More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0831 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_0831  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 		 344 aa  676    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06730  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  56.13 
 
 		 343 aa  345  8e-94  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2983  alpha/beta hydrolase fold protein  51.02 
 
 		 303 aa  259  6e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.283426 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8386  hydrolase, alpha  48.25 
 
 		 304 aa  234  2.0000000000000002e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.139718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4590  alpha/beta hydrolase fold protein  47.08 
 
 		 327 aa  232  6e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.775489  normal  0.0737458 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4250  alpha/beta hydrolase fold protein  47.77 
 
 		 352 aa  228  2e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.2493  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2137  alpha/beta hydrolase fold protein  43.14 
 
 		 363 aa  207  2e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0198184  normal  0.0171478 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1121  alpha/beta hydrolase fold protein  41.04 
 
 		 322 aa  192  7e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1778  alpha/beta hydrolase fold  39.85 
 
 		 366 aa  150  4e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0401666  normal  0.253947 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2024  alpha/beta hydrolase fold  36.13 
 
 		 329 aa  107  3e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.44574 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  34.93 
 
 		 299 aa  104  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1258  putative hydrolase  31.41 
 
 		 312 aa  103  4e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2918  alpha/beta hydrolase fold  31.41 
 
 		 312 aa  103  4e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.906544 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2696  alpha/beta hydrolase fold  30.22 
 
 		 312 aa  100  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.623815  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3469  alpha/beta hydrolase fold protein  35.23 
 
 		 304 aa  100  3e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.210979  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2705  alpha/beta hydrolase fold  28.03 
 
 		 309 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.601677  normal  0.0914485 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2065  cyclic nucleotide-binding protein  31.82 
 
 		 462 aa  94.7  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3452  alpha/beta hydrolase fold  28.99 
 
 		 311 aa  92.8  7e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.156566  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2863  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 		 314 aa  90.5  3e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.334442  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2212  putative lipase  28.67 
 
 		 315 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.799877  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25910  putative lipase  28.67 
 
 		 315 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0600573 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0993  alpha/beta hydrolase fold  26.8 
 
 		 345 aa  89.7  7e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.87511  unclonable  0.000000000579867 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1786  cyclic nucleotide-binding protein  29.72 
 
 		 462 aa  88.6  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00355982 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2433  hypothetical protein  29.89 
 
 		 306 aa  87.8  2e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.409696 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6643  putative triacylglycerol lipase  32.53 
 
 		 275 aa  86.7  5e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.192902  normal  0.181736 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0119  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  29.93 
 
 		 380 aa  85.5  0.000000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.156608 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1052  alpha/beta fold family hydrolase  27.74 
 
 		 302 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3731  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  28.52 
 
 		 372 aa  84.3  0.000000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5048  hydrolase, alpha/beta fold family  26.89 
 
 		 279 aa  84  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2916  alpha/beta hydrolase fold protein  29.2 
 
 		 284 aa  84.3  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0174  cyclic nucleotide-binding protein  28.17 
 
 		 456 aa  84  0.000000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000271627  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3515  alpha/beta hydrolase fold  26.24 
 
 		 279 aa  84  0.000000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4614  alpha/beta hydrolase fold protein  28 
 
 		 279 aa  83.2  0.000000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2885  alpha/beta hydrolase fold protein  29.82 
 
 		 275 aa  82.4  0.000000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00297178 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5043  alpha/beta fold family hydrolase  27.27 
 
 		 279 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4774  alpha/beta fold family hydrolase  28 
 
 		 279 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4636  alpha/beta hydrolase fold protein  28 
 
 		 279 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5136  alpha/beta fold family hydrolase  28 
 
 		 279 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4750  alpha/beta hydrolase fold protein  32.71 
 
 		 268 aa  82.4  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5015  hydrolase, alpha/beta fold family  28 
 
 		 279 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5036  hydrolase, alpha/beta fold family  28 
 
 		 279 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0878  alpha/beta hydrolase fold  27.8 
 
 		 317 aa  82.4  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0136792  hitchhiker  0.00000592996 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3522  alpha/beta hydrolase fold protein  26.85 
 
 		 289 aa  81.3  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.328717  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0023  alpha/beta hydrolase fold  27.06 
 
 		 315 aa  81.6  0.00000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00672386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0316  alpha/beta hydrolase fold  28.94 
 
 		 316 aa  81.3  0.00000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00247828  hitchhiker  0.00660595 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3844  alpha/beta hydrolase fold protein  28.4 
 
 		 289 aa  80.5  0.00000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.185404  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2147  alpha/beta hydrolase fold  26.16 
 
 		 278 aa  80.5  0.00000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4501  alpha/beta hydrolase fold protein  24.53 
 
 		 285 aa  80.5  0.00000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.569639  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1080  alpha/beta hydrolase fold  28.97 
 
 		 296 aa  80.5  0.00000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3143  alpha/beta hydrolase fold  28.72 
 
 		 309 aa  80.1  0.00000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.03403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0672  alpha/beta hydrolase fold  27.99 
 
