More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_3280 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_3280  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 302 aa  612  9.999999999999999e-175  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1697  putative epoxide hydrolase  72.01 
 
 		 298 aa  427  1e-118  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19710  alpha/beta family hydrolase  71.48 
 
 		 298 aa  422  1e-117  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0902  Alpha/beta hydrolase fold  68.6 
 
 		 300 aa  411  1e-114  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.685434 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4608  alpha/beta hydrolase fold  59.06 
 
 		 301 aa  352  4e-96  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.692037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4484  alpha/beta hydrolase fold  59.14 
 
 		 301 aa  352  5.9999999999999994e-96  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4624  alpha/beta fold family hydrolase  58.14 
 
 		 299 aa  348  6e-95  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.186809  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0814  alpha/beta hydrolase fold  58.39 
 
 		 301 aa  348  7e-95  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3624  alpha/beta hydrolase fold  49.65 
 
 		 292 aa  291  7e-78  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3781  alpha/beta hydrolase fold  48.79 
 
 		 295 aa  279  4e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3365  alpha/beta hydrolase fold  47 
 
 		 297 aa  239  4e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11863  hydrolase  39.85 
 
 		 288 aa  170  2e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.905253 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3277  alpha/beta hydrolase fold  28.83 
 
 		 296 aa  90.1  5e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.38923  normal  0.207617 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13197  epoxide hydrolase mesT  30 
 
 		 318 aa  89  8e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.394653 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01213  probable epoxide hydrolase  52 
 
 		 78 aa  83.6  0.000000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2212  putative lipase  26.16 
 
 		 315 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.799877  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25910  putative lipase  26.16 
 
 		 315 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0600573 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2367  alpha/beta hydrolase fold  30.88 
 
 		 291 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.926143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1714  alpha/beta hydrolase fold  25.52 
 
 		 290 aa  79  0.0000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0391  alpha/beta hydrolase fold  30 
 
 		 291 aa  77  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0403  alpha/beta hydrolase fold  30 
 
 		 291 aa  77  0.0000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0412  alpha/beta hydrolase fold  30 
 
 		 291 aa  77  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0866892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2735  alpha/beta hydrolase fold  24.25 
 
 		 301 aa  75.9  0.0000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.211844  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0795  alpha/beta hydrolase fold protein  28.57 
 
 		 267 aa  75.9  0.0000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.814605  normal  0.361628 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5038  Alpha/beta hydrolase fold  25.56 
 
 		 282 aa  74.3  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.434824 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0955  alpha/beta hydrolase fold  44.44 
 
 		 309 aa  74.3  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10135  epoxide hydrolase ephF  28.21 
 
 		 300 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.890635 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2714  alpha/beta hydrolase fold  25.17 
 
 		 320 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2799  alpha/beta hydrolase fold protein  25 
 
 		 302 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  31.82 
 
 		 295 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1547  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 		 302 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1551  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 		 302 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1581  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 		 302 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.217247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1511  alpha/beta hydrolase fold  24.31 
 
 		 295 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3642  alpha/beta hydrolase fold  31.37 
 
 		 379 aa  73.2  0.000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.20936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1446  alpha/beta hydrolase fold  23.67 
 
 		 303 aa  73.2  0.000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.947535  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3158  alpha/beta hydrolase fold  24.32 
 
 		 297 aa  73.2  0.000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1370  alpha/beta hydrolase fold  25.91 
 
 		 297 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9195  alpha/beta hydrolase fold protein  35.66 
 
 		 296 aa  71.6  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0552  alpha/beta hydrolase fold protein  27.44 
 
 		 294 aa  72  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1179  alpha/beta hydrolase fold protein  27.47 
 
 		 278 aa  72  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0798469  normal  0.0102944 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1114  alpha/beta hydrolase fold  25.18 
 
 		 405 aa  72  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.060895  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2547  alpha/beta hydrolase fold  24.83 
 
 		 339 aa  72  0.00000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2614  alpha/beta hydrolase fold  24.83 
 
 		 339 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2705  alpha/beta hydrolase fold  26.52 
 
 		 309 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.601677  normal  0.0914485 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0809  alpha/beta hydrolase fold  29.26 
 
 		 283 aa  71.2  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  30.04 
 
 		 287 aa  70.9  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4279  alpha/beta hydrolase fold  29.9 
 
 		 290 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0429244  normal  0.222336 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3935  alpha/beta hydrolase fold protein  30.2 
 
 		 371 aa  70.9  0.00000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3788  alpha/beta hydrolase fold  25.1 
 
 		 330 aa  70.5  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2154  alpha/beta fold family hydrolase  24.66 
 
 		 308 aa  70.5  0.00000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0592253  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1743  alpha/beta fold family hydrolase  24.32 
 
 		 318 aa  70.5  0.00000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4848  alpha/beta hydrolase fold  41.35 
 
