169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_1962 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_1962  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
246 aa  506  9.999999999999999e-143  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03059  putative esterase protein  71.54 
 
 
246 aa  357  9.999999999999999e-98  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.71029  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3124  alpha/beta hydrolase fold  42.74 
 
 
247 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0321729  normal  0.028375 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1914  alpha/beta fold family hydrolase  39.34 
 
 
243 aa  150  2e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5167  alpha/beta hydrolase fold  36.44 
 
 
246 aa  139  3e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0855179 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0524  Alpha/beta hydrolase  36.29 
 
 
246 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0610982  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3254  alpha/beta hydrolase fold  37.05 
 
 
246 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5114  alpha/beta hydrolase fold  37.05 
 
 
246 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5050  alpha/beta hydrolase fold  39.22 
 
 
243 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2065  alpha/beta hydrolase fold protein  26.19 
 
 
252 aa  60.8  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0179548  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0821  alpha/beta hydrolase fold  23.98 
 
 
252 aa  57.8  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3175  hypothetical protein  26.58 
 
 
260 aa  56.2  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.567712  normal  0.0913717 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00325  alpha/beta hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G02390)  33.33 
 
 
295 aa  56.2  0.0000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2696  alpha/beta hydrolase fold protein  26.05 
 
 
268 aa  55.5  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.094894  normal  0.233594 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4215  alpha/beta hydrolase fold  28.9 
 
 
271 aa  54.3  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756479  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0504  inner-membrane translocator  32.98 
 
 
571 aa  53.9  0.000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.92013  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1820  alpha/beta hydrolase fold  30.63 
 
 
267 aa  53.5  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.65199  normal  0.0137069 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1436  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  28.4 
 
 
371 aa  52  0.000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00517321 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5996  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)  27.76 
 
 
260 aa  51.6  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1917  alpha/beta hydrolase fold protein  22.99 
 
 
278 aa  51.2  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0033  alpha/beta hydrolase fold  28.45 
 
 
290 aa  51.6  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54655  predicted protein  22.52 
 
 
293 aa  51.2  0.00001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6242  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  27.69 
 
 
371 aa  50.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1837  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  27.69 
 
 
371 aa  50.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.282403  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  23.41 
 
 
264 aa  50.4  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12729  hydrolase  36.36 
 
 
341 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2652  alpha/beta hydrolase fold protein  23.35 
 
 
268 aa  51.2  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.191504  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2172  alpha/beta hydrolase fold  25.11 
 
 
340 aa  50.4  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2218  alpha/beta hydrolase fold  25.11 
 
 
340 aa  50.4  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.158046  normal  0.0966577 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2445  alpha/beta hydrolase fold  38.64 
 
 
340 aa  50.4  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.54824  normal  0.191947 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2161  alpha/beta hydrolase fold  25.11 
 
 
340 aa  50.4  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.170083  hitchhiker  0.00519685 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12070  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  36.08 
 
 
276 aa  49.7  0.00004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3029  alpha/beta hydrolase fold protein  26.61 
 
 
305 aa  49.7  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3091  alpha/beta hydrolase fold protein  26.61 
 
 
305 aa  49.7  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2174  alpha/beta hydrolase fold protein  33.8 
 
 
277 aa  49.7  0.00004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.633996  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1861  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  27.69 
 
 
371 aa  49.7  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0337473  normal  0.0227354 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0315  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  34.69 
 
 
370 aa  49.7  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1209  esterase/lipase  22.99 
 
 
311 aa  49.3  0.00005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4082  alpha/beta hydrolase fold  29.29 
 
 
284 aa  49.3  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.29051 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3758  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  27.2 
 
 
370 aa  49.3  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.239484  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5449  alpha/beta hydrolase fold  29.52 
 
 
272 aa  48.9  0.00007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.343862 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1935  alpha/beta hydrolase  34.41 
 
 
268 aa  48.9  0.00008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3055  alpha/beta hydrolase fold  24.78 
 
 
277 aa  48.5  0.00009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0115287 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5225  alpha/beta hydrolase fold  35.05 
 
 
283 aa  48.1  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1609  Alpha/beta hydrolase fold  23.69 
 
 
293 aa  48.5  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1801  hypothetical protein  33.67 
 
 
238 aa  48.1  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0314686 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0507  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 
264 aa  48.5  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0990  alpha/beta hydrolase fold  34.48 
 
 
298 aa  48.5  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3383  alpha/beta hydrolase fold  34.15 
 
 
284 aa  48.1  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4924  alpha/beta hydrolase fold  35.05 
 
 
283 aa  47.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0304  Alpha/beta hydrolase  35.05 
 
 
283 aa  47.4  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0774  esterase  35 
 
