More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A1609 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007347  Reut_A1609  Alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
293 aa  605  9.999999999999999e-173  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0682  alpha/beta family hydrolase  64.95 
 
 
286 aa  391  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.819683 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4356  alpha/beta hydrolase fold  65.26 
 
 
283 aa  390  1e-107  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0304  Alpha/beta hydrolase  63.41 
 
 
283 aa  373  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3383  alpha/beta hydrolase fold  63.76 
 
 
284 aa  374  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6598  alpha/beta hydrolase fold protein  63.86 
 
 
283 aa  368  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4924  alpha/beta hydrolase fold  64.11 
 
 
283 aa  365  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5225  alpha/beta hydrolase fold  64.46 
 
 
283 aa  365  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4694  alpha/beta hydrolase fold  64.81 
 
 
283 aa  367  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.165062 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3020  alpha/beta hydrolase fold  63.76 
 
 
283 aa  363  2e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.702014  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5346  alpha/beta hydrolase fold  63.76 
 
 
283 aa  363  2e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00669533  normal  0.437988 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5527  alpha/beta hydrolase fold  59.19 
 
 
307 aa  328  6e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.563792  normal  0.509486 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1132  putative hydrolase  60 
 
 
285 aa  328  7e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.96812  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5203  alpha/beta hydrolase fold protein  58.69 
 
 
260 aa  317  2e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.112668  normal  0.598208 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2502  putative hydrolase  44.36 
 
 
283 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28630  putative hydrolase  43.45 
 
 
287 aa  195  7e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000201744 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1813  alpha/beta hydrolase fold  33.7 
 
 
287 aa  133  3.9999999999999996e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.557453  normal  0.0116174 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2533  alpha/beta hydrolase fold  33.58 
 
 
394 aa  129  6e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.763523  hitchhiker  0.000713201 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1592  alpha/beta hydrolase fold  31.6 
 
 
267 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.121533  normal  0.0764642 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4916  alpha/beta hydrolase fold  31.56 
 
 
277 aa  98.2  1e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.503338  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03123  hydrolase protein  28.15 
 
 
279 aa  95.5  9e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5136  alpha/beta hydrolase fold protein  26.74 
 
 
291 aa  83.6  0.000000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0353  alpha/beta hydrolase fold  31.01 
 
 
256 aa  80.9  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4707  alpha/beta hydrolase fold protein  29.66 
 
 
289 aa  77.8  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  26.33 
 
 
265 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0413  alpha/beta hydrolase fold  26.49 
 
 
257 aa  74.7  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.732531  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2945  alpha/beta hydrolase fold  25.29 
 
 
259 aa  74.3  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.796705  normal  0.238938 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0912  alpha/beta hydrolase fold  28.36 
 
 
264 aa  74.3  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2398  alpha/beta hydrolase fold protein  38.06 
 
 
282 aa  73.6  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.240634  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0369  alpha/beta hydrolase fold protein  27.13 
 
 
262 aa  72.8  0.000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.598497 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0511  alpha/beta hydrolase fold protein  25.91 
 
 
265 aa  72.8  0.000000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327319  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4611  alpha/beta hydrolase fold  26.64 
 
 
259 aa  72.4  0.000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6120  alpha/beta hydrolase fold  27.69 
 
 
272 aa  72  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.894817  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4696  alpha/beta hydrolase fold  23.83 
 
 
270 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  24.39 
 
 
267 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1587  alpha/beta hydrolase fold protein  24.56 
 
 
301 aa  70.5  0.00000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4985  SHCHC synthase  23.1 
 
 
270 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.30423  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4681  alpha/beta hydrolase fold protein  26.16 
 
 
333 aa  70.5  0.00000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  23.66 
 
 
270 aa  69.7  0.00000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0186  alpha/beta hydrolase fold protein  26.34 
 
 
258 aa  69.7  0.00000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2307  alpha/beta fold family hydrolase  23.9 
 
 
277 aa  69.7  0.00000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1823  alpha/beta hydrolase fold protein  27.84 
 
 
264 aa  69.7  0.00000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.754545  normal  0.278795 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  25.54 
 
 
262 aa  69.3  0.00000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7676  alpha/beta hydrolase fold protein  27.37 
 
 
269 aa  69.3  0.00000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1090  hydrolase, alpha/beta fold family  25.75 
 
 
275 aa  69.3  0.00000000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5014  alpha/beta fold family hydrolase  22.38 
 
 
270 aa  68.9  0.00000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0809  alpha/beta hydrolase fold  25.18 
 
 
283 aa  68.9  0.00000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  23.44 
 
 
270 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1808  hypothetical protein  31.25 
 
 
219 aa  68.6  0.0000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3786  Alpha/beta hydrolase fold  26.81 
 
 
274 aa  68.9  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00563208  hitchhiker  0.00293132 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4996  hydrolase, alpha/beta fold family  22.38 
 
