More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_3365 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_3365  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 297 aa  610  9.999999999999999e-175  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1697  putative epoxide hydrolase  50.18 
 
 		 298 aa  256  5e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19710  alpha/beta family hydrolase  50.18 
 
 		 298 aa  255  6e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0902  Alpha/beta hydrolase fold  46.92 
 
 		 300 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.685434 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3624  alpha/beta hydrolase fold  43.9 
 
 		 292 aa  246  3e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3280  alpha/beta hydrolase fold  46.64 
 
 		 302 aa  241  7.999999999999999e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4484  alpha/beta hydrolase fold  43.54 
 
 		 301 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4624  alpha/beta fold family hydrolase  43.2 
 
 		 299 aa  231  1e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.186809  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4608  alpha/beta hydrolase fold  45.39 
 
 		 301 aa  230  2e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.692037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0814  alpha/beta hydrolase fold  43.91 
 
 		 301 aa  225  9e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3781  alpha/beta hydrolase fold  40.08 
 
 		 295 aa  214  9.999999999999999e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11863  hydrolase  37.7 
 
 		 288 aa  170  3e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.905253 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13197  epoxide hydrolase mesT  30.71 
 
 		 318 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.394653 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2749  alpha/beta hydrolase fold  27.07 
 
 		 330 aa  82  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1370  alpha/beta hydrolase fold  27.11 
 
 		 297 aa  79.7  0.00000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0074  alpha/beta hydrolase fold  26.3 
 
 		 275 aa  79  0.00000000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.224768  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3788  alpha/beta hydrolase fold  25.94 
 
 		 330 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2735  alpha/beta hydrolase fold  27.11 
 
 		 301 aa  77  0.0000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.211844  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  32.89 
 
 		 265 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  26.34 
 
 		 262 aa  73.6  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1998  alpha/beta hydrolase fold  27.3 
 
 		 293 aa  73.6  0.000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.918963  normal  0.449099 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1366  alpha/beta hydrolase fold  26.37 
 
 		 291 aa  72.8  0.000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0671  alpha/beta hydrolase fold protein  27.76 
 
 		 291 aa  71.2  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.437446  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0821  alpha/beta hydrolase fold  36.45 
 
 		 252 aa  71.2  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3277  alpha/beta hydrolase fold  27.57 
 
 		 296 aa  70.9  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.38923  normal  0.207617 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2547  alpha/beta hydrolase fold  27.44 
 
 		 339 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2614  alpha/beta hydrolase fold  27.44 
 
 		 339 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2714  alpha/beta hydrolase fold  27.44 
 
 		 320 aa  70.5  0.00000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3104  alpha/beta hydrolase fold  26.91 
 
 		 296 aa  70.1  0.00000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2065  alpha/beta hydrolase fold protein  35.51 
 
 		 252 aa  70.1  0.00000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0179548  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2154  alpha/beta fold family hydrolase  26.22 
 
 		 308 aa  69.7  0.00000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0592253  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1778  alpha/beta hydrolase fold  25.09 
 
 		 366 aa  69.3  0.00000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0401666  normal  0.253947 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2009  alpha/beta hydrolase fold  26.47 
 
 		 294 aa  69.3  0.00000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9195  alpha/beta hydrolase fold protein  24.91 
 
 		 296 aa  69.3  0.00000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0955  alpha/beta hydrolase fold  26.71 
 
 		 309 aa  68.9  0.00000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2270  alpha/beta hydrolase fold  26.16 
 
 		 298 aa  68.9  0.00000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1743  alpha/beta fold family hydrolase  27.08 
 
 		 318 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1714  alpha/beta hydrolase fold  25.27 
 
 		 290 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4848  alpha/beta hydrolase fold  23.91 
 
 		 287 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0987  alpha/beta hydrolase fold  23.51 
 
 		 288 aa  68.2  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0567924  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0108  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  25.33 
 
 		 639 aa  67.4  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1551  alpha/beta hydrolase fold  25.83 
 
 		 302 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3158  alpha/beta hydrolase fold  26.37 
 
 		 297 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1446  alpha/beta hydrolase fold  26.57 
 
 		 303 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.947535  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1547  alpha/beta hydrolase fold  25.27 
 
 		 302 aa  66.2  0.0000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2009  alpha/beta hydrolase fold  23.43 
 
 		 299 aa  65.9  0.0000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1581  alpha/beta hydrolase fold  25.27 
 
 		 302 aa  65.5  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.217247  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2799  alpha/beta hydrolase fold protein  25.27 
 
 		 302 aa  65.5  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2769  alpha/beta hydrolase fold protein  33.83 
 
 		 305 aa  63.9  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.293551  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1823  alpha/beta hydrolase fold protein  26.87 
 
 		 322 aa  63.5  0.000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26790  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  30.94 
 
 		 290 aa  63.5  0.000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.330263 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1083  alpha/beta hydrolase fold  35.05 
 
 		 291 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2117  alpha/beta hydrolase fold protein  31.29 
 
