More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_0316 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_0316  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
316 aa  621  1e-177  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00247828  hitchhiker  0.00660595 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3858  alpha/beta hydrolase fold  47.74 
 
 
304 aa  242  7e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2696  alpha/beta hydrolase fold  42.59 
 
 
312 aa  209  7e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.623815  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53540  hydrolase  38.77 
 
 
313 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.187191  decreased coverage  0.0000594216 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2918  alpha/beta hydrolase fold  41.83 
 
 
312 aa  196  5.000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.906544 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1258  putative hydrolase  41.44 
 
 
312 aa  194  2e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4692  hydrolase  38.04 
 
 
313 aa  188  1e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.236013  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3655  alpha/beta hydrolase fold  36.92 
 
 
312 aa  187  3e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0993  alpha/beta hydrolase fold  35.54 
 
 
345 aa  177  1e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.87511  unclonable  0.000000000579867 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2302  alpha/beta hydrolase fold  38.28 
 
 
329 aa  175  8e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1955  Alpha/beta hydrolase fold  35.52 
 
 
339 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0521356  normal  0.151931 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0672  alpha/beta hydrolase fold  35.44 
 
 
315 aa  171  2e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.240082 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1770  alpha/beta hydrolase fold  33.1 
 
 
323 aa  168  1e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00973065  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3361  alpha/beta hydrolase fold  39.56 
 
 
340 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.013073  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3014  alpha/beta hydrolase fold protein  38.08 
 
 
340 aa  166  5e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3600  alpha/beta hydrolase fold  39.36 
 
 
333 aa  144  2e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1945  alpha/beta hydrolase fold  33.71 
 
 
346 aa  142  8e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1353  alpha/beta hydrolase fold  32.62 
 
 
339 aa  130  2.0000000000000002e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.687878  normal  0.202512 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  34.6 
 
 
299 aa  114  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  32.74 
 
 
287 aa  110  3e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  33.83 
 
 
308 aa  103  3e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3250  Alpha/beta hydrolase fold  31.35 
 
 
273 aa  103  5e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000000000180136  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1565  alpha/beta hydrolase fold  31.52 
 
 
363 aa  101  1e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.461626  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0994  alpha/beta hydrolase fold  28.02 
 
 
281 aa  102  1e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.795664 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1968  putative alpha/beta hydrolase fold  31.3 
 
 
259 aa  102  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0153168  normal  0.143128 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  30.69 
 
 
295 aa  102  1e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0403  alpha/beta hydrolase fold  29.5 
 
 
291 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0412  alpha/beta hydrolase fold  29.5 
 
 
291 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0866892  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0391  alpha/beta hydrolase fold  29.5 
 
 
291 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2047  Alpha/beta hydrolase fold  28.02 
 
 
312 aa  99  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2405  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  33.75 
 
 
369 aa  97.1  4e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0222007  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2367  alpha/beta hydrolase fold  30.53 
 
 
291 aa  96.3  6e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.926143  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4681  alpha/beta hydrolase fold protein  32.05 
 
 
333 aa  96.3  6e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0592  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  31.3 
 
 
368 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3452  alpha/beta hydrolase fold  25.29 
 
 
311 aa  94.4  2e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.156566  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1002  alpha/beta family hydrolase  31.43 
 
 
292 aa  94.7  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1023  alpha/beta family hydrolase  31.32 
 
 
287 aa  94.4  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4748  alpha/beta hydrolase fold  30.04 
 
 
295 aa  94  3e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.259792  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5552  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  31.34 
 
 
370 aa  93.6  4e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.077135  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4321  alpha/beta hydrolase fold  31.72 
 
 
280 aa  93.2  5e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0798376 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1600  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  27.73 
 
 
371 aa  92.8  6e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0935  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  31.11 
 
 
370 aa  93.2  6e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2705  alpha/beta hydrolase fold  28.14 
 
 
309 aa  92.8  7e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.601677  normal  0.0914485 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0475  alpha/beta hydrolase fold protein  25.99 
 
 
290 aa  92.8  7e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1824  alpha/beta hydrolase fold protein  30.53 
 
 
309 aa  92.8  7e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1310  alpha/beta hydrolase fold protein  30.91 
 
 
301 aa  92.4  8e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2445  alpha/beta hydrolase fold  29.07 
 
 
340 aa  92.4  8e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.54824  normal  0.191947 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3143  alpha/beta hydrolase fold  31.25 
 
 
309 aa  92  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.03403  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3952  alpha/beta hydrolase fold  29.76 
 
 
340 aa  92  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.675872  normal  0.742045 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12729  hydrolase  29.37 
 
 
341 aa  91.7  1e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2440  alpha/beta hydrolase fold  28.93 
 
 
287 aa  92  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.329878 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0598  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  30.89 
 
 
368 aa  92  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0447613 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3543  alpha/beta hydrolase fold  28.85 
 