 		 315 aa  80.1  0.00000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.240082 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0274  Alpha/beta hydrolase fold  28.27 
 
 		 289 aa  80.1  0.00000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.642233  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  31.23 
 
 		 308 aa  79.7  0.00000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3055  alpha/beta hydrolase fold  27.53 
 
 		 277 aa  78.6  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0115287 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0323  alpha/beta hydrolase fold  28.36 
 
 		 285 aa  79.3  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.619665  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0312  alpha/beta hydrolase fold  27.99 
 
 		 285 aa  79  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0333  alpha/beta hydrolase fold  28.36 
 
 		 285 aa  79.3  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.240836 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4676  alpha/beta hydrolase fold-containing protein  27.8 
 
 		 331 aa  78.2  0.0000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.318593  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1463  Alpha/beta hydrolase  24.02 
 
 		 278 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.234917  normal  0.480235 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2696  putative hydrolase  28.52 
 
 		 387 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0198  alpha/beta hydrolase fold  26.04 
 
 		 311 aa  78.2  0.0000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.593906 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0198  hydrolase, alpha/beta fold family  27.27 
 
 		 279 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1168  alpha/beta hydrolase fold protein  30.04 
 
 		 271 aa  77.8  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.375352  normal  0.0130652 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3798  alpha/beta hydrolase fold protein  25.83 
 
 		 258 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5046  alpha/beta hydrolase fold protein  31.51 
 
 		 281 aa  77.8  0.0000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.186398  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3779  cyclic nucleotide-binding protein  27.34 
 
 		 453 aa  77.4  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0440455  normal  0.0476196 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4516  alpha/beta hydrolase fold  27.1 
 
 		 310 aa  77.4  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.320967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_35123  predicted protein  26.74 
 
 		 348 aa  77.4  0.0000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0809  alpha/beta hydrolase fold  25.75 
 
 		 283 aa  76.6  0.0000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2400  alpha/beta hydrolase fold  27.86 
 
 		 288 aa  76.3  0.0000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4726  alpha/beta hydrolase fold  27.59 
 
 		 279 aa  75.9  0.0000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0829  alpha/beta hydrolase fold protein  27.08 
 
 		 305 aa  75.5  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1765  alpha/beta hydrolase fold protein  23.88 
 
 		 291 aa  75.1  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22090  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  29.39 
 
 		 285 aa  74.7  0.000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00622193 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1793  alpha/beta hydrolase fold protein  23.88 
 
 		 291 aa  74.7  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000234271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1361  Alpha/beta hydrolase fold  26.35 
 
 		 298 aa  74.3  0.000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00841082  hitchhiker  0.00000857461 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4708  Alpha/beta hydrolase fold  23.11 
 
 		 295 aa  74.3  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00337944  normal  0.50622 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1259  alpha/beta hydrolase fold  25.27 
 
 		 284 aa  73.9  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8642  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  30.07 
 
 		 321 aa  73.9  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0725  alpha/beta hydrolase fold protein  28.52 
 
 		 286 aa  73.9  0.000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0726  Alpha/beta hydrolase fold  27.62 
 
 		 297 aa  73.9  0.000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.418477  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4026  alpha/beta hydrolase fold protein  26.28 
 
 		 298 aa  73.9  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3158  alpha/beta hydrolase fold protein  23.77 
 
 		 290 aa  73.6  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.511657 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2047  Alpha/beta hydrolase fold  24.72 
 
 		 312 aa  73.2  0.000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3757  alpha/beta hydrolase fold-containing protein  24.44 
 
 		 295 aa  72.8  0.000000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1937  alpha/beta hydrolase fold protein  26.14 
 
 		 299 aa  72.8  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.926814 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1227  alpha/beta hydrolase fold protein  26.99 
 
 		 387 aa  73.2  0.000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2898  alpha/beta hydrolase fold  26.69 
 
 		 291 aa  72.8  0.000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.14294 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1199  alpha/beta hydrolase fold protein  21.95 
 
 		 280 aa  72.8  0.000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0627  Alpha/beta hydrolase  28.47 
 
 		 289 aa  72.8  0.000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.355065 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0801  alpha/beta hydrolase fold protein  27.02 
 
 		 305 aa  72.8  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  29.6 
 
 		 265 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4246  alpha/beta hydrolase fold  26.14 
 
 		 288 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.912428  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3501  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  28.67 
 
 		 374 aa  71.2  0.00000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0571139 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4675  alpha/beta hydrolase fold  30.29 
 
 		 334 aa  71.2  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.719467  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3987  alpha/beta hydrolase fold  28.81 
 
 		 329 aa  71.6  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.38084 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1408  alpha/beta hydrolase fold protein  27.38 
 
 		 421 aa  71.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.259617 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2754  alpha/beta hydrolase fold protein  29.75 
 
 		 284 aa  72  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2200  alpha/beta hydrolase fold protein  25.17 
 
 		 278 aa  71.6  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1296  alpha/beta hydrolase fold protein  30.88 
 
 		 292 aa  70.9  0.00000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0671878  hitchhiker  0.00361499 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>