 		 300 aa  63.2  0.000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1083  alpha/beta hydrolase fold  35.05 
 
 		 291 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1552  alpha/beta hydrolase fold protein  33.9 
 
 		 329 aa  63.2  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.116512  hitchhiker  0.00140159 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  27.07 
 
 		 295 aa  62.8  0.000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2886  alpha/beta hydrolase fold  22.06 
 
 		 290 aa  62.8  0.000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2161  alpha/beta hydrolase fold  35.96 
 
 		 340 aa  62.8  0.000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.170083  hitchhiker  0.00519685 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3187  Alpha/beta hydrolase fold  24.75 
 
 		 293 aa  62.8  0.000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.162983 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1824  alpha/beta hydrolase fold protein  23.91 
 
 		 309 aa  62.4  0.000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2172  alpha/beta hydrolase fold  35.96 
 
 		 340 aa  62.8  0.000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2218  alpha/beta hydrolase fold  35.96 
 
 		 340 aa  62.8  0.000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.158046  normal  0.0966577 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1511  alpha/beta hydrolase fold  26.42 
 
 		 295 aa  62.4  0.000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2101  alpha/beta hydrolase fold  26.35 
 
 		 300 aa  62.4  0.000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.933589  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1183  alpha/beta fold family hydrolase  23.16 
 
 		 310 aa  62.4  0.000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4733  alpha/beta hydrolase fold  33.03 
 
 		 294 aa  62.4  0.000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.596805  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1970  alpha/beta hydrolase fold  28.28 
 
 		 311 aa  61.6  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000319634  normal  0.0578642 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6705  alpha/beta hydrolase fold protein  24.62 
 
 		 335 aa  62  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3721  Alpha/beta hydrolase  31.85 
 
 		 306 aa  62  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.305299  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8523  alpha/beta hydrolase fold protein  24.1 
 
 		 323 aa  62.4  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0403  alpha/beta hydrolase fold  24.91 
 
 		 291 aa  62  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0391  alpha/beta hydrolase fold  24.91 
 
 		 291 aa  62  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0412  alpha/beta hydrolase fold  24.91 
 
 		 291 aa  62  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0866892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0993  alpha/beta hydrolase fold  26.79 
 
 		 345 aa  61.2  0.00000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.87511  unclonable  0.000000000579867 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2495  hydrolase, alpha/beta fold family  29.5 
 
 		 293 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.263259  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12729  hydrolase  37.08 
 
 		 341 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0439  alpha/beta hydrolase fold protein  27.86 
 
 		 293 aa  61.6  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.580414  normal  0.906073 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2445  alpha/beta hydrolase fold  37.08 
 
 		 340 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.54824  normal  0.191947 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  26.28 
 
 		 299 aa  61.6  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5015  hydrolase, alpha/beta fold family  24.06 
 
 		 279 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0809  alpha/beta hydrolase fold  35.37 
 
 		 283 aa  60.5  0.00000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4774  alpha/beta fold family hydrolase  24.06 
 
 		 279 aa  60.5  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4614  alpha/beta hydrolase fold protein  24.06 
 
 		 279 aa  60.8  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0693  alpha/beta hydrolase fold  25.61 
 
 		 258 aa  60.5  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5150  alpha/beta hydrolase fold  32.48 
 
 		 324 aa  60.5  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0685525  normal  0.697415 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4636  alpha/beta hydrolase fold protein  24.06 
 
 		 279 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1310  haloalkane dehalogenase  29.58 
 
 		 302 aa  60.5  0.00000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000017212  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5136  alpha/beta fold family hydrolase  24.06 
 
 		 279 aa  60.5  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2918  alpha/beta hydrolase fold protein  26.01 
 
 		 310 aa  60.8  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000917268  normal  0.0712608 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5048  hydrolase, alpha/beta fold family  24.44 
 
 		 279 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0552  alpha/beta hydrolase fold protein  25.64 
 
 		 294 aa  60.8  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1370  haloalkane dehalogenase  29.58 
 
 		 293 aa  60.5  0.00000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  6.59212e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1402  alpha/beta hydrolase fold protein  25.75 
 
 		 298 aa  60.5  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0653602  normal  0.476592 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0132  putative hydrolase  25 
 
 		 311 aa  60.5  0.00000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.282626  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1520  alpha/beta hydrolase fold  31.21 
 
 		 323 aa  60.1  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1077  alpha/beta hydrolase fold protein  30.51 
 
 		 290 aa  60.1  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0749091  normal  0.76361 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3885  alpha/beta hydrolase fold  23.15 
 
 		 304 aa  60.1  0.00000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.345695  normal  0.363483 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3998  alpha/beta hydrolase fold protein  23.15 
 
 		 304 aa  60.1  0.00000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.901488  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3743  Alpha/beta hydrolase  30.41 
 
 		 300 aa  60.5  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0220967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0322  alpha/beta hydrolase fold  41.67 
 
 		 349 aa  59.7  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.529473  normal  0.20701 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>