 
268 aa  92  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.447096  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3987  alpha/beta hydrolase fold  29.82 
 
 
329 aa  91.3  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.38084 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3235  magnesium chelatase accessory protein  30.92 
 
 
301 aa  90.9  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2172  alpha/beta hydrolase fold  29.93 
 
 
340 aa  90.9  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41750  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  30.74 
 
 
370 aa  91.3  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.942263  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2218  alpha/beta hydrolase fold  29.93 
 
 
340 aa  90.9  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.158046  normal  0.0966577 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4279  alpha/beta hydrolase fold  29.33 
 
 
290 aa  90.5  3e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0429244  normal  0.222336 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2161  alpha/beta hydrolase fold  29.93 
 
 
340 aa  90.9  3e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.170083  hitchhiker  0.00519685 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2292  alpha/beta hydrolase fold  30.68 
 
 
275 aa  90.9  3e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.288944 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0553  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  30.89 
 
 
368 aa  90.5  4e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0725  alpha/beta hydrolase fold protein  29.55 
 
 
286 aa  90.1  4e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10240  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  30.74 
 
 
370 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1052  alpha/beta fold family hydrolase  25.29 
 
 
302 aa  90.1  5e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4887  3-oxoadipate enol-lactonase  31.25 
 
 
397 aa  90.1  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.307912  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2400  alpha/beta hydrolase fold  30.15 
 
 
288 aa  90.1  5e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4600  alpha/beta hydrolase fold protein  32.33 
 
 
286 aa  90.1  5e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.413191  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4983  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  30.92 
 
 
367 aa  89.7  6e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.40688 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2974  3-oxoadipate enol-lactonase  30.85 
 
 
260 aa  89.4  7e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.108542  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3016  3-oxoadipate enol-lactonase  30.85 
 
 
260 aa  89.4  7e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.352868  normal  0.357434 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42230  2-hydroxymuconic semialdehyde hydrolase  31.85 
 
 
271 aa  89.4  8e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1348  3-oxoadipate enol-lactonase  31.38 
 
 
256 aa  88.6  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.786206 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3291  alpha/beta hydrolase fold protein  27.24 
 
 
296 aa  88.6  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2857  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 
286 aa  88.6  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.668026  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3606  3-oxoadipate enol-lactonase  30.88 
 
 
265 aa  89  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0197721  hitchhiker  0.000894779 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1367  3-oxoadipate enol-lactonase  29.62 
 
 
256 aa  88.6  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2212  putative lipase  26.49 
 
 
315 aa  89  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.799877  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3822  alpha/beta hydrolase fold  30.91 
 
 
308 aa  88.6  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25910  putative lipase  26.49 
 
 
315 aa  89  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0600573 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1823  alpha/beta hydrolase fold protein  29.75 
 
 
322 aa  89  1e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1385  3-oxoadipate enol-lactonase  29.62 
 
 
256 aa  88.6  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.279159  normal  0.947236 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1970  alpha/beta hydrolase fold  25.3 
 
 
311 aa  87.4  2e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000319634  normal  0.0578642 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0726  Alpha/beta hydrolase fold  26.79 
 
 
297 aa  88.2  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.418477  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0778  alpha/beta hydrolase fold  26.16 
 
 
290 aa  87.8  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.588108  normal  0.620375 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4246  alpha/beta hydrolase fold  29.55 
 
 
288 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.912428  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1401  3-oxoadipate enol-lactonase  29.62 
 
 
256 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.926851 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2335  alpha/beta hydrolase fold  30.18 
 
 
315 aa  88.2  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1042  alpha/beta hydrolase fold  29.92 
 
 
265 aa  87.4  3e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3826  3-oxoadipate enol-lactonase  32 
 
 
265 aa  87  4e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1217  alpha/beta hydrolase fold protein  26.1 
 
 
335 aa  86.7  4e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1259  alpha/beta hydrolase fold  29.55 
 
 
284 aa  87  4e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0198  alpha/beta hydrolase fold  28.11 
 
 
311 aa  86.7  5e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.593906 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4012  Alpha/beta hydrolase  30.28 
 
 
296 aa  86.3  6e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0123555 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1179  alpha/beta hydrolase fold protein  29.15 
 
 
278 aa  86.3  6e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0798469  normal  0.0102944 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0952  alpha/beta hydrolase fold  31.25 
 
 
350 aa  86.3  6e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167574  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2443  alpha/beta hydrolase fold  30.98 
 
 
275 aa  86.3  6e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.752916  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0675  alpha/beta hydrolase fold  25.99 
 
 
290 aa  86.3  7e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0467323 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4130  alpha/beta hydrolase fold protein  32.81 
 
 
301 aa  85.9  8e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2523  alpha/beta hydrolase fold protein  29.45 
 
 
267 aa  85.9  8e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.737323 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>