More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_1620 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008789  Hhal_1620  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
303 aa  594  1e-169  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3235  magnesium chelatase accessory protein  54.61 
 
 
301 aa  280  2e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3010  magnesium chelatase accessory protein  53.87 
 
 
299 aa  271  7e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.219603  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6446  putative Alpha/beta hydrolase, putative protoporphyrin IX magnesium chelatase bchO-like protein  51.1 
 
 
301 aa  268  5.9999999999999995e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.606393 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1698  magnesium chelatase accessory protein  51.09 
 
 
295 aa  260  2e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.28396  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4012  Alpha/beta hydrolase  49.46 
 
 
296 aa  256  3e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0123555 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3199  magnesium chelatase accessory protein  53.36 
 
 
309 aa  256  4e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.825802  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1260  alpha/beta hydrolase fold  48.14 
 
 
304 aa  255  7e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.92818  normal  0.0170464 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0379  alpha/beta hydrolase fold  49.3 
 
 
327 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3767  alpha/beta hydrolase fold  47.44 
 
 
296 aa  253  3e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0136912 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0558  alpha/beta hydrolase fold  47.72 
 
 
338 aa  251  1e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3733  magnesium chelatase accessory protein  50 
 
 
293 aa  247  2e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.229293  normal  0.0818214 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0348  magnesium chelatase accessory protein  51.27 
 
 
322 aa  246  4.9999999999999997e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.80309  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0476  Alpha/beta hydrolase  50.18 
 
 
330 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2065  magnesium chelatase accessory protein  45.7 
 
 
384 aa  242  7e-63  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.178825 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0487  Alpha/beta hydrolase fold  43.89 
 
 
310 aa  237  2e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1832  magnesium chelatase accessory protein  47.7 
 
 
302 aa  230  3e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0474032 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0147  alpha/beta hydrolase  39.05 
 
 
282 aa  181  1e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3504  magnesium-chelatase 30 kDa subunit  37.19 
 
 
302 aa  175  9e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.477882 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0275  magnesium-chelatase, BchO  43.17 
 
 
288 aa  165  9e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.522227  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1918  alpha/beta hydrolase fold  43.17 
 
 
288 aa  165  9e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.683828  normal  0.386783 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1020  alpha/beta hydrolase fold  40.59 
 
 
290 aa  151  1e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0139875  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1945  alpha/beta hydrolase fold  31.6 
 
 
346 aa  100  3e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  30.36 
 
 
308 aa  90.9  2e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2916  alpha/beta hydrolase fold protein  30.29 
 
 
284 aa  89.7  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0672  alpha/beta hydrolase fold  29.5 
 
 
315 aa  89  8e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.240082 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  31.39 
 
 
299 aa  88.2  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1353  alpha/beta hydrolase fold  27.24 
 
 
339 aa  88.6  1e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.687878  normal  0.202512 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0837  alpha/beta fold family hydrolase  29.64 
 
 
299 aa  87  4e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1412  alpha/beta fold family hydrolase  28.81 
 
 
295 aa  86.7  5e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.405065 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0627  Alpha/beta hydrolase  30.32 
 
 
289 aa  85.5  9e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.355065 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4681  alpha/beta hydrolase fold protein  30.38 
 
 
333 aa  85.1  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1770  alpha/beta hydrolase fold  25.37 
 
 
323 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00973065  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0986  alpha/beta hydrolase fold protein  32.17 
 
 
279 aa  83.6  0.000000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.900551 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1052  alpha/beta fold family hydrolase  29.02 
 
 
302 aa  82.4  0.000000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2167  alpha/beta hydrolase fold  27.27 
 
 
317 aa  80.9  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3235  alpha/beta hydrolase fold  26.64 
 
 
316 aa  80.1  0.00000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.423188  normal  0.602457 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2645  Alpha/beta hydrolase  28.97 
 
 
289 aa  80.5  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0678318 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1955  Alpha/beta hydrolase fold  28.32 
 
 
339 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0521356  normal  0.151931 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0971  alpha/beta hydrolase fold  29.62 
 
 
287 aa  79.7  0.00000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.419723 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1168  alpha/beta hydrolase fold protein  31.34 
 
 
271 aa  79.3  0.00000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.375352  normal  0.0130652 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3372  alpha/beta hydrolase fold protein  30.18 
 
 
287 aa  79.3  0.00000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000420005  normal  0.0275463 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3952  alpha/beta hydrolase fold  28.81 
 
 
340 aa  78.6  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.675872  normal  0.742045 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2302  alpha/beta hydrolase fold  27.37 
 
 
329 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0316  alpha/beta hydrolase fold  27.34 
 
 
316 aa  78.6  0.0000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00247828  hitchhiker  0.00660595 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7003  alpha/beta hydrolase fold  30.24 
 
 
291 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00535586 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1594  putative alpha/beta hydrolase  28.52 
 
 
320 aa  77.4  0.0000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.404575 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0726  Alpha/beta hydrolase fold  29.23 
 
 
297 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.418477  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1232  alpha/beta hydrolase fold protein  25.09 
 
