More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_3624 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_3624  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 292 aa  603  1.0000000000000001e-171  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3781  alpha/beta hydrolase fold  47 
 
 		 295 aa  291  1e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1697  putative epoxide hydrolase  47.9 
 
 		 298 aa  280  2e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19710  alpha/beta family hydrolase  47.2 
 
 		 298 aa  276  3e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0902  Alpha/beta hydrolase fold  47.06 
 
 		 300 aa  273  3e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.685434 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3280  alpha/beta hydrolase fold  49.65 
 
 		 302 aa  272  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4484  alpha/beta hydrolase fold  44.64 
 
 		 301 aa  257  2e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0814  alpha/beta hydrolase fold  43.25 
 
 		 301 aa  256  3e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4624  alpha/beta fold family hydrolase  43.94 
 
 		 299 aa  255  6e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.186809  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4608  alpha/beta hydrolase fold  43.94 
 
 		 301 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.692037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3365  alpha/beta hydrolase fold  43.9 
 
 		 297 aa  228  7e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11863  hydrolase  37.63 
 
 		 288 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.905253 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13197  epoxide hydrolase mesT  26.85 
 
 		 318 aa  103  4e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.394653 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0439  alpha/beta hydrolase fold protein  26.22 
 
 		 293 aa  88.6  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.580414  normal  0.906073 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01213  probable epoxide hydrolase  49.33 
 
 		 78 aa  88.2  1e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3788  alpha/beta hydrolase fold  23.97 
 
 		 330 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26790  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  35.56 
 
 		 290 aa  82  0.00000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.330263 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4848  alpha/beta hydrolase fold  32.33 
 
 		 287 aa  81.6  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3277  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 		 296 aa  79.7  0.00000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.38923  normal  0.207617 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3930  alpha/beta hydrolase fold protein  23.79 
 
 		 303 aa  77.4  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6705  alpha/beta hydrolase fold protein  23.51 
 
 		 335 aa  75.1  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  24.91 
 
 		 295 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1698  magnesium chelatase accessory protein  25.36 
 
 		 295 aa  73.9  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.28396  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9195  alpha/beta hydrolase fold protein  33.96 
 
 		 296 aa  73.6  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0879  alpha/beta hydrolase fold  29.93 
 
 		 290 aa  73.2  0.000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2705  alpha/beta hydrolase fold  25.17 
 
 		 309 aa  73.2  0.000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.601677  normal  0.0914485 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0873  alpha/beta hydrolase fold  29.93 
 
 		 290 aa  73.2  0.000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2749  alpha/beta hydrolase fold  25.17 
 
 		 330 aa  73.2  0.000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0890  alpha/beta hydrolase fold  29.93 
 
 		 290 aa  73.2  0.000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.167811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0266  alpha/beta hydrolase fold protein  32.54 
 
 		 301 aa  72.8  0.000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0391  alpha/beta hydrolase fold  24.03 
 
 		 291 aa  72.4  0.000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0403  alpha/beta hydrolase fold  24.03 
 
 		 291 aa  72.4  0.000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0412  alpha/beta hydrolase fold  24.03 
 
 		 291 aa  72.4  0.000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0866892  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2696  alpha/beta hydrolase fold protein  27.82 
 
 		 268 aa  72.4  0.000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.094894  normal  0.233594 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  25.53 
 
 		 287 aa  71.6  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2769  alpha/beta hydrolase fold protein  32.56 
 
 		 305 aa  71.6  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.293551  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2561  alpha/beta hydrolase fold protein  32.03 
 
 		 289 aa  71.6  0.00000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.192273 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3409  putative alpha/beta hydrolase  24.49 
 
 		 409 aa  71.2  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.620958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0420  alpha/beta hydrolase  25.43 
 
 		 319 aa  71.2  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2886  alpha/beta hydrolase fold  25.37 
 
 		 290 aa  70.9  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1114  alpha/beta hydrolase fold  24.83 
 
 		 405 aa  71.2  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.060895  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0955  alpha/beta hydrolase fold  32.89 
 
 		 309 aa  71.2  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1402  alpha/beta hydrolase fold protein  25.09 
 
 		 298 aa  70.5  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0653602  normal  0.476592 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3642  alpha/beta hydrolase fold  26.18 
 
 		 379 aa  70.1  0.00000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.20936  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3935  alpha/beta hydrolase fold protein  25.82 
 
 		 371 aa  70.1  0.00000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4529  alpha/beta hydrolase fold  26.52 
 
 		 311 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.190868 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0795  alpha/beta hydrolase fold protein  25.09 
 
 		 267 aa  69.7  0.00000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.814605  normal  0.361628 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1370  alpha/beta hydrolase fold  24.46 
 
 		 297 aa  69.3  0.00000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3071  alpha/beta hydrolase fold  30.77 
 
 		 290 aa  68.9  0.00000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.357729  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0809  alpha/beta hydrolase fold  25.29 
 
 		 283 aa  69.3  0.00000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6373  alpha/beta hydrolase fold protein  29.63 
 
 		 303 aa  68.9  0.00000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0521  alpha/beta hydrolase fold  31.43 
 
