More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_19710 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_19710  alpha/beta family hydrolase  100 
 
 
298 aa  597  1e-170  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1697  putative epoxide hydrolase  93.62 
 
 
298 aa  570  1e-161  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0902  Alpha/beta hydrolase fold  72.28 
 
 
300 aa  437  1e-121  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.685434 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3280  alpha/beta hydrolase fold  71.97 
 
 
302 aa  407  1e-113  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0814  alpha/beta hydrolase fold  65.61 
 
 
301 aa  385  1e-106  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4608  alpha/beta hydrolase fold  64.44 
 
 
301 aa  380  1e-104  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.692037  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4624  alpha/beta fold family hydrolase  64.54 
 
 
299 aa  376  1e-103  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.186809  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4484  alpha/beta hydrolase fold  63.38 
 
 
301 aa  375  1e-103  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3624  alpha/beta hydrolase fold  47.2 
 
 
292 aa  276  3e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3781  alpha/beta hydrolase fold  48.59 
 
 
295 aa  275  5e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3365  alpha/beta hydrolase fold  50.18 
 
 
297 aa  242  7e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11863  hydrolase  40 
 
 
288 aa  159  7e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.905253 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13197  epoxide hydrolase mesT  28.88 
 
 
318 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.394653 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  31.43 
 
 
295 aa  87  3e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0403  alpha/beta hydrolase fold  30.18 
 
 
291 aa  85.9  8e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0391  alpha/beta hydrolase fold  30.18 
 
 
291 aa  85.9  8e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01213  probable epoxide hydrolase  52.78 
 
 
78 aa  85.9  8e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0412  alpha/beta hydrolase fold  30.18 
 
 
291 aa  85.9  8e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0866892  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2270  alpha/beta hydrolase fold  26.57 
 
 
298 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0074  alpha/beta hydrolase fold  23.69 
 
 
275 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.224768  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2367  alpha/beta hydrolase fold  30.07 
 
 
291 aa  79.7  0.00000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.926143  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2735  alpha/beta hydrolase fold  26.64 
 
 
301 aa  79.3  0.00000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.211844  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  30.63 
 
 
287 aa  79  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3642  alpha/beta hydrolase fold  31.48 
 
 
379 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.20936  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5011  putative alpha/beta hydrolase  35.2 
 
 
350 aa  76.6  0.0000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.418737  normal  0.1806 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1547  alpha/beta hydrolase fold  27.66 
 
 
302 aa  76.6  0.0000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2799  alpha/beta hydrolase fold protein  27.66 
 
 
302 aa  76.3  0.0000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1581  alpha/beta hydrolase fold  27.66 
 
 
302 aa  76.3  0.0000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.217247  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1551  alpha/beta hydrolase fold  26.6 
 
 
302 aa  76.3  0.0000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10135  epoxide hydrolase ephF  28.42 
 
 
300 aa  75.5  0.0000000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.890635 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2154  alpha/beta fold family hydrolase  27.27 
 
 
308 aa  75.1  0.000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0592253  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3935  alpha/beta hydrolase fold protein  30.37 
 
 
371 aa  75.1  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2212  putative lipase  27.3 
 
 
315 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.799877  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0809  alpha/beta hydrolase fold  28.4 
 
 
283 aa  74.7  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2614  alpha/beta hydrolase fold  26.3 
 
 
339 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25910  putative lipase  27.3 
 
 
315 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0600573 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4279  alpha/beta hydrolase fold  29.29 
 
 
290 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0429244  normal  0.222336 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2009  alpha/beta hydrolase fold  26.87 
 
 
294 aa  73.9  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2714  alpha/beta hydrolase fold  26.64 
 
 
320 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1736  alpha/beta hydrolase fold  38.26 
 
 
290 aa  73.6  0.000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2547  alpha/beta hydrolase fold  26.3 
 
 
339 aa  73.6  0.000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2720  alpha/beta hydrolase fold protein  36.3 
 
 
342 aa  73.6  0.000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1824  alpha/beta hydrolase fold protein  29.89 
 
 
309 aa  73.2  0.000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1446  alpha/beta hydrolase fold  26.6 
 
 
303 aa  73.2  0.000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.947535  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0023  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 
315 aa  72.8  0.000000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00672386  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4681  alpha/beta hydrolase fold protein  28.62 
 
 
333 aa  72.4  0.000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3925  alpha/beta hydrolase fold  37.98 
 
 
367 aa  72.4  0.000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.182869  normal  0.384279 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2638  alpha/beta hydrolase fold protein  27.82 
 
 
294 aa  72.4  0.000000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1743  alpha/beta fold family hydrolase  25.8 
 
 
318 aa  72  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1418  alpha/beta hydrolase fold protein  27.48 
 
 
276 aa  72  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.961025  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2782  alpha/beta hydrolase fold protein  30.43 
 
