More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_2065 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_2065  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 		 252 aa  520  1e-146  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0179548  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0821  alpha/beta hydrolase fold  84.86 
 
 		 252 aa  450  1.0000000000000001e-126  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0750  putative branched-chain amino acid transport protein  34.14 
 
 		 256 aa  140  1.9999999999999998e-32  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4406  hydrolase  28.4 
 
 		 271 aa  120  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.018151 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1534  alpha/beta hydrolase fold protein  28.76 
 
 		 263 aa  105  5e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0444471 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2174  alpha/beta hydrolase fold protein  29.79 
 
 		 277 aa  95.5  7e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.633996  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03173  hypothetical protein  29.26 
 
 		 272 aa  85.1  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.188182 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1513  Alpha/beta hydrolase fold  40.91 
 
 		 293 aa  84  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1108  alpha/beta hydrolase fold  27.17 
 
 		 246 aa  74.7  0.000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00367251  hitchhiker  0.00365287 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6643  putative triacylglycerol lipase  43 
 
 		 275 aa  70.5  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.192902  normal  0.181736 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1463  Alpha/beta hydrolase  38.98 
 
 		 278 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.234917  normal  0.480235 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0809  alpha/beta hydrolase fold  33.06 
 
 		 283 aa  70.9  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1827  alpha/beta hydrolase fold  37.04 
 
 		 285 aa  68.9  0.00000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3545  alpha/beta hydrolase fold protein  39.25 
 
 		 283 aa  67  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.158387  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4621  alpha/beta hydrolase fold  39.25 
 
 		 283 aa  67  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2696  alpha/beta hydrolase fold  35.2 
 
 		 312 aa  67.4  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.623815  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2945  alpha/beta hydrolase fold protein  36.75 
 
 		 330 aa  67  0.0000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2147  alpha/beta hydrolase fold  33.9 
 
 		 278 aa  65.9  0.0000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3143  alpha/beta hydrolase fold  37.62 
 
 		 309 aa  65.9  0.0000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.03403  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0726  Alpha/beta hydrolase fold  43.62 
 
 		 297 aa  65.9  0.0000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.418477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0990  alpha/beta hydrolase fold  33.65 
 
 		 298 aa  65.9  0.0000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2775  alpha/beta hydrolase fold  35.34 
 
 		 302 aa  65.5  0.0000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.562879  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3110  alpha/beta hydrolase fold protein  35.19 
 
 		 304 aa  65.5  0.0000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.228638  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1681  alpha/beta hydrolase fold  27.69 
 
 		 273 aa  65.1  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0641945  normal  0.147127 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5449  alpha/beta hydrolase fold  28.63 
 
 		 272 aa  64.7  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.343862 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3781  alpha/beta hydrolase fold  32.28 
 
 		 295 aa  64.7  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1459  alpha/beta hydrolase fold  34.51 
 
 		 276 aa  63.9  0.000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5996  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)  26.51 
 
 		 260 aa  63.9  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0608  alpha/beta hydrolase fold  31.48 
 
 		 311 aa  63.9  0.000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000717376  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4806  alpha/beta hydrolase fold  35.14 
 
 		 321 aa  63.2  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.786039  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0553  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  31.82 
 
 		 368 aa  63.2  0.000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4111  alpha/beta hydrolase fold protein  36.36 
 
 		 288 aa  63.2  0.000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0346007  normal  0.0462514 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0598  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  31.82 
 
 		 368 aa  63.2  0.000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0447613 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4425  alpha/beta hydrolase fold  35.14 
 
 		 321 aa  63.2  0.000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0592  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  31.82 
 
 		 368 aa  63.2  0.000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4130  alpha/beta hydrolase fold protein  32.2 
 
 		 301 aa  63.2  0.000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4512  alpha/beta hydrolase fold  35.14 
 
 		 321 aa  63.2  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.999363 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1754  alpha/beta hydrolase fold  35.9 
 
 		 277 aa  62.8  0.000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1121  alpha/beta hydrolase fold protein  27.04 
 
 		 322 aa  62.8  0.000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0221  alpha/beta hydrolase fold  32.41 
 
 		 286 aa  62.8  0.000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2918  alpha/beta hydrolase fold  33.57 
 
 		 312 aa  62.4  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.906544 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2782  alpha/beta hydrolase fold protein  35.04 
 
 		 325 aa  62.4  0.000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2446  alpha/beta hydrolase fold protein  36.28 
 
 		 309 aa  62.8  0.000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.969901  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3786  Alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 274 aa  62.4  0.000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00563208  hitchhiker  0.00293132 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0531  alpha/beta hydrolase fold protein  36.54 
 
 		 273 aa  62.4  0.000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1052  alpha/beta fold family hydrolase  44.21 
 
 		 302 aa  62  0.000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2274  2-hydroxymuconic semialdehyde hydrolase  32.41 
 
 		 291 aa  62  0.000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4138  alpha/beta hydrolase fold  36.09 
 
 		 268 aa  62  0.000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.511306  normal  0.651356 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7870  alpha/beta hydrolase fold protein  37.38 
 
 		 250 aa  61.2  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.645188  normal  0.180866 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1920  alpha/beta hydrolase fold  36.54 
 
