25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_13197 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_13197  epoxide hydrolase mesT  100 
 
 
318 aa  641    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.394653 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3365  alpha/beta hydrolase fold  32.17 
 
 
297 aa  104  2e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3624  alpha/beta hydrolase fold  26.85 
 
 
292 aa  103  4e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3781  alpha/beta hydrolase fold  28.19 
 
 
295 aa  95.5  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0814  alpha/beta hydrolase fold  29.23 
 
 
301 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1697  putative epoxide hydrolase  30.32 
 
 
298 aa  92.4  8e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4484  alpha/beta hydrolase fold  28.52 
 
 
301 aa  92  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4624  alpha/beta fold family hydrolase  28.17 
 
 
299 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.186809  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0902  Alpha/beta hydrolase fold  29.63 
 
 
300 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.685434 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11863  hydrolase  28.93 
 
 
288 aa  88.2  1e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.905253 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19710  alpha/beta family hydrolase  28.88 
 
 
298 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4608  alpha/beta hydrolase fold  27.18 
 
 
301 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.692037  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3280  alpha/beta hydrolase fold  30 
 
 
302 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9195  alpha/beta hydrolase fold protein  28.89 
 
 
296 aa  52  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2886  alpha/beta hydrolase fold  26.11 
 
 
290 aa  47.8  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7174  alpha/beta hydrolase fold  27.54 
 
 
284 aa  47.4  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6373  alpha/beta hydrolase fold protein  26.32 
 
 
303 aa  44.3  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0821  alpha/beta hydrolase fold  37.31 
 
 
252 aa  43.1  0.007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12729  hydrolase  40.79 
 
 
341 aa  43.1  0.007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1310  haloalkane dehalogenase  30.85 
 
 
302 aa  43.1  0.007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000017212  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1370  haloalkane dehalogenase  30.85 
 
 
293 aa  42.7  0.007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  6.59212e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4031  Alpha/beta hydrolase  28.26 
 
 
284 aa  42.7  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1077  alpha/beta hydrolase fold protein  25.64 
 
 
290 aa  42.7  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0749091  normal  0.76361 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3952  alpha/beta hydrolase fold  39.44 
 
 
340 aa  42.7  0.008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.675872  normal  0.742045 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2445  alpha/beta hydrolase fold  30.91 
 
 
340 aa  42.7  0.008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.54824  normal  0.191947 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>