More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_3987 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_3987  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 329 aa  643    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.38084 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4675  alpha/beta hydrolase fold  67.97 
 
 		 334 aa  395  1e-109  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.719467  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1400  alpha/beta hydrolase fold  63.11 
 
 		 320 aa  385  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.700473 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1420  alpha/beta hydrolase fold  64.53 
 
 		 320 aa  375  1e-103  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1217  alpha/beta hydrolase fold  61.99 
 
 		 342 aa  344  1e-93  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1660  putative alpha/beta hydrolase  58.39 
 
 		 319 aa  342  5e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5208  alpha/beta hydrolase fold  45.24 
 
 		 346 aa  211  1e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.32318  normal  0.119045 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5961  alpha/beta hydrolase fold protein  44.97 
 
 		 345 aa  205  7e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.576377  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3689  hypothetical protein  41.38 
 
 		 335 aa  185  8e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.29493  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2029  alpha/beta hydrolase fold  42.25 
 
 		 343 aa  185  8e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.62215 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2970  alpha/beta hydrolase fold protein  38.94 
 
 		 331 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3577  alpha/beta hydrolase fold protein  34.92 
 
 		 358 aa  183  4.0000000000000006e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.351187  normal  0.127844 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3278  alpha/beta hydrolase fold  35.93 
 
 		 351 aa  182  8.000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2865  alpha/beta hydrolase fold  39.25 
 
 		 331 aa  179  5.999999999999999e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2743  alpha/beta hydrolase fold  39.6 
 
 		 331 aa  179  5.999999999999999e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.529791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0129  alpha/beta hydrolase fold  43.75 
 
 		 338 aa  171  1e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.773269  normal  0.28797 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2534  alpha/beta hydrolase fold  34.46 
 
 		 330 aa  169  9e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2352  alpha/beta hydrolase  36.1 
 
 		 314 aa  166  4e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.517024  normal  0.362082 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1594  putative alpha/beta hydrolase  33.99 
 
 		 320 aa  154  2e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.404575 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0446  alpha/beta hydrolase fold protein  34.11 
 
 		 318 aa  149  8e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.2537  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1380  alpha/beta hydrolase fold  34.59 
 
 		 321 aa  146  4.0000000000000006e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5045  alpha/beta hydrolase fold  34.97 
 
 		 325 aa  146  5e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.6879  normal  0.399471 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0434  alpha/beta hydrolase fold  34.39 
 
 		 318 aa  145  7.0000000000000006e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.332302  hitchhiker  0.0000000111123 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49180  Alpha/beta hydrolase fold protein  36.08 
 
 		 321 aa  145  8.000000000000001e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0011  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase)  33.21 
 
 		 317 aa  144  2e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.903743  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3884  alpha/beta hydrolase fold  33.22 
 
 		 341 aa  144  2e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.447806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1641  alpha/beta hydrolase fold  33.21 
 
 		 317 aa  144  2e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.24202 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03823  Alpha/beta hydrolase fold protein  30.13 
 
 		 310 aa  142  6e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1838  alpha/beta hydrolase fold  35.09 
 
 		 333 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.886983  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8725  alpha/beta hydrolase fold protein  35.15 
 
 		 332 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3829  alpha/beta hydrolase fold  37.45 
 
 		 331 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1905  alpha/beta hydrolase fold  34.6 
 
 		 354 aa  138  1e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1468  alpha/beta hydrolase fold  34.7 
 
 		 340 aa  137  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.890362 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2167  alpha/beta hydrolase fold  32.49 
 
 		 317 aa  136  5e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5411  alpha/beta hydrolase fold  34.93 
 
 		 328 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.173049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2989  alpha/beta hydrolase fold  33.65 
 
 		 339 aa  134  9.999999999999999e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.720192 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0056  alpha/beta hydrolase fold  34.72 
 
 		 332 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2445  Alpha/beta hydrolase  34.04 
 
 		 327 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5377  alpha/beta hydrolase fold protein  33.11 
 
 		 332 aa  134  3e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.306055  normal  0.839367 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0102  alpha/beta hydrolase fold  33.67 
 
 		 332 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0105  alpha/beta hydrolase  33.1 
 
 		 328 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00875507  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3567  alpha/beta hydrolase fold  34.19 
 
 		 328 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.253365  hitchhiker  0.00645223 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4699  alpha/beta hydrolase fold  33.1 
 
 		 327 aa  130  3e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3663  alpha/beta hydrolase fold  33.1 
 
 		 327 aa  130  3e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.378837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1076  hypothetical protein  32 
 
 		 324 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.773392  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1260  alpha/beta fold family hydrolase  32.4 
 
 		 327 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.809  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0099  alpha/beta fold family hydrolase  32.4 
 
 		 324 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3858  alpha/beta hydrolase fold  32.74 
 
 		 327 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.387123 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0087  alpha/beta hydrolase fold protein  33.91 
 
 		 332 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2822  alpha/beta fold family hydrolase  32.4 
 
 		 324 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2675  alpha/beta fold family hydrolase  31.69 
 