 
277 aa  77.8  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1905  alpha/beta hydrolase fold  27.4 
 
 
354 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1492  alpha/beta hydrolase fold  29.9 
 
 
291 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6337  alpha/beta hydrolase fold  29.9 
 
 
291 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2445  alpha/beta hydrolase fold  28.14 
 
 
340 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.54824  normal  0.191947 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5036  hydrolase, alpha/beta fold family  26.57 
 
 
279 aa  76.6  0.0000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0952  alpha/beta hydrolase fold  29.7 
 
 
350 aa  76.6  0.0000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167574  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5208  alpha/beta hydrolase fold  32.37 
 
 
346 aa  75.9  0.0000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.32318  normal  0.119045 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3858  alpha/beta hydrolase fold  26.94 
 
 
304 aa  75.9  0.0000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4334  alpha/beta hydrolase fold protein  36.84 
 
 
278 aa  75.9  0.0000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0684332 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2679  alpha/beta hydrolase fold  28.47 
 
 
288 aa  75.9  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.113925  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4774  alpha/beta fold family hydrolase  27.47 
 
 
279 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1095  alpha/beta hydrolase fold  25.98 
 
 
302 aa  75.5  0.000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4636  alpha/beta hydrolase fold protein  27.47 
 
 
279 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1491  alpha/beta hydrolase fold  25.98 
 
 
297 aa  75.1  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00412587  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5136  alpha/beta fold family hydrolase  27.47 
 
 
279 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1253  alpha/beta hydrolase fold  27.21 
 
 
298 aa  75.5  0.000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.188153  normal  0.590935 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5048  hydrolase, alpha/beta fold family  27.05 
 
 
279 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5015  hydrolase, alpha/beta fold family  27.47 
 
 
279 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2989  alpha/beta hydrolase fold  26.24 
 
 
339 aa  74.3  0.000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.720192 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4614  alpha/beta hydrolase fold protein  27.11 
 
 
279 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4115  alpha/beta hydrolase fold  29.71 
 
 
280 aa  74.7  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2172  alpha/beta hydrolase fold  28.77 
 
 
340 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2218  alpha/beta hydrolase fold  28.77 
 
 
340 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.158046  normal  0.0966577 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0198  hydrolase, alpha/beta fold family  26.2 
 
 
279 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2161  alpha/beta hydrolase fold  28.77 
 
 
340 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.170083  hitchhiker  0.00519685 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1316  alpha/beta hydrolase fold  26.64 
 
 
311 aa  73.9  0.000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.541831  normal  0.727397 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5788  alpha/beta hydrolase fold protein  26.24 
 
 
321 aa  73.9  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1080  alpha/beta hydrolase fold  27.82 
 
 
296 aa  73.9  0.000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3776  alpha/beta hydrolase fold  28.77 
 
 
361 aa  73.9  0.000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.904669  decreased coverage  0.00241214 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3515  alpha/beta hydrolase fold  25.9 
 
 
279 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1512  alpha/beta hydrolase fold protein  26.64 
 
 
311 aa  73.9  0.000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2996  alpha/beta hydrolase fold protein  29.35 
 
 
335 aa  73.9  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.761802  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  27.85 
 
 
295 aa  73.9  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3014  alpha/beta hydrolase fold protein  30 
 
 
340 aa  73.9  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5043  alpha/beta fold family hydrolase  27.11 
 
 
279 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4726  alpha/beta hydrolase fold  27.18 
 
 
279 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1402  alpha/beta hydrolase fold protein  29 
 
 
298 aa  73.6  0.000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0653602  normal  0.476592 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2367  alpha/beta hydrolase fold  29.56 
 
 
291 aa  73.6  0.000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.926143  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0993  alpha/beta hydrolase fold  21.99 
 
 
345 aa  73.6  0.000000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.87511  unclonable  0.000000000579867 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1823  alpha/beta hydrolase fold protein  29.33 
 
 
322 aa  73.2  0.000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3361  alpha/beta hydrolase fold  30.36 
 
 
340 aa  73.2  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.013073  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49180  Alpha/beta hydrolase fold protein  29.07 
 
 
321 aa  73.2  0.000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  28.9 
 
 
314 aa  73.2  0.000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3291  alpha/beta hydrolase fold protein  26.27 
 
 
296 aa  73.2  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0403  alpha/beta hydrolase fold  27.4 
 
 
291 aa  73.2  0.000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0412  alpha/beta hydrolase fold  27.4 
 
 
291 aa  73.2  0.000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0866892  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0527  inner-membrane translocator  25.54 
 
 
562 aa  72.8  0.000000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.142697  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0391  alpha/beta hydrolase fold  27.4 
 
 
291 aa  73.2  0.000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0011  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase)  27.38 
 
 
317 aa  72.8  0.000000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.903743  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3925  alpha/beta hydrolase fold  26.81 
 
 
367 aa  72.8  0.000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.182869  normal  0.384279 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2918  alpha/beta hydrolase fold protein  30.04 
 
 
310 aa  72.8  0.000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000917268  normal  0.0712608 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>