- dienoate hydrolase (BphD)  33.6 
 
 		 286 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.644621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0935  alpha/beta hydrolase fold  38.93 
 
 		 288 aa  66.6  0.0000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0423109  normal  0.641404 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>