 		 287 aa  69.3  0.00000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1310  alpha/beta hydrolase fold protein  26.58 
 
 		 301 aa  69.3  0.00000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3930  alpha/beta hydrolase fold protein  26.69 
 
 		 303 aa  68.6  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0672  alpha/beta hydrolase fold  24.9 
 
 		 315 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.240082 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21050  short chain dehydrogenase  35.1 
 
 		 592 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0439  alpha/beta hydrolase fold protein  38.52 
 
 		 293 aa  68.2  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.580414  normal  0.906073 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0023  alpha/beta hydrolase fold  23.79 
 
 		 315 aa  67.8  0.0000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00672386  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2266  alpha/beta hydrolase fold protein  28.52 
 
 		 274 aa  67.8  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.620512 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0168  alpha/beta hydrolase fold  32.19 
 
 		 296 aa  67.4  0.0000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2009  alpha/beta hydrolase fold  26.06 
 
 		 294 aa  67.4  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0074  alpha/beta hydrolase fold  25.98 
 
 		 275 aa  66.6  0.0000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.224768  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4339  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.36 
 
 		 588 aa  66.2  0.0000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0726  Alpha/beta hydrolase fold  25.5 
 
 		 297 aa  66.2  0.0000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.418477  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0475  alpha/beta hydrolase fold protein  24.48 
 
 		 290 aa  66.2  0.0000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3925  alpha/beta hydrolase fold  29.01 
 
 		 367 aa  65.9  0.0000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.182869  normal  0.384279 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2886  alpha/beta hydrolase fold  31.54 
 
 		 290 aa  65.9  0.0000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0547  twin-arginine translocation pathway signal  31.29 
 
 		 356 aa  65.9  0.0000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5150  alpha/beta hydrolase fold  37.6 
 
 		 324 aa  65.9  0.0000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0685525  normal  0.697415 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1520  alpha/beta hydrolase fold  37.3 
 
 		 323 aa  65.1  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3658  alpha/beta hydrolase fold  36.62 
 
 		 311 aa  65.5  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1736  alpha/beta hydrolase fold  36.44 
 
 		 290 aa  65.1  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0037  putative alpha/beta hydrolase  28.67 
 
 		 276 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4016  alpha/beta hydrolase fold  35.83 
 
 		 303 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.459613  normal  0.722956 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3743  Alpha/beta hydrolase  38.21 
 
 		 300 aa  65.5  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0220967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6643  putative triacylglycerol lipase  25.26 
 
 		 275 aa  65.5  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.192902  normal  0.181736 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3452  alpha/beta hydrolase fold  23.64 
 
 		 311 aa  65.1  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.156566  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1142  Alpha/beta hydrolase  30.84 
 
 		 307 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.627946  normal  0.179334 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2352  alpha/beta hydrolase  28.42 
 
 		 314 aa  64.3  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.517024  normal  0.362082 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12729  hydrolase  27.34 
 
 		 341 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2749  alpha/beta hydrolase fold  24.23 
 
 		 330 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3331  alpha/beta hydrolase fold  32.3 
 
 		 340 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0127235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0524  alpha/beta hydrolase fold protein  30.5 
 
 		 308 aa  63.9  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4681  alpha/beta hydrolase fold protein  28.57 
 
 		 333 aa  64.3  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1387  putative 2-hydroxy-6-oxohepta-2,4-dienoate hydrolase  38 
 
 		 288 aa  63.9  0.000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.196692  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1366  alpha/beta hydrolase fold  22.57 
 
 		 291 aa  63.9  0.000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1047  alpha/beta hydrolase fold  29.61 
 
 		 275 aa  64.3  0.000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.975256  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5068  alpha/beta hydrolase fold protein  39.09 
 
 		 297 aa  63.9  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1637  alpha/beta hydrolase fold  25.18 
 
 		 287 aa  63.9  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1418  alpha/beta hydrolase fold protein  28.57 
 
 		 276 aa  63.9  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.961025  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1079  alpha/beta hydrolase fold  25.94 
 
 		 283 aa  63.9  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.622662  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1552  alpha/beta hydrolase fold protein  33.59 
 
 		 329 aa  63.5  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.116512  hitchhiker  0.00140159 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2065  cyclic nucleotide-binding protein  26.35 
 
 		 462 aa  63.5  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1796  short chain dehydrogenase  38.6 
 
 		 590 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.425571  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1823  alpha/beta hydrolase fold protein  26.69 
 
 		 322 aa  63.5  0.000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6705  alpha/beta hydrolase fold protein  23.69 
 
 		 335 aa  63.2  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1448  alpha/beta hydrolase fold  27.37 
 
 		 294 aa  63.2  0.000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.358742 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2270  alpha/beta hydrolase fold  23.29 
 
 		 298 aa  63.2  0.000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3071  alpha/beta hydrolase fold  30.33 
 
 		 290 aa  62.8  0.000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.357729  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>