 		 255 aa  61.6  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00389314  unclonable  0.00000223856 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3344  alpha/beta hydrolase fold  37.84 
 
 		 289 aa  61.2  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2720  alpha/beta hydrolase fold protein  32.73 
 
 		 342 aa  61.2  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1778  alpha/beta hydrolase fold  34.26 
 
 		 366 aa  61.6  0.00000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0401666  normal  0.253947 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1331  Alpha/beta hydrolase fold  30 
 
 		 278 aa  60.8  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000258733 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1387  putative 2-hydroxy-6-oxohepta-2,4-dienoate hydrolase  33.59 
 
 		 288 aa  60.5  0.00000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.196692  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3207  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 		 294 aa  60.5  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.157905  normal  0.711574 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2456  alpha/beta hydrolase fold  31.67 
 
 		 278 aa  60.8  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0153839  normal  0.505758 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1913  alpha/beta hydrolase fold  33.65 
 
 		 257 aa  60.8  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000359899  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2916  alpha/beta hydrolase fold protein  32.74 
 
 		 284 aa  60.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1962  alpha/beta hydrolase fold  26.19 
 
 		 246 aa  60.8  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3822  alpha/beta hydrolase fold  31.36 
 
 		 308 aa  60.1  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6120  alpha/beta hydrolase fold  36.21 
 
 		 272 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.894817  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2732  alpha/beta hydrolase fold  31.16 
 
 		 271 aa  60.5  0.00000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1230  alpha/beta hydrolase fold  36.94 
 
 		 261 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3338  alpha/beta hydrolase fold  37.38 
 
 		 271 aa  60.5  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0955603 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2334  alpha/beta hydrolase fold  34.62 
 
 		 258 aa  60.1  0.00000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000909068  hitchhiker  0.0000846948 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0248  alpha/beta hydrolase fold  34.48 
 
 		 254 aa  60.1  0.00000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6602  alpha/beta hydrolase fold  36.94 
 
 		 261 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.472817  normal  0.1504 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1402  alpha/beta hydrolase fold protein  34.29 
 
 		 298 aa  59.7  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0653602  normal  0.476592 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3289  alpha/beta hydrolase fold  31.11 
 
 		 250 aa  59.7  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.931458  normal  0.0266601 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2786  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 283 aa  60.1  0.00000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.200125 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0056  alpha/beta hydrolase fold  36.89 
 
 		 332 aa  59.7  0.00000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4696  alpha/beta hydrolase fold  24.81 
 
 		 270 aa  59.7  0.00000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1258  putative hydrolase  32.87 
 
 		 312 aa  59.7  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0952  alpha/beta hydrolase fold  38.24 
 
 		 350 aa  59.3  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167574  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5377  alpha/beta hydrolase fold protein  36.04 
 
 		 332 aa  59.7  0.00000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.306055  normal  0.839367 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2449  alpha/beta fold family hydrolase  25 
 
 		 242 aa  59.3  0.00000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00496811  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6064  alpha/beta hydrolase fold protein  34.86 
 
 		 262 aa  59.3  0.00000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25213  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0504  inner-membrane translocator  23.85 
 
 		 571 aa  59.3  0.00000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.92013  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5036  hydrolase, alpha/beta fold family  32.46 
 
 		 279 aa  59.3  0.00000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4841  alpha/beta hydrolase fold protein  31.97 
 
 		 266 aa  58.9  0.00000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4749  alpha/beta fold family hydrolase  26.15 
 
 		 270 aa  58.9  0.00000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5110  alpha/beta fold family hydrolase  26.15 
 
 		 270 aa  58.9  0.00000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.98697  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0600  alpha/beta hydrolase fold protein  34.59 
 
 		 253 aa  58.9  0.00000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000132287  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0806  alpha/beta hydrolase fold  36.19 
 
 		 279 aa  58.9  0.00000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0845651 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  35.92 
 
 		 265 aa  58.9  0.00000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  36.54 
 
 		 314 aa  58.9  0.00000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4562  alpha/beta hydrolase fold protein  33.06 
 
 		 260 aa  58.9  0.00000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0592  alpha/beta hydrolase fold  33.62 
 
 		 288 aa  58.9  0.00000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  39.56 
 
 		 262 aa  58.5  0.00000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9504  alpha/beta hydrolase protein  33.04 
 
 		 272 aa  58.5  0.00000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.932687  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06730  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  34.58 
 
 		 343 aa  58.5  0.00000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_5003  hypothetical protein  35.65 
 
 		 305 aa  58.5  0.00000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.219261  hitchhiker  0.00420621 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2839  alpha/beta hydrolase fold protein  23.72 
 
 		 267 aa  58.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.39297 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0413  alpha/beta hydrolase fold  23.98 
 
 		 257 aa  58.5  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.732531  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1935  alpha/beta hydrolase  36.8 
 
 		 268 aa  58.5  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3020  alpha/beta hydrolase fold  35.14 
 
 		 283 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.702014  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5346  alpha/beta hydrolase fold  35.14 
 
 		 283 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00669533  normal  0.437988 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4924  alpha/beta hydrolase fold  36.04 
 
 		 283 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3383  alpha/beta hydrolase fold  35.14 
 
 		 284 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>