 		 288 aa  68.9  0.00000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2212  putative lipase  26.55 
 
 		 315 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.799877  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0178  alpha/beta hydrolase  30.65 
 
 		 323 aa  68.9  0.0000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4071  alpha/beta hydrolase fold  26.55 
 
 		 310 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.634618 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25910  putative lipase  26.55 
 
 		 315 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0600573 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0862  alpha/beta hydrolase fold protein  26.34 
 
 		 291 aa  68.2  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0771679  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2754  alpha/beta hydrolase fold protein  24.18 
 
 		 284 aa  68.6  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1077  alpha/beta hydrolase fold protein  30.47 
 
 		 290 aa  67.8  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0749091  normal  0.76361 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4733  alpha/beta hydrolase fold  29.85 
 
 		 294 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.596805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1714  alpha/beta hydrolase fold  23.02 
 
 		 290 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0074  alpha/beta hydrolase fold  30.08 
 
 		 275 aa  67.8  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.224768  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0136  alpha/beta hydrolase fold protein  28.97 
 
 		 289 aa  67  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.732439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2473  alpha/beta hydrolase fold protein  25.54 
 
 		 324 aa  67.4  0.0000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0409911  normal  0.0604811 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2799  alpha/beta hydrolase fold protein  24.74 
 
 		 302 aa  67  0.0000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4012  Alpha/beta hydrolase  25.35 
 
 		 296 aa  67.4  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0123555 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0023  alpha/beta hydrolase fold  26.45 
 
 		 315 aa  67  0.0000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00672386  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4681  alpha/beta hydrolase fold protein  24.32 
 
 		 333 aa  67.4  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2885  alpha/beta hydrolase fold protein  24.73 
 
 		 275 aa  67.4  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00297178 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4196  alpha/beta hydrolase fold  29.25 
 
 		 294 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1551  alpha/beta hydrolase fold  24.74 
 
 		 302 aa  66.6  0.0000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1142  Alpha/beta hydrolase  26.2 
 
 		 307 aa  67  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.627946  normal  0.179334 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1547  alpha/beta hydrolase fold  24.74 
 
 		 302 aa  67  0.0000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7101  alpha/beta hydrolase fold protein  29.91 
 
 		 289 aa  67  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.974573 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4827  alpha/beta hydrolase fold protein  25.72 
 
 		 352 aa  66.6  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.692638  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4016  alpha/beta hydrolase fold  26.99 
 
 		 303 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.459613  normal  0.722956 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4430  alpha/beta fold family hydrolase  28.3 
 
 		 287 aa  66.6  0.0000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.12561  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4478  alpha/beta hydrolase fold  39.22 
 
 		 317 aa  66.6  0.0000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.192753 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3323  alpha/beta hydrolase fold protein  24.03 
 
 		 296 aa  66.6  0.0000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4681  alpha/beta hydrolase fold  29.37 
 
 		 321 aa  66.2  0.0000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.490512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0672  alpha/beta hydrolase fold  20.5 
 
 		 315 aa  66.6  0.0000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.240082 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6314  Alpha/beta hydrolase  32.74 
 
 		 298 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4468  hydrolase, alpha/beta fold family  28.3 
 
 		 294 aa  65.9  0.0000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000249417  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4481  hydrolase, alpha/beta fold family  28.3 
 
 		 294 aa  65.9  0.0000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1945  alpha/beta hydrolase fold  23.13 
 
 		 346 aa  65.9  0.0000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1520  alpha/beta hydrolase fold  30.16 
 
 		 323 aa  65.9  0.0000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1057  hydrolase, alpha/beta fold family  29.31 
 
 		 290 aa  65.9  0.0000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000161202  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6643  putative triacylglycerol lipase  23.38 
 
 		 275 aa  65.5  0.0000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.192902  normal  0.181736 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0939  alpha/beta hydrolase fold family lipase  28.45 
 
 		 291 aa  65.5  0.0000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000150383  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4095  alpha/beta fold family hydrolase  28.85 
 
 		 294 aa  65.5  0.0000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000787751  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1100  hydrolase, alpha/beta fold family  28.45 
 
 		 291 aa  65.9  0.0000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.59036e-57 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1581  alpha/beta hydrolase fold  24.74 
 
 		 302 aa  65.9  0.0000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.217247  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0769  hydrolase, alpha/beta fold family  28.3 
 
 		 294 aa  65.5  0.0000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000479635  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5957  alpha/beta hydrolase fold  25.27 
 
 		 296 aa  65.5  0.0000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0650876 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3691  alpha/beta hydrolase fold  26.2 
 
 		 312 aa  65.5  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5623  alpha/beta hydrolase fold  26.2 
 
 		 312 aa  65.5  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4677  alpha/beta hydrolase fold  26.2 
 
 		 312 aa  65.5  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.246976  normal  0.206505 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1552  alpha/beta hydrolase fold protein  29.92 
 
 		 329 aa  65.5  0.0000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.116512  hitchhiker  0.00140159 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0931  alpha/beta hydrolase fold family lipase  28.45 
 
 		 291 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000302651  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3743  Alpha/beta hydrolase  30.23 
 
 		 300 aa  65.1  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0220967  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>