More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_2989 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_2989  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 339 aa  689    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.720192 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49180  Alpha/beta hydrolase fold protein  48.97 
 
 		 321 aa  293  2e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5011  putative alpha/beta hydrolase  45.05 
 
 		 350 aa  268  1e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.418737  normal  0.1806 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1905  alpha/beta hydrolase fold  44.9 
 
 		 354 aa  266  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8725  alpha/beta hydrolase fold protein  46.64 
 
 		 332 aa  260  3e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2782  alpha/beta hydrolase fold protein  44.44 
 
 		 325 aa  259  4e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2945  alpha/beta hydrolase fold protein  45.12 
 
 		 330 aa  259  4e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5377  alpha/beta hydrolase fold protein  42.62 
 
 		 332 aa  255  8e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.306055  normal  0.839367 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0056  alpha/beta hydrolase fold  44.68 
 
 		 332 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0102  alpha/beta hydrolase fold  44.33 
 
 		 332 aa  252  5.000000000000001e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6057  alpha/beta hydrolase fold  46.26 
 
 		 332 aa  251  2e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00402067  normal  0.493992 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0087  alpha/beta hydrolase fold protein  43.77 
 
 		 332 aa  246  4e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2535  alpha/beta hydrolase fold  40.99 
 
 		 344 aa  241  9e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2720  alpha/beta hydrolase fold protein  44.12 
 
 		 342 aa  233  5e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3466  alpha/beta hydrolase fold protein  43.31 
 
 		 390 aa  230  3e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1512  alpha/beta hydrolase fold protein  39.86 
 
 		 311 aa  227  2e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1316  alpha/beta hydrolase fold  39.86 
 
 		 311 aa  227  2e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.541831  normal  0.727397 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3935  alpha/beta hydrolase fold protein  42.67 
 
 		 371 aa  224  1e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3642  alpha/beta hydrolase fold  44.4 
 
 		 379 aa  224  1e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.20936  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3925  alpha/beta hydrolase fold  42.35 
 
 		 367 aa  208  1e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.182869  normal  0.384279 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0434  alpha/beta hydrolase fold  31.29 
 
 		 318 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.332302  hitchhiker  0.0000000111123 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0446  alpha/beta hydrolase fold protein  31.35 
 
 		 318 aa  129  6e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.2537  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3987  alpha/beta hydrolase fold  34.63 
 
 		 329 aa  129  6e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.38084 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5140  alpha/beta hydrolase fold  35.71 
 
 		 305 aa  127  3e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.773664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1660  putative alpha/beta hydrolase  31.73 
 
 		 319 aa  124  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1641  alpha/beta hydrolase fold  30.55 
 
 		 317 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.24202 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0741  hypothetical protein  44.83 
 
 		 292 aa  119  6e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0011  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase)  30.18 
 
 		 317 aa  119  7.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.903743  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2534  alpha/beta hydrolase fold  28.94 
 
 		 330 aa  116  3.9999999999999997e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4934  Alpha/beta hydrolase fold  33.56 
 
 		 320 aa  116  5e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0105  alpha/beta hydrolase  31.12 
 
 		 328 aa  115  8.999999999999998e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00875507  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1217  alpha/beta hydrolase fold  30.72 
 
 		 342 aa  115  8.999999999999998e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2352  alpha/beta hydrolase  29.83 
 
 		 314 aa  115  1.0000000000000001e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.517024  normal  0.362082 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4675  alpha/beta hydrolase fold  32.01 
 
 		 334 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.719467  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5045  alpha/beta hydrolase fold  29.51 
 
 		 325 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.6879  normal  0.399471 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2167  alpha/beta hydrolase fold  28.73 
 
 		 317 aa  112  9e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2445  Alpha/beta hydrolase  30.58 
 
 		 327 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1011  alpha/beta hydrolase fold  30.48 
 
 		 322 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.99925 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1140  alpha/beta hydrolase fold  28.98 
 
 		 320 aa  108  1e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.64719  normal  0.115917 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3567  alpha/beta hydrolase fold  31.43 
 
 		 328 aa  107  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.253365  hitchhiker  0.00645223 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2029  alpha/beta hydrolase fold  30.21 
 
 		 343 aa  107  3e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.62215 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1400  alpha/beta hydrolase fold  30.94 
 
 		 320 aa  107  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.700473 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4699  alpha/beta hydrolase fold  29.29 
 
 		 327 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5411  alpha/beta hydrolase fold  32.06 
 
 		 328 aa  107  3e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.173049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3663  alpha/beta hydrolase fold  29.29 
 
 		 327 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.378837  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3858  alpha/beta hydrolase fold  29.29 
 
 		 327 aa  106  7e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.387123 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1420  alpha/beta hydrolase fold  30.53 
 
 		 320 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1380  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 		 321 aa  105  1e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5208  alpha/beta hydrolase fold  30.1 
 
 		 346 aa  105  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.32318  normal  0.119045 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2970  alpha/beta hydrolase fold protein  28.26 
 
 		 331 aa  104  2e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5961  alpha/beta hydrolase fold protein  31.33 
 
