More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_0902 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_0902  Alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 300 aa  615  1e-175  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.685434 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4484  alpha/beta hydrolase fold  72.43 
 
 		 301 aa  455  1e-127  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4624  alpha/beta fold family hydrolase  71.91 
 
 		 299 aa  451  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.186809  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4608  alpha/beta hydrolase fold  72.92 
 
 		 301 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.692037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0814  alpha/beta hydrolase fold  70.1 
 
 		 301 aa  444  1e-123  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19710  alpha/beta family hydrolase  72.28 
 
 		 298 aa  437  1e-121  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1697  putative epoxide hydrolase  71.93 
 
 		 298 aa  433  1e-120  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3280  alpha/beta hydrolase fold  68.6 
 
 		 302 aa  397  9.999999999999999e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3781  alpha/beta hydrolase fold  48.24 
 
 		 295 aa  284  1.0000000000000001e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3624  alpha/beta hydrolase fold  47.06 
 
 		 292 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3365  alpha/beta hydrolase fold  46.6 
 
 		 297 aa  239  5e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11863  hydrolase  39.6 
 
 		 288 aa  152  5e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.905253 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13197  epoxide hydrolase mesT  29.63 
 
 		 318 aa  90.5  3e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.394653 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2154  alpha/beta fold family hydrolase  26.6 
 
 		 308 aa  86.7  5e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0592253  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4681  alpha/beta hydrolase fold protein  28.91 
 
 		 333 aa  85.9  7e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3925  alpha/beta hydrolase fold  28.88 
 
 		 367 aa  84.3  0.000000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.182869  normal  0.384279 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0391  alpha/beta hydrolase fold  28.91 
 
 		 291 aa  83.6  0.000000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0403  alpha/beta hydrolase fold  28.91 
 
 		 291 aa  83.6  0.000000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0412  alpha/beta hydrolase fold  28.91 
 
 		 291 aa  83.6  0.000000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0866892  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  29.3 
 
 		 295 aa  83.2  0.000000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3642  alpha/beta hydrolase fold  29.68 
 
 		 379 aa  82  0.00000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.20936  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01213  probable epoxide hydrolase  49.33 
 
 		 78 aa  82  0.00000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3935  alpha/beta hydrolase fold protein  28.87 
 
 		 371 aa  81.3  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1511  alpha/beta hydrolase fold  26.33 
 
 		 295 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2799  alpha/beta hydrolase fold protein  27.14 
 
 		 302 aa  80.5  0.00000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1714  alpha/beta hydrolase fold  25.18 
 
 		 290 aa  80.1  0.00000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3158  alpha/beta hydrolase fold  25.78 
 
 		 297 aa  79.7  0.00000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1547  alpha/beta hydrolase fold  27.14 
 
 		 302 aa  79.3  0.00000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0809  alpha/beta hydrolase fold  28.4 
 
 		 283 aa  79.3  0.00000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1581  alpha/beta hydrolase fold  27.14 
 
 		 302 aa  79.3  0.00000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.217247  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1114  alpha/beta hydrolase fold  26.39 
 
 		 405 aa  79  0.00000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.060895  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1551  alpha/beta hydrolase fold  27.14 
 
 		 302 aa  79  0.00000000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2270  alpha/beta hydrolase fold  26.12 
 
 		 298 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1370  alpha/beta hydrolase fold  24.47 
 
 		 297 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2714  alpha/beta hydrolase fold  26.26 
 
 		 320 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2735  alpha/beta hydrolase fold  25.54 
 
 		 301 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.211844  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2266  alpha/beta hydrolase fold protein  27.59 
 
 		 274 aa  76.6  0.0000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.620512 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1446  alpha/beta hydrolase fold  26.57 
 
 		 303 aa  76.6  0.0000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.947535  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2547  alpha/beta hydrolase fold  25.9 
 
 		 339 aa  76.3  0.0000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2614  alpha/beta hydrolase fold  25.9 
 
 		 339 aa  76.6  0.0000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1366  alpha/beta hydrolase fold  27.01 
 
 		 291 aa  76.3  0.0000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1743  alpha/beta fold family hydrolase  25.9 
 
 		 318 aa  75.9  0.0000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0037  putative alpha/beta hydrolase  30.47 
 
 		 276 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2212  putative lipase  25.09 
 
 		 315 aa  75.9  0.0000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.799877  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25910  putative lipase  25.09 
 
 		 315 aa  75.9  0.0000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0600573 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  29.33 
 
 		 287 aa  75.9  0.0000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  30.81 
 
 		 265 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0552  alpha/beta hydrolase fold protein  35.19 
 
 		 294 aa  75.1  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6643  putative triacylglycerol lipase  26.43 
 
 		 275 aa  75.1  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.192902  normal  0.181736 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0795  alpha/beta hydrolase fold protein  29.28 
 