 		 324 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.457884  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1011  alpha/beta hydrolase fold  33.45 
 
 		 322 aa  127  3e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.99925 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0402  alpha/beta fold family hydrolase  31.25 
 
 		 324 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4934  Alpha/beta hydrolase fold  33.77 
 
 		 320 aa  125  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1140  alpha/beta hydrolase fold  33.83 
 
 		 320 aa  124  2e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.64719  normal  0.115917 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6057  alpha/beta hydrolase fold  34.52 
 
 		 332 aa  123  4e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00402067  normal  0.493992 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5011  putative alpha/beta hydrolase  33.45 
 
 		 350 aa  121  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.418737  normal  0.1806 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1537  alpha/beta fold family hydrolase  31.8 
 
 		 326 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0118  alpha/beta fold family hydrolase  31.8 
 
 		 326 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.347516  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3642  alpha/beta hydrolase fold  31.9 
 
 		 379 aa  120  3e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.20936  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2782  alpha/beta hydrolase fold protein  30.59 
 
 		 325 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2720  alpha/beta hydrolase fold protein  32.75 
 
 		 342 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3466  alpha/beta hydrolase fold protein  33.69 
 
 		 390 aa  119  6e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3935  alpha/beta hydrolase fold protein  31.18 
 
 		 371 aa  119  6e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2535  alpha/beta hydrolase fold  32.98 
 
 		 344 aa  117  3e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2945  alpha/beta hydrolase fold protein  30 
 
 		 330 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5140  alpha/beta hydrolase fold  34.55 
 
 		 305 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.773664  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1512  alpha/beta hydrolase fold protein  30.38 
 
 		 311 aa  108  1e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1316  alpha/beta hydrolase fold  30.38 
 
 		 311 aa  108  1e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.541831  normal  0.727397 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3925  alpha/beta hydrolase fold  30.47 
 
 		 367 aa  104  2e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.182869  normal  0.384279 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1353  alpha/beta hydrolase fold  29.59 
 
 		 339 aa  98.6  1e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.687878  normal  0.202512 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0316  alpha/beta hydrolase fold  29.82 
 
 		 316 aa  91.3  2e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00247828  hitchhiker  0.00660595 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5680  alpha/beta hydrolase fold protein  28.73 
 
 		 324 aa  90.9  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1095  alpha/beta hydrolase fold  27 
 
 		 302 aa  89  1e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2696  alpha/beta hydrolase fold  28.3 
 
 		 312 aa  87.8  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.623815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2918  alpha/beta hydrolase fold  27.42 
 
 		 312 aa  86.7  5e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.906544 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1945  alpha/beta hydrolase fold  26.95 
 
 		 346 aa  85.9  9e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4425  alpha/beta hydrolase fold  27.84 
 
 		 321 aa  85.9  9e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4512  alpha/beta hydrolase fold  27.84 
 
 		 321 aa  85.9  9e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.999363 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4806  alpha/beta hydrolase fold  27.84 
 
 		 321 aa  85.9  9e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.786039  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1258  putative hydrolase  27.09 
 
 		 312 aa  84.3  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0672  alpha/beta hydrolase fold  28.38 
 
 		 315 aa  83.6  0.000000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.240082 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1770  alpha/beta hydrolase fold  22.8 
 
 		 323 aa  83.2  0.000000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00973065  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1253  alpha/beta hydrolase fold  25.33 
 
 		 298 aa  80.9  0.00000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.188153  normal  0.590935 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  29.79 
 
 		 299 aa  80.1  0.00000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0608  alpha/beta hydrolase fold  28.16 
 
 		 300 aa  80.1  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3858  alpha/beta hydrolase fold  29.18 
 
 		 304 aa  78.2  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2528  alpha/beta hydrolase fold  23.18 
 
 		 301 aa  77  0.0000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3143  alpha/beta hydrolase fold  30.5 
 
 		 309 aa  75.9  0.0000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.03403  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3588  alpha/beta hydrolase fold protein  29.89 
 
 		 282 aa  74.3  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.291858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0837  alpha/beta fold family hydrolase  26.71 
 
 		 299 aa  75.1  0.000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1491  alpha/beta hydrolase fold  25.16 
 
 		 297 aa  73.9  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00412587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10135  epoxide hydrolase ephF  27.59 
 
 		 300 aa  73.9  0.000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.890635 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3655  alpha/beta hydrolase fold  27.54 
 
 		 312 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3779  cyclic nucleotide-binding protein  28.03 
 
 		 453 aa  73.6  0.000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0440455  normal  0.0476196 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4692  hydrolase  25.34 
 
 		 313 aa  72.8  0.000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.236013  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5766  alpha/beta hydrolase fold protein  27.6 
 
 		 302 aa  72.8  0.000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1827  alpha/beta hydrolase fold  27.21 
 
 		 285 aa  72  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2302  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 		 329 aa  72  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2334  alpha/beta hydrolase fold  24.09 
 
 		 258 aa  72  0.00000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000909068  hitchhiker  0.0000846948 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>