 		 345 aa  105  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.576377  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1594  putative alpha/beta hydrolase  28.04 
 
 		 320 aa  103  3e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.404575 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2743  alpha/beta hydrolase fold  28.76 
 
 		 331 aa  102  1e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.529791  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1838  alpha/beta hydrolase fold  29.09 
 
 		 333 aa  100  4e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.886983  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2865  alpha/beta hydrolase fold  28.35 
 
 		 331 aa  99.8  6e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3278  alpha/beta hydrolase fold  28.03 
 
 		 351 aa  97.4  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1468  alpha/beta hydrolase fold  30.37 
 
 		 340 aa  96.7  5e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.890362 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0099  alpha/beta fold family hydrolase  28.29 
 
 		 324 aa  96.3  7e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0402  alpha/beta fold family hydrolase  28.62 
 
 		 324 aa  96.3  7e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2822  alpha/beta fold family hydrolase  28.29 
 
 		 324 aa  96.3  7e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3577  alpha/beta hydrolase fold protein  27.95 
 
 		 358 aa  96.3  7e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.351187  normal  0.127844 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1260  alpha/beta fold family hydrolase  28.29 
 
 		 327 aa  96.3  7e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.809  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2675  alpha/beta fold family hydrolase  28.29 
 
 		 324 aa  95.9  9e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.457884  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1076  hypothetical protein  28.29 
 
 		 324 aa  95.5  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.773392  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1095  alpha/beta hydrolase fold  28.29 
 
 		 302 aa  94.7  2e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0129  alpha/beta hydrolase fold  29.32 
 
 		 338 aa  94.4  3e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.773269  normal  0.28797 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1412  alpha/beta fold family hydrolase  28.57 
 
 		 295 aa  93.2  6e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.405065 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3829  alpha/beta hydrolase fold  29.35 
 
 		 331 aa  91.7  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3884  alpha/beta hydrolase fold  27.15 
 
 		 341 aa  90.9  3e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.447806  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3689  hypothetical protein  27.04 
 
 		 335 aa  90.5  4e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.29493  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0837  alpha/beta fold family hydrolase  25.86 
 
 		 299 aa  87.8  3e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4425  alpha/beta hydrolase fold  27.34 
 
 		 321 aa  85.9  9e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4806  alpha/beta hydrolase fold  27.34 
 
 		 321 aa  85.9  9e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.786039  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4512  alpha/beta hydrolase fold  27.34 
 
 		 321 aa  85.9  9e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.999363 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  29.17 
 
 		 287 aa  85.5  0.000000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1537  alpha/beta fold family hydrolase  28.1 
 
 		 326 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0118  alpha/beta fold family hydrolase  28.1 
 
 		 326 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.347516  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5680  alpha/beta hydrolase fold protein  28.52 
 
 		 324 aa  83.2  0.000000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0403  alpha/beta hydrolase fold  28.18 
 
 		 291 aa  83.2  0.000000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0391  alpha/beta hydrolase fold  28.18 
 
 		 291 aa  83.2  0.000000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0412  alpha/beta hydrolase fold  28.18 
 
 		 291 aa  83.2  0.000000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0866892  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1698  alpha/beta hydrolase fold  26.15 
 
 		 397 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2528  alpha/beta hydrolase fold  26.9 
 
 		 301 aa  80.5  0.00000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2885  alpha/beta hydrolase fold protein  30.6 
 
 		 275 aa  79.7  0.00000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00297178 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0527  inner-membrane translocator  26.83 
 
 		 562 aa  79.3  0.00000000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.142697  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1253  alpha/beta hydrolase fold  23.55 
 
 		 298 aa  77.4  0.0000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.188153  normal  0.590935 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1491  alpha/beta hydrolase fold  25.08 
 
 		 297 aa  77  0.0000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00412587  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0726  Alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 		 297 aa  76.6  0.0000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.418477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0023  alpha/beta hydrolase fold  25.15 
 
 		 315 aa  73.9  0.000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00672386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1620  alpha/beta hydrolase fold  26.24 
 
 		 303 aa  74.3  0.000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4279  alpha/beta hydrolase fold  30.24 
 
 		 290 aa  74.3  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0429244  normal  0.222336 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3317  putative hydrolase or acyltransferase  32.52 
 
 		 296 aa  73.9  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3241  putative hydrolase or acyltransferase  32.52 
 
 		 296 aa  73.6  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2754  alpha/beta hydrolase fold protein  26.36 
 
 		 284 aa  73.2  0.000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1080  alpha/beta hydrolase fold  25.08 
 
 		 296 aa  72.8  0.000000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3429  alpha/beta hydrolase fold protein  27.96 
 
 		 270 aa  72.8  0.000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.210707 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3421  putative hydrolase or acyltransferase  31.71 
 
 		 296 aa  72.4  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0121666 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0902  Alpha/beta hydrolase fold  26.62 
 
 		 300 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.685434 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1042  alpha/beta hydrolase fold  29.28 
 
 		 265 aa  72  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6643  putative triacylglycerol lipase  26.22 
 
 		 275 aa  72.4  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.192902  normal  0.181736 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>