 		 267 aa  75.1  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.814605  normal  0.361628 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1625  putative 2-hydroxy-6-oxohepta-2,4-dienoate hydrolase  30.74 
 
 		 288 aa  74.7  0.000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.997053  normal  0.416685 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2117  alpha/beta hydrolase fold protein  25.37 
 
 		 300 aa  74.3  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10240  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  30.08 
 
 		 370 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1637  alpha/beta hydrolase fold  25.67 
 
 		 287 aa  73.6  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  27.11 
 
 		 314 aa  73.9  0.000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3261  alpha/beta hydrolase fold protein  36.07 
 
 		 272 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.767293  normal  0.718789 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2638  alpha/beta hydrolase fold protein  27.84 
 
 		 294 aa  73.2  0.000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0023  alpha/beta hydrolase fold  24.65 
 
 		 315 aa  73.2  0.000000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00672386  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3645  alpha/beta fold family hydrolase  28.83 
 
 		 292 aa  72.8  0.000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0431011  normal  0.291573 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0935  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  29.04 
 
 		 370 aa  72.8  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2885  alpha/beta hydrolase fold protein  26.42 
 
 		 275 aa  72.8  0.000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00297178 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6488  Alpha/beta hydrolase  25 
 
 		 271 aa  72.4  0.000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.642032 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2085  alpha/beta hydrolase fold  28.83 
 
 		 277 aa  72.4  0.000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.622652  normal  0.427031 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1736  alpha/beta hydrolase fold  25.56 
 
 		 290 aa  72.4  0.000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2101  alpha/beta hydrolase fold  24.65 
 
 		 300 aa  71.6  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.933589  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2989  alpha/beta hydrolase fold  26.62 
 
 		 339 aa  72  0.00000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.720192 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1693  putative hydrolase  25.27 
 
 		 272 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.800205 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0074  alpha/beta hydrolase fold  26.35 
 
 		 275 aa  72  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.224768  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2705  alpha/beta hydrolase fold  27.7 
 
 		 309 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.601677  normal  0.0914485 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2535  alpha/beta hydrolase fold  30.81 
 
 		 344 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4957  alpha/beta hydrolase fold  25.98 
 
 		 272 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.174321  normal  0.0565751 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1418  alpha/beta hydrolase fold protein  39 
 
 		 276 aa  70.9  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.961025  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2263  alpha/beta hydrolase fold  27.74 
 
 		 277 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1770  alpha/beta hydrolase fold  23.63 
 
 		 323 aa  71.2  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00973065  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1310  alpha/beta hydrolase fold protein  27.18 
 
 		 301 aa  70.9  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3137  alpha/beta hydrolase fold  27.9 
 
 		 271 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3083  alpha/beta hydrolase fold  24.58 
 
 		 292 aa  70.5  0.00000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000632175  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1823  alpha/beta hydrolase fold protein  28.42 
 
 		 322 aa  70.1  0.00000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3466  alpha/beta hydrolase fold protein  29.49 
 
 		 390 aa  70.5  0.00000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0693  alpha/beta hydrolase fold  24.24 
 
 		 258 aa  70.5  0.00000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4828  alpha/beta hydrolase fold-containing protein  27.36 
 
 		 301 aa  69.7  0.00000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2065  cyclic nucleotide-binding protein  29.33 
 
 		 462 aa  69.7  0.00000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1641  alpha/beta hydrolase fold  27.02 
 
 		 317 aa  69.7  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.24202 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1998  alpha/beta hydrolase fold  24.09 
 
 		 293 aa  70.1  0.00000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.918963  normal  0.449099 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2009  alpha/beta hydrolase fold  25.71 
 
 		 294 aa  69.7  0.00000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3192  alpha/beta hydrolase fold  26.33 
 
 		 267 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.421689  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0011  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase)  26.67 
 
 		 317 aa  69.3  0.00000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.903743  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3104  alpha/beta hydrolase fold  25.67 
 
 		 296 aa  69.3  0.00000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0892  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 		 272 aa  68.9  0.00000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0423954 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3075  alpha/beta hydrolase fold  36.07 
 
 		 267 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.260909 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2258  alpha/beta hydrolase fold  28.1 
 
 		 277 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.40096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1065  alpha/beta hydrolase fold  27.14 
 
 		 275 aa  68.9  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.289777  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4421  alpha/beta hydrolase fold protein  26.21 
 
 		 299 aa  68.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2524  alpha/beta hydrolase fold  27.54 
 
 		 271 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.191212  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0726  Alpha/beta hydrolase fold  27.43 
 
 		 297 aa  67.4  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.418477  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3153  alpha/beta hydrolase fold  37.82 
 
 		 271 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0769848 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  26.77 
 
 		 270 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  25.56 
 
 		 262 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2367  alpha/beta hydrolase fold  27.9 
 
 		 291 aa  67.4  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.926143  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0439  alpha/beta hydrolase fold protein  30.1 
 
 		 293 aa  67  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.580414  normal  0.906073 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>