 
295 aa  47.4  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.391328  normal  0.148596 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3020  alpha/beta hydrolase fold  35.05 
 
 
283 aa  47.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.702014  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0074  alpha/beta hydrolase fold  23.88 
 
 
275 aa  47.4  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.224768  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4694  alpha/beta hydrolase fold  35.05 
 
 
283 aa  47.8  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.165062 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5346  alpha/beta hydrolase fold  35.05 
 
 
283 aa  47.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00669533  normal  0.437988 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3952  alpha/beta hydrolase fold  37.65 
 
 
340 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.675872  normal  0.742045 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1310  alpha/beta hydrolase fold  34.55 
 
 
269 aa  47.8  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.557665  normal  0.708974 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4729  alpha/beta fold family hydrolase  39.08 
 
 
249 aa  47.4  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0133586 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1480  Alpha/beta hydrolase fold  22.76 
 
 
304 aa  47  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000123975  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2037  Alpha/beta hydrolase fold  27.55 
 
 
302 aa  47  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.421524 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1078  alpha/beta hydrolase fold protein  29 
 
 
314 aa  46.6  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.143754 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1637  alpha/beta hydrolase fold  22.59 
 
 
287 aa  47  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18381  alpha/beta fold family hydrolase  22.95 
 
 
304 aa  47  0.0003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0831  alpha/beta hydrolase fold protein  34.02 
 
 
344 aa  46.6  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29750  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  32.29 
 
 
293 aa  46.6  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2398  alpha/beta hydrolase fold protein  31 
 
 
282 aa  46.6  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.240634  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0128  alpha/beta hydrolase fold  30.23 
 
 
262 aa  46.2  0.0004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0879  alpha/beta hydrolase fold  27.72 
 
 
278 aa  46.6  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.101145 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4976  alpha/beta hydrolase fold-containing protein  21.96 
 
 
304 aa  46.2  0.0005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.000041043  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0803  alpha/beta hydrolase fold  34.02 
 
 
353 aa  46.2  0.0005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4611  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 
259 aa  46.2  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04345  alpha/beta superfamily hydrolase  32.32 
 
 
253 aa  46.2  0.0005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.660124  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2772  putative hydrolase protein  29.76 
 
 
312 aa  45.8  0.0006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0837  putative esterase  24.49 
 
 
258 aa  45.8  0.0006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1773  alpha/beta hydrolase fold  30.85 
 
 
243 aa  45.8  0.0006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000223645  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0598  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  37.23 
 
 
368 aa  45.8  0.0006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0447613 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1402  alpha/beta hydrolase fold protein  26.16 
 
 
298 aa  45.8  0.0007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0653602  normal  0.476592 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004122  putative esterase/lipase ybfF  30.53 
 
 
255 aa  45.8  0.0007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000112375  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06730  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  34 
 
 
343 aa  45.8  0.0007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0413  alpha/beta hydrolase fold  35 
 
 
257 aa  45.4  0.0007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.732531  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0493  alpha/beta hydrolase fold  33.68 
 
 
290 aa  45.8  0.0007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.5355  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1459  alpha/beta hydrolase fold  31.07 
 
 
276 aa  45.8  0.0007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0553  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  37.23 
 
 
368 aa  45.4  0.0008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4111  alpha/beta hydrolase fold protein  32.84 
 
 
288 aa  45.1  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0346007  normal  0.0462514 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4122  alpha/beta hydrolase fold protein  22.81 
 
 
287 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0119  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  27.49 
 
 
380 aa  45.1  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.156608 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1987  alpha/beta hydrolase fold  28 
 
 
253 aa  44.7  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000145275  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3781  alpha/beta hydrolase fold  27.66 
 
 
293 aa  45.1  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.668878  normal  0.527561 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1941  alpha/beta hydrolase fold  28.87 
 
 
291 aa  44.7  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0494053  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1408  alpha/beta hydrolase fold protein  26.8 
 
 
421 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.259617 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2256  alpha/beta hydrolase fold protein  25.51 
 
 
297 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2307  alpha/beta hydrolase fold protein  25.51 
 
 
297 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.960741 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06565  Alpha/beta hydrolase  25.5 
 
 
254 aa  44.7  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1681  alpha/beta hydrolase fold  31.25 
 
 
273 aa  45.1  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0641945  normal  0.147127 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0392  alpha/beta hydrolase fold  23.85 
 
 
273 aa  44.7  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0341  alpha/beta hydrolase fold  22.22 
 
 
265 aa  44.7  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  24.43 
 
 
267 aa  43.9  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3719  alpha/beta hydrolase fold  25.88 
 
 
260 aa  43.9  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.815141  hitchhiker  0.00169195 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4272  alpha/beta hydrolase fold  31.68 
 
 
275 aa  44.3  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.328456  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>