 
325 aa  72.4  0.00000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6643  putative triacylglycerol lipase  25.71 
 
 
275 aa  70.9  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.192902  normal  0.181736 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0994  alpha/beta hydrolase fold  23.21 
 
 
281 aa  70.9  0.00000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.795664 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1714  alpha/beta hydrolase fold  24.3 
 
 
290 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1511  alpha/beta hydrolase fold  27.11 
 
 
295 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0273  alpha/beta fold family hydrolase  23.36 
 
 
258 aa  70.5  0.00000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00000365907  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  28.73 
 
 
314 aa  70.5  0.00000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1448  alpha/beta hydrolase fold  28.78 
 
 
294 aa  70.1  0.00000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.358742 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0795  alpha/beta hydrolase fold protein  30.25 
 
 
267 aa  69.7  0.00000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.814605  normal  0.361628 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4828  alpha/beta hydrolase fold-containing protein  27.62 
 
 
301 aa  69.7  0.00000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2535  alpha/beta hydrolase fold  32.88 
 
 
344 aa  69.3  0.00000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1998  alpha/beta hydrolase fold  24.48 
 
 
293 aa  69.3  0.00000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.918963  normal  0.449099 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3466  alpha/beta hydrolase fold protein  37.5 
 
 
390 aa  68.9  0.00000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1366  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 
291 aa  68.9  0.00000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2117  alpha/beta hydrolase fold protein  26.12 
 
 
300 aa  68.9  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1114  alpha/beta hydrolase fold  28.36 
 
 
405 aa  68.9  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.060895  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2989  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 
339 aa  68.2  0.0000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.720192 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2200  alpha/beta hydrolase fold protein  25.72 
 
 
278 aa  67.8  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2101  alpha/beta hydrolase fold  26.12 
 
 
300 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.933589  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1310  alpha/beta hydrolase fold protein  28.94 
 
 
301 aa  67.8  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2352  alpha/beta hydrolase  28.77 
 
 
314 aa  68.2  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.517024  normal  0.362082 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1705  alpha/beta hydrolase fold  26.83 
 
 
321 aa  68.2  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00565807 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1905  alpha/beta hydrolase fold  34.74 
 
 
354 aa  67.4  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0068  alpha/beta hydrolase fold-containing protein  28.01 
 
 
297 aa  67  0.0000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.392587  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6705  alpha/beta hydrolase fold protein  24.49 
 
 
335 aa  67  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0147  alpha/beta hydrolase  28.57 
 
 
282 aa  67  0.0000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2749  alpha/beta hydrolase fold  26.26 
 
 
330 aa  66.6  0.0000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  27.66 
 
 
265 aa  66.6  0.0000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1823  alpha/beta hydrolase fold protein  28.68 
 
 
322 aa  66.6  0.0000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4339  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.38 
 
 
588 aa  66.2  0.0000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0013  Alpha/beta hydrolase fold  25.17 
 
 
300 aa  66.2  0.0000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.798898  normal  0.992459 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2266  alpha/beta hydrolase fold protein  28.07 
 
 
274 aa  66.2  0.0000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.620512 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9195  alpha/beta hydrolase fold protein  36.43 
 
 
296 aa  66.2  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5038  Alpha/beta hydrolase fold  23.4 
 
 
282 aa  66.2  0.0000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.434824 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5377  alpha/beta hydrolase fold protein  35.42 
 
 
332 aa  66.2  0.0000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.306055  normal  0.839367 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1520  alpha/beta hydrolase fold  37.4 
 
 
323 aa  66.2  0.0000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0037  putative alpha/beta hydrolase  29.55 
 
 
276 aa  65.9  0.0000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2885  alpha/beta hydrolase fold protein  28.41 
 
 
275 aa  65.9  0.0000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00297178 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2945  alpha/beta hydrolase fold protein  28.26 
 
 
330 aa  65.1  0.000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3158  alpha/beta hydrolase fold  25.71 
 
 
297 aa  65.5  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0552  alpha/beta hydrolase fold protein  26.67 
 
 
294 aa  64.3  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2956  Alpha/beta hydrolase  27.7 
 
 
275 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.419373  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1047  alpha/beta hydrolase fold  33.01 
 
 
275 aa  64.3  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.975256  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2640  putative hydrolase  36.19 
 
 
194 aa  63.9  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.660495  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1770  alpha/beta hydrolase fold  23.63 
 
 
323 aa  63.9  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00973065  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0234  hypothetical protein  33.33 
 
 
330 aa  63.9  0.000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.833519 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1370  alpha/beta hydrolase fold  24.37 
 
 
297 aa  63.9  0.000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2350  alpha/beta hydrolase fold  27.72 
 
 
298 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2964  alpha/beta hydrolase fold  27.72 
 
 
298 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.391734  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1179  alpha/beta hydrolase fold protein  27.35 
 
 
278 aa  63.9  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0798469  normal  0.0102944 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>