 
270 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.556402  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1308  alpha/beta fold family hydrolase  26.02 
 
 
275 aa  67.8  0.0000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.100773  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4002  alpha/beta hydrolase fold protein  24.91 
 
 
266 aa  67.8  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0531  alpha/beta hydrolase fold protein  26.22 
 
 
273 aa  67.8  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5645  alpha/beta hydrolase fold protein  26.44 
 
 
273 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.530376  normal  0.570131 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4279  alpha/beta hydrolase fold  24.65 
 
 
287 aa  67.4  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.52768  normal  0.131681 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4064  alpha/beta hydrolase fold  24.54 
 
 
283 aa  67  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1799  Alpha/beta hydrolase fold  37.17 
 
 
275 aa  66.6  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4227  alpha/beta hydrolase fold protein  21.82 
 
 
266 aa  66.6  0.0000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2126  alpha/beta hydrolase fold protein  25.65 
 
 
263 aa  66.6  0.0000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0220  alpha/beta hydrolase fold  27.21 
 
 
272 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.723702 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5163  alpha/beta hydrolase fold  27.21 
 
 
272 aa  66.6  0.0000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.365318  normal  0.119098 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3731  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  35.94 
 
 
372 aa  66.2  0.0000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0253  hydrolase, alpha/beta fold family  23.1 
 
 
270 aa  66.6  0.0000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000360358  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1996  alpha/beta hydrolase fold  27.54 
 
 
254 aa  66.2  0.0000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.507588  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0115  alpha/beta hydrolase fold protein  24.91 
 
 
267 aa  66.2  0.0000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  23.08 
 
 
270 aa  66.2  0.0000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1118  alpha/beta hydrolase fold  25.09 
 
 
275 aa  66.2  0.0000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1230  alpha/beta hydrolase fold  27.69 
 
 
261 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6602  alpha/beta hydrolase fold  27.69 
 
 
261 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.472817  normal  0.1504 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4287  alpha/beta hydrolase fold  25.19 
 
 
269 aa  65.9  0.0000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2473  hypothetical protein  22.22 
 
 
286 aa  65.9  0.0000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1627  3-oxoadipate enol-lactonase, putative  26.16 
 
 
262 aa  65.9  0.0000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2882  alpha/beta hydrolase fold  25.37 
 
 
276 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.035123 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7140  alpha/beta hydrolase fold protein  25.1 
 
 
425 aa  65.1  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4587  hydrolase; menaquinone biosynthesis related protein; prolyl aminopeptidase  21.9 
 
 
270 aa  65.1  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2846  alpha/beta hydrolase  25.37 
 
 
263 aa  65.1  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.455911  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3377  alpha/beta hydrolase fold  25.45 
 
 
273 aa  65.1  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6643  putative triacylglycerol lipase  35.59 
 
 
275 aa  65.5  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.192902  normal  0.181736 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1183  Alpha/beta hydrolase  23.7 
 
 
279 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.330922  normal  0.0773535 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4967  hydrolase, alpha/beta fold family  21.9 
 
 
270 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5253  arylesterase, putative  26.86 
 
 
272 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5984  alpha/beta hydrolase fold  24.63 
 
 
300 aa  63.9  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0152397 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4111  alpha/beta hydrolase fold protein  24.36 
 
 
288 aa  63.9  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0346007  normal  0.0462514 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0351  alpha/beta hydrolase fold  36.94 
 
 
275 aa  63.5  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.347807 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  31.09 
 
 
314 aa  63.9  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4609  hydrolase; menaquinone biosynthesis related protein; prolyl aminopeptidase  21.61 
 
 
270 aa  63.5  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  22.71 
 
 
270 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2331  alpha/beta hydrolase fold  23.67 
 
 
274 aa  63.5  0.000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0600878  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0504  inner-membrane translocator  24.36 
 
 
571 aa  63.2  0.000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.92013  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0527  inner-membrane translocator  30.4 
 
 
562 aa  63.2  0.000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.142697  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1023  alpha/beta family hydrolase  23.81 
 
 
287 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4969  Alpha/beta hydrolase  25.09 
 
 
273 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0107972 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2798  alpha/beta hydrolase fold protein  24.18 
 
 
270 aa  62.8  0.000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2893  alpha/beta fold family hydrolase  29.52 
 
 
273 aa  62.4  0.000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.511984  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1008  alpha/beta hydrolase fold protein  22.61 
 
 
275 aa  62.4  0.000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3974  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  29.52 
 
 
273 aa  62.4  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3470  alpha/beta fold family hydrolase  30.3 
 
 
328 aa  62  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4749  alpha/beta fold family hydrolase  21.53 
 
 
270 aa  61.6  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3325  putative hydrolase or acyltransferase  25.3 
 
 
296 aa  61.6  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0252993  